Polymorphisms in the 5′-UTR of PTEN and other gene polymorphisms in normal Japanese individuals

Polymorphisms in the 5′-UTR of PTEN and other gene polymorphisms in normal Japanese individuals

Polymorphisms are distributed differently in populations, including those of regions, ethnic groups, and diseased patients. In order to investigate variation in nucleotide sequences in normal individuals, we isolated genomic DNA from the blood of healthy Japanese individuals and sequenced the 5...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Цитология и генетика
Datum:2012
Hauptverfasser: Ohsaka, Y., Nishino, H.
Format: Artikel
Sprache:English
Veröffentlicht: Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України 2012
Schlagworte:
Оригинальные работы
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126462
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Polymorphisms in the 5′-UTR of PTEN and other gene polymorphisms in normal Japanese individuals / Y. Ohsaka, H. Nishino // Цитология и генетика. — 2012. — Т. 46, № 2. — С. 24-35. — Бібліогр.: 58 назв. — англ.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-126462
record_format dspace
spelling Ohsaka, Y.
Nishino, H.
2017-11-24T10:17:05Z
2017-11-24T10:17:05Z
2012
Polymorphisms in the 5′-UTR of PTEN and other gene polymorphisms in normal Japanese individuals / Y. Ohsaka, H. Nishino // Цитология и генетика. — 2012. — Т. 46, № 2. — С. 24-35. — Бібліогр.: 58 назв. — англ.
0564-3783
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126462
Polymorphisms are distributed differently in populations, including those of regions, ethnic groups, and diseased patients. In order to investigate variation in nucleotide sequences in normal individuals, we isolated genomic DNA from the blood of healthy Japanese individuals and sequenced the 5'-untranslated region (5'- UTR) of the phosphatase and tensin homolog deleted on chromosome 10 (PTEN) gene and the gene promoter, intron, and exon nucleotides of p53, p14ARF, murine double minute 2 (MDM2), and the β2- and β3-adrenoceptor (-AR). We found polymorphisms in these regions, including a deletion at positions –465 to –463 and a substitution at position –404 in PTEN and a substitution at position –4924 in p14ARF, in normal individuals. Individuals with or without the PTEN polymorphism harbored a different distribution of polymorphisms, including simultaneous alterations in nucleotides of p53, MDM2, and β3-AR, and also harbored some polymorphic nucleotides located in the same set of associatively altered nucleotides. Our results show that multiple nucleotides, including the PTEN nucleotides, are altered in normal Japanese individuals and provide useful information for genotyping studies in individuals and populations.
Полиморфизмы широко распространены в популяциях, включая регионы, этнические группы и больных пациентов. Для исследования изменчивости нуклеотидных последовательностей у нормальных индивидов , мы выделили геномную ДНК из крови здоровых японцев и секвенировали 5′-нетранслируемый участок (5′-UTR) гена фосфатазы и гомолога тензина (PTEN), промоторные последовательности, интроны и экзоны генов p53 и p14ARF, ингибитора супрессора опухолевого роста p53 (MDM2) и генов β2- and β3-адренореце (-AR). Мы обнаружили полиморфизм по этим участкам, включая делецию в положении с −465 to −463 и замену в положении −404 в PTEN и замену в положении −4924 в p14ARF у нормальных индивидов. Индивиды с и без полиморфизма PTEN имели различное распределение полиморфизма, включая одновременные изменения в нуклеотидах p53, MDM2 и 3-AR, и также имели полиморфные нуклеотиды, локализованные в том же наборе совместно измененных нуклеотидов. Наши результаты показывают, что множественные нуклеотиды, включая нуклеотиды PTEN, изменены у нормальных японских индивидов и дают полезную информацию для исследований по генотипированию индивидов и популяций.
This work was supported in part by grants-inaid from the Ministry of Education, Science, and Culture of Japan, and ProBRAIN.
en
Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
Цитология и генетика
Оригинальные работы
Polymorphisms in the 5′-UTR of PTEN and other gene polymorphisms in normal Japanese individuals
Полиморфизм 5′-UTR гена PTEN и другие генные полиморфизмы среди здоровых японских индивидов
