Влияние ионов Сd²⁺ на конформационное равновесие трехцепочечного полинуклеотида полиU·полиА·полиU в условиях, близких к физиологическим
Методом дифференциальной УФ-спектроскопии изучено влияние ионов Cd²⁺ на конформационное равновесие трехцепочечного полинуклеотида полиU ·полиA ·полиU (0,1 М Na+, pH 7). Показано, что эти ионы не связываются с гетероатомами азотистых оснований полиA и полиU, находящихся в составе тройной (A²U) и двой...
Збережено в:
| Дата: | 2007 |
|---|---|
| Автори: | , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Russian |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2007
|
| Назва видання: | Біополімери і клітина |
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/157502 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Влияние ионов Сd²⁺ на конформационное равновесие трехцепочечного полинуклеотида полиU·полиА·полиU в условиях, близких к физиологическим / В.А. Сорокин, В.А. Валеев, Е.Л. Усенко, Ю.П. Благой // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 5. — С. 433-440. — Бібліогр.: 35 назв. — рос., англ. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
irk-123456789-157502 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
irk-123456789-1575022019-06-21T01:30:08Z Влияние ионов Сd²⁺ на конформационное равновесие трехцепочечного полинуклеотида полиU·полиА·полиU в условиях, близких к физиологическим Сорокин, В.А. Валеев, В.А. Усенко, Е.Л. Благой, Ю.П. Молекулярна біофізика Методом дифференциальной УФ-спектроскопии изучено влияние ионов Cd²⁺ на конформационное равновесие трехцепочечного полинуклеотида полиU ·полиA ·полиU (0,1 М Na+, pH 7). Показано, что эти ионы не связываются с гетероатомами азотистых оснований полиA и полиU, находящихся в составе тройной (A²U) и двойной (AU) спиралей, и не изменяют их конформации. Нагревание A²U индуцирует два последовательных процесса: первый соответствует отделению от A²U одной нити полиU, то есть реализации перехода 3→2, второй – более кооперативному плавлению AU, т. е. переходу 2→1. Концентрационные зависимости температур плавления, соответствующие этим процессам, имеют точку пересечения (Tm = 60 оС; концентрация Cd²⁺ ≈ 3,5·10–4M), при которой термостабильности A²U и AU становятся одинаковыми. Теоретические расчеты концентрационных зависимостей (Tm)3→2 показали, что наилучшее согласие между опытом и теорией наблюдается при энтальпии перехода ΔН3→2 = 5 ккалмоль⁻¹ триплет⁻¹ . Методом диференційної УФ-спектроскопії вивчено вплив іонів Cd²⁺ на конформаційну рівновагу триланцюгового полінуклеотиду поліU·поліA·поліU (0,1 М Na+, pH 7). Показано, що ці іони не зв’язуються с гетероатомами азотистих основ поліA та поліU, що знаходяться у складі потрійної (A²U) та подвійної (AU) спіралей, та не змінюють їхньої конформації. Нагрівання A2U индукує два послідовних процеси: перший відповідає відділенню від A²U однієї нитки поліU, тобто реалізації переходу 3→2, другий – більш кооперативному плавленню AU, тобто переходу 2→1. Концентраційні залежності температур плавлення, які відповідають цим процесам, мають точку перетину (Tm=60 оС; [Cd²⁺] 3,5·10–4 M), при якій термостабільності A²U та AU стають однаковими. Теоретичними розрахунками концентраційних залежностей (Tm)3→2 показали, що результати досліду та теорії найкраще узгоджуються при ентальпії переходу ΔН3→2 = 5 ккалмоль⁻¹ триплет⁻¹ . Cd²⁺ ions effect on the conformational equilibrium of three-stranded polyU·polyA·polyU polynucleotide (0.1M Na⁺, pH 7) has been studied by the method of differential UV spectroscopy. It has been revealed that Cd²⁺ ions do not bind heteroatoms of nitrogen bases of polyA and polyU being in triple (A²U) and double (AU) helices and do not change their conformation. The heating of A²U results in two subsequent processes: the first one represents separation of one strand of poly U from A2U i. e. A2U AU + U transition (3 → 2 transition) is realized, and the second one corresponds to more cooperative melting of AU, i. e. 2 → 1 (U + A U + A + U) transition. The concentration dependences of melting temperatures for these processes have some intersection point (Tm = 60 °C; [Cd²⁺] ~ 3.5·10–4 M) at which thermal stability of A²U and AU become identical. The theoretical calculations of concentration dependences (Tm)3→2 revealed that the best agreement between experiment and theory is observed at the enthalpy of transitionΔH3→2 = 5 kcal/mol·triplet. 2007 Article Влияние ионов Сd²⁺ на конформационное равновесие трехцепочечного полинуклеотида полиU·полиА·полиU в условиях, близких к физиологическим / В.А. Сорокин, В.А. Валеев, Е.Л. Усенко, Ю.П. Благой // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 5. — С. 433-440. — Бібліогр.: 35 назв. — рос., англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00077E http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/157502 577.3 ru Біополімери і клітина Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
