Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr

Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr

С помощью низкотемпературной ИК фурье-спектроскопии матричной изоляции и квантово-химических расчетов методами DFT и MP2 исследовано конформационное равновесие молекул нуклеозида 2'-дезоксиуридина (dU) в низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Установлено, что в низкотемпературных матрицах доми...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Опубліковано в: :Физика низких температур
Дата:2008
Автор: Иванов, А.Ю.
Формат: Стаття
Мова:Russian
Опубліковано: Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України 2008
Теми:
Физические свойства криокристаллов
Онлайн доступ:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/117480
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr / А.Ю. Иванов // Физика низких температур. — 2008. — Т. 34, № 9. — С. 962-969. — Бібліогр.: 30 назв. — рос.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-117480
record_format dspace
spelling Иванов, А.Ю.
2017-05-23T17:10:20Z
2017-05-23T17:10:20Z
2008
Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr / А.Ю. Иванов // Физика низких температур. — 2008. — Т. 34, № 9. — С. 962-969. — Бібліогр.: 30 назв. — рос.
0132-6414
PACS : 33.15.–e;67.80.–s
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/117480
С помощью низкотемпературной ИК фурье-спектроскопии матричной изоляции и квантово-химических расчетов методами DFT и MP2 исследовано конформационное равновесие молекул нуклеозида 2'-дезоксиуридина (dU) в низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Установлено, что в низкотемпературных матрицах доминируют два анти-конформера dU с разными структурами сахарного кольца: С2'-эндо и С3'-эндо. Основной син-конформер стабилизирован внутримолекулярной водородной связью O5'H—O2, а С2'-эндо является доминирующей конформацией его дезоксирибозного кольца в низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Продемонстрирована возможность присутствия в матричных образцах минорных син-конформеров без внутримолекулярной водородной связи O5'H—O2. Обнаружено влияние матрицы на ориентацию гидроксильной группы O3'H сахарного кольца основного син-конформера.
За допомогою низькотемпературної ІЧ фур’є-спектроскопії матричної ізоляції та квантовох імічних розрахунків методами DFT та MP2 досліджено конформаційну рівновагу молекул нуклеозиду 2'-дезоксиуридину (dU) у низькотемпературних матрицях Ar та Kr. Встановлено, що у низькотемпературних матрицях домінують два анти-конформера dU з різними структурами цукрового кільця: С2'-ендо та С3'-ендо. Основний син-конформер стабілізовано внутрішньо-молекулярним водневим зв’язком O5'H—O2, а С2'-ендо є домінуючою конформацією його дезоксирібозного кільця у низькотемпературних матрицях Ar та Kr. Продемонстровано можливість присутності у матричних зразках мінорних син-конформерів, які не мають внутрішньо-молекулярного водневого зв’язку O5'H—O2. Виявлено вплив матриці на орієнтацію гідроксильної групи O3'H цукрового кільця основного синконформера.
The conformational equilibrium of 2'-deoxyuridine (dU) in the low-temperature matrices of Ar and Kr was investigated by using FTIR matrix isolation spectroscopy and quantum chemical calculations with the DFT and MP2 methods. It is found that two anti-conformers of dU with different structures of the sugar ring (С2'-endo and С3'-endo) are dominated. The main syn-conformer is stabilized by the intramolecular hydrogen bond O5'H…O2 and has a С2'-endo conformation of the deoxyribose ring in the inert Ar and Kr matrices. It is demonstrated that in the low-temperature matrices there may occur minor minor syn-conformers without intramolecular hydrogen bond O5'H…O2. The orientation of hydroxyl group O3'H of the sugar ring is found to depend on matrix.
Работа выполнена при финансовой поддержке НАН Украины. Автор благодарит А.М. Плохотниченко за полезные дискуссии в процессе написания статьи.
ru
Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України
Физика низких температур
Физические свойства криокристаллов
Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr
