Однонуклеотидный полиморфизм гена интерлейкина-6 (IL-6) у жителей Харькова, больных сахарным диабетом 2 типа
Aims. To examine the association between SNP rs2069840 (174G / C) of interleukin-6 gene and type 2 diabetes in the population of Kharkov. Objects were venous blood samples of 60 patients with type 2 diabetes and 49 healthy persons (all residents of Kharkiv, Ukrainian and Russian). Methods. Genotypin...
Gespeichert in:
| Datum: | 2015 |
|---|---|
| Hauptverfasser: | , , , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Russian |
| Veröffentlicht: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2015
|
| Schriftenreihe: | Фактори експериментальної еволюції організмів |
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/177405 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Однонуклеотидный полиморфизм гена интерлейкина-6 (IL-6) у жителей Харькова, больных сахарным диабетом 2 типа / Н.А. Козак, А.К. Почерняев, Д.В. Лыткин, М.Ю. Горшунская, С.С. Почерняева // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 16. — С. 206-209. — Бібліогр.: 13 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
irk-123456789-177405 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
irk-123456789-1774052021-02-16T01:26:24Z Однонуклеотидный полиморфизм гена интерлейкина-6 (IL-6) у жителей Харькова, больных сахарным диабетом 2 типа Козак, Н.А. Почерняев, А.К. Лыткин, Д.В. Горшунская, М.Ю. Почерняева, С.С. Генетика людини та медична генетика Aims. To examine the association between SNP rs2069840 (174G / C) of interleukin-6 gene and type 2 diabetes in the population of Kharkov. Objects were venous blood samples of 60 patients with type 2 diabetes and 49 healthy persons (all residents of Kharkiv, Ukrainian and Russian). Methods. Genotyping by PCR-RFLP. Results. The distribution of genotypes for SNP rs2069840 corresponds to the Hardy-Weinberg equilibrium. Allele frequencies in the control group is 0.5; in the group of patients pC = 0.4, qG = 0.6. The weak non-signifi cant association between CC genotype and type 2 diabetes was marked. The odds ratio for genotype GG is 0.54. The sensitivity of the test is 15 %, specificity — 76 %. The positive predictive value is equal to 2 %, negative — 97 %, the accuracy of the test is 74 %, positive likelihood ratio result is 0.63, a negative — 1.6. Conclusions. The distribution of genotypes for SNP rs2069840 of interleukin-6 in the Kharkov population does not deviate from the Hardy-Weinberg equilibrium. According to the results of a pilot study was founded that the CC genotype increases the risk of type 2 diabetes in 1.2 times. 2015 Article Однонуклеотидный полиморфизм гена интерлейкина-6 (IL-6) у жителей Харькова, больных сахарным диабетом 2 типа / Н.А. Козак, А.К. Почерняев, Д.В. Лыткин, М.Ю. Горшунская, С.С. Почерняева // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 16. — С. 206-209. — Бібліогр.: 13 назв. — рос. 2219-3782 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/177405 575:616.379-008.64 ru Фактори експериментальної еволюції організмів Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
Russian |
| topic |
Генетика людини та медична генетика Генетика людини та медична генетика |
| spellingShingle |
Генетика людини та медична генетика Генетика людини та медична генетика Козак, Н.А. Почерняев, А.К. Лыткин, Д.В. Горшунская, М.Ю. Почерняева, С.С. Однонуклеотидный полиморфизм гена интерлейкина-6 (IL-6) у жителей Харькова, больных сахарным диабетом 2 типа Фактори експериментальної еволюції організмів |
| description |
