Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой
На основании известных пространственных структур протеинфосфатаз 1 и 2А из Homo sapiens выполнено профильное моделирование их растительных гомологов из Arabidopsis thaliana. Качество построенных моделей подтверждено значениями среднеквадратических отклонений между атомами и результатами конфирмацион...
Збережено в:
Дата: | 2011 |
---|---|
Автори: | , , , |
Формат: | Стаття |
Мова: | Russian |
Опубліковано: |
Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
2011
|
Назва видання: | Цитология и генетика |
Теми: | |
Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/66840 |
Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
Цитувати: | Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой / Д.А. Самофалова, П.А. Карпов, А.Ю. Ныпорко, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2011. — Т. 45, № 3. — С. 26-34. — Бібліогр.: 55 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraineid |
irk-123456789-66840 |
---|---|
record_format |
dspace |
spelling |
irk-123456789-668402014-07-24T03:01:27Z Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой Самофалова, Д.А. Карпов, П.А. Ныпорко, А.Ю. Блюм Я.Б. Оригинальные работы На основании известных пространственных структур протеинфосфатаз 1 и 2А из Homo sapiens выполнено профильное моделирование их растительных гомологов из Arabidopsis thaliana. Качество построенных моделей подтверждено значениями среднеквадратических отклонений между атомами и результатами конфирмационного анализа. По результатам сравнительного анализа и молекулярной динамики идентифицированы и подтверждены сайты связывания окадаиновой кислоты молекулами протеинфосфатаз типов 1 и 2А из A. thaliana. На підставі відомих просторових структур протеїнфосфатаз 1 та 2А з Homo sapiens виконано профільне моделювання їхніх рослинних гомологів з Arabidopsis thaliana. Якість побудованих моделей підтверджена значеннями середньоквадратичних відхилень між атомами, а також даними конформаційного аналізу. За результатами порівняльного аналізу і молекулярної динаміки ідентифіковано і підтверджено сайти зв’язування окадаїнової кислоти молекулами протеїнфосфатаз типів 1 і 2А з A. thaliana. The homology modeling, based on known temple structures of Homo sapiens protein phosphatase type-1 and -2А was implemented. The spatial structures of the human protein phosphatases and their plant homologs from Arabidopsis thaliana was predicted. The quality of models was confirmed by conformational analysis and root mean square deviations. The sites of okadaic acid binding in molecules of plant protein phosphatases (type-1 and -2А) were proved by the data of comparative analysis and molecular dynamics. 2011 Article Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой / Д.А. Самофалова, П.А. Карпов, А.Ю. Ныпорко, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2011. — Т. 45, № 3. — С. 26-34. — Бібліогр.: 55 назв. — рос. 0564-3783 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/66840 577.212:004 ru Цитология и генетика Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України |
institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
collection |
DSpace DC |
language |
Russian |
topic |
Оригинальные работы Оригинальные работы |
spellingShingle |
Оригинальные работы Оригинальные работы Самофалова, Д.А. Карпов, П.А. Ныпорко, А.Ю. Блюм Я.Б. Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой Цитология и генетика |
description |
На основании известных пространственных структур протеинфосфатаз 1 и 2А из Homo sapiens выполнено профильное моделирование их растительных гомологов из Arabidopsis thaliana. Качество построенных моделей подтверждено значениями среднеквадратических отклонений между атомами и результатами конфирмационного анализа. По результатам сравнительного анализа и молекулярной динамики идентифицированы и подтверждены сайты связывания окадаиновой кислоты молекулами протеинфосфатаз типов 1 и 2А из A. thaliana. |
format |
Article |
author |
Самофалова, Д.А. Карпов, П.А. Ныпорко, А.Ю. Блюм Я.Б. |
author_facet |
Самофалова, Д.А. Карпов, П.А. Ныпорко, А.Ю. Блюм Я.Б. |
author_sort |
Самофалова, Д.А. |
title |
Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой |
title_short |
Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой |
title_full |
Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой |
title_fullStr |
Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой |
title_full_unstemmed |
Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой |
title_sort |
реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2а с окадаиновой кислотой |
publisher |
Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України |
publishDate |
2011 |
topic_facet |
Оригинальные работы |
url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/66840 |
citation_txt |
Реконструкция пространственной структуры комплексов растительных протеинфосфатаз типа 1 и 2А с окадаиновой кислотой / Д.А. Самофалова, П.А. Карпов, А.Ю. Ныпорко, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2011. — Т. 45, № 3. — С. 26-34. — Бібліогр.: 55 назв. — рос. |
series |
Цитология и генетика |
work_keys_str_mv |
AT samofalovada rekonstrukciâprostranstvennojstrukturykompleksovrastitelʹnyhproteinfosfataztipa1i2asokadainovojkislotoj AT karpovpa rekonstrukciâprostranstvennojstrukturykompleksovrastitelʹnyhproteinfosfataztipa1i2asokadainovojkislotoj AT nyporkoaû rekonstrukciâprostranstvennojstrukturykompleksovrastitelʹnyhproteinfosfataztipa1i2asokadainovojkislotoj AT blûmâb rekonstrukciâprostranstvennojstrukturykompleksovrastitelʹnyhproteinfosfataztipa1i2asokadainovojkislotoj |
first_indexed |
2023-10-18T18:50:59Z |
last_indexed |
2023-10-18T18:50:59Z |
_version_ |
1796145324392185856 |