Структурна біоінформатика в постгеномну еру
Структурна біоінформатика – це нова галузь молекулярної біології, яка використовує методи комп'ютерного аналізу для моделювання просторової структури білків і макромолекулярних комплексів для з'ясування їхніх функцій. Метою структурної біоінформатика є також створення селективних модулятор...
Збережено в:
Дата: | 2004 |
---|---|
Автори: | , , , , |
Формат: | Стаття |
Мова: | Ukrainian |
Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2004
|
Назва видання: | Біополімери і клітина |
Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156874 |
Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
Цитувати: | Структурна біоінформатика в постгеномну еру / К.О. Одинець, С.С. Івахно, Д.Б. Ковальський, Б.Т. Токовенко, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2004. — Т. 20, № 1-2. — С. 78-91. — Бібліогр.: 116 назв. — укр. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraineid |
irk-123456789-156874 |
---|---|
record_format |
dspace |
spelling |
irk-123456789-1568742019-06-20T01:26:37Z Структурна біоінформатика в постгеномну еру Одинець, К.О. Івахно, С.С. Ковальський, Д.Б. Токовенко, Б.Т. Корнелюк, О.І. Структурна біоінформатика – це нова галузь молекулярної біології, яка використовує методи комп'ютерного аналізу для моделювання просторової структури білків і макромолекулярних комплексів для з'ясування їхніх функцій. Метою структурної біоінформатика є також створення селективних модуляторів функціональної активності білків як нових лікарських препаратів. Прогрес структурної біоінформатики обумовлений бурхливим розвитком геноміки – розишфровкою декількох сотень геномів про- та еукаріотних організмів і переходом біології в постгеномну еру. В огляді розглянуто такі питання, як моделювання просторової структури білків, протеоміка та інтерактоміка, біоінформатика при аналізі транскриптому, молекулярна динаміка білків, моделювання взаємодій з лігандами, комп'ютерний дизайн лікарських препаратів тощо. Описано застосування цих підходів при дослідженні тирозил-тРНК синтетази ссавців та протеази вірусу імунодефіциту людини. Подано інформацію про перший український біоінформаційний web-портал BioUA, який створено для проведення досліджень у галузі геноміки та структурної біоінформатики. Structural bioinformatics is a novel branch of biology which uses the computational methods of analysis with the aim of modeling the 3D structures of proteins and macromolecular complexes. The goal of structural bioinformatics research is also the creation of novel modulators of functional activities of proteins, such as novel drugs (drug design). Progress in structural bioinformatics is determined by the rapid growth in the deciphering of several hundreds of genomes of both prokaryotic and eukaryotic organisms and transition to post-genomic era. In this review some aspects of structural bioinformatics such as 3D structure modeling, proteomics and interactomics, bioinformatics in transcriptome analysis, molecular dynamics of proteins, protein-ligand interactions modeling and computer aided drug design are discussed. The development and applications of these methods for mammalian tyrosyl-tRNA synthetase and viral HIV-protease are discussed. The first Ukrainian web-portal BioUA devoted to the genomics and structural bioinformatics investigations is described in this review. Структурная биоинформатика – новая область биологии, использующая методы компьютерного анализа для моделирования пространственной структуры белков и макромолекулярных комплексов для выяснения их функций. Целью структурной биоинформатики является также создание селективных модуляторов функциональной активности белков как новых лекарственных препаратов. Прогресс структурной биоинформатики обусловлен бурным развитием геномики – расшифровкой нескольких сотен геномов про- и эукариотических организмов и переходом биологии в постгеномную эру. В обзоре рассмотрены такие вопросы, как моделирование пространственной структуры белков, протеомика и интерактомика, биоинформатика при анализе транскриптома, молекулярная динамика белков, моделирование взаимодействий с лигандами, компьютерный дизайн лекарственных препаратов. Описано применение этих подходов при исследовании тирозил-тРНК синтетазы млекопитающих и протеазы вируса иммунодефицита человека. Для проведения исследований в области геномики и структурной биоинформатики создан первый украинский биоинформационный web-портал BioUA. 2004 Article Структурна біоінформатика в постгеномну еру / К.О. Одинець, С.С. Івахно, Д.Б. Ковальський, Б.Т. Токовенко, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2004. — Т. 20, № 1-2. — С. 78-91. — Бібліогр.: 116 назв. — укр. 0233-7657 DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.000695 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156874 577.322:577.332 uk Біополімери і клітина Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
collection |
DSpace DC |
language |
Ukrainian |
description |
Структурна біоінформатика – це нова галузь молекулярної біології, яка використовує методи комп'ютерного аналізу для моделювання просторової структури білків і макромолекулярних комплексів для з'ясування їхніх функцій. Метою структурної біоінформатика є також створення селективних модуляторів функціональної активності білків як нових лікарських препаратів. Прогрес структурної біоінформатики обумовлений бурхливим розвитком геноміки – розишфровкою декількох сотень геномів про- та еукаріотних організмів і переходом біології в постгеномну еру. В огляді розглянуто такі питання, як моделювання просторової структури білків, протеоміка та інтерактоміка, біоінформатика при аналізі транскриптому, молекулярна динаміка білків, моделювання взаємодій з лігандами, комп'ютерний дизайн лікарських препаратів тощо. Описано застосування цих підходів при дослідженні тирозил-тРНК синтетази ссавців та протеази вірусу імунодефіциту людини. Подано інформацію про перший український біоінформаційний web-портал BioUA, який створено для проведення досліджень у галузі геноміки та структурної біоінформатики. |
format |
Article |
author |
Одинець, К.О. Івахно, С.С. Ковальський, Д.Б. Токовенко, Б.Т. Корнелюк, О.І. |
spellingShingle |
Одинець, К.О. Івахно, С.С. Ковальський, Д.Б. Токовенко, Б.Т. Корнелюк, О.І. Структурна біоінформатика в постгеномну еру Біополімери і клітина |
author_facet |
Одинець, К.О. Івахно, С.С. Ковальський, Д.Б. Токовенко, Б.Т. Корнелюк, О.І. |
author_sort |
Одинець, К.О. |
title |
Структурна біоінформатика в постгеномну еру |
title_short |
Структурна біоінформатика в постгеномну еру |
title_full |
Структурна біоінформатика в постгеномну еру |
title_fullStr |
Структурна біоінформатика в постгеномну еру |
title_full_unstemmed |
Структурна біоінформатика в постгеномну еру |
title_sort |
структурна біоінформатика в постгеномну еру |
publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
publishDate |
2004 |
url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156874 |
citation_txt |
Структурна біоінформатика в постгеномну еру / К.О. Одинець, С.С. Івахно, Д.Б. Ковальський, Б.Т. Токовенко, О.І. Корнелюк // Біополімери і клітина. — 2004. — Т. 20, № 1-2. — С. 78-91. — Бібліогр.: 116 назв. — укр. |
series |
Біополімери і клітина |
work_keys_str_mv |
AT odinecʹko strukturnabíoínformatikavpostgenomnueru AT ívahnoss strukturnabíoínformatikavpostgenomnueru AT kovalʹsʹkijdb strukturnabíoínformatikavpostgenomnueru AT tokovenkobt strukturnabíoínformatikavpostgenomnueru AT kornelûkoí strukturnabíoínformatikavpostgenomnueru |
first_indexed |
2023-05-20T17:50:50Z |
last_indexed |
2023-05-20T17:50:50Z |
_version_ |
1796154229519286272 |