Aims. To examine the association between SNP rs2069840 (174G / C) of interleukin-6 gene and type 2 diabetes in the population of Kharkov. Objects were venous blood samples of 60 patients with type 2 diabetes and 49 healthy persons (all residents of Kharkiv, Ukrainian and Russian). Methods. Genotyping by PCR-RFLP. Results. The distribution of genotypes for SNP rs2069840 corresponds to the Hardy-Weinberg equilibrium. Allele frequencies in the control group is 0.5; in the group of patients pC = 0.4, qG = 0.6. The weak non-signifi cant association between CC genotype and type 2 diabetes was marked. The odds ratio for genotype GG is 0.54. The sensitivity of the test is 15 %, specificity — 76 %. The positive predictive value is equal to 2 %, negative — 97 %, the accuracy of the test is 74 %, positive likelihood ratio result is 0.63, a negative — 1.6. Conclusions. The distribution of genotypes for SNP rs2069840 of interleukin-6 in the Kharkov population does not deviate from the Hardy-Weinberg equilibrium. According to the results of a pilot study was founded that the CC genotype increases the risk of type 2 diabetes in 1.2 times. |
| format |
Article |
| author |
Козак, Н.А. Почерняев, А.К. Лыткин, Д.В. Горшунская, М.Ю. Почерняева, С.С. |
| author_facet |
Козак, Н.А. Почерняев, А.К. Лыткин, Д.В. Горшунская, М.Ю. Почерняева, С.С. |
| author_sort |
Козак, Н.А. |
| title |
Однонуклеотидный полиморфизм гена интерлейкина-6 (IL-6) у жителей Харькова, больных сахарным диабетом 2 типа |
| title_short |
Однонуклеотидный полиморфизм гена интерлейкина-6 (IL-6) у жителей Харькова, больных сахарным диабетом 2 типа |
| title_full |
Однонуклеотидный полиморфизм гена интерлейкина-6 (IL-6) у жителей Харькова, больных сахарным диабетом 2 типа |
| title_fullStr |
Однонуклеотидный полиморфизм гена интерлейкина-6 (IL-6) у жителей Харькова, больных сахарным диабетом 2 типа |
| title_full_unstemmed |
Однонуклеотидный полиморфизм гена интерлейкина-6 (IL-6) у жителей Харькова, больных сахарным диабетом 2 типа |
| title_sort |
однонуклеотидный полиморфизм гена интерлейкина-6 (il-6) у жителей харькова, больных сахарным диабетом 2 типа |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| publishDate |
2015 |
| topic_facet |
Генетика людини та медична генетика |
| url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/177405 |
| citation_txt |
Однонуклеотидный полиморфизм гена интерлейкина-6 (IL-6) у жителей Харькова, больных сахарным диабетом 2 типа / Н.А. Козак, А.К. Почерняев, Д.В. Лыткин, М.Ю. Горшунская, С.С. Почерняева // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2015. — Т. 16. — С. 206-209. — Бібліогр.: 13 назв. — рос. |
| series |
Фактори експериментальної еволюції організмів |
| work_keys_str_mv |
AT kozakna odnonukleotidnyjpolimorfizmgenainterlejkina6il6užitelejharʹkovabolʹnyhsaharnymdiabetom2tipa AT počernâevak odnonukleotidnyjpolimorfizmgenainterlejkina6il6užitelejharʹkovabolʹnyhsaharnymdiabetom2tipa AT lytkindv odnonukleotidnyjpolimorfizmgenainterlejkina6il6užitelejharʹkovabolʹnyhsaharnymdiabetom2tipa AT goršunskaâmû odnonukleotidnyjpolimorfizmgenainterlejkina6il6užitelejharʹkovabolʹnyhsaharnymdiabetom2tipa AT počernâevass odnonukleotidnyjpolimorfizmgenainterlejkina6il6užitelejharʹkovabolʹnyhsaharnymdiabetom2tipa |
| first_indexed |
2025-07-15T15:31:17Z |
| last_indexed |
2025-07-15T15:31:17Z |
| _version_ |
1837727459000188928 |
| fulltext |
206 ISSN 2219-3782. Ôàêòîðè åêñïåðèìåíòàëüíî¿ åâîëþö³¿ îðãàí³çì³â. 2015. Òîì 16
© КОЗАК Н. А., ПОЧЕРНЯЕВ А. К., ЛЫТКИН Д. В., ГОРШУНСКАЯ М. Ю., ПОЧЕРНЯЕВА С. С.
В настоящее время для многих мультифак-
ториальных заболеваний, таких как сахарный
диабет, ведётся поиск генов-кандидатов. Уже
надежно идентифицированы несколько локусов,
которые отвечают за развитие сахарного диабета
1 и 2 типов. Но имеются гены, ассоциация кото-
рых с сахарным диабетом остаётся под вопро-
сом. Одним из них является ген интерлейкина-6
(IL-6) [1].
