Високопропускний скринінг речовин з антимітотичною активністю на базі віртуальної організації СSLabGrid
Описано створення репозиторію 3-D моделей білків цитоскелету (тубулінів і FtsZ-білків) у рамках віртуальної організації CSLabGrid з використанням обчислень в Ґрід. Розглянуто питання створення репозиторію просторових структур канонічних антимікротрубочкових агентів (інгібіторів полімеризації тубул...
Saved in:
| Published in: | Наука та інновації |
|---|---|
| Date: | 2015 |
| Main Authors: | , , , , , , , , , , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2015
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/116274 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Високопропускний скринінг речовин з антимітотичною активністю на базі віртуальної організації СSLabGrid / П.А. Карпов, В.М. Брицун, О.В. Раєвський, О.М. Демчук, М.О. Пидюра, С.П. Ожерєдов, Д.О. Самофалова, С.І. Співак, А.І. Ємець, В.І. Кальченко, Я.Б. Блюм // Наука та інновації. — 2015. — Т. 11, № 1. — С. 92-100. — Бібліогр.: 23 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-116274 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| spelling |
Карпов, П.А. Брицун, В.М. Раєвський, О.В. Демчук, О.М. Пидюра, М.О. Ожерєдов, С.П. Самофалова, Д.О. Співак, С.І. Ємець, А.І. Кальченко, В.І. Блюм, Я.Б. 2017-04-23T18:01:43Z 2017-04-23T18:01:43Z 2015 Високопропускний скринінг речовин з антимітотичною активністю на базі віртуальної організації СSLabGrid / П.А. Карпов, В.М. Брицун, О.В. Раєвський, О.М. Демчук, М.О. Пидюра, С.П. Ожерєдов, Д.О. Самофалова, С.І. Співак, А.І. Ємець, В.І. Кальченко, Я.Б. Блюм // Наука та інновації. — 2015. — Т. 11, № 1. — С. 92-100. — Бібліогр.: 23 назв. — укр. 1815-2066 DOI: doi.org/10.15407/scin11.01.092 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/116274 Описано створення репозиторію 3-D моделей білків цитоскелету (тубулінів і FtsZ-білків) у рамках віртуальної організації CSLabGrid з використанням обчислень в Ґрід. Розглянуто питання створення репозиторію просторових структур канонічних антимікротрубочкових агентів (інгібіторів полімеризації тубуліну), а також бібліотеки речовин, придатних для віртуального молекулярного скринінгу в Ґрід. За результатами високопропускного віртуального скринінгу цієї бібліотеки відібрано 1164 речовини з підвищеною спорідненістю до тубуліну: 205 — до α-тубуліну і 959 — до β-тубуліну. Встановлено, що з 2886 сполук, синтезованих в Інституті органічної хімії НАН України, 6 речовин є перспективними інгібіторами полімеризації α- і β-тубуліну з таких збудників хвороб людини, як Pneumocystis carinii, Giardia intestinalis, Ajellomyces capsulatus, Neosartorya fumigata, Candida albicans. Відповідно ці речовини рекомендовані для подальшої експериментальної оцінки їх біологічної активності з метою застосування як нових фармакологічних засобів. Описано создание репозитория 3-D моделей белков цитоскелета (тубулинов и FtsZ-белков) в рамках виртуальной организации CSLabGrіd с использованием вычислений в Грид. Рассмотрен вопрос создания репозитория пространственных структур канонических антимикротрубочковых агентов (ингибиторов полимеризации тубулина), а также библиотеки веществ, пригодных для виртуального молекулярного скрининга в Грид. В соответствии с результатами высокопропускного виртуального скрининга этой библиотеки отобрано 1164 вещества с повышенным сродством к тубулину: 205 – к α-тубулину и 959 – к β-тубулину. Установлено, что из 2 886 соединений, синтезированных в Институте органической химии НАН Украины, 6 веществ являются перспективными ингибиторами полимеризации α- и β-тубулина из таких возбудителей болезней человека, как Pne u mocystis carinii, Giardia intestinalis, Ajellomyces capsulatus, Neo sartorya fumigata, Can dida al bi cans. Соответственно, эти вещества рекомендованы для дальнейшей экспериментальной оценки их биологической активности с целью использования в качестве новых фармакологических средств. In the frameworks of virtual organization CSLabGrid using Grid calculations the repository of 3-D models of cytoskeletal proteins (tubulins and FtsZ-proteins) verified by stereochemistry, is described. The repository of structures of canonical antimicrotubular compounds (inhibitors of tubulin polymerization) as well as library of ligands, suitable for high-throughput screening (HTS) in Grid were created. According to the results of the library HTS 1,164 compounds that demonstrated an elevated affinity to tubulin molecules: 205 — to α-tubulin and 