Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу
Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один iз ключових ферментiв синтезу бiлка на дорибосомному етапi, тому його iнгiбування є перспективним шляхом розробки нових антибiотикiв. Ефективним та одним iз найбiльш дослiджених iнгiбiторiв TyrRS бактерiй є сполука SB-219383. Автора...
Збережено в:
Дата: | 2016 |
---|---|
Автори: | , , |
Формат: | Стаття |
Мова: | Ukrainian |
Опубліковано: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2016
|
Назва видання: | Доповіді НАН України |
Теми: | |
Онлайн доступ: | http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/98145 |
Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
Цитувати: | Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу / В.В. Микуляк, І.С. Войтешенко, О.І. Корнелюк // Доповіді Національної академії наук України. — 2016. — № 1. — С. 99-104. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraineid |
irk-123456789-98145 |
---|---|
record_format |
dspace |
spelling |
irk-123456789-981452017-11-26T22:48:29Z Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу Микуляк, В.В. Войтешенко, І.С. Корнелюк, О.І. Біофізика Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один iз ключових ферментiв синтезу бiлка на дорибосомному етапi, тому його iнгiбування є перспективним шляхом розробки нових антибiотикiв. Ефективним та одним iз найбiльш дослiджених iнгiбiторiв TyrRS бактерiй є сполука SB-219383. Авторами дослiджено природу взаємодiй мiж SB-219383 та MtTyrRS iз застосуванням гiбридного пiдходу молекулярної динамiки QM/MM. Особливу увагу придiлено iдентифiкацiї водневих зв’язкiв i дослiдженню їхнiх структурних та фiзико-хiмiчних параметрiв. Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один из ключевых ферментов синтеза белка на дорибосомном этапе, поэтому его ингибирование является перспективным путем разработки новых антибиотиков. Эффективным и одним из самых исследованных ингибиторов TyrRS бактерий является соединение SB-219383. Авторами исследована природа взаимодействий между SB-219383 и MtTyrRS с использованием гибридного подхода молекулярной динамики QM/MM. Особое внимание уделено идентификации водородных связей и исследованию их структурных и физико-химических параметров. Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase (MtTyrRS) is one of the key enzymes at the pre-ribosomal step of protein synthesis. Therefore, its inhibition is a promising way for the development of new antibiotics. Effective and one of the most studied bacterial TyrRS inhibitors is SB-219383 compound. We have studied the nature of the interactions between SB-219383 and MtTyrRS using the hybrid approach of QM/MM simulations. In particular, a special attention has been paid to the identification of hydrogen bonds and their structural and physico-chemical parameters. 2016 Article Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу / В.В. Микуляк, І.С. Войтешенко, О.І. Корнелюк // Доповіді Національної академії наук України. — 2016. — № 1. — С. 99-104. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. 1025-6415 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/98145 577.32 uk Доповіді НАН України Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
collection |
DSpace DC |
language |
Ukrainian |
topic |
Біофізика Біофізика |
spellingShingle |
Біофізика Біофізика Микуляк, В.В. Войтешенко, І.С. Корнелюк, О.І. Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу Доповіді НАН України |
description |
Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один iз ключових ферментiв синтезу бiлка на дорибосомному етапi, тому його iнгiбування є перспективним шляхом розробки нових антибiотикiв. Ефективним та одним iз найбiльш дослiджених
iнгiбiторiв TyrRS бактерiй є сполука SB-219383. Авторами дослiджено природу взаємодiй мiж SB-219383 та MtTyrRS iз застосуванням гiбридного пiдходу молекулярної динамiки QM/MM. Особливу увагу придiлено iдентифiкацiї водневих зв’язкiв i дослiдженню
їхнiх структурних та фiзико-хiмiчних параметрiв. |
format |
Article |
author |
Микуляк, В.В. Войтешенко, І.С. Корнелюк, О.І. |
author_facet |
Микуляк, В.В. Войтешенко, І.С. Корнелюк, О.І. |
author_sort |
Микуляк, В.В. |
title |
Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу |
title_short |
Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу |
title_full |
Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу |
title_fullStr |
Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу |
title_full_unstemmed |
Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу |
title_sort |
моделювання динаміки тирозил-трнк синтетази mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором sb-219383 з використанням qm/mm підходу |
publisher |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
publishDate |
2016 |
topic_facet |
Біофізика |
url |
http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/98145 |
citation_txt |
Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу / В.В. Микуляк, І.С. Войтешенко, О.І. Корнелюк // Доповіді Національної академії наук України. — 2016. — № 1. — С. 99-104. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. |
series |
Доповіді НАН України |
work_keys_str_mv |
AT mikulâkvv modelûvannâdinamíkitiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisukompleksízíngíbítoromsb219383zvikoristannâmqmmmpídhodu AT vojtešenkoís modelûvannâdinamíkitiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisukompleksízíngíbítoromsb219383zvikoristannâmqmmmpídhodu AT kornelûkoí modelûvannâdinamíkitiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisukompleksízíngíbítoromsb219383zvikoristannâmqmmmpídhodu |
first_indexed |
2023-10-18T19:59:08Z |
last_indexed |
2023-10-18T19:59:08Z |
_version_ |
1796148443625816064 |