Повышенный уровень интерлейкина-6 свя-
зан не только с сахарным диабетом, но и с на-
рушенной толерантностью к глюкозе, что ука-
зывает на потенциальную роль этого цитокина
в этиологии сахарного диабета. Интерлейкин-6
представляет собой макромолекулы, которые
продуцируют лимфоциты [4], а также моноциты,
макрофаги, CD4+Th2-лимфоциты, клетки стромы
костного мозга, фибробласты, гепатоциты и ряд
других клеток. Эти про- и противовоспалитель-
ные цитокины влияют на индукцию В-лимфоци-
тов, стимулируя их превращение в плазматиче-
ские клетки, способные вырабатывать антитела
[5]. Интерлейкин-6 влияет на клетки-мишени
посредством их взаимодействия со специфиче-
скими рецепторами на поверхности, чем спосо-
бен воздействовать на рост костной ткани, ангио-
генез, развитие опухолей, расщепление жиров
и резистентность миоцитов к инсулину [6].
Предполагается, что концентрация интер-
лейкина-6 регулируется в основном на уровне
транскрипции и трансляции. Таким образом,
обнаружение единичных нуклеотидных поли-
морфизмов (SNP) в промоторной области гена
IL-6 дают возможность рассматривать некоторые
его аллели в качестве факторов риска сахарного
диабета. Недавнее исследование доказало ассо-
циацию полиморфизма rs2069840 С-174G с диа-
бетом у жителей Аугсбурга (Германия) [2], у ко-
ренных американцев и у белых испанцев [3].
УДК 575:616.379-008.64
КОЗАК Н. А.1, ПОЧЕРНЯЕВ А. К.2, ЛЫТКИН Д. В.1, ГОРШУНСКАЯ М. Ю.3,
ПОЧЕРНЯЕВА С. С.2
1 Харьковский национальный университет имени В.Н. Каразина,
Украина, 61022, г. Харьков, пл. Свободы, 4, e-mail: kozaknatasha@mail.ru
2 ГУ «Институт проблем эндокринной патологии им. В.Я. Данилевского НАМН Украины»,
Украина, 61002, г. Харьков, ул. Артема, 10, e-mail: pochernyaev.ak84@mail.ru
3 Харьковская медицинская академия последипломного образования,
Украина, 61176, г. Харьков, ул. Корчагинцев, 58
ОДНОНУКЛЕОТИДНЫЙ ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНА ИНТЕРЛЕЙКИНА-6 (IL-6)
У ЖИТЕЛЕЙ ХАРЬКОВА, БОЛЬНЫХ САХАРНЫМ ДИАБЕТОМ 2 ТИПА
Ген IL-6 находится в локусе 7р21, включает
пять экзонов [7]. Продукт гена активирует эндо-
телиальные клетки и обеспечивает сбор лейко-
цитов около стенок сосудов. Предполагается, что
активность интерлейкина-6 может приводить
к постепенному разрушению β-клеток поджелу-
дочной железы [1]. Генетическим маркером гена
IL-6 является полиморфизм, в результате которо-
го происходит замена гуанина (G) на цитозин (С)
в позиции 174 (174G/C). Данный полиморфизм
влияет на уровень экспрессии гена, изменяя ско-
рость его транскрипции [8].
Целью данного исследования было прове-
сти пилотное исследование по изучению связи
однонуклеотидного полиморфизма rs2069840
(174G/C) гена интерлейкина-6 у населения Харь-
кова.
Материалы и методы
Исследованы образцы крови 60 больных са-
харным диабетом 2 типа (33 мужчины и 27 жен-
щин). Контрольную группу составили 49 че-
ловек (26 мужчин и 23 женщины) без диагноза
сахарный диабет 2 типа, ишемической болезни
и артериальной гипертензии. Все обследованные
были жителями Харькова, украинцами и русски-
ми. Образцы крови здоровых людей собраны на
Харьковской областной станции переливания
крови при условии добровольного информиро-
ванного согласия.
ДНК выделялось из лейкоцитов с помощью
ионообменной смолы Chelex-100 [9]. Определе-
ние аллельного состояния гена IL-6 по однонукле-
отидной замене 174G/C (rs2069840) проводили
с помощью полимеразной цепной реакции. Для
амплификации фрагмента гена IL-6, в котором
находится полиморфный сайт 174G/C, использо-
вались олигонуклеотидные праймеры — прямой
IL6174F: TGACTTCAGCTTTACTCTTTGT и об-
ISSN 2219-3782. Ôàêòîðè åêñïåðèìåíòàëüíî¿ åâîëþö³¿ îðãàí³çì³â. 2015. Òîì 16 207
Îäíîíóêëåîòèäíûé ïîëèìîðôèçì ãåíà èíòåðëåéêèíà-6 (IL-6) ó æèòåëåé Õàðüêîâà, áîëüíûõ ñàõàðíûì äèàáåòîì 2 òèïà
ратный IL6174R: AATAGGTTTTGAGGGCCATG.
