Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов
Приведен обзор и анализ возможностей применения технологии CUDA для ускорения расчетов в области структурной биологии и биоинформатики. На примере работы с программой HEX 6.1 выполнен сравнительный анализ прироста производительности и качества результатов жесткого докинга низкомолекулярных соединени...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Цитология и генетика |
|---|---|
| Дата: | 2012 |
| Автори: | Демчук, О.Н., Карпов, П.А., Блюм, Я.Б. |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Російська |
| Опубліковано: |
Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
2012
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126471 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов / О.Н. Демчук, П.А. Карпов, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2012. — Т. 46, № 3. — С. 55-64. — Бібліогр.: 54 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of UkraineСхожі ресурси
Сравнительный анализ вторичной структуры тубулинов и FtsZ-белков
за авторством: Ныпорко, А.Ю., та інші
Опубліковано: (2001)
за авторством: Ныпорко, А.Ю., та інші
Опубліковано: (2001)
Structural profile of ligand-based inhibition of bacterial FtsZ
за авторством: D. S. Ozheriedov, та інші
Опубліковано: (2023)
за авторством: D. S. Ozheriedov, та інші
Опубліковано: (2023)
Ligand-induced variability of the FtsZ protein interdomain cleft site pocket
за авторством: D. S. Ozheriedov, та інші
Опубліковано: (2024)
за авторством: D. S. Ozheriedov, та інші
Опубліковано: (2024)
Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro
за авторством: Карпов, П.А., та інші
Опубліковано: (2016)
за авторством: Карпов, П.А., та інші
Опубліковано: (2016)
Использование технологии CUDA для ускорения вычислений в задачах химической кинетики
за авторством: Сарсембаев, М.C., та інші
Опубліковано: (2020)
за авторством: Сарсембаев, М.C., та інші
Опубліковано: (2020)
New Imidazole Inhibitors of Mycobacterial FtsZ: the Way from High-Throughput Molecular Screening in Grid up to in vitro Verification
за авторством: P. A. Karpov, та інші
Опубліковано: (2016)
за авторством: P. A. Karpov, та інші
Опубліковано: (2016)
Уравнение абсорбции паров низкомолекулярных веществ их растворами
за авторством: Романкевич, О.В.
Опубліковано: (2007)
за авторством: Романкевич, О.В.
Опубліковано: (2007)
Нитротирозилирование как посттрансляционная модификация растительного α-тубулина
за авторством: Блюм, Я.Б., та інші
Опубліковано: (2011)
за авторством: Блюм, Я.Б., та інші
Опубліковано: (2011)
Влияние избирательного связывания лигандов на молекулярное плавление ДНК
за авторством: Фридман, А.С., та інші
Опубліковано: (1987)
за авторством: Фридман, А.С., та інші
Опубліковано: (1987)
Creation of design methods for the CUDA hardware and software platform
за авторством: Pogorilyy, S.D., та інші
Опубліковано: (2025)
за авторством: Pogorilyy, S.D., та інші
Опубліковано: (2025)
Solving the problems of chemical kinetics by using the CUDA technology
за авторством: M. C. Sarsembaev, та інші
Опубліковано: (2020)
за авторством: M. C. Sarsembaev, та інші
Опубліковано: (2020)
Docking of lowmolecular ligands on the plant FtsZprotein with application of CUDAaccelerated calculations
за авторством: O. N. Demchuk, та інші
Опубліковано: (2012)
за авторством: O. N. Demchuk, та інші
Опубліковано: (2012)
Створення методики проектування застосувань для програмно-апаратної платформи CUDA
за авторством: Погорілий, С.Д., та інші
Опубліковано: (2013)
за авторством: Погорілий, С.Д., та інші
Опубліковано: (2013)
Реализация алгоритма Флойда-Уоршалла для программно-аппаратной платформы CUDA
за авторством: Погорелый, С.Д., та інші
Опубліковано: (2011)
за авторством: Погорелый, С.Д., та інші
Опубліковано: (2011)
Топливные брикеты из отходов растительного сырья
за авторством: Барбаш, В.А., та інші
Опубліковано: (2011)
за авторством: Барбаш, В.А., та інші
Опубліковано: (2011)
Вызванная адсорбцией лигандов инверсия относительной стабильности AT- и GC-пар оснований ДНК
за авторством: Ландо, Д.Ю., та інші
Опубліковано: (1988)
за авторством: Ландо, Д.Ю., та інші
Опубліковано: (1988)
Разработка алгоритмических методов ускорения вычислений
за авторством: Криворуков, Е.В., та інші
Опубліковано: (1999)
за авторством: Криворуков, Е.В., та інші
Опубліковано: (1999)
Электроразрядное экстрагирование целевых компонентов из растительного сырья
за авторством: Рудобашта, С.П., та інші
Опубліковано: (2007)
за авторством: Рудобашта, С.П., та інші
Опубліковано: (2007)
Огнестойкие прессованные строительные плиты из растительного сырья
за авторством: Грабовский, О.В., та інші
Опубліковано: (2010)
за авторством: Грабовский, О.В., та інші
Опубліковано: (2010)
Развитие безналичных расчетов в Украине
за авторством: Хачатрян, А.А., та інші
Опубліковано: (2010)
за авторством: Хачатрян, А.А., та інші
Опубліковано: (2010)
О форме градуировочных графиков при фотометрическом определении лигандов в виде комплексных соединений
за авторством: Желтвай, И.И., та інші
Опубліковано: (2009)
за авторством: Желтвай, И.И., та інші
Опубліковано: (2009)
Синхронный механизм ускорения электронов гауссовой волной
за авторством: Милантьев, В.П., та інші
Опубліковано: (2000)
за авторством: Милантьев, В.П., та інші
Опубліковано: (2000)
Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие
за авторством: Костюков, В.В.
