Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of the hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker

Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of the hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker

Mammalian tyrosyl-tRNA synthetase is composed of two structural modules: N-terminal catalytic miniTyrRS and non-catalytic cytokine-like C-terminal module connected by a flexible peptide linker. Till now, the 3D structure of any full-length mammalian TyrRS has not been solved by X-ray crystallography...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Дата:	2012
Автори:	Pydiura, N.A., Kornelyuk, A.I.
Формат:	Стаття
Мова:	English
Опубліковано:	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2012
Назва видання:	Вiopolymers and Cell
Теми:	Bioinformatics
Онлайн доступ:	http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/156942
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:	Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of the hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker / N.A. Pydiura, A.I. Kornelyuk // Вiopolymers and Cell. — 2012. — Т. 28, № 5. — С. 397-403. — Бібліогр.: 35 назв. — англ.

Репозиторії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

Схожі ресурси

Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker
за авторством: N. A. Pydiura, та інші
Опубліковано: (2012)

The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
за авторством: Mykuliak, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)

Computational approaches for parameterization of aminoacyl-tRNA synthetase substrates
за авторством: Rayevsky, O.V., та інші
Опубліковано: (2018)

Molecular docking and molecular dynamics simulation studies on Thermus thermophilus leucyl-tRNA synthetase complexed with different amino acids and pre-transfer editing substrates
за авторством: Rayevsky, A.V., та інші
Опубліковано: (2016)

Conformational flexibility of interdomain linker in bovine tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulation
за авторством: Pydiura, N.A., та інші
Опубліковано: (2006)

Objective clustering inductive technology of gene expression profiles based on sota clustering algorithm
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2017)

Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2016)

Identification of hierarchy of dynamic domains in proteins: comparison of HDWA and HCCP techniques
за авторством: Yesylevskyy, S.O.
Опубліковано: (2010)

Mathematical modeling of folate-related processes in human placenta
за авторством: Dotsenko, V.A., та інші
Опубліковано: (2014)

Критерії оцінки результатів мікромасив-експерименту з дослідження транскриптому гепатоцитів щура під впливом інтерферону альфа
за авторством: Куклін, А.В., та інші
Опубліковано: (2013)

Bioinformatics analysis of cis-regulatory elements in Mbl1 and Mbl2 genes in Rattus norvegicus
за авторством: Bondarenko, V.S., та інші
Опубліковано: (2015)

A link between β-catenin and hypertrophy: evaluation and meta-analysis
за авторством: Palchevska, O.L., та інші
Опубліковано: (2016)

Creation of gene expression database on preeclampsia-affected human placenta
за авторством: Lykhenko, O., та інші
Опубліковано: (2017)

Geometric filters for protein–ligand complexes based on phenomenological molecular models
за авторством: Sudakov, O.O., та інші
Опубліковано: (2013)

Comparative analysis of nuclear localization signal (NLS) prediction methods
за авторством: Lisitsyna, O.M., та інші
Опубліковано: (2017)

Similarity and dissimilarity of primary structures of some Streptomyces spp. genomes and the Streptomyces globisporus 1912-2 chromosomal DNA
за авторством: Polishchuk, L.V.
Опубліковано: (2017)

New technique of identifying the hierarchy of dynamic domains in proteins using a method of molecular dynamics simulations
за авторством: Yesylevskyy, S.O.
Опубліковано: (2010)

Design of potentially active ligands for SH2 domains by molecular modeling methods
за авторством: Hurmach, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)

Біоінформатичний аналіз вторинної структури тринскриптів інтрона 1 гена whp1 кукурудзи
за авторством: Сліщук, Г.І., та інші
Опубліковано: (2012)

Cobaltand nickel-containing enzyme constructs from the sequences of methanogens
за авторством: Chellapandi P., та інші
Опубліковано: (2012)

PTI-1: novel way to oncogenicity
за авторством: Vislovukh, A.A., та інші
Опубліковано: (2012)

Homology modeling of structure of NH₂-terminal module of mammalian (Bos taurus) tyrosyl-tRNA synthetase
за авторством: Odynets, K.A., та інші
Опубліковано: (2002)

Autoantibodies against tyrosyl-tRNA synthetase and its separated domains at essential hypertension
за авторством: Yu. Grom, та інші
Опубліковано: (2015)

Autoantibodies against tyrosyl-tRNA synthetase and its separated domains at essential hypertension
за авторством: Grom, M.Yu., та інші
Опубліковано: (2015)

Cytokine activity of the non-catalytic EMAP-2-like domain of mammalian tyrosyl-tRNA synthetase
за авторством: Kornelyuk, A., та інші
Опубліковано: (1999)

The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
за авторством: V. V. Mykuliak, та інші
Опубліковано: (2014)

Molecular cloning, sequencing and sequence analysis of Thermus thermophilus tyrosyl-tRNA synthetase
за авторством: Yaremchuk, A.D., та інші
Опубліковано: (2004)

Structure and dynamics of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor
за авторством: V. V. Mykuliak, та інші
Опубліковано: (2014)

Bioactive peptides of the cow milk whey proteins (Bos taurus)
за авторством: A. V. Yukalo, та інші
Опубліковано: (2013)

MD simulations of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor using QM/MM approach
за авторством: V. V. Mykuliak, та інші
Опубліковано: (2016)

Cow milk casein complex (Bos taurus) proteins as the precursors of bioactive peptides
за авторством: A. V. Yukalo, та інші
Опубліковано: (2012)

Иннервационный аппарат и микроциркуляция мышечных фасций быка домашнего (Bos taurus L.)
за авторством: Орчук, К.И.
Опубліковано: (1978)

Computational modeling of molecular dynamics of G41R mutant form of human tyrosyl-tRNA synthetase, assosiated with Charcot-Marie-Tooth neuropathy
за авторством: O. V. Savytskyi, та інші
Опубліковано: (2015)

К характеристике быка домашнего (Bos taurus dometsicus L.) из древнерусского города Воиня
за авторством: Тимченко, Н.Г.
Опубліковано: (1969)

Prolyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus is eukaryotic-like but aminoacylates prokaryotic tRNA Pro
за авторством: A. D. Yaremchuk, та інші
Опубліковано: (2012)

Характеристика волосяного покрова гибридов бантенга [Bos (Bibos) javanicus D’alton] с домашней коровой (Bos primigenius taurus L.) в сравнении с исходными видами
за авторством: Стекленев, Е.П., та інші
Опубліковано: (2009)

The immunochemical cross-reactivity between cytoplasmic and mitochondrial mammalian lysyl-tRNA synthetases
за авторством: Sidorik, L.L., та інші
Опубліковано: (2000)

Recognition of tRNAs with a long variable arm by aminoacyl-tRNA synthetases
за авторством: Tukalo, M.A., та інші
Опубліковано: (2013)

Recognition of tRNAs with a long variable arm by aminoacyl-tRNA synthetases
за авторством: M. A. Tukalo, та інші
Опубліковано: (2013)

Somparative genetic characteristics of the russian and belarusian populations of wisent (Bison bonasus), north american bison (Bison bison) and cattle (Bos taurus)
за авторством: O. V. Kostjunina, та інші
Опубліковано: (2020)