Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr
С помощью низкотемпературной ИК фурье-спектроскопии матричной изоляции и квантово-химических
 расчетов методами DFT и MP2 исследовано конформационное равновесие молекул нуклеозида
 2'-дезоксиуридина (dU) в низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Установлено, что в низкотемпературны...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Физика низких температур |
|---|---|
| Datum: | 2008 |
| 1. Verfasser: | |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Russisch |
| Veröffentlicht: |
Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України
2008
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/117480 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr
 / А.Ю. Иванов // Физика низких температур. — 2008. — Т. 34, № 9. — С. 962-969. — Бібліогр.: 30 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862736234670981120 |
|---|---|
| author | Иванов, А.Ю. |
| author_facet | Иванов, А.Ю. |
| citation_txt | Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr
 / А.Ю. Иванов // Физика низких температур. — 2008. — Т. 34, № 9. — С. 962-969. — Бібліогр.: 30 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Физика низких температур |
| description | С помощью низкотемпературной ИК фурье-спектроскопии матричной изоляции и квантово-химических
расчетов методами DFT и MP2 исследовано конформационное равновесие молекул нуклеозида
2'-дезоксиуридина (dU) в низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Установлено, что в низкотемпературных
матрицах доминируют два анти-конформера dU с разными структурами сахарного кольца:
С2'-эндо и С3'-эндо. Основной син-конформер стабилизирован внутримолекулярной водородной
связью O5'H—O2, а С2'-эндо является доминирующей конформацией его дезоксирибозного кольца в
низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Продемонстрирована возможность присутствия в матричных
образцах минорных син-конформеров без внутримолекулярной водородной связи O5'H—O2. Обнаружено
влияние матрицы на ориентацию гидроксильной группы O3'H сахарного кольца основного
син-конформера.
За допомогою низькотемпературної ІЧ фур’є-спектроскопії матричної ізоляції та квантовох
імічних розрахунків методами DFT та MP2 досліджено конформаційну рівновагу молекул нуклеозиду
2'-дезоксиуридину (dU) у низькотемпературних матрицях Ar та Kr. Встановлено, що у низькотемпературних
матрицях домінують два анти-конформера dU з різними структурами цукрового кільця:
С2'-ендо та С3'-ендо. Основний син-конформер стабілізовано внутрішньо-молекулярним водневим
зв’язком O5'H—O2, а С2'-ендо є домінуючою конформацією його дезоксирібозного кільця у низькотемпературних
матрицях Ar та Kr. Продемонстровано можливість присутності у матричних зразках
мінорних син-конформерів, які не мають внутрішньо-молекулярного водневого зв’язку O5'H—O2.
Виявлено вплив матриці на орієнтацію гідроксильної групи O3'H цукрового кільця основного синконформера.
The conformational equilibrium of 2'-deoxyuridine
(dU) in the low-temperature matrices of Ar
and Kr was investigated by using FTIR matrix isolation
spectroscopy and quantum chemical calculations
with the DFT and MP2 methods. It is found
that two anti-conformers of dU with different structures
of the sugar ring (С2'-endo and С3'-endo) are
dominated. The main syn-conformer is stabilized
by the intramolecular hydrogen bond O5'H…O2
and has a С2'-endo conformation of the deoxyribose
ring in the inert Ar and Kr matrices. It is demonstrated
that in the low-temperature matrices
there may occur minor minor syn-conformers without
intramolecular hydrogen bond O5'H…O2. The
orientation of hydroxyl group O3'H of the sugar
ring is found to depend on matrix.