Рестрикцию продуктов амплификации осущест-
вляли с помощью эндонуклеазы Hin1II (NlaIII)
(MBI Fermentas, Литва). Генотипы исследуемых
определяли по виду электрефореграммы (рис. 1).
Продукты рестрикции анализировали с помощью
электрофореза в 2 % агарозном геле в 1хТВЕ.
В качестве маркера молекулярной массы была
использована ДНК pUC19, которая была гидро-
лизирована нуклеазой MspI (MBI Fermentas,
Литва). Визуализацию продуктов амплификации
и рестрикции проводили путем подкрашивания
геля бромистым этидием и фотографированием
на трансилюминаторе в ультрафиолетовом свете.
Рестриктный фрагмент размером 164 п. н. соот-
ветствовал аллелю (C), два рестриктных фраг-
мента размером 112 и 52 п. н. — аллелю (G) [10].
Рассчитаны частоты аллелей рC и qG. Ассо-
циацию сахарного диабета 2 типа с изученным
локусом оценивали с помощью критерия χ2. Срав-
нение долей проведено с помощью φ-трансфор-
мации и критерия F [11]. Силу и направление ас-
социации аллеля с сахарным диабетом оценивали
с помощью тетрахорического показателя связи r
[12]. Рассчитаны показатели отношения шансов
(OR), чувствительность и специфичность теста,
индекс точности теста. Прогностическую цен-
ность положительного и отрицательного резуль-
татов вычисляли из расчёта распространённости
сахарного диабета среди населения Харьковской
области. Проверку статистических гипотез про-
водили на уровне значимости 0,05.
Результаты и обсуждение
Частоты аллелей и распределение геноти-
пов у мужчин и женщин статистически значимо
не различались, поэтому дальнейшие расчёты
проводились на общей группе. Проверка рас-
пределения генотипов по SNP 174 G/C гена IL-6
у здоровых людей на соответствие равновесию
Харди-Вайнберга, показала, что распределение
генотипов значимо не отличалось от теоретиче-
ски ожидаемого (табл. 1).
Частоты аллелей pC и qG в контрольной груп-
пе равняются 0,5, у больных сахарным диабетом
2 типа pC = 0,6 и qG = 0,4 (p > 0,05, табл. 2).
Хотя в распределении генотипов у больных
и здоровых людей не выявлено статистически
значимой разницы (табл. 3), тем не менее, следу-
ет отметить, что частота генотипа GG у больных
на 20 % выше, чем в контрольной группе (30,0
и 24,5 %, соответственно). Немного повышена
также и частота генотипа CG (55 и 51 %). Частота
генотипа СС у больных сахарным диабетом по-
нижена по сравнению с контролем (15,0 и 24,5 %
соответственно).
На силу и направление ассоциации генотипа
СС с сахарным диабетом 2 типа указывает тетра-
хорический показатель связи: r = 0,06 (р > 0,05).
Отношение шансов для сахарного диабета
2 типа при каждом из трёх генотипов составляет:
ORСС = 1,32; ORСG= 1,17; ORGG= 0,54. Получен-
ные результаты, которые следует рассматривать
как предварительные, свидетельствуют, что но-
сительство аллеля С в изученном населении яв-
ляется фактором повышенного риска по сахар-
ному диабету 2 типа. В терминах классической
генетики аллель С в отношении сахарного диабе-
та проявляет эффект полудоминирования. Гено-
тип GG можно рассматривать как потенциально
протективный в отношении сахарного диабета
2 типа.
Чувствительность данного диагностического
метода составила 15 %, а его специфичность —
76 %. При этом прогностическая ценность по-
ложительного результата, которая отражает ве-
роятность быть больным при положительном
показателе, не превышает двух процентов. Про-
гностическая ценность отрицательного результа-
та составляет 97 %. Индекс точности равняется
74 %. Отношение правдоподобия положительного
результата составляет 0,63; отношение правдо-
подобия отрицательного результата — 1,6. Для
статистического доказательства обнаруженных
эффектов необходимо повысить мощность крите-
рия до принятого уровня Р = 80 %, доведя объём
каждой из сравниваемых групп до n = 270 [13].
