Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу

Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один iз ключових ферментiв синтезу бiлка на дорибосомному етапi, тому його iнгiбування є перспективним шляхом розробки нових антибiотикiв. Ефективним та одним iз найбiльш дослiджених iнгiбiторiв TyrRS бактерiй є сполука SB-219383. Автора...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Дата:2016
Автори: Микуляк, В.В., Войтешенко, І.С., Корнелюк, О.І.
Формат: Стаття
Мова:Ukrainian
Опубліковано: Видавничий дім "Академперіодика" НАН України 2016
Назва видання:Доповіді НАН України
Теми:
Онлайн доступ:http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/98145
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу / В.В. Микуляк, І.С. Войтешенко, О.І. Корнелюк // Доповіді Національної академії наук України. — 2016. — № 1. — С. 99-104. — Бібліогр.: 15 назв. — укр.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id irk-123456789-98145
record_format dspace
spelling irk-123456789-981452017-11-26T22:48:29Z Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу Микуляк, В.В. Войтешенко, І.С. Корнелюк, О.І. Біофізика Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один iз ключових ферментiв синтезу бiлка на дорибосомному етапi, тому його iнгiбування є перспективним шляхом розробки нових антибiотикiв. Ефективним та одним iз найбiльш дослiджених iнгiбiторiв TyrRS бактерiй є сполука SB-219383. Авторами дослiджено природу взаємодiй мiж SB-219383 та MtTyrRS iз застосуванням гiбридного пiдходу молекулярної динамiки QM/MM. Особливу увагу придiлено iдентифiкацiї водневих зв’язкiв i дослiдженню їхнiх структурних та фiзико-хiмiчних параметрiв. Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один из ключевых ферментов синтеза белка на дорибосомном этапе, поэтому его ингибирование является перспективным путем разработки новых антибиотиков. Эффективным и одним из самых исследованных ингибиторов TyrRS бактерий является соединение SB-219383. Авторами исследована природа взаимодействий между SB-219383 и MtTyrRS с использованием гибридного подхода молекулярной динамики QM/MM. Особое внимание уделено идентификации водородных связей и исследованию их структурных и физико-химических параметров. Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase (MtTyrRS) is one of the key enzymes at the pre-ribosomal step of protein synthesis. Therefore, its inhibition is a promising way for the development of new antibiotics. Effective and one of the most studied bacterial TyrRS inhibitors is SB-219383 compound. We have studied the nature of the interactions between SB-219383 and MtTyrRS using the hybrid approach of QM/MM simulations. In particular, a special attention has been paid to the identification of hydrogen bonds and their structural and physico-chemical parameters. 2016 Article Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу / В.В. Микуляк, І.С. Войтешенко, О.І. Корнелюк // Доповіді Національної академії наук України. — 2016. — № 1. — С. 99-104. — Бібліогр.: 15 назв. — укр. 1025-6415 http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/98145 577.32 uk Доповіді НАН України Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
language Ukrainian
topic Біофізика
Біофізика
spellingShingle Біофізика
Біофізика
Микуляк, В.В.
Войтешенко, І.С.
Корнелюк, О.І.
Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу
Доповіді НАН України
description Тирозил-тРНК синтетаза Mycobacterium tuberculosis (MtTyrRS) – один iз ключових ферментiв синтезу бiлка на дорибосомному етапi, тому його iнгiбування є перспективним шляхом розробки нових антибiотикiв. Ефективним та одним iз найбiльш дослiджених iнгiбiторiв TyrRS бактерiй є сполука SB-219383. Авторами дослiджено природу взаємодiй мiж SB-219383 та MtTyrRS iз застосуванням гiбридного пiдходу молекулярної динамiки QM/MM. Особливу увагу придiлено iдентифiкацiї водневих зв’язкiв i дослiдженню їхнiх структурних та фiзико-хiмiчних параметрiв.
format Article
author Микуляк, В.В.
Войтешенко, І.С.
Корнелюк, О.І.
author_facet Микуляк, В.В.
Войтешенко, І.С.
Корнелюк, О.І.
author_sort Микуляк, В.В.
title Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу
title_short Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу
title_full Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу
title_fullStr Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу
title_full_unstemmed Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу
title_sort моделювання динаміки тирозил-трнк синтетази mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором sb-219383 з використанням qm/mm підходу
publisher Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
publishDate 2016
topic_facet Біофізика
url http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/98145
citation_txt Моделювання динаміки тирозил-тРНК синтетази Mycobacterium tuberculosis у комплексі з інгібітором SB-219383 з використанням QM/MM підходу / В.В. Микуляк, І.С. Войтешенко, О.І. Корнелюк // Доповіді Національної академії наук України. — 2016. — № 1. — С. 99-104. — Бібліогр.: 15 назв. — укр.
series Доповіді НАН України
work_keys_str_mv AT mikulâkvv modelûvannâdinamíkitiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisukompleksízíngíbítoromsb219383zvikoristannâmqmmmpídhodu
AT vojtešenkoís modelûvannâdinamíkitiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisukompleksízíngíbítoromsb219383zvikoristannâmqmmmpídhodu
AT kornelûkoí modelûvannâdinamíkitiroziltrnksintetazimycobacteriumtuberculosisukompleksízíngíbítoromsb219383zvikoristannâmqmmmpídhodu
first_indexed 2023-10-18T19:59:08Z
last_indexed 2023-10-18T19:59:08Z
_version_ 1796148443625816064