Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro
У рамках реалізації головної мети створеної в УНГ віртуальної організації CSLabGrid було виконано пошук нових
 протитуберкульозних сполук. З використанням встановленої на IFBG Claster програми FlexX і моделі чотирьох перспективних сайтів зв’язування лігандів на поверхні FtsZ-білка Mycobacter...
Saved in:
| Published in: | Наука та інновації |
|---|---|
| Date: | 2016 |
| Main Authors: | , , , , , , , , , , |
| Format: | Article |
| Language: | Ukrainian |
| Published: |
Видавничий дім "Академперіодика" НАН України
2016
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/117288 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro / П.А. Карпов, О.М. Демчук, В.М. Брицун, Д.І. Литвин, М.О. Пидюра, О.В. Раєвський, Д.О. Самофалова, С.І. Співак, Д.М. Волочнюк, А.І. Ємець, Я.Б. Блюм // Наука та інновації. — 2016. — Т. 12, № 3. — С. 44-59. — Бібліогр.: 57 назв. — укр. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862708235156324352 |
|---|---|
| author | Карпов, П.А. Демчук, О.М. Брицун, В.М. Литвин, Д.І. Пидюра, М.О. Раєвський, О.В. Самофалова, Д.О. Співак, С.І. Волочнюк, Д.М. Ємець, А.І. Блюм, Я.Б. |
| author_facet | Карпов, П.А. Демчук, О.М. Брицун, В.М. Литвин, Д.І. Пидюра, М.О. Раєвський, О.В. Самофалова, Д.О. Співак, С.І. Волочнюк, Д.М. Ємець, А.І. Блюм, Я.Б. |
| citation_txt | Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro / П.А. Карпов, О.М. Демчук, В.М. Брицун, Д.І. Литвин, М.О. Пидюра, О.В. Раєвський, Д.О. Самофалова, С.І. Співак, Д.М. Волочнюк, А.І. Ємець, Я.Б. Блюм // Наука та інновації. — 2016. — Т. 12, № 3. — С. 44-59. — Бібліогр.: 57 назв. — укр. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Наука та інновації |
| description | У рамках реалізації головної мети створеної в УНГ віртуальної організації CSLabGrid було виконано пошук нових
протитуберкульозних сполук. З використанням встановленої на IFBG Claster програми FlexX і моделі чотирьох перспективних сайтів зв’язування лігандів на поверхні FtsZ-білка Mycobacterium tuberculosis було виконано скринінг бази
даних, що містила 2886 сполук, синтезованих в Інституті органічної хімії НАН України. На підставі показників LE і ΔG, результатів докінгу в програмі CCDC Gold і обрахунку молекулярної динаміки комплексів було відібрано групу перспективних інгібіторів FtsZ. Під час експериментальної перевірки in vitro шість речовин проявили найвищу ефективність інгібування ГТФ-азної активності FtsZ-білка. Також за результатами експериментальної оцінки in vitro було обрано три
речовини, які водночас проявляють максимальне пригнічення полімеризації та ГТФ-азної активності FtsZ-білка.
В рамках реализации главной цели созданной в УНГ
виртуальной организации CSLabGrіd был выполнен поиск новых противотуберкулезных соединений. С использованием установленной на ІFBG Claster программы Flex и модели четырех перспективных сайтов связывания лигандов на поверхности FtsZ-белка Mycobacterіum
tuberculosіs было выполнено скрининг базы данных, которая содержала 2886 соединений, синтезированных в
Институте органической химии НАН Украины. На основании показателей LE и ΔG, результатов докинга в
программе CCDC Gold и обсчета молекулярной динамики комплексов была отобрана группа перспективных ингибиторов Fts. Во время экспериментальной проверки іn
vіtro шесть веществ проявили высочайшую эффективность ингибирования ГТФ-азной активности FtsZ-белка. Также по результатам экспериментальной оценки іn
vіtro было избрано три вещества, которые одновременно
проявляют максимальное угнетение полимеризации и ГТФ-азной активности FtsZ-белка.