В отличие от полученных нами данных,
в работах [2, 3, 8] протективные свойства в от-
Рис. 1. Электрофореграмма продуктов рестрикции ам-
плифицированных в ПЦР фрагментов SNP rs2069840
гена IL-6
208 ISSN 2219-3782. Ôàêòîðè åêñïåðèìåíòàëüíî¿ åâîëþö³¿ îðãàí³çì³â. 2015. Òîì 16
Êîçàê Í. À., Ïî÷åðíÿåâ À. Ê., Ëûòêèí Ä. Â., Ãîðøóíñêàÿ Ì. Þ., Ïî÷åðíÿåâà Ñ. Ñ.
ношении сахарного диабета 2 типа были отмече-
ны у генотипа СС. Неоднозначность результатов,
полученных в разных исследованиях, статисти-
ческая незначимость ряда из них указывают на
целесообразность включить данные разных авто-
ров в метаанализ.
Целесообразность дальнейшего набора дан-
ных определяется ценностью этого теста, что
можно оценить по результатам данного исследо-
вания.
Выводы
1. Распределение генотипов SNP rs2069840
гена интерлейкина-6 в харьковской популяции не
отклоняется от равновесия Харди-Вайнберга.
2. По результатам пилотного исследования
обнаружено, что генотип СС повышает риск раз-
вития сахарного диабета 2 типа у жителей Харь-
кова в 1,2 раза.
Авторы выражают благодарность профессору Л. А. Ат-
раментовой за помощь в статистическом анализе и профессору
В. В. Полторак за помощь в обсуждении результатов.
Таблица 1
Проверка популяционной выборки на соответствие равновесию Харди-Вайнберга по rs2069840 гена IL-6
Распределение
Количество людей (n) с генотипами
CC CG GG
Фактическое 12,0 25,0 12,0
Теоретически ожидаемое 12,3 24,5 12,3
Статистики χ2 = 0,024; χ2
0,05 (1) = 3,84; р > 0,05
Примечания: χ2 — рассчитанный критерий Пирсона; χ2
0,05 (1) — пороговое значение критерия; р — уровень значи-
мости разницы между фактическими данными и теоретически ожидаемыми.
Таблица 2
Частота аллеля G rs2069840 гена IL-6 у больных сахарным диабетом 2 типа и здоровых людей
Группа
Частота аллеля G
контроль сахарный диабет 2 типа
Мужчины 0,48 0,47
Женщины 0,52 0,37
Все 0,50 0,43
Таблица 3
Соотношение генотипов rs2069840 гена IL-6 у больных и здоровых
Группа
Генотипы, %
GG CG CC
Контроль 24,5 51,0 24,5
Сахарный диабет 2 типа 15,0 55,0 30,0
Статистики FGG = 0,24; FCG = 0,09; FCC = 0,11; F0,05 (1) = 4,40; р > 0,05
Примечания: F — критерий Фишера, р — уровень значимости разницы между долями.
ЛИТЕРАТУРА
1. Носиков В. В., Серегин Ю. А. Молекулярная генетика сахарного диабета типа 1: достижения и перспективы //
Молекулярная биология. — 2008. — 42, № 5. — С. 867–879.
2. Illig T., Bongardt F., Schöpfer A., Müller-Scholze S., Rathmann W., Koenig W., Thorand B., Vollmert C., Holle R.,
Kolb H., Herder C. Kooperative Gesundheitsforschung im Raum Augsburg. Cooperative Research in the Region of
Augsburg. Signifi cant association of the interleukin-6 gene polymorphisms C-174G and A-598G with type 2 diabetes
// J. Clin. Endocrinol. Metab. — 2004. — 89. — P. 5053–5058.
3. Vozarova B., Fernández-Real J.M., Knowler W. C., Gallart L., Hanson R. L., Gruber J. D., Ricart W., Ven drell J.,
Richart C., Tataranni P. A., Wolford J. K. The interleukin-6. (–174) G/C promoter polymorphism is associated with
type-2 diabetes mellitus in Native Americans and Caucasians // Hum Genet 112. — 2003. — P. 409–413.
4. Черешнев В. А., Гусев В. Ю. Иммунология воспаления: роль цитокинов // Медицинская иммунология. —
2001. — 3, № 3. — C. 361–368.
5. Попов Н. Н., Лавров В. Ф., Солошенко Э. Н. Клиническая иммунология и алергология: Учеб. пособие. — М.:
ООО Фирма «Релнфор», 2004. — 524 с.
