Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов
Рассматривается гидрофобно-полярная модель сворачивания протеина, предлагается и исследуется алгоритм прогнозирования третичной структуры белка, построенный на базе метода ОМК. Строится модель молекулы протеинов в трехмерной треугольной решетке. Разработаны методы априорной оценки позиции в решетке...
Збережено в:
Дата: | 2012 |
---|---|
Формат: | Стаття |
Мова: | Russian |
Опубліковано: |
Інститут кібернетики ім. В.М. Глушкова НАН України
2012
|
Назва видання: | Теорія оптимальних рішень |
Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/85018 |
Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
Цитувати: | Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов / В.А. Рудык // Теорія оптимальних рішень: Зб. наук. пр. — 2012. — № 11. — С. 66-72. — Бібліогр.: 7 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraineid |
irk-123456789-85018 |
---|---|
record_format |
dspace |
spelling |
irk-123456789-850182015-07-19T03:02:11Z Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов Рассматривается гидрофобно-полярная модель сворачивания протеина, предлагается и исследуется алгоритм прогнозирования третичной структуры белка, построенный на базе метода ОМК. Строится модель молекулы протеинов в трехмерной треугольной решетке. Разработаны методы априорной оценки позиции в решетке и обновления матрицы феромонных путей, их эффективность подтверждена вычислительным экспериментом. Розглядається гідрофобно-полярна модель згортання протеїну, пропонується та досліджується алгоритм прогнозування третинної структури білка, розроблений на базі методу ОМК. Будується модель молекули протеїну в тривимірній трикутній решітці. Запропоновані методи апріорної оцінки позиції в решітці та поновлення матриці феромонних шляхів, їх ефективність підтверджена обчислювальним експериментом. The Hydrophobic-Hydrophilic protein folding model is examined, the algorithm based on ACO optimization method is proposed and analyzed for protein tertiary structure prediction. The molecule model is considered to be a chain whose monomers are placed on the vertices of 3D triangular lattice. The a priori position estimation method and pheromone trails updating method are deviced, computational experiment confirms their appropriateness. 2012 Article Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов / В.А. Рудык // Теорія оптимальних рішень: Зб. наук. пр. — 2012. — № 11. — С. 66-72. — Бібліогр.: 7 назв. — рос. XXXX-0013 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/85018 519.21 ru Теорія оптимальних рішень Інститут кібернетики ім. В.М. Глушкова НАН України |
institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
collection |
DSpace DC |
language |
Russian |
description |
Рассматривается гидрофобно-полярная модель сворачивания протеина, предлагается и исследуется алгоритм прогнозирования третичной структуры белка, построенный на базе метода ОМК. Строится модель молекулы протеинов в трехмерной треугольной решетке. Разработаны методы априорной оценки позиции в решетке и обновления матрицы феромонных путей, их эффективность подтверждена вычислительным экспериментом. |
format |
Article |
title |
Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов |
spellingShingle |
Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов Теорія оптимальних рішень |
title_short |
Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов |
title_full |
Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов |
title_fullStr |
Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов |
title_full_unstemmed |
Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов |
title_sort |
анализ эффективности алгоритмов омк для решения задачи о сворачивании протеинов |
publisher |
Інститут кібернетики ім. В.М. Глушкова НАН України |
publishDate |
2012 |
url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/85018 |
citation_txt |
Анализ эффективности алгоритмов ОМК для решения задачи о сворачивании протеинов / В.А. Рудык // Теорія оптимальних рішень: Зб. наук. пр. — 2012. — № 11. — С. 66-72. — Бібліогр.: 7 назв. — рос. |
series |
Теорія оптимальних рішень |
first_indexed |
2023-10-18T19:30:11Z |
last_indexed |
2023-10-18T19:30:11Z |
_version_ |
1796147136965902336 |