In the framework of UNG virtual organization CSLab-
Grid, high-throughput molecular screening was performed
for new anti-TB compounds. Using program FlexX installed
on IFBG Claster and models of four perspective
ligand binding sites on the surface of FtsZ of Mycobacterium
tuberculosis, virtual screening was performed for database
containing 2886 compounds synthesized in the Institute
of Organic Chemistry of NAS of Ukraine. Based on
LE and ΔG score, docking scores of CCDC Gold, and results
of molecular dynamics, we selected a group of perspective
FtsZ inhibitors. In vitro validation have revealed 6 compounds with the highest inhibition of GTPase activity
of FtsZ. Also, based on in vitro experiment, we have selected three compounds exhibiting both - strong inhibition of FtsZ polymerization and inhibition of GTPase activity.
|
| first_indexed | 2025-12-07T17:10:17Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-117288 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 1815-2066 |
| language | Ukrainian |
| last_indexed | 2025-12-07T17:10:17Z |
| publishDate | 2016 |
| publisher | Видавничий дім "Академперіодика" НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Карпов, П.А. Демчук, О.М. Брицун, В.М. Литвин, Д.І. Пидюра, М.О. Раєвський, О.В. Самофалова, Д.О. Співак, С.І. Волочнюк, Д.М. Ємець, А.І. Блюм, Я.Б. 2017-05-21T18:45:22Z 2017-05-21T18:45:22Z 2016 Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro / П.А. Карпов, О.М. Демчук, В.М. Брицун, Д.І. Литвин, М.О. Пидюра, О.В. Раєвський, Д.О. Самофалова, С.І. Співак, Д.М. Волочнюк, А.І. Ємець, Я.Б. Блюм // Наука та інновації. — 2016. — Т. 12, № 3. — С. 44-59. — Бібліогр.: 57 назв. — укр. 1815-2066 DOI: doi.org/10.15407/scin12.03.044 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/117288 У рамках реалізації головної мети створеної в УНГ віртуальної організації CSLabGrid було виконано пошук нових
 протитуберкульозних сполук. З використанням встановленої на IFBG Claster програми FlexX і моделі чотирьох перспективних сайтів зв’язування лігандів на поверхні FtsZ-білка Mycobacterium tuberculosis було виконано скринінг бази
 даних, що містила 2886 сполук, синтезованих в Інституті органічної хімії НАН України. На підставі показників LE і ΔG, результатів докінгу в програмі CCDC Gold і обрахунку молекулярної динаміки комплексів було відібрано групу перспективних інгібіторів FtsZ. Під час експериментальної перевірки in vitro шість речовин проявили найвищу ефективність інгібування ГТФ-азної активності FtsZ-білка. Також за результатами експериментальної оцінки in vitro було обрано три
 речовини, які водночас проявляють максимальне пригнічення полімеризації та ГТФ-азної активності FtsZ-білка. В рамках реализации главной цели созданной в УНГ
 виртуальной организации CSLabGrіd был выполнен поиск новых противотуберкулезных соединений. С использованием установленной на ІFBG Claster программы Flex и модели четырех перспективных сайтов связывания лигандов на поверхности FtsZ-белка Mycobacterіum
 tuberculosіs было выполнено скрининг базы данных, которая содержала 2886 соединений, синтезированных в
 Институте органической химии НАН Украины. На основании показателей LE и ΔG, результатов докинга в
 программе CCDC Gold и обсчета молекулярной динамики комплексов была отобрана группа перспективных ингибиторов Fts. Во время экспериментальной проверки іn
 vіtro шесть веществ проявили высочайшую эффективность ингибирования ГТФ-азной активности FtsZ-белка. Также по результатам экспериментальной оценки іn
 vіtro было избрано три вещества, которые одновременно
 проявляют максимальное угнетение полимеризации и ГТФ-азной активности FtsZ-белка. In the framework of UNG virtual organization CSLab-
 Grid, high-throughput molecular screening was performed
 for new anti-TB compounds. Using program FlexX installed
 on IFBG Claster and models of four perspective
 ligand binding sites on the surface of FtsZ of Mycobacterium
 tuberculosis, virtual screening was performed for database
 containing 2886 compounds synthesized in the Institute
 of Organic Chemistry of NAS of Ukraine. Based on
 LE and ΔG score, docking scores of CCDC Gold, and results
 of molecular dynamics, we selected a group of perspective
 FtsZ inhibitors. In vitro validation have revealed 6 compounds with the highest inhibition of GTPase activity
 of FtsZ. Also, based on in vitro experiment, we have selected three compounds exhibiting both - strong inhibition of FtsZ polymerization and inhibition of GTPase activity. Дослідження були підтримані проектом цільової комплексної програми фундаментальних
 досліджень НАН України «Фундаментальні проблеми створення нових речовин і матеріалів хімічного виробництва» (2012–13 рр.): «Пошук
 та оцінка протитуберкульозної активності
 нових сполук гетероциклічного ряду на основі
 структурно-біологічного докінгу та дизайну»,
 (№ держреєстрації 0112U003389). Частина досліджень, безпосередньо пов’язана зі створенням баз даних і використанням обчислень у Ґрід,
 була підтримана проектом Державної цільової
 науково-технічної програми впровадження і
 застосування Ґрід-технологій на 2009–13 рр.