959 — to β-tubulin were selected. It was found that among 2,886 compounds synthesized in the Institute of Organic Chemistry of NAS of Ukraine, 6 were perspective inhibitors of α- and β-tubulin polymerization in such human pathogens as Pneumocystis carinii, Giardia intestinalis Ajellomyces capsulatus, Neosartorya fumigata and Candida albicans. Respectively, these compounds were recommended for subsequent experimental evaluation of their biological activity for use as new pharmacological agents. Дослідження було підтримано грантом Державної цільової науково-технічної програми впровадження і застосування Ґрід-технологій на 2009–2013 рр.: № 15: «Застосування Ґрід- ресурсу для біоінформаційного вивчення цитоскелету та високопропускного віртуального скринінгу речовин з антимікротрубочковою активністю для потреб фармацевтики та захисту рослин» (2010—2013 рр.), № 0113U004047 «Використання Ґрід для високопропускного скринінгу біологічно активних речовин з підвищеною спорідненістю до тубулінів як базової складової реалізації програмних засад віртуальної організації CSLabGrid» (2013 р.). uk Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Наука та інновації До 10-річчя журналу Високопропускний скринінг речовин з антимітотичною активністю на базі віртуальної організації СSLabGrid Высокопропускной скрининг веществ с антимитотической активностью на базе виртуальной организации CSLabGrid High-throughput Screening of New Antimitotic Compounds Based on Potential of Virtual Organization CSLabGrid Article published earlier |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| title |
Високопропускний скринінг речовин з антимітотичною активністю на базі віртуальної організації СSLabGrid |
| spellingShingle |
Високопропускний скринінг речовин з антимітотичною активністю на базі віртуальної організації СSLabGrid Карпов, П.А. Брицун, В.М. Раєвський, О.В. Демчук, О.М. Пидюра, М.О. Ожерєдов, С.П. Самофалова, Д.О. Співак, С.І. Ємець, А.І. Кальченко, В.І. Блюм, Я.Б. До 10-річчя журналу |
| title_short |
Високопропускний скринінг речовин з антимітотичною активністю на базі віртуальної організації СSLabGrid |
| title_full |
Високопропускний скринінг речовин з антимітотичною активністю на базі віртуальної організації СSLabGrid |
| title_fullStr |
Високопропускний скринінг речовин з антимітотичною активністю на базі віртуальної організації СSLabGrid |
| title_full_unstemmed |
Високопропускний скринінг речовин з антимітотичною активністю на базі віртуальної організації СSLabGrid |
| title_sort |
високопропускний скринінг речовин з антимітотичною активністю на базі віртуальної організації сslabgrid |
| author |
Карпов, П.А. Брицун, В.М. Раєвський, О.В. Демчук, О.М. Пидюра, М.О. Ожерєдов, С.П. Самофалова, Д.О. Співак, С.І. Ємець, А.І. Кальченко, В.І. Блюм, Я.Б. |
| author_facet |
Карпов, П.А. Брицун, В.М. Раєвський, О.В. Демчук, О.М. Пидюра, М.О. Ожерєдов, С.П. Самофалова, Д.О. Співак, С.І. Ємець, А.І. Кальченко, В.І. Блюм, Я.Б. |
| topic |
До 10-річчя журналу |
| topic_facet |
До 10-річчя журналу |
| publishDate |
2015 |
| language |
Ukrainian |
| container_title |
Наука та інновації |
| publisher |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| format |
Article |
| title_alt |
Высокопропускной скрининг веществ с антимитотической активностью на базе виртуальной организации CSLabGrid High-throughput Screening of New Antimitotic Compounds Based on Potential of Virtual Organization CSLabGrid |
| description |
Описано створення репозиторію 3-D моделей білків цитоскелету (тубулінів і FtsZ-білків) у рамках віртуальної
організації CSLabGrid з використанням обчислень в Ґрід. Розглянуто питання створення репозиторію просторових
структур канонічних антимікротрубочкових агентів (інгібіторів полімеризації тубуліну), а також бібліотеки речовин, придатних для віртуального молекулярного скринінгу в Ґрід. За результатами високопропускного віртуального скринінгу цієї бібліотеки відібрано 1164 речовини з підвищеною спорідненістю до тубуліну: 205 — до α-тубуліну і
959 — до β-тубуліну. Встановлено, що з 2886 сполук, синтезованих в Інституті органічної хімії НАН України, 6 речовин є перспективними інгібіторами полімеризації α- і β-тубуліну з таких збудників хвороб людини, як Pneumocystis
carinii, Giardia intestinalis, Ajellomyces capsulatus, Neosartorya fumigata, Candida albicans. Відповідно ці речовини рекомендовані для подальшої експериментальної оцінки їх біологічної активності з метою застосування як нових фармакологічних засобів.
