Предполагаемый активный центр редактирующего домена пролил-тРНК синтетазы бактерии Enterococcus faecalis

Предполагаемый активный центр редактирующего домена пролил-тРНК синтетазы бактерии Enterococcus faecalis

Обеспечение аминокислотной специфичности аминоацил-тРНК синтетаз в ряде случаев требует проведения гидролиза ошибочно синтезированных продуктов, известного как аминокислотное редактирование. Бактериальные пролил-тРНК синтетазы содержат специальный редактирующий домен, деацилирующий аланил-тРНКPro и...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2009
Автори: Бояршин, К.С., Крикливый, И.А., Раевский, А.В., Химин, А.А., Яремчук, А.Д., Тукало, М.А.
Формат: Стаття
Мова:Russian
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2009
Теми:
Структура і функції біополімерів
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/5641
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Предполагаемый активный центр редактирующего домена пролил-тРНК синтетазы бактерии Enterococcus faecalis / К.С. Бояршин, И.А. Крикливый, А.В. Раевский, А.А. Химин, А.Д. Яремчук, М.А. Тукало // Біополімери і клітина. — 2009. — Т. 25, № 1. — С. 39-43. — Бібліогр.: 13 назв. — pос.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-5641
record_format dspace
spelling irk-123456789-56412010-03-25T15:29:37Z Предполагаемый активный центр редактирующего домена пролил-тРНК синтетазы бактерии Enterococcus faecalis Бояршин, К.С. Крикливый, И.А. Раевский, А.В. Химин, А.А. Яремчук, А.Д. Тукало, М.А. Структура і функції біополімерів Обеспечение аминокислотной специфичности аминоацил-тРНК синтетаз в ряде случаев требует проведения гидролиза ошибочно синтезированных продуктов, известного как аминокислотное редактирование. Бактериальные пролил-тРНК синтетазы содержат специальный редактирующий домен, деацилирующий аланил-тРНКPro и таким образом демонстрирующий посттрансферную редактирующую активность. Механизм тРНК-зависимого редактирования пролил-тРНК синтетазой остается нераскрытым. Цель настоящей работы состояла в изучении структуры активного центраредактирующего домена пролил-тРНК синтетазы E. faecalis. Аминокислотные позиции E218, T257, K279, G331, S332, G334, H366 избраны для сайт-направленного мутагенеза (аланинового сканирования), а редактирующая активность мутантных форм сопоставлена с диким типом пролил-тРНК синтетазы. Выявлены три аминокислотных остатка, имеющих значение для посттрансферной редактирующей активности фермента, – K279, G331 и H366. Полученные данные подтверждают существующие предположения о структуреактивного центра редактирующего домена бактериальных пролил-тРНК синтетаз. The maintenance of amino acid specificity by aminoacyl-tRNA synthetases can require the hydrolysis of missynthesized products that is known as amino acid editing. Bacterial prolyl-tRNA synthetase includes a special editing domain, that deacylates alanyl-tRNAPro, and so exhibits post-transfer editing activity. The mechanism of tRNA-dependent editing by prolyl-tRNA synthetase has to be defined. The present work aim is to study the structure of the active site of enterobacteria E. faecalis prolyl-tRNA synthetase editing domain. The amino acids positions E218, T257, K279, G331, S332, G334, and H366 have been chosen for the site-directed mutagenesis (alanine scanning). An editing activity of the mutants was compared with the wild type prolyl-tRNA synthetase. Three amino acid residues, important for the editing activity, K279, G331 and H366, were revealed. This data are consistent with the existing suppositions about the structure of bacterial prolyl-tRNA synthetase deacylating active site. 2009 Article Предполагаемый активный центр редактирующего домена пролил-тРНК синтетазы бактерии Enterococcus faecalis / К.С. Бояршин, И.А. Крикливый, А.В. Раевский, А.А. Химин, А.Д. Яремчук, М.А. Тукало // Біополімери і клітина. — 2009. — Т. 25, № 1. — С. 39-43. — Бібліогр.: 13 назв. — pос. 0233-7657 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/5641 577.217.32 ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language Russian
