Overview of methods of reverse engineering of gene regulatory networks: Boolean and Bayesian networks

Одна из проблем современной системной биологии – моделирование сетей генной регуляции, в наиболее полной мере отображающих регуляторные взаимодействия между генами всего организма. Большая вычислительная сложность такой задачи и отсутствие основательных обзоров методов реконструкции генных сетей явл...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2012
Автор: Frolova, A.O.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2012
Назва видання:Вiopolymers and Cell
Теми:
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156844
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Overview of methods of reverse engineering of gene regulatory networks: Boolean and Bayesian networks / A.O. Frolova // Вiopolymers and Cell. — 2012. — Т. 28, № 3. — С. 163-170. — Бібліогр.: 32 назв. — англ., укр.

Репозиторії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Опис
Резюме:Одна из проблем современной системной биологии – моделирование сетей генной регуляции, в наиболее полной мере отображающих регуляторные взаимодействия между генами всего организма. Большая вычислительная сложность такой задачи и отсутствие основательных обзоров методов реконструкции генных сетей являются значительной преградой для дальнейшего развития этого направления системной биологии. В данной статье рассмотрены два наиболее распространенных метода моделирования сетей генной регуляции: булевые и баесовые сети, а также дано их математическое описание, а также раскрыто несколько алгоритмических подходов к моделированию генных сетей с помощью этих методов, указаны сложность алгоритмов и проблемы, которые возникают при их использовании. Ключевые слова: реконструкция сетей генной регуляции, булевые сети, баесовые сети.