Описано создание репозитория 3-D моделей белков
цитоскелета (тубулинов и FtsZ-белков) в рамках виртуальной организации CSLabGrіd с использованием вычислений в Грид. Рассмотрен вопрос создания репозитория пространственных структур канонических антимикротрубочковых агентов (ингибиторов полимеризации
тубулина), а также библиотеки веществ, пригодных для
виртуального молекулярного скрининга в Грид. В соответствии с результатами высокопропускного виртуального скрининга этой библиотеки отобрано 1164 вещества с повышенным сродством к тубулину: 205 – к α-тубулину и 959 – к β-тубулину. Установлено, что из 2 886
соединений, синтезированных в Институте органической химии НАН Украины, 6 веществ являются перспективными ингибиторами полимеризации α- и β-тубулина
из таких возбудителей болезней человека, как Pne u mocystis
carinii, Giardia intestinalis, Ajellomyces capsulatus,
Neo sartorya fumigata, Can dida al bi cans. Соответственно,
эти вещества рекомендованы для дальнейшей экспериментальной оценки их биологической активности с целью использования в качестве новых фармакологических средств.
In the frameworks of virtual organization CSLabGrid
using Grid calculations the repository of 3-D models of cytoskeletal
proteins (tubulins and FtsZ-proteins) verified
by stereochemistry, is described. The repository of structures
of canonical antimicrotubular compounds (inhibitors
of tubulin polymerization) as well as library of ligands, suitable
for high-throughput screening (HTS) in Grid were
created. According to the results of the library HTS 1,164
compounds that demonstrated an elevated affinity to tubulin
molecules: 205 — to α-tubulin and 959 — to β-tubulin
were selected. It was found that among 2,886 compounds
synthesized in the Institute of Organic Chemistry of NAS
of Ukraine, 6 were perspective inhibitors of α- and β-tubulin
polymerization in such human pathogens as Pneumocystis carinii, Giardia intestinalis Ajellomyces capsulatus, Neosartorya fumigata and Candida albicans. Respectively, these compounds were recommended for subsequent experimental evaluation of their biological activity for use as new pharmacological agents.
|
| issn |
1815-2066 |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/116274 |
| citation_txt |
Високопропускний скринінг речовин з антимітотичною активністю на базі віртуальної організації СSLabGrid / П.А. Карпов, В.М. Брицун, О.В. Раєвський, О.М. Демчук, М.О. Пидюра, С.П. Ожерєдов, Д.О. Самофалова, С.І. Співак, А.І. Ємець, В.І. Кальченко, Я.Б. Блюм // Наука та інновації. — 2015. — Т. 11, № 1. — С. 92-100. — Бібліогр.: 23 назв. — укр. |
| work_keys_str_mv |
AT karpovpa visokopropuskniiskriníngrečovinzantimítotičnoûaktivnístûnabazívírtualʹnoíorganízacíísslabgrid AT bricunvm visokopropuskniiskriníngrečovinzantimítotičnoûaktivnístûnabazívírtualʹnoíorganízacíísslabgrid AT raêvsʹkiiov visokopropuskniiskriníngrečovinzantimítotičnoûaktivnístûnabazívírtualʹnoíorganízacíísslabgrid AT demčukom visokopropuskniiskriníngrečovinzantimítotičnoûaktivnístûnabazívírtualʹnoíorganízacíísslabgrid AT pidûramo visokopropuskniiskriníngrečovinzantimítotičnoûaktivnístûnabazívírtualʹnoíorganízacíísslabgrid AT