 «Використання Ґрід-технологій у фундаментальних та прикладних дослідженнях цитоскелету шляхом створення та розвитку віртуальної організації CSLabGrid» (2012 р., № держреєстрації 0112U004000). uk Видавничий дім "Академперіодика" НАН України Наука та інновації Наукові основи інноваційної діяльності Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro Новые имидазольные производные как ингибиторы FtsZ-белков микобактерий: от высокопропускного молекулярного скрининга в Грид до экспериментального анализа іn vіtro New Imidazole Inhibitors of Mycobacterial FtsZ: the Way from High-Throughput Molecular Screening in Grid up to in vitro Verification Article published earlier |
| spellingShingle | Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro Карпов, П.А. Демчук, О.М. Брицун, В.М. Литвин, Д.І. Пидюра, М.О. Раєвський, О.В. Самофалова, Д.О. Співак, С.І. Волочнюк, Д.М. Ємець, А.І. Блюм, Я.Б. Наукові основи інноваційної діяльності |
| title | Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro |
| title_alt | Новые имидазольные производные как ингибиторы FtsZ-белков микобактерий: от высокопропускного молекулярного скрининга в Грид до экспериментального анализа іn vіtro New Imidazole Inhibitors of Mycobacterial FtsZ: the Way from High-Throughput Molecular Screening in Grid up to in vitro Verification |
| title_full | Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro |
| title_fullStr | Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro |
| title_full_unstemmed | Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro |
| title_short | Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro |
| title_sort | нові імідазольні похідні як інгібітори ftsz-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в ґрід до експериментального аналізу in vitro |
| topic | Наукові основи інноваційної діяльності |
| topic_facet | Наукові основи інноваційної діяльності |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/117288 |
| work_keys_str_mv | AT karpovpa novíímídazolʹnípohídníâkíngíbítoriftszbílkívmíkobakteríivídvisokopropusknogomolekulârnogoskrinínguvgríddoeksperimentalʹnogoanalízuinvitro AT demčukom novíímídazolʹnípohídníâkíngíbítoriftszbílkívmíkobakteríivídvisokopropusknogomolekulârnogoskrinínguvgríddoeksperimentalʹnogoanalízuinvitro AT bricunvm novíímídazolʹnípohídníâkíngíbítoriftszbílkívmíkobakteríivídvisokopropusknogomolekulârnogoskrinínguvgríddoeksperimentalʹnogoanalízuinvitro AT litvindí novíímídazolʹnípohídníâkíngíbítoriftszbílkívmíkobakteríivídvisokopropusknogomolekulârnogoskrinínguvgríddoeksperimentalʹnogoanalízuinvitro AT pidûramo novíímídazolʹnípohídníâkíngíbítoriftszbílkívmíkobakteríivídvisokopropusknogomolekulârnogoskrinínguvgríddoeksperimentalʹnogoanalízuinvitro AT raêvsʹkiiov novíímídazolʹnípohídníâkíngíbítoriftszbílkívmíkobakteríivídvisokopropusknogomolekulârnogoskrinínguvgríddoeksperimentalʹnogoanalízuinvitro AT samofalovado novíímídazolʹnípohídníâkíngíbítoriftszbílkívmíkobakteríivídvisokopropusknogomolekulârnogoskrinínguvgríddoeksperimentalʹnogoanalízuinvitro AT spívaksí novíímídazolʹnípohídníâkíngíbítoriftszbílkívmíkobakteríivídvisokopropusknogomolekulârnogoskrinínguvgríddoeksperimentalʹnogoanalízuinvitro AT voločnûkdm novíímídazolʹnípohídníâkíngíbítoriftszbílkívmíkobakteríivídvisokopropusknogomolekulârnogoskrinínguvgríddoeksperimentalʹnogoanalízuinvitro AT êmecʹaí