Связывание производного актиноцина с фрагментами ДНК: моделирование методом Монте Карло

Связывание производного актиноцина с фрагментами ДНК: моделирование методом Монте Карло

Методом Монте Карло проведено компьютерное моделирование взаимодействия фрагментов ДНК и производного актиноцина (АсШ) с учетом водного окружения. Получены низкоэнергетические молекулярные структуры, соответствующие наиболее вероятным типам взаимодействия — связыванию АсШ в малом желобке и интерк...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Дата:	2007
Автор:	Шестопалова, A.V.
Формат:	Стаття
Мова:	Russian
Опубліковано:	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2007
Назва видання:	Біополімери і клітина
Теми:	Молекулярна біофізика
Онлайн доступ:	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156907
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:	Связывание производного актиноцина с фрагментами ДНК: моделирование методом Монте Карло / А.В. Шестопалова // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 1. — С. 35-44. — Бібліогр.: 22 назв. — рос., англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

Схожі ресурси

Связывание антибиотиков актиноцинового ряда с матрицей полифосфата
за авторством: Круглова, Е.Б., та інші
Опубліковано: (2005)

Исследование комплексообразования бромистого этидия с ДНК методом спектроскопии комбинационного рассеяния света
за авторством: Близнюк, Ю.Н., та інші
Опубліковано: (2009)

Квантово-химическое моделирование радиационных повреждений компонентов ДНК при неупругом взаимодействии с медленными электронами. Облучение дезоксирибозы
за авторством: Минаев, Б.Ф., та інші
Опубліковано: (2005)

Гидрофобный вклад в свободную энергию комплексообразования ароматических лигандов с ДНК
за авторством: Костюков, В.В., та інші
Опубліковано: (2009)

Спектрофотометрическое исследование механизмов связывания аналогов цитидина и бромистого этидия с ДНК
за авторством: Ермак, Е.Л., та інші
Опубліковано: (2007)

Чи є комплементарність основ у ДНК іманентною фізико-хімічною властивістю самих основ? Результати неемпіричного квантово-хімічного дослідження
за авторством: Кречківська, О.М., та інші
Опубліковано: (2003)

Повний конформаційний аналіз дезоксиаденозину квантово-хімічним методом функціоналу густини
за авторством: Жураківський, Р.О., та інші
Опубліковано: (2007)

Конформаційні можливості уридину: квантово-механічне дослідження методом функціоналу густини
за авторством: Жураківський, Р.О., та інші
Опубліковано: (2008)

Исследование спектра комбинационного рассеяния Fe(II)-порфина методом функционала плотности
за авторством: Минаева, В.А., та інші
Опубліковано: (2009)

Вичерпний конформаційний аналіз 2-дезоксиуридину квантово-хімічним методом функціоналу густини
за авторством: Жураківський, Р.О., та інші
Опубліковано: (2006)

Исследование инфракрасного спектра 17β-эстрадиола квантово-химическим методом функционала плотности
за авторством: Минаев, Б.Ф., та інші
Опубліковано: (2006)

Дослідження інфрачервоного спектра молекули Fe(II)-порфіну в різних спінових станах квантово-хімічним методом функціоналу густини
за авторством: Мінаєв, Б.П., та інші
Опубліковано: (2007)

Фіксація прототропних таутомерів ксантину метальною групою практично не впливає на їхню відносну енергію: квантово-хімічне дослідження методом DFT
за авторством: Платонов, М.О., та інші
Опубліковано: (2003)

Гидратация мембран эритроцитов и их взаимодействие с высокодисперсным кремнеземом
за авторством: Туров, В.В., та інші
Опубліковано: (2006)

Дослідження конформаційної рухливості С-модуля тирозил-тРНК синтетази та його комплексу з тРНК методами часороздільної флуоресцентної спектроскопії
за авторством: Кордиш, М.О., та інші
Опубліковано: (2007)

Влияние ионов Сd²⁺ на конформационное равновесие трехцепочечного полинуклеотида полиU·полиА·полиU в условиях, близких к физиологическим
за авторством: Сорокин, В.А., та інші
Опубліковано: (2007)

