Біоінформатичний аналіз інвертованих повторів геному коронавірусів

• Дата: 2009
• Автор: Лиманська, О.Ю.
• Формат: Стаття
• Мова: Ukrainian
• Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2009
• Теми: Біоінформатика
• Онлайн доступ: http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/5685
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Цитувати: Біоінформатичний аналіз інвертованих повторів геному коронавірусів / О.Ю. Лиманська // Біополімери і клітина. — 2009. — Т. 25, № 4. — С. 307-314. — Бібліогр.: 16 назв. — укp.

Мета. Створення карт локалізації досконалих і недосконалих потенційних шпилькових структур у геномі коронавірусів людини і тварин. Методи. Біоінформатичний аналіз нуклеотидних послідовностей коронавірусів, атомно-силова мікроскопія. Результати. Визначено термодинамічно стабільні досконалі та недосконалі інвертовані повтори, які утворюють шпилькові структури, що можуть виникати у геномній РНК коронавірусів людини і тварин – вірусів тяжкого гострого респіраторного синдрому, гепатиту миші, епідемічної діареї свині, трансмісивного гастроентериту та бичачого коронавірусу. Створено карти локалізації шпильок (які є одним із ланцюгів сигнальних механізмів функціонування геному) на геномі коронавірусів. Висновки. Основними сайтами локалізації потенційно можливих консервативних структурних мотивів є гени реплікази та глікопротеїнів шипів коронавірусів. Шпилькові структури є консервативними елементами всередині набору ізолятів одного виду коронавірусів.