novíímídazolʹnípohídníâkíngíbítoriftszbílkívmíkobakteríivídvisokopropusknogomolekulârnogoskrinínguvgríddoeksperimentalʹnogoanalízuinvitro AT blûmâb novíímídazolʹnípohídníâkíngíbítoriftszbílkívmíkobakteríivídvisokopropusknogomolekulârnogoskrinínguvgríddoeksperimentalʹnogoanalízuinvitro AT karpovpa novyeimidazolʹnyeproizvodnyekakingibitoryftszbelkovmikobakteriiotvysokopropusknogomolekulârnogoskriningavgriddoéksperimentalʹnogoanalizaínvítro AT demčukom novyeimidazolʹnyeproizvodnyekakingibitoryftszbelkovmikobakteriiotvysokopropusknogomolekulârnogoskriningavgriddoéksperimentalʹnogoanalizaínvítro AT bricunvm novyeimidazolʹnyeproizvodnyekakingibitoryftszbelkovmikobakteriiotvysokopropusknogomolekulârnogoskriningavgriddoéksperimentalʹnogoanalizaínvítro AT litvindí novyeimidazolʹnyeproizvodnyekakingibitoryftszbelkovmikobakteriiotvysokopropusknogomolekulârnogoskriningavgriddoéksperimentalʹnogoanalizaínvítro AT pidûramo novyeimidazolʹnyeproizvodnyekakingibitoryftszbelkovmikobakteriiotvysokopropusknogomolekulârnogoskriningavgriddoéksperimentalʹnogoanalizaínvítro AT raêvsʹkiiov novyeimidazolʹnyeproizvodnyekakingibitoryftszbelkovmikobakteriiotvysokopropusknogomolekulârnogoskriningavgriddoéksperimentalʹnogoanalizaínvítro AT samofalovado novyeimidazolʹnyeproizvodnyekakingibitoryftszbelkovmikobakteriiotvysokopropusknogomolekulârnogoskriningavgriddoéksperimentalʹnogoanalizaínvítro AT spívaksí novyeimidazolʹnyeproizvodnyekakingibitoryftszbelkovmikobakteriiotvysokopropusknogomolekulârnogoskriningavgriddoéksperimentalʹnogoanalizaínvítro AT voločnûkdm novyeimidazolʹnyeproizvodnyekakingibitoryftszbelkovmikobakteriiotvysokopropusknogomolekulârnogoskriningavgriddoéksperimentalʹnogoanalizaínvítro AT êmecʹaí novyeimidazolʹnyeproizvodnyekakingibitoryftszbelkovmikobakteriiotvysokopropusknogomolekulârnogoskriningavgriddoéksperimentalʹnogoanalizaínvítro AT blûmâb novyeimidazolʹnyeproizvodnyekakingibitoryftszbelkovmikobakteriiotvysokopropusknogomolekulârnogoskriningavgriddoéksperimentalʹnogoanalizaínvítro AT karpovpa newimidazoleinhibitorsofmycobacterialftszthewayfromhighthroughputmolecularscreeningingriduptoinvitroverification AT demčukom newimidazoleinhibitorsofmycobacterialftszthewayfromhighthroughputmolecularscreeningingriduptoinvitroverification AT bricunvm newimidazoleinhibitorsofmycobacterialftszthewayfromhighthroughputmolecularscreeningingriduptoinvitroverification AT litvindí newimidazoleinhibitorsofmycobacterialftszthewayfromhighthroughputmolecularscreeningingriduptoinvitroverification AT pidûramo newimidazoleinhibitorsofmycobacterialftszthewayfromhighthroughputmolecularscreeningingriduptoinvitroverification AT raêvsʹkiiov newimidazoleinhibitorsofmycobacterialftszthewayfromhighthroughputmolecularscreeningingriduptoinvitroverification AT samofalovado newimidazoleinhibitorsofmycobacterialftszthewayfromhighthroughputmolecularscreeningingriduptoinvitroverification AT spívaksí newimidazoleinhibitorsofmycobacterialftszthewayfromhighthroughputmolecularscreeningingriduptoinvitroverification AT voločnûkdm newimidazoleinhibitorsofmycobacterialftszthewayfromhighthroughputmolecularscreeningingriduptoinvitroverification AT êmecʹaí newimidazoleinhibitorsofmycobacterialftszthewayfromhighthroughputmolecularscreeningingriduptoinvitroverification AT blûmâb newimidazoleinhibitorsofmycobacterialftszthewayfromhighthroughputmolecularscreeningingriduptoinvitroverification |