О молекулярных механизмах сокращения мышечного волокна при переходе к новому равновесному состоянию: анализ экспериментальных данных с использованием трехкомпонентного электростимулирующего сигнала
за авторством: Ноздренко, Д.Н., та інші
Опубліковано: (2005)

Неэмпирическое квантово-химическое исследование различных структурных форм алкалоида берберина
за авторством: Данилов, В.И., та інші
Опубліковано: (2007)

Электрофоретическое исследование конформационных переходов в поли(G) под действием моновалентных катионов
за авторством: Зарудная, М.И., та інші
Опубліковано: (2007)

Які внутрішньомолекулярні водневі зв’язки стабілізують конформери дезоксиаденозину? Результати квантово-хімічного аналізу топології електронної густини
за авторством: Жураківський, Р.О., та інші
Опубліковано: (2007)

Фазовая диаграмма комплексов ионов Ni2+ c полиUполиAполиU
за авторством: Сорокин, В.А., та інші
Опубліковано: (2009)

Дослідження моделей зв’язування кисню гемом за допомогою теорії функціоналу густини
за авторством: Мінаєв, Б.П., та інші
Опубліковано: (2009)

Влияние высокодисперсных материалов на физиологическую активность дрожжевых клеток
за авторством: Крупская, Т.В., та інші
Опубліковано: (2009)

Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 1. Geometry and energetics of the gating
за авторством: Kharkyanen, V.N., та інші
Опубліковано: (2009)

Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 2. Dynamic self-organization model of the gating
за авторством: Kharkyanen, V.N., та інші
Опубліковано: (2009)

The molecular mechanism of the spontaneous substitution mutations caused by tautomerism of bases: Post Hartree-Fock study of the DNA rare base pairs
за авторством: Danilov, V.I., та інші
Опубліковано: (2005)

Возможный молекулярный механизм нелинейности мышечного сокращения и его экспериментальное обоснование
за авторством: Ноздренко, Д.Н., та інші
Опубліковано: (2005)

Влияние хлороформа на состояние воды, адсорбированной сывороточным альбумином
за авторством: Нечипор, О.В., та інші
Опубліковано: (2006)

Физические факторы стабильности трехспиральных структур коллагенового типа
за авторством: Борискина, Е.П., та інші
Опубліковано: (2006)

Самоасоціація цитозину у зневодненому ДМСО за допомогою двох еквівалентних Н-зв'язків N1H...O=C2 знижує бар'єр повертання аміногрупи: дані ¹Н ЯМР спектроскопії
за авторством: Самійленко, С.П., та інші
Опубліковано: (2003)

Possible electronic mechanisms of generation and quenching of luminescence of singlet oxygen in the course of photodynamic therapy: ab initio study
за авторством: Minaev, B.F., та інші
Опубліковано: (2006)

Теоретическая оценка подвижности участков пептидной цепи молекулы сывороточного
за авторством: Щечкин, И.Е., та інші
Опубліковано: (2006)

Сендвічоподібна самоасоціація цитозину та її прояви в оптичних спектрах
за авторством: Петрушко, І.А., та інші
Опубліковано: (2005)

Утворення негативних іонів молекули цитозину при електронному ударі та його можливе біофізичне значення
за авторством: Суховія, М.І., та інші
Опубліковано: (2005)

Дослідження впливу мікрохвильового опромінення на деякі гідробіонти
за авторством: Григорьева, О.О., та інші
Опубліковано: (2004)

Возможный механизм стабилизации одной из двух форм двуспирального поли(А)
за авторством: Зарудная, М.И.
Опубліковано: (2008)

The collective vibration modes of hydrogen bonds as a gauge of water states in fruits and leaves
за авторством: Kornienko, M.E., та інші
Опубліковано: (2006)

Clustering Monte Carlo simulations of the hierarchical protein folding on a simple lattice model
за авторством: Yesylevskyy, S.O., та інші
Опубліковано: (2004)

Влияние ионов Ni²⁺ на конформационное равновесие полинуклеотидов полиA·полиU, полиА и полиU в условиях, близких к физиологическим
за авторством: Сорокин, В.А., та інші
Опубліковано: (2008)

Термодинамика взаимодействия ионов Zn²⁺ с природной ДНК в условиях B→m перехода
за авторством: Сорокин, В.А., та інші
Опубліковано: (2013)