Evolutionary transition-transversion bias by the example of the cytb gene of palearctic Muridae (Rodentia) and Vespertilionidae (Chiroptera)

A comparative analysis of the features of the transition-transversion bias of the nucleotide sequence of the cytb gene in microbats (Vespertilionidae, Chiroptera) and mice (Muridae, Rodentia) shows both general regularities and certain family-level features. A common feature of the two families is...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2023
Автори: Mezhzherin, S.V., Morozov-Leonov, S.Y., Zhalay, O.I., Kokodiy, S.V., Tereshchenko, V.O., Rostovskaya, О.V., Tsyba, A.O.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: Видавничий дім "Академперіодика" НАН України 2023
Назва видання:Доповіді НАН України
Теми:
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/193006
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Evolutionary transition-transversion bias by the example of the cytb gene of palearctic Muridae (Rodentia) and Vespertilionidae (Chiroptera) / S.V. Mezhzherin, S.Y. Morozov-Leonov, O.I. Zhalay, S.V. Kokodiy, V.O. Tereshchenko, О.V. Rostovskaya, A.O. Tsyba // Доповіді Національної академії наук України. — 2023. — № 2. — С. 93-98. — Бібліогр.: 11 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-193006
record_format dspace
spelling irk-123456789-1930062023-07-30T16:21:32Z Evolutionary transition-transversion bias by the example of the cytb gene of palearctic Muridae (Rodentia) and Vespertilionidae (Chiroptera) Mezhzherin, S.V. Morozov-Leonov, S.Y. Zhalay, O.I. Kokodiy, S.V. Tereshchenko, V.O. Rostovskaya, О.V. Tsyba, A.O. Біологія A comparative analysis of the features of the transition-transversion bias of the nucleotide sequence of the cytb gene in microbats (Vespertilionidae, Chiroptera) and mice (Muridae, Rodentia) shows both general regularities and certain family-level features. A common feature of the two families is the fact of the sharp predominance of transitions over transversions at the early stages of the evolutionary process, followed by the equalization of the ts/tv-displacement at the species and genus levels of divergences, as well as the fact that the increase in the frequency of transitions in phyletic lineages is gradual, and the transition is intermittent. At the same time, the levels of spontaneous mutations and evolutionary drift, as well as the rate of ts/tv drift compensation, are specific to families. These circumstances do not make it possible to obtain comparable estimates of divergence in different phyla and cause insurmountable difficulties in creating a universal formula for molecular clocks. Порівняльний аналіз особливостей транзитивно-трансверсивного зсуву нуклеотидної послідовності гена cуtb гладконосих (Vespertilionidae, Chiroptera) і мишачих (Muridae, Rodentia) показує як загальні закономірності, так і певні особливості родинного рівня. Загальними для двох родин є факт різкого переважання переходів над трансверсіями на ранніх етапах еволюційного процесу з наступним вирівнюванням ts/tv-зміщення на видовому та родовому рівнях дивергенцій, а також та обставина, що зростання частоти транзицій у філетичних рядах носить поступовий характер, а транзицій — стрибкоподібний. При цьому рівень спонтанного мутування та еволюційного зсуву, а також швидкість компенсації ts/tv зсуву є специфічними для родин. Ці обставини не дають можливості отримати порівнянні оцінки дивергенції в різних філумах і спричиняють непереборні труднощі для створення універсальної формули молекулярних годин. 2023 Article Evolutionary transition-transversion bias by the example of the cytb gene of palearctic Muridae (Rodentia) and Vespertilionidae (Chiroptera) / S.V. Mezhzherin, S.Y. Morozov-Leonov, O.I. Zhalay, S.V. Kokodiy, V.O. Tereshchenko, О.V. Rostovskaya, A.O. Tsyba // Доповіді Національної академії наук України. — 2023. — № 2. — С. 93-98. — Бібліогр.: 11 назв. — англ. 1025-6415 DOI: doi.org/10.15407/dopovidi2023.02.093 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/193006 575.83:599 en Доповіді НАН України Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language English
topic Біологія
Біологія
spellingShingle Біологія
Біологія
Mezhzherin, S.V.
Morozov-Leonov, S.Y.
Zhalay, O.I.
Kokodiy, S.V.
Tereshchenko, V.O.
Rostovskaya, О.V.
Tsyba, A.O.
