Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов

Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов

Aims. defining of evolutionary relationship of glycosyltransferases which catalyzing synthesis of carbohydrate chain of landomycines in producing microorganisms (Streptomyces globisporus 1912, S. syanogenus S 136 and uncultivated microorganisms from soil of Arizona, USA). Methods. Information about...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Видавець:Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Дата:2014
Автори: Полищук, Л.В., Лукьянчук, В.В.
Формат: Стаття
Мова:Russian
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2014
Назва видання:Фактори експериментальної еволюції організмів
Теми:
Еволюція геномів в природі та експерименті
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/178047
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Цитувати:Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов / Л.В. Полищук, В.В. Лукьянчук // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2014. — Т. 14. — С. 71-76. — Бібліогр.: 7 назв. — рос.

Репозиторії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-178047
record_format dspace
spelling irk-123456789-1780472021-02-18T01:27:36Z Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов Полищук, Л.В. Лукьянчук, В.В. Еволюція геномів в природі та експерименті Aims. defining of evolutionary relationship of glycosyltransferases which catalyzing synthesis of carbohydrate chain of landomycines in producing microorganisms (Streptomyces globisporus 1912, S. syanogenus S 136 and uncultivated microorganisms from soil of Arizona, USA). Methods. Information about the aminoacid sequences of the enzymes from the available Internet databases was used in this study. In silico analysis of patterns structures was performed using the technical capaibilities of the program BLAST. Results. Degree of homology of enzymes structures (D-olivosyltransferases and L- rhodinyltransferases) within the same organism and different producers was determined. The amino acid structures of analogous glycosyltransferases (LanGT1/LndGT1/Orf27, LanGT2/LndGT2/Orf29 and LanGT4/LndGT4/Orf32) synthesizing carbohydrate chain of landomycin E all three producers were identical more than 75%, meanwhile there was less than 33% identity of enzymes strucrures (LanGT1/LanGT2/LanGT4, LndGT1/LndGT2/LndGT4, Orf27/Orf29/Orf32) within each particular microorganism. Conclusions. Evolutionary relationship between analogous enzymes was revealed: they are ortologs. Two enzymes (LanGT3 and LanGT1) of S. cyanogenus S136 were identified as paralogous ones. Key words: structure, in silico analysis, homology, ortholog, paralog, glycosyltransferase. 2014 Article Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов / Л.В. Полищук, В.В. Лукьянчук // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2014. — Т. 14. — С. 71-76. — Бібліогр.: 7 назв. — рос. 2219-3782 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/178047 579.873.71:577.152.24:004.9 ru Фактори експериментальної еволюції організмів Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language Russian
topic Еволюція геномів в природі та експерименті
Еволюція геномів в природі та експерименті
spellingShingle Еволюція геномів в природі та експерименті
Еволюція геномів в природі та експерименті
Полищук, Л.В.
Лукьянчук, В.В.
Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов
Фактори експериментальної еволюції організмів
description Aims. defining of evolutionary relationship of glycosyltransferases which catalyzing synthesis of carbohydrate chain of landomycines in producing microorganisms (Streptomyces globisporus 1912, S. syanogenus S 136 and uncultivated microorganisms from soil of Arizona, USA). Methods. Information about the aminoacid sequences of the enzymes from the available Internet databases was used in this study. In silico analysis of patterns structures was performed using the technical capaibilities of the program BLAST. Results. Degree of homology of enzymes structures (D-olivosyltransferases and L- rhodinyltransferases) within the same organism and different producers was determined. The amino acid structures of analogous glycosyltransferases (LanGT1/LndGT1/Orf27, LanGT2/LndGT2/Orf29 and LanGT4/LndGT4/Orf32) synthesizing carbohydrate chain of landomycin E all three producers were identical more than 75%, meanwhile there was less than 33% identity of enzymes strucrures (LanGT1/LanGT2/LanGT4, LndGT1/LndGT2/LndGT4, Orf27/Orf29/Orf32) within each particular microorganism. Conclusions. Evolutionary relationship between analogous enzymes was revealed: they are ortologs. Two enzymes (LanGT3 and LanGT1) of S. cyanogenus S136 were identified as paralogous ones. Key words: structure, in silico analysis, homology, ortholog, paralog, glycosyltransferase.
format Article
author Полищук, Л.В.
Лукьянчук, В.В.
author_facet Полищук, Л.В.
Лукьянчук, В.В.
author_sort Полищук, Л.В.
title Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов
title_short Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов
title_full Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов
title_fullStr Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов
title_full_unstemmed Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов
title_sort гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 2014
topic_facet Еволюція геномів в природі та експерименті
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/178047
citation_txt Гомология первичного строения гликозилтрансфераз биосинтетического пути ландомицинов у стрептомицетов / Л.В. Полищук, В.В. Лукьянчук // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2014. — Т. 14. — С. 71-76. — Бібліогр.: 7 назв. — рос.
series Фактори експериментальної еволюції організмів
work_keys_str_mv AT poliŝuklv gomologiâpervičnogostroeniâglikoziltransferazbiosintetičeskogoputilandomicinovustreptomicetov
AT lukʹânčukvv gomologiâpervičnogostroeniâglikoziltransferazbiosintetičeskogoputilandomicinovustreptomicetov
first_indexed 2023-10-18T22:45:05Z
last_indexed 2023-10-18T22:45:05Z
_version_ 1796156337182212096

Схожі ресурси