ISSN 2219-3782. Ôàêòîðè åêñïåðèìåíòàëüíî¿ åâîëþö³¿ îðãàí³çì³â. 2015. Òîì 16 209
Îäíîíóêëåîòèäíûé ïîëèìîðôèçì ãåíà èíòåðëåéêèíà-6 (IL-6) ó æèòåëåé Õàðüêîâà, áîëüíûõ ñàõàðíûì äèàáåòîì 2 òèïà
6. Pedersen B., Steensberg A., Schjerling P. Muscle-derived interleukin-6: possible biological effects // J. Physiol. —
2001. — 536. — P. 329–337.
7. Yasukawa K., Hirano T., Watanabe Y., Muratani K., Matsuda T., Nakai S., Kishimoto T. Structure and expression of
human B cell stimulatory factor-2 (BSF-2/IL-6) gene // EMBO J. — 1987. — 7, N 10. — P. 2939–2945.
8. Коненков В. И., Шевченко А. В., Прокофьев В. Ф., Климонтов В. В., Королев М. А., Фазуллина О. Н., Лапси-
на С. А., Королева Е. А. Ассоциации вариантов гена фактора роста сосудистого эндотелия (VEGF) и генов
цитокинов (IL-1B, IL-4, IL-6, IL-10, TNFA) с сахарным диабетом 2 типа у женщин // Сахарный диабет. — 2012,
№ 3. — C. 4–10.
9. Walsh P. S., Metzger D. A., Higuchi R. Chelex 100 as a mediumforextractionof DNA for PCR-based typing from
forensicmaterial // BioTechniques. — 1991. — 10. — P. 506–513.
10. Fernandez-Real J.M., Broch M., Vendrell J., Richart C., Ricart W. Interleukin-6 gene polymorphism and lipid
abnormalities in healthy subjects // Clin. Endocrinol. Metab. — 2000. — 85, N 3. — P. 1334–1339.
11. Атраментова Л. А., Утевская О. М. Статистические методы в биологии. — Горловка: ЧП «Видавництво Ліх-
тар», 2008. — 248 с.
12. Плохинский Н. А. Биометрия. — М.: МГУ, 1970. — С. 367–368.
13. Атраментова Л. А. Дизайн и статистика биологического исследования. — Харьков: Издательство «НТМТ»,
2014. — 255 с.
KOZAK N.A.1, POCHERNYAYEV A.K.2, LYTKIN D.V.1, GORSHUNSKA M. Yu.3, POCHERNYAYEVA S.S.2
1 V. N. Karazin Kharkiv National University,
Ukraine, 61022, Kharkiv, Svobody sq., 8, e-mail: kozaknatasha@mail.ru
2 State Institution «V. Danilevsky Institute for Endocrine Pathology Problems
of National Academy of Medical Science of Ukraine»,
Ukraine, 61002, Kharkiv, Artema str., 10, e-mail: pochernyaev.ak84@mail.ru
3 Kharkiv Medical Postgraduate Academy,
Ukraine, 61000, Kharkiv, Korchagintcev str., 58
SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM OF INTERLEUKIN-6 (IL-6) IN RESIDENTS OF KHARKIV
PATIENTS WITH TUPE 2 DIABETES MELLITUS
Aims. To examine the association between SNP rs2069840 (174G / C) of interleukin-6 gene and type 2 diabetes in the
population of Kharkov. Objects were venous blood samples of 60 patients with type 2 diabetes and 49 healthy persons
(all residents of Kharkiv, Ukrainian and Russian). Methods. Genotyping by PCR-RFLP. Results. The distribution of
genotypes for SNP rs2069840 corresponds to the Hardy-Weinberg equilibrium. Allele frequencies in the control group
is 0.5; in the group of patients pC = 0.4, qG = 0.6. The weak non-signifi cant association between CC genotype and type 2
diabetes was marked. The odds ratio for genotype GG is 0.54. The sensitivity of the test is 15 %, specifi city — 76 %. The
positive predictive value is equal to 2 %, negative — 97 %, the accuracy of the test is 74 %, positive likelihood ratio result
is 0.63, a negative — 1.6. Conclusions. The distribution of genotypes for SNP rs2069840 of interleukin-6 in the Kharkov
population does not deviate from the Hardy-Weinberg equilibrium. According to the results of a pilot study was founded
that the CC genotype increases the risk of type 2 diabetes in 1.2 times.
Keywords: type 2 diabetes mellitus, interleukin-6 gene, Kharkov population, allele frequencies.
|