Evolutionary transition-transversion bias by the example of the cytb gene of palearctic Muridae (Rodentia) and Vespertilionidae (Chiroptera)
Доповіді НАН України
description A comparative analysis of the features of the transition-transversion bias of the nucleotide sequence of the cytb gene in microbats (Vespertilionidae, Chiroptera) and mice (Muridae, Rodentia) shows both general regularities and certain family-level features. A common feature of the two families is the fact of the sharp predominance of transitions over transversions at the early stages of the evolutionary process, followed by the equalization of the ts/tv-displacement at the species and genus levels of divergences, as well as the fact that the increase in the frequency of transitions in phyletic lineages is gradual, and the transition is intermittent. At the same time, the levels of spontaneous mutations and evolutionary drift, as well as the rate of ts/tv drift compensation, are specific to families. These circumstances do not make it possible to obtain comparable estimates of divergence in different phyla and cause insurmountable difficulties in creating a universal formula for molecular clocks.
format Article
author Mezhzherin, S.V.
Morozov-Leonov, S.Y.
Zhalay, O.I.
Kokodiy, S.V.
Tereshchenko, V.O.
Rostovskaya, О.V.
Tsyba, A.O.
author_facet Mezhzherin, S.V.
Morozov-Leonov, S.Y.
Zhalay, O.I.
Kokodiy, S.V.
Tereshchenko, V.O.
Rostovskaya, О.V.
Tsyba, A.O.
author_sort Mezhzherin, S.V.
title Evolutionary transition-transversion bias by the example of the cytb gene of palearctic Muridae (Rodentia) and Vespertilionidae (Chiroptera)
title_short Evolutionary transition-transversion bias by the example of the cytb gene of palearctic Muridae (Rodentia) and Vespertilionidae (Chiroptera)
title_full Evolutionary transition-transversion bias by the example of the cytb gene of palearctic Muridae (Rodentia) and Vespertilionidae (Chiroptera)
title_fullStr Evolutionary transition-transversion bias by the example of the cytb gene of palearctic Muridae (Rodentia) and Vespertilionidae (Chiroptera)
title_full_unstemmed Evolutionary transition-transversion bias by the example of the cytb gene of palearctic Muridae (Rodentia) and Vespertilionidae (Chiroptera)
title_sort evolutionary transition-transversion bias by the example of the cytb gene of palearctic muridae (rodentia) and vespertilionidae (chiroptera)
publisher Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
publishDate 2023
topic_facet Біологія
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/193006
citation_txt Evolutionary transition-transversion bias by the example of the cytb gene of palearctic Muridae (Rodentia) and Vespertilionidae (Chiroptera) / S.V. Mezhzherin, S.Y. Morozov-Leonov, O.I. Zhalay, S.V. Kokodiy, V.O. Tereshchenko, О.V. Rostovskaya, A.O. Tsyba // Доповіді Національної академії наук України. — 2023. — № 2. — С. 93-98. — Бібліогр.: 11 назв. — англ.
series Доповіді НАН України
work_keys_str_mv AT mezhzherinsv evolutionarytransitiontransversionbiasbytheexampleofthecytbgeneofpalearcticmuridaerodentiaandvespertilionidaechiroptera
AT morozovleonovsy evolutionarytransitiontransversionbiasbytheexampleofthecytbgeneofpalearcticmuridaerodentiaandvespertilionidaechiroptera
AT zhalayoi evolutionarytransitiontransversionbiasbytheexampleofthecytbgeneofpalearcticmuridaerodentiaandvespertilionidaechiroptera
AT kokodiysv evolutionarytransitiontransversionbiasbytheexampleofthecytbgeneofpalearcticmuridaerodentiaandvespertilionidaechiroptera
AT tereshchenkovo evolutionarytransitiontransversionbiasbytheexampleofthecytbgeneofpalearcticmuridaerodentiaandvespertilionidaechiroptera
AT rostovskayaov evolutionarytransitiontransversionbiasbytheexampleofthecytbgeneofpalearcticmuridaerodentiaandvespertilionidaechiroptera
AT tsybaao evolutionarytransitiontransversionbiasbytheexampleofthecytbgeneofpalearcticmuridaerodentiaandvespertilionidaechiroptera
first_indexed 2023-10-18T23:19:30Z
last_indexed 2023-10-18T23:19:30Z
_version_ 1796157818860994560