Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК
Вперше квантово-механічним методом на рівні теорії MP2/6–311++G(2df,pd)//DFT B3LYP/6–31G(d,p) проведено вичерпний конформаційний аналіз низькомолекулярної сполуки, що моделює електронейтральний цукрово-фосфатний кістяк ДНК. Встановлено, що із усіх 14495 можливих конформерів лише 107 є твірними цукро...
Збережено в:
| Дата: | 2011 |
|---|---|
| Автори: | , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Ukrainian |
| Опубліковано: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2011
|
| Назва видання: | Доповіді НАН України |
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/37807 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК / І.С. Войтешенко, Р.О. Жураківський, Л.А. Булавін, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2011. — № 6. — С. 188-196. — Бібліогр.: 14 назв. — укр. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
irk-123456789-37807 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
irk-123456789-378072012-10-23T12:15:38Z Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК Войтешенко, І.С. Жураківський, Р.О. Булавін, Л.А. Говорун, Д.М. Біофізика Вперше квантово-механічним методом на рівні теорії MP2/6–311++G(2df,pd)//DFT B3LYP/6–31G(d,p) проведено вичерпний конформаційний аналіз низькомолекулярної сполуки, що моделює електронейтральний цукрово-фосфатний кістяк ДНК. Встановлено, що із усіх 14495 можливих конформерів лише 107 є твірними цукрово-фосфатного кістяка A-подібних форм ДНК. Не виявлено модельних A-подібних форм ДНК з нативними значеннями торсійних кутів. Зафіксовано 62 твірних конформера цукрово-фосфатного кістяка B-подібних форм ДНК, 11 з яких мають ідентичний до природного набір номенклатурних торсійних кутів α, β, γ, δ, ε та ζ. Виявлено 803 твірні конформери цукрово-фосфатного кістяка P-подібних форм ДНК з цукрами C2'-endo та C3'-endo. Решта 1160 структур мають широкий спектр конформацій цукрів, найчисленнішими серед яких є C1'-exo та C2'-exo. The complete conformation analysis of a low-molecular compound which simulates the electroneutral sugar-phosphate frame of DNA is performed by a quantum-mechanical method at the MP2/6–311++G(2df,pd)//DFT B3LYP/6–31G(d,p) level of the theory. It is shown that only 107 from all 14495 possible conformers can be formative for the sugar-phosphate frame of A-like DNA forms. No modeled DNA A-forms with native values of torsion angles were registered. 62 formative conformers of sugar-phosphate frame of B- like DNA forms are found, and 11 of them have a set of nomenclatural torsion angles α, β, γ, δ, ε, and ζ, which are identical to natural ones. The 803 formative conformers of sugar-phosphate frame of P-like DNA forms with sugars C2'-endo and C3'-endo were determined. Other 1160 remaining compounds have a wide spectrum of sugar's conformations among which the most numerous are C1'-exo and C2'-exo. 2011 Article Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК / І.С. Войтешенко, Р.О. Жураківський, Л.А. Булавін, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2011. — № 6. — С. 188-196. — Бібліогр.: 14 назв. — укр. 1025-6415 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/37807 577.32 uk Доповіді НАН України Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
Ukrainian |
| topic |
Біофізика Біофізика |
| spellingShingle |
Біофізика Біофізика Войтешенко, І.С. Жураківський, Р.О. Булавін, Л.А. Говорун, Д.М. Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК Доповіді НАН України |
| description |
Вперше квантово-механічним методом на рівні теорії MP2/6–311++G(2df,pd)//DFT B3LYP/6–31G(d,p) проведено вичерпний конформаційний аналіз низькомолекулярної сполуки, що моделює електронейтральний цукрово-фосфатний кістяк ДНК. Встановлено, що із усіх 14495 можливих конформерів лише 107 є твірними цукрово-фосфатного кістяка A-подібних форм ДНК. Не виявлено модельних A-подібних форм ДНК з нативними значеннями торсійних кутів. Зафіксовано 62 твірних конформера цукрово-фосфатного кістяка B-подібних форм ДНК, 11 з яких мають ідентичний до природного набір номенклатурних торсійних кутів α, β, γ, δ, ε та ζ. Виявлено 803 твірні конформери цукрово-фосфатного кістяка P-подібних форм ДНК з цукрами C2'-endo та C3'-endo. Решта 1160 структур мають широкий спектр конформацій цукрів, найчисленнішими серед яких є C1'-exo та C2'-exo. |
| format |
Article |
| author |
Войтешенко, І.С. Жураківський, Р.О. Булавін, Л.А. Говорун, Д.М. |
| author_facet |
Войтешенко, І.С. Жураківський, Р.О. Булавін, Л.А. Говорун, Д.М. |
| author_sort |
Войтешенко, І.С. |
| title |
Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК |
| title_short |
Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК |
| title_full |
Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК |
| title_fullStr |
Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК |
| title_full_unstemmed |
Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК |
| title_sort |
повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга днк |
| publisher |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| publishDate |
2011 |
| topic_facet |
Біофізика |
| url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/37807 |
| citation_txt |
Повний конформаційний аналіз низькомолекулярної електронейтральної моделі цукрово-фосфатного ланцюга ДНК / І.С. Войтешенко, Р.О. Жураківський, Л.А. Булавін, Д.М. Говорун // Доп. НАН України. — 2011. — № 6. — С. 188-196. — Бібліогр.: 14 назв. — укр. |
| series |
Доповіді НАН України |
| work_keys_str_mv |
AT vojtešenkoís povnijkonformacíjnijanalíznizʹkomolekulârnoíelektronejtralʹnoímodelícukrovofosfatnogolancûgadnk AT žurakívsʹkijro povnijkonformacíjnijanalíznizʹkomolekulârnoíelektronejtralʹnoímodelícukrovofosfatnogolancûgadnk AT bulavínla povnijkonformacíjnijanalíznizʹkomolekulârnoíelektronejtralʹnoímodelícukrovofosfatnogolancûgadnk AT govorundm povnijkonformacíjnijanalíznizʹkomolekulârnoíelektronejtralʹnoímodelícukrovofosfatnogolancûgadnk |
| first_indexed |
2023-10-18T17:46:43Z |
| last_indexed |
2023-10-18T17:46:43Z |
| _version_ |
1796142457383026688 |