|
| first_indexed | 2025-12-07T19:52:42Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-117480 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0132-6414 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-12-07T19:52:42Z |
| publishDate | 2008 |
| publisher | Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Иванов, А.Ю. 2017-05-23T17:10:20Z 2017-05-23T17:10:20Z 2008 Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr
 / А.Ю. Иванов // Физика низких температур. — 2008. — Т. 34, № 9. — С. 962-969. — Бібліогр.: 30 назв. — рос. 0132-6414 PACS : 33.15.–e;67.80.–s https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/117480 С помощью низкотемпературной ИК фурье-спектроскопии матричной изоляции и квантово-химических
 расчетов методами DFT и MP2 исследовано конформационное равновесие молекул нуклеозида
 2'-дезоксиуридина (dU) в низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Установлено, что в низкотемпературных
 матрицах доминируют два анти-конформера dU с разными структурами сахарного кольца:
 С2'-эндо и С3'-эндо. Основной син-конформер стабилизирован внутримолекулярной водородной
 связью O5'H—O2, а С2'-эндо является доминирующей конформацией его дезоксирибозного кольца в
 низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Продемонстрирована возможность присутствия в матричных
 образцах минорных син-конформеров без внутримолекулярной водородной связи O5'H—O2. Обнаружено
 влияние матрицы на ориентацию гидроксильной группы O3'H сахарного кольца основного
 син-конформера. За допомогою низькотемпературної ІЧ фур’є-спектроскопії матричної ізоляції та квантовох
 імічних розрахунків методами DFT та MP2 досліджено конформаційну рівновагу молекул нуклеозиду
 2'-дезоксиуридину (dU) у низькотемпературних матрицях Ar та Kr. Встановлено, що у низькотемпературних
 матрицях домінують два анти-конформера dU з різними структурами цукрового кільця:
 С2'-ендо та С3'-ендо. Основний син-конформер стабілізовано внутрішньо-молекулярним водневим
 зв’язком O5'H—O2, а С2'-ендо є домінуючою конформацією його дезоксирібозного кільця у низькотемпературних
 матрицях Ar та Kr. Продемонстровано можливість присутності у матричних зразках
 мінорних син-конформерів, які не мають внутрішньо-молекулярного водневого зв’язку O5'H—O2.
 Виявлено вплив матриці на орієнтацію гідроксильної групи O3'H цукрового кільця основного синконформера. The conformational equilibrium of 2'-deoxyuridine
 (dU) in the low-temperature matrices of Ar
 and Kr was investigated by using FTIR matrix isolation
 spectroscopy and quantum chemical calculations
 with the DFT and MP2 methods. It is found
 that two anti-conformers of dU with different structures
 of the sugar ring (С2'-endo and С3'-endo) are
 dominated. The main syn-conformer is stabilized
 by the intramolecular hydrogen bond O5'H…O2
 and has a С2'-endo conformation of the deoxyribose
 ring in the inert Ar and Kr matrices. It is demonstrated
 that in the low-temperature matrices
 there may occur minor minor syn-conformers without
 intramolecular hydrogen bond O5'H…O2. The
 orientation of hydroxyl group O3'H of the sugar
 ring is found to depend on matrix. Работа выполнена при финансовой поддержке
 НАН Украины. Автор благодарит А.М. Плохотниченко
 за полезные дискуссии в процессе написания
 статьи. ru Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України Физика низких температур Физические свойства криокристаллов Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr The peculiarities of conformational structures of 2'-deoxyuridine isolated in the low-temperature matrices of Ar and Kr Article published earlier |
| spellingShingle | Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr Иванов, А.Ю. Физические свойства криокристаллов |
| title | Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr |
| title_alt | The peculiarities of conformational structures of 2'-deoxyuridine isolated in the low-temperature matrices of Ar and Kr |
| title_full | Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr |
| title_fullStr | Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr |
| title_full_unstemmed | Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr |
| title_short | Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr |
| title_sort | особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах ar и kr |
| topic | Физические свойства криокристаллов |
| topic_facet | Физические свойства криокристаллов |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/117480 |
| work_keys_str_mv | AT ivanovaû osobennostikonformacionnyhstruktur2dezoksiuridinaizolirovannyhvnizkotemperaturnyhmatricaharikr AT ivanovaû thepeculiaritiesofconformationalstructuresof2deoxyuridineisolatedinthelowtemperaturematricesofarandkr |