Биоинформатический поиск потенциальных сайтов фосфорилирования мелузина – интегрин-β1-связывающего белка

Биоинформатический поиск потенциальных сайтов фосфорилирования мелузина – интегрин-β1-связывающего белка

Фосфорилирование белков является важным механизмом посттрансляционной модификации и существенно влияет на клеточные процессы, такие как метаболизм, дифференциация, мембранный транспорт и сигнальные пути клетки. Мелузин – интегрин-β1-связывающий белок – относится к белкам, остро реагирующим на порого...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2008
Автори: Крупская, И.В., Капустян, Л.Н., Сидорик, Л.Л.
Формат: Стаття
Мова:Ukrainian
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2008
Назва видання:Біополімери і клітина
Теми:
Біоінформатика
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/157890
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Биоинформатический поиск потенциальных сайтов фосфорилирования мелузина – интегрин-β1-связывающего белка / И.В. Крупская, Л.Н. Капустян, Л.Л. Сидорик // Біополімери і клітина. — 2008. — Т. 24, № 6. — С. 503-507. — Бібліогр.: 23 назв. — рос., англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-157890
record_format dspace
spelling irk-123456789-1578902019-06-22T01:26:31Z Биоинформатический поиск потенциальных сайтов фосфорилирования мелузина – интегрин-β1-связывающего белка Крупская, И.В. Капустян, Л.Н. Сидорик, Л.Л. Біоінформатика Фосфорилирование белков является важным механизмом посттрансляционной модификации и существенно влияет на клеточные процессы, такие как метаболизм, дифференциация, мембранный транспорт и сигнальные пути клетки. Мелузин – интегрин-β1-связывающий белок – относится к белкам, остро реагирующим на пороговые уровни механического стресса и активирующим сигнальные пути кардиомиоцитов. В данной работе проведен поиск потенциальных сайтов фосфорилирования мелузина с использованием биоинформатического анализа первичной последовательности белка. С помощью объединенного биоинформатического подхода к предсказанию сайтов фосфорилирования, а также эволюционных и структурных исследований идентифицировано, что именно Ser326, Ser329, Ser334 мелузина являются потенциальными участками для фосфорилирования протеинкиназой СК2. Фосфорилювання білків є важливим механізмом посттрансляційної модифікації, що суттєво впливає на клітинні процеси, такі як метаболізм, диференціація, мембранний транспорт та сигнальні шляхи клітини. Мелузин належить до білків, які гостро реагують на порогові рівні механічного стресу та активують сигнальні шляхи кардіоміоцитів. Наші дослідження присвячені пошуку потенційних сайтів фосфорилювання мелузину з використанням біоінформаційного аналізу послідовності білка. Внаслідок об’єднаного біоінформатичного підходу передбачення сайтів фосфорилювання, еволюційних і структурних досліджень идентифіковано, що Ser326, Ser329, і Ser334 мелузина є потенційними ділянками для фосфорилювання протеїнкіназою СК2. Phosphorylation is one of the most frequently occurring posttranslational modifications in proteins. It plays an essential role in transferring outside signals into a cell and regulates different cellular processes such as growth, metabolism, proliferation, motility and differentiation. Melusin is a stress response protein which strictly reacts to the threshold levels of mechanic stress and activates cardiomyocytes signaling pathways. The search for potential sites of melusin phosphorylation was performed using bioinformatic analysis of primary protein sequences. The comparative bioinformatic analysis of possible phosphorylation sites, evolutionary and structural motifs has identified Ser326, Ser329 and Ser334 as the most likely sites for phosphorylation of melusin by protein kinase CK2 in cardiamyocytes. 2008 Article Биоинформатический поиск потенциальных сайтов фосфорилирования мелузина – интегрин-β1-связывающего белка / И.В. Крупская, Л.Н. Капустян, Л.Л. Сидорик // Біополімери і клітина. — 2008. — Т. 24, № 6. — С. 503-507. — Бібліогр.: 23 назв. — рос., англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0007C3 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/157890 577.21 uk Біополімери і клітина Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language Ukrainian
topic Біоінформатика
Біоінформатика
spellingShingle Біоінформатика
Біоінформатика
Крупская, И.В.
Капустян, Л.Н.
Сидорик, Л.Л.
Биоинформатический поиск потенциальных сайтов фосфорилирования мелузина – интегрин-β1-связывающего белка
Біополімери і клітина
description Фосфорилирование белков является важным механизмом посттрансляционной модификации и существенно влияет на клеточные процессы, такие как метаболизм, дифференциация, мембранный транспорт и сигнальные пути клетки. Мелузин – интегрин-β1-связывающий белок – относится к белкам, остро реагирующим на пороговые уровни механического стресса и активирующим сигнальные пути кардиомиоцитов. В данной работе проведен поиск потенциальных сайтов фосфорилирования мелузина с использованием биоинформатического анализа первичной последовательности белка. С помощью объединенного биоинформатического подхода к предсказанию сайтов фосфорилирования, а также эволюционных и структурных исследований идентифицировано, что именно Ser326, Ser329, Ser334 мелузина являются потенциальными участками для фосфорилирования протеинкиназой СК2.
format Article
author Крупская, И.В.
Капустян, Л.Н.
Сидорик, Л.Л.
author_facet Крупская, И.В.
Капустян, Л.Н.
Сидорик, Л.Л.
author_sort Крупская, И.В.
title Биоинформатический поиск потенциальных сайтов фосфорилирования мелузина – интегрин-β1-связывающего белка
title_short Биоинформатический поиск потенциальных сайтов фосфорилирования мелузина – интегрин-β1-связывающего белка
title_full Биоинформатический поиск потенциальных сайтов фосфорилирования мелузина – интегрин-β1-связывающего белка
title_fullStr Биоинформатический поиск потенциальных сайтов фосфорилирования мелузина – интегрин-β1-связывающего белка
title_full_unstemmed Биоинформатический поиск потенциальных сайтов фосфорилирования мелузина – интегрин-β1-связывающего белка
title_sort биоинформатический поиск потенциальных сайтов фосфорилирования мелузина – интегрин-β1-связывающего белка
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 2008
topic_facet Біоінформатика
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/157890
citation_txt Биоинформатический поиск потенциальных сайтов фосфорилирования мелузина – интегрин-β1-связывающего белка / И.В. Крупская, Л.Н. Капустян, Л.Л. Сидорик // Біополімери і клітина. — 2008. — Т. 24, № 6. — С. 503-507. — Бібліогр.: 23 назв. — рос., англ.
series Біополімери і клітина
work_keys_str_mv AT krupskaâiv bioinformatičeskijpoiskpotencialʹnyhsajtovfosforilirovaniâmeluzinaintegrinb1svâzyvaûŝegobelka
AT kapustânln bioinformatičeskijpoiskpotencialʹnyhsajtovfosforilirovaniâmeluzinaintegrinb1svâzyvaûŝegobelka
AT sidorikll bioinformatičeskijpoiskpotencialʹnyhsajtovfosforilirovaniâmeluzinaintegrinb1svâzyvaûŝegobelka
first_indexed 2023-05-20T17:53:31Z
last_indexed 2023-05-20T17:53:31Z
_version_ 1796154330220331008

Схожі ресурси