Russian |
| topic |
Молекулярна біофізика Молекулярна біофізика |
| spellingShingle |
Молекулярна біофізика Молекулярна біофізика Сорокин, В.А. Валеев, В.А. Усенко, Е.Л. Благой, Ю.П. Влияние ионов Сd²⁺ на конформационное равновесие трехцепочечного полинуклеотида полиU·полиА·полиU в условиях, близких к физиологическим Біополімери і клітина |
| description |
Методом дифференциальной УФ-спектроскопии изучено влияние ионов Cd²⁺ на конформационное равновесие трехцепочечного полинуклеотида полиU ·полиA ·полиU (0,1 М Na+, pH 7). Показано, что эти ионы не связываются с гетероатомами азотистых оснований полиA и полиU, находящихся в составе тройной (A²U) и двойной (AU) спиралей, и не изменяют их конформации. Нагревание A²U индуцирует два последовательных процесса: первый соответствует отделению от A²U одной нити полиU, то есть реализации перехода 3→2, второй – более кооперативному плавлению AU, т. е. переходу 2→1. Концентрационные зависимости температур плавления, соответствующие этим процессам, имеют точку пересечения (Tm = 60 оС; концентрация Cd²⁺ ≈ 3,5·10–4M), при которой термостабильности A²U и AU становятся одинаковыми. Теоретические расчеты концентрационных зависимостей (Tm)3→2 показали, что наилучшее согласие между опытом и теорией наблюдается при энтальпии перехода ΔН3→2 = 5 ккалмоль⁻¹ триплет⁻¹ . |
| format |
Article |
| author |
Сорокин, В.А. Валеев, В.А. Усенко, Е.Л. Благой, Ю.П. |
| author_facet |
Сорокин, В.А. Валеев, В.А. Усенко, Е.Л. Благой, Ю.П. |
| author_sort |
Сорокин, В.А. |
| title |
Влияние ионов Сd²⁺ на конформационное равновесие трехцепочечного полинуклеотида полиU·полиА·полиU в условиях, близких к физиологическим |
| title_short |
Влияние ионов Сd²⁺ на конформационное равновесие трехцепочечного полинуклеотида полиU·полиА·полиU в условиях, близких к физиологическим |
| title_full |
Влияние ионов Сd²⁺ на конформационное равновесие трехцепочечного полинуклеотида полиU·полиА·полиU в условиях, близких к физиологическим |
| title_fullStr |
Влияние ионов Сd²⁺ на конформационное равновесие трехцепочечного полинуклеотида полиU·полиА·полиU в условиях, близких к физиологическим |
| title_full_unstemmed |
Влияние ионов Сd²⁺ на конформационное равновесие трехцепочечного полинуклеотида полиU·полиА·полиU в условиях, близких к физиологическим |
| title_sort |
влияние ионов сd²⁺ на конформационное равновесие трехцепочечного полинуклеотида полиu·полиа·полиu в условиях, близких к физиологическим |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| publishDate |
2007 |
| topic_facet |
Молекулярна біофізика |
| url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/157502 |
| citation_txt |
Влияние ионов Сd²⁺ на конформационное равновесие трехцепочечного полинуклеотида полиU·полиА·полиU в условиях, близких к физиологическим / В.А. Сорокин, В.А. Валеев, Е.Л. Усенко, Ю.П. Благой // Біополімери і клітина. — 2007. — Т. 23, № 5. — С. 433-440. — Бібліогр.: 35 назв. — рос., англ. |
| series |
Біополімери і клітина |
| work_keys_str_mv |
AT sorokinva vliânieionovsd2nakonformacionnoeravnovesietrehcepočečnogopolinukleotidapoliupoliapoliuvusloviâhblizkihkfiziologičeskim AT valeevva vliânieionovsd2nakonformacionnoeravnovesietrehcepočečnogopolinukleotidapoliupoliapoliuvusloviâhblizkihkfiziologičeskim AT usenkoel vliânieionovsd2nakonformacionnoeravnovesietrehcepočečnogopolinukleotidapoliupoliapoliuvusloviâhblizkihkfiziologičeskim AT blagojûp vliânieionovsd2nakonformacionnoeravnovesietrehcepočečnogopolinukleotidapoliupoliapoliuvusloviâhblizkihkfiziologičeskim |
| first_indexed |
2023-05-20T17:52:27Z |
| last_indexed |
2023-05-20T17:52:27Z |
| _version_ |
1796154299234910208 |