Анализ гомологов генов основных белков цитоскелета у различных видов высших растений
Aims. The genes of cytoskeletal proteins are important to maintain essential life processes and functions at different stages of the ontogenesis. Intron length polymorphism (ILP) of some of them can be used as convenient and reliable tool for the study of genetic diversity and phylogenetic relations...
Збережено в:
| Дата: | 2014 |
|---|---|
| Автори: | , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Russian |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2014
|
| Назва видання: | Фактори експериментальної еволюції організмів |
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/178048 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Анализ гомологов генов основных белков цитоскелета у различных видов высших растений / А.Н. Рабоконь, А.С. Постовойтова, Я.В. Пирко, Я.Б. Блюм // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2014. — Т. 14. — С. 76-78. — Бібліогр.: 6 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
irk-123456789-178048 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
irk-123456789-1780482021-02-18T01:28:05Z Анализ гомологов генов основных белков цитоскелета у различных видов высших растений Рабоконь, А.Н. Постовойтова, А.С. Пирко, Я.В. Блюм, Я.Б. Еволюція геномів в природі та експерименті Aims. The genes of cytoskeletal proteins are important to maintain essential life processes and functions at different stages of the ontogenesis. Intron length polymorphism (ILP) of some of them can be used as convenient and reliable tool for the study of genetic diversity and phylogenetic relationships between different plant species. ILP also can be used for genotyping different plants. In this connection, analysis of exon-intron structure of some cytoskeletal protein genes in different plant species represents considerable interest to extend the possible range of molecular markers. Methods. Using Arabidopsis actin and tubulin genes we have performed the similarity search of genes via TBLASTN predicted proteins of the Oriza sativa, Solanum tuberosum and Solanum lycopersicum genomes available at Phytozome v9.1. Results. We conducted out selection of actin, α- and β-tubulin gene homologues in the genomes of analyzed plants; studied its exon-intron structure; established the percent identity of CDS in these genes. Conclusions. Obtained data show that the exon sequences of these cytoskeleton genes in various species of higher plants are very similar, and intron sequences have significant differences, that reflects a high degree of polymorphism. Thus, the introns of these genes may be used as molecular markers in ILP-analysis. Key words: gene, cytoskeletal proteins, actin, tubulin, homologue, exon, intron polymorphism. 2014 Article Анализ гомологов генов основных белков цитоскелета у различных видов высших растений / А.Н. Рабоконь, А.С. Постовойтова, Я.В. Пирко, Я.Б. Блюм // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2014. — Т. 14. — С. 76-78. — Бібліогр.: 6 назв. — рос. 2219-3782 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/178048 633.52:577.21:632.165 ru Фактори експериментальної еволюції організмів Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
Russian |
| topic |
Еволюція геномів в природі та експерименті Еволюція геномів в природі та експерименті |
| spellingShingle |
Еволюція геномів в природі та експерименті Еволюція геномів в природі та експерименті Рабоконь, А.Н. Постовойтова, А.С. Пирко, Я.В. Блюм, Я.Б. Анализ гомологов генов основных белков цитоскелета у различных видов высших растений Фактори експериментальної еволюції організмів |
| description |
Aims. The genes of cytoskeletal proteins are important to maintain essential life processes and functions at different stages of the ontogenesis. Intron length polymorphism (ILP) of some of them can be used as convenient and reliable tool for the study of genetic diversity and phylogenetic relationships between different plant species. ILP also can be used for genotyping different plants. In this connection, analysis of exon-intron structure of some cytoskeletal protein genes in different plant species represents considerable interest to extend the possible range of molecular markers. Methods. Using Arabidopsis actin and tubulin genes we have performed the similarity search of genes via TBLASTN predicted proteins of the Oriza sativa, Solanum tuberosum and Solanum lycopersicum genomes available at Phytozome v9.1. Results. We conducted out selection of actin, α- and β-tubulin gene homologues in the genomes of analyzed plants; studied its exon-intron structure; established the percent identity of CDS in these genes. Conclusions. Obtained data show that the exon sequences of these cytoskeleton genes in various species of higher plants are very similar, and intron sequences have significant differences, that reflects a high degree of polymorphism. Thus, the introns of these genes may be used as molecular markers in ILP-analysis.
Key words: gene, cytoskeletal proteins, actin, tubulin, homologue, exon, intron polymorphism. |
| format |
Article |
| author |
Рабоконь, А.Н. Постовойтова, А.С. Пирко, Я.В. Блюм, Я.Б. |
| author_facet |
Рабоконь, А.Н. Постовойтова, А.С. Пирко, Я.В. Блюм, Я.Б. |
| author_sort |
Рабоконь, А.Н. |
| title |
Анализ гомологов генов основных белков цитоскелета у различных видов высших растений |
| title_short |
Анализ гомологов генов основных белков цитоскелета у различных видов высших растений |
| title_full |
Анализ гомологов генов основных белков цитоскелета у различных видов высших растений |
| title_fullStr |
Анализ гомологов генов основных белков цитоскелета у различных видов высших растений |
| title_full_unstemmed |
Анализ гомологов генов основных белков цитоскелета у различных видов высших растений |
| title_sort |
анализ гомологов генов основных белков цитоскелета у различных видов высших растений |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| publishDate |
2014 |
| topic_facet |
Еволюція геномів в природі та експерименті |
| url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/178048 |
| citation_txt |
Анализ гомологов генов основных белков цитоскелета у различных видов высших растений / А.Н. Рабоконь, А.С. Постовойтова, Я.В. Пирко, Я.Б. Блюм // Фактори експериментальної еволюції організмів: Зб. наук. пр. — 2014. — Т. 14. — С. 76-78. — Бібліогр.: 6 назв. — рос. |
| series |
Фактори експериментальної еволюції організмів |
| work_keys_str_mv |
AT rabokonʹan analizgomologovgenovosnovnyhbelkovcitoskeletaurazličnyhvidovvysšihrastenij AT postovojtovaas analizgomologovgenovosnovnyhbelkovcitoskeletaurazličnyhvidovvysšihrastenij AT pirkoâv analizgomologovgenovosnovnyhbelkovcitoskeletaurazličnyhvidovvysšihrastenij AT blûmâb analizgomologovgenovosnovnyhbelkovcitoskeletaurazličnyhvidovvysšihrastenij |
| first_indexed |
2023-10-18T22:45:05Z |
| last_indexed |
2023-10-18T22:45:05Z |
| _version_ |
1796156337289166848 |