Розподіл шпилькових структур у плазмідах збудника сибірської виразки

• Дата: 2008
• Автори: Лиманська, О.Ю., Лиманський, О.П.
• Формат: Стаття
• Мова: Ukrainian
• Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2008
• Назва видання: Біополімери і клітина
• Теми: Структура та функції біополімерів
• Онлайн доступ: http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/157884
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Цитувати: Розподіл шпилькових структур у плазмідах збудника сибірської виразки / О.Ю. Лиманська, О.П. Лиманський // Біополімери і клітина. — 2008. — Т. 24, № 6. — С. 463-469. — Бібліогр.: 24 назв. — укр., англ.

Однією з важливих біологічних функцій шпилькових структур є захист РНК-транскриптів від деградувальної дії різних факторів, а також регуляція транскрипції за рахунок їхнього формування у термінаторах транскрипції. Проведено пошук та визначено розподіли термодинамічно стабільних досконалих і недосконалих інвертованих повторів у плазмідах рХО1 і рХО2 патогенних штамів Bacillus anthracis. Аналіз послідовностей плазмід рХО1 і рХО2 B. anthracis виявив, що перша містить 176 інвертованих послідовностей з енергією від –30,6 до –10,0 ккал/моль, а друга – 57 шпильок з енергією від –27,2 до –10,0 ккал/моль. Представлено фізичні карти плазмід рХО1 і рХО2 з локалізованими шпильковими структурами. Показано, що останні на фізичних картах плазмід рХО1 і рХО2 розташовані в ділянці регуляторних генів або в елементах з невизначеною функцією.