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Polymorphisms in the 5′-UTR of PTEN and other gene polymorphisms in normal Japanese individuals
spellingShingle Polymorphisms in the 5′-UTR of PTEN and other gene polymorphisms in normal Japanese individuals
Ohsaka, Y.
Nishino, H.
Оригинальные работы
title_short Polymorphisms in the 5′-UTR of PTEN and other gene polymorphisms in normal Japanese individuals
title_full Polymorphisms in the 5′-UTR of PTEN and other gene polymorphisms in normal Japanese individuals
title_fullStr Polymorphisms in the 5′-UTR of PTEN and other gene polymorphisms in normal Japanese individuals
title_full_unstemmed Polymorphisms in the 5′-UTR of PTEN and other gene polymorphisms in normal Japanese individuals
title_sort polymorphisms in the 5′-utr of pten and other gene polymorphisms in normal japanese individuals
author Ohsaka, Y.
Nishino, H.
author_facet Ohsaka, Y.
Nishino, H.
topic Оригинальные работы
topic_facet Оригинальные работы
publishDate 2012
language English
container_title Цитология и генетика
publisher Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
format Article
title_alt Полиморфизм 5′-UTR гена PTEN и другие генные полиморфизмы среди здоровых японских индивидов
description Polymorphisms are distributed differently in populations, including those of regions, ethnic groups, and diseased patients. In order to investigate variation in nucleotide sequences in normal individuals, we isolated genomic DNA from the blood of healthy Japanese individuals and sequenced the 5'-untranslated region (5'- UTR) of the phosphatase and tensin homolog deleted on chromosome 10 (PTEN) gene and the gene promoter, intron, and exon nucleotides of p53, p14ARF, murine double minute 2 (MDM2), and the β2- and β3-adrenoceptor (-AR). We found polymorphisms in these regions, including a deletion at positions –465 to –463 and a substitution at position –404 in PTEN and a substitution at position –4924 in p14ARF, in normal individuals. Individuals with or without the PTEN polymorphism harbored a different distribution of polymorphisms, including simultaneous alterations in nucleotides of p53, MDM2, and β3-AR, and also harbored some polymorphic nucleotides located in the same set of associatively altered nucleotides. Our results show that multiple nucleotides, including the PTEN nucleotides, are altered in normal Japanese individuals and provide useful information for genotyping studies in individuals and populations. Полиморфизмы широко распространены в популяциях, включая регионы, этнические группы и больных пациентов. Для исследования изменчивости нуклеотидных последовательностей у нормальных индивидов , мы выделили геномную ДНК из крови здоровых японцев и секвенировали 5′-нетранслируемый участок (5′-UTR) гена фосфатазы и гомолога тензина (PTEN), промоторные последовательности, интроны и экзоны генов p53 и p14ARF, ингибитора супрессора опухолевого роста p53 (MDM2) и генов β2- and β3-адренореце (-AR). Мы обнаружили полиморфизм по этим участкам, включая делецию в положении с −465 to −463 и замену в положении −404 в PTEN и замену в положении −4924 в p14ARF у нормальных индивидов. Индивиды с и без полиморфизма PTEN имели различное распределение полиморфизма, включая одновременные изменения в нуклеотидах p53, MDM2 и 3-AR, и также имели полиморфные нуклеотиды, локализованные в том же наборе совместно измененных нуклеотидов. Наши результаты показывают, что множественные нуклеотиды, включая нуклеотиды PTEN, изменены у нормальных японских индивидов и дают полезную информацию для исследований по генотипированию индивидов и популяций.
issn 0564-3783
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126462
citation_txt Polymorphisms in the 5′-UTR of PTEN and other gene polymorphisms in normal Japanese individuals / Y. Ohsaka, H. Nishino // Цитология и генетика. — 2012. — Т. 46, № 2. — С. 24-35. — Бібліогр.: 58 назв. — англ.
work_keys_str_mv AT ohsakay polymorphismsinthe5utrofptenandothergenepolymorphismsinnormaljapaneseindividuals
AT nishinoh polymorphismsinthe5utrofptenandothergenepolymorphismsinnormaljapaneseindividuals
AT ohsakay polimorfizm5utrgenaptenidrugiegennyepolimorfizmysredizdorovyhâponskihindividov
AT nishinoh polimorfizm5utrgenaptenidrugiegennyepolimorfizmysredizdorovyhâponskihindividov
first_indexed 2025-12-07T18:43:12Z
last_indexed 2025-12-07T18:43:12Z
_version_ 1850876092910403584

Ähnliche Einträge