Опубліковано: (2011)
за авторством: Костюков, В.В.
Опубліковано: (2011)
Инновационные тепломассообменные технологии производства биотоплива из растительного сырья
за авторством: Долинский, А.А., та інші
Опубліковано: (2006)
за авторством: Долинский, А.А., та інші
Опубліковано: (2006)
Гигиеническая оценка загрязнения продуктов растительного происхождения выбросами автотранспорта
за авторством: Казимов, М.А., та інші
Опубліковано: (2008)
за авторством: Казимов, М.А., та інші
Опубліковано: (2008)
Проблемы и перспективы развития украинского рынка растительного масла
за авторством: Черепанова, Н.А.
Опубліковано: (2012)
за авторством: Черепанова, Н.А.
Опубліковано: (2012)
Ингибирование биокоррозии стали композициями на основе растительного сырья
за авторством: Бондарь, Е.С., та інші
Опубліковано: (2012)
за авторством: Бондарь, Е.С., та інші
Опубліковано: (2012)
Генетическая, эпигенетическая и гормональная регуляция развития растительного организма
за авторством: Медведев, С.С.
Опубліковано: (2010)
за авторством: Медведев, С.С.
Опубліковано: (2010)
Application of the opportunities of tool system ”CUDA” for graphic processors programming in scientific and technical calculation tasks
за авторством: Dudnik, V.A., та інші
Опубліковано: (2009)
за авторством: Dudnik, V.A., та інші
Опубліковано: (2009)
СОВРЕМЕННЫЕ СПОСОБЫ ПЛЕНОЧНОГО ОХЛАЖДЕНИЯ: ВЛИЯНИЕ УСКОРЕНИЯ ПОТОКА
за авторством: Khalatov, А.А., та інші
Опубліковано: (2018)
за авторством: Khalatov, А.А., та інші
Опубліковано: (2018)
Численное исследование возможности ускорения ионов виртуальным катодом
за авторством: Лымарь, А.Г., та інші
Опубліковано: (2012)
за авторством: Лымарь, А.Г., та інші
Опубліковано: (2012)
Современные способы пленочного охлаждения: влияние ускорения потока
за авторством: Халатов, А.А., та інші
Опубліковано: (2018)
за авторством: Халатов, А.А., та інші
Опубліковано: (2018)
Контроль и ревизия расчетов с подотчетными лицами
за авторством: Бурак, И.В.
Опубліковано: (2007)
за авторством: Бурак, И.В.
Опубліковано: (2007)
Использование метода классификационных деревьев для анализа связи структура аффинитет лигандов 5-НТ1A рецепторов
за авторством: Полищук, П.Г., та інші
Опубліковано: (2008)
за авторством: Полищук, П.Г., та інші
Опубліковано: (2008)
Стабилизация сингулярно возмущенных систем силами, зависящими от ускорения
за авторством: Жечев, М.М.
Опубліковано: (2009)
за авторством: Жечев, М.М.
Опубліковано: (2009)
О возможности ускорения ионов пространственно-периодическим виртуальным катодом
за авторством: Лымарь, А.Г.
Опубліковано: (2004)
за авторством: Лымарь, А.Г.
Опубліковано: (2004)
Использование карт Кохонена для ускорения фрактального сжатия изображений
за авторством: Прохоров, В.Г.
Опубліковано: (2009)
за авторством: Прохоров, В.Г.
Опубліковано: (2009)
Равновесная динамика белка. Изучение собственной флюоресценции мелиттина
за авторством: Ладохин, А.С.
Опубліковано: (1990)
за авторством: Ладохин, А.С.
Опубліковано: (1990)
Выделение и кристаллизация рибосомного белка TS9
за авторством: Агаларов, С.Ч., та інші
Опубліковано: (1989)
за авторством: Агаларов, С.Ч., та інші
Опубліковано: (1989)
Защитная эффективность летучих ингибиторов коррозии на основе отходов растительного сырья
за авторством: Воробьева, В.И., та інші
Опубліковано: (2014)
за авторством: Воробьева, В.И., та інші
Опубліковано: (2014)
Схожі ресурси
-
Сравнительный анализ вторичной структуры тубулинов и FtsZ-белков
за авторством: Ныпорко, А.Ю., та інші
Опубліковано: (2001) -
Structural profile of ligand-based inhibition of bacterial FtsZ
за авторством: D. S. Ozheriedov, та інші
Опубліковано: (2023) -
Ligand-induced variability of the FtsZ protein interdomain cleft site pocket
за авторством: D. S. Ozheriedov, та інші
Опубліковано: (2024) -
Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro
за авторством: Карпов, П.А., та інші
Опубліковано: (2016) -
Использование технологии CUDA для ускорения вычислений в задачах химической кинетики
за авторством: Сарсембаев, М.C., та інші
Опубліковано: (2020)