The peculiarities of conformational structures of 2'-deoxyuridine isolated in the low-temperature matrices of Ar and Kr
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr
spellingShingle Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr
Иванов, А.Ю.
Физические свойства криокристаллов
title_short Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr
title_full Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr
title_fullStr Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr
title_full_unstemmed Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr
title_sort особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах ar и kr
author Иванов, А.Ю.
author_facet Иванов, А.Ю.
topic Физические свойства криокристаллов
topic_facet Физические свойства криокристаллов
publishDate 2008
language Russian
container_title Физика низких температур
publisher Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України
format Article
title_alt The peculiarities of conformational structures of 2'-deoxyuridine isolated in the low-temperature matrices of Ar and Kr
description С помощью низкотемпературной ИК фурье-спектроскопии матричной изоляции и квантово-химических расчетов методами DFT и MP2 исследовано конформационное равновесие молекул нуклеозида 2'-дезоксиуридина (dU) в низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Установлено, что в низкотемпературных матрицах доминируют два анти-конформера dU с разными структурами сахарного кольца: С2'-эндо и С3'-эндо. Основной син-конформер стабилизирован внутримолекулярной водородной связью O5'H—O2, а С2'-эндо является доминирующей конформацией его дезоксирибозного кольца в низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Продемонстрирована возможность присутствия в матричных образцах минорных син-конформеров без внутримолекулярной водородной связи O5'H—O2. Обнаружено влияние матрицы на ориентацию гидроксильной группы O3'H сахарного кольца основного син-конформера. За допомогою низькотемпературної ІЧ фур’є-спектроскопії матричної ізоляції та квантовох імічних розрахунків методами DFT та MP2 досліджено конформаційну рівновагу молекул нуклеозиду 2'-дезоксиуридину (dU) у низькотемпературних матрицях Ar та Kr. Встановлено, що у низькотемпературних матрицях домінують два анти-конформера dU з різними структурами цукрового кільця: С2'-ендо та С3'-ендо. Основний син-конформер стабілізовано внутрішньо-молекулярним водневим зв’язком O5'H—O2, а С2'-ендо є домінуючою конформацією його дезоксирібозного кільця у низькотемпературних матрицях Ar та Kr. Продемонстровано можливість присутності у матричних зразках мінорних син-конформерів, які не мають внутрішньо-молекулярного водневого зв’язку O5'H—O2. Виявлено вплив матриці на орієнтацію гідроксильної групи O3'H цукрового кільця основного синконформера. The conformational equilibrium of 2'-deoxyuridine (dU) in the low-temperature matrices of Ar and Kr was investigated by using FTIR matrix isolation spectroscopy and quantum chemical calculations with the DFT and MP2 methods. It is found that two anti-conformers of dU with different structures of the sugar ring (С2'-endo and С3'-endo) are dominated. The main syn-conformer is stabilized by the intramolecular hydrogen bond O5'H…O2 and has a С2'-endo conformation of the deoxyribose ring in the inert Ar and Kr matrices. It is demonstrated that in the low-temperature matrices there may occur minor minor syn-conformers without intramolecular hydrogen bond O5'H…O2. The orientation of hydroxyl group O3'H of the sugar ring is found to depend on matrix.
issn 0132-6414
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/117480
citation_txt Особенности конформационных структур 2'-дезоксиуридина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar и Kr / А.Ю. Иванов // Физика низких температур. — 2008. — Т. 34, № 9. — С. 962-969. — Бібліогр.: 30 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT ivanovaû osobennostikonformacionnyhstruktur2dezoksiuridinaizolirovannyhvnizkotemperaturnyhmatricaharikr
AT ivanovaû thepeculiaritiesofconformationalstructuresof2deoxyuridineisolatedinthelowtemperaturematricesofarandkr
first_indexed 2025-12-07T19:52:42Z
last_indexed 2025-12-07T19:52:42Z
_version_ 1850880465837228032

Схожі ресурси