ožerêdovsp visokopropuskniiskriníngrečovinzantimítotičnoûaktivnístûnabazívírtualʹnoíorganízacíísslabgrid AT samofalovado visokopropuskniiskriníngrečovinzantimítotičnoûaktivnístûnabazívírtualʹnoíorganízacíísslabgrid AT spívaksí visokopropuskniiskriníngrečovinzantimítotičnoûaktivnístûnabazívírtualʹnoíorganízacíísslabgrid AT êmecʹaí visokopropuskniiskriníngrečovinzantimítotičnoûaktivnístûnabazívírtualʹnoíorganízacíísslabgrid AT kalʹčenkoví visokopropuskniiskriníngrečovinzantimítotičnoûaktivnístûnabazívírtualʹnoíorganízacíísslabgrid AT blûmâb visokopropuskniiskriníngrečovinzantimítotičnoûaktivnístûnabazívírtualʹnoíorganízacíísslabgrid AT karpovpa vysokopropusknoiskriningveŝestvsantimitotičeskoiaktivnostʹûnabazevirtualʹnoiorganizaciicslabgrid AT bricunvm vysokopropusknoiskriningveŝestvsantimitotičeskoiaktivnostʹûnabazevirtualʹnoiorganizaciicslabgrid AT raêvsʹkiiov vysokopropusknoiskriningveŝestvsantimitotičeskoiaktivnostʹûnabazevirtualʹnoiorganizaciicslabgrid AT demčukom vysokopropusknoiskriningveŝestvsantimitotičeskoiaktivnostʹûnabazevirtualʹnoiorganizaciicslabgrid AT pidûramo vysokopropusknoiskriningveŝestvsantimitotičeskoiaktivnostʹûnabazevirtualʹnoiorganizaciicslabgrid AT ožerêdovsp vysokopropusknoiskriningveŝestvsantimitotičeskoiaktivnostʹûnabazevirtualʹnoiorganizaciicslabgrid AT samofalovado vysokopropusknoiskriningveŝestvsantimitotičeskoiaktivnostʹûnabazevirtualʹnoiorganizaciicslabgrid AT spívaksí vysokopropusknoiskriningveŝestvsantimitotičeskoiaktivnostʹûnabazevirtualʹnoiorganizaciicslabgrid AT êmecʹaí vysokopropusknoiskriningveŝestvsantimitotičeskoiaktivnostʹûnabazevirtualʹnoiorganizaciicslabgrid AT kalʹčenkoví vysokopropusknoiskriningveŝestvsantimitotičeskoiaktivnostʹûnabazevirtualʹnoiorganizaciicslabgrid AT blûmâb vysokopropusknoiskriningveŝestvsantimitotičeskoiaktivnostʹûnabazevirtualʹnoiorganizaciicslabgrid AT karpovpa highthroughputscreeningofnewantimitoticcompoundsbasedonpotentialofvirtualorganizationcslabgrid AT bricunvm highthroughputscreeningofnewantimitoticcompoundsbasedonpotentialofvirtualorganizationcslabgrid AT raêvsʹkiiov highthroughputscreeningofnewantimitoticcompoundsbasedonpotentialofvirtualorganizationcslabgrid AT demčukom highthroughputscreeningofnewantimitoticcompoundsbasedonpotentialofvirtualorganizationcslabgrid AT pidûramo highthroughputscreeningofnewantimitoticcompoundsbasedonpotentialofvirtualorganizationcslabgrid AT ožerêdovsp highthroughputscreeningofnewantimitoticcompoundsbasedonpotentialofvirtualorganizationcslabgrid AT samofalovado highthroughputscreeningofnewantimitoticcompoundsbasedonpotentialofvirtualorganizationcslabgrid AT spívaksí highthroughputscreeningofnewantimitoticcompoundsbasedonpotentialofvirtualorganizationcslabgrid AT êmecʹaí highthroughputscreeningofnewantimitoticcompoundsbasedonpotentialofvirtualorganizationcslabgrid AT kalʹčenkoví highthroughputscreeningofnewantimitoticcompoundsbasedonpotentialofvirtualorganizationcslabgrid AT blûmâb highthroughputscreeningofnewantimitoticcompoundsbasedonpotentialofvirtualorganizationcslabgrid |
| first_indexed |
2025-12-07T20:46:24Z |
| last_indexed |
2025-12-07T20:46:24Z |
| _version_ |
1850883843435790336 |