topic Структура і функції біополімерів
Структура і функції біополімерів
spellingShingle Структура і функції біополімерів
Структура і функції біополімерів
Бояршин, К.С.
Крикливый, И.А.
Раевский, А.В.
Химин, А.А.
Яремчук, А.Д.
Тукало, М.А.
Предполагаемый активный центр редактирующего домена пролил-тРНК синтетазы бактерии Enterococcus faecalis
description Обеспечение аминокислотной специфичности аминоацил-тРНК синтетаз в ряде случаев требует проведения гидролиза ошибочно синтезированных продуктов, известного как аминокислотное редактирование. Бактериальные пролил-тРНК синтетазы содержат специальный редактирующий домен, деацилирующий аланил-тРНКPro и таким образом демонстрирующий посттрансферную редактирующую активность. Механизм тРНК-зависимого редактирования пролил-тРНК синтетазой остается нераскрытым. Цель настоящей работы состояла в изучении структуры активного центраредактирующего домена пролил-тРНК синтетазы E. faecalis. Аминокислотные позиции E218, T257, K279, G331, S332, G334, H366 избраны для сайт-направленного мутагенеза (аланинового сканирования), а редактирующая активность мутантных форм сопоставлена с диким типом пролил-тРНК синтетазы. Выявлены три аминокислотных остатка, имеющих значение для посттрансферной редактирующей активности фермента, – K279, G331 и H366. Полученные данные подтверждают существующие предположения о структуреактивного центра редактирующего домена бактериальных пролил-тРНК синтетаз.
format Article
author Бояршин, К.С.
Крикливый, И.А.
Раевский, А.В.
Химин, А.А.
Яремчук, А.Д.
Тукало, М.А.
author_facet Бояршин, К.С.
Крикливый, И.А.
Раевский, А.В.
Химин, А.А.
Яремчук, А.Д.
Тукало, М.А.
author_sort Бояршин, К.С.
title Предполагаемый активный центр редактирующего домена пролил-тРНК синтетазы бактерии Enterococcus faecalis
title_short Предполагаемый активный центр редактирующего домена пролил-тРНК синтетазы бактерии Enterococcus faecalis
title_full Предполагаемый активный центр редактирующего домена пролил-тРНК синтетазы бактерии Enterococcus faecalis
title_fullStr Предполагаемый активный центр редактирующего домена пролил-тРНК синтетазы бактерии Enterococcus faecalis
title_full_unstemmed Предполагаемый активный центр редактирующего домена пролил-тРНК синтетазы бактерии Enterococcus faecalis
title_sort предполагаемый активный центр редактирующего домена пролил-трнк синтетазы бактерии enterococcus faecalis
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
publishDate 2009
topic_facet Структура і функції біополімерів
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/5641
citation_txt Предполагаемый активный центр редактирующего домена пролил-тРНК синтетазы бактерии Enterococcus faecalis / К.С. Бояршин, И.А. Крикливый, А.В. Раевский, А.А. Химин, А.Д. Яремчук, М.А. Тукало // Біополімери і клітина. — 2009. — Т. 25, № 1. — С. 39-43. — Бібліогр.: 13 назв. — pос.
work_keys_str_mv AT boâršinks predpolagaemyjaktivnyjcentrredaktiruûŝegodomenaproliltrnksintetazybakteriienterococcusfaecalis
AT kriklivyjia predpolagaemyjaktivnyjcentrredaktiruûŝegodomenaproliltrnksintetazybakteriienterococcusfaecalis
AT raevskijav predpolagaemyjaktivnyjcentrredaktiruûŝegodomenaproliltrnksintetazybakteriienterococcusfaecalis
AT himinaa predpolagaemyjaktivnyjcentrredaktiruûŝegodomenaproliltrnksintetazybakteriienterococcusfaecalis
AT âremčukad predpolagaemyjaktivnyjcentrredaktiruûŝegodomenaproliltrnksintetazybakteriienterococcusfaecalis
AT tukaloma predpolagaemyjaktivnyjcentrredaktiruûŝegodomenaproliltrnksintetazybakteriienterococcusfaecalis
first_indexed 2023-03-24T08:33:59Z
last_indexed 2023-03-24T08:33:59Z
_version_ 1796139293445455872

Схожі ресурси