Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов
Приведен обзор и анализ возможностей применения технологии CUDA для ускорения расчетов в области структурной биологии и биоинформатики. На примере работы с программой HEX 6.1 выполнен сравнительный анализ прироста производительности и качества результатов жесткого докинга низкомолекулярных соединени...
Saved in:
| Published in: | Цитология и генетика |
|---|---|
| Date: | 2012 |
| Main Authors: | Демчук, О.Н., Карпов, П.А., Блюм, Я.Б. |
| Format: | Article |
| Language: | Russian |
| Published: |
Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
2012
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126471 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов / О.Н. Демчук, П.А. Карпов, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2012. — Т. 46, № 3. — С. 55-64. — Бібліогр.: 54 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of UkraineSimilar Items
Сравнительный анализ вторичной структуры тубулинов и FtsZ-белков
by: Ныпорко, А.Ю., et al.
Published: (2001)
by: Ныпорко, А.Ю., et al.
Published: (2001)
Structural profile of ligand-based inhibition of bacterial FtsZ
by: D. S. Ozheriedov, et al.
Published: (2023)
by: D. S. Ozheriedov, et al.
Published: (2023)
Ligand-induced variability of the FtsZ protein interdomain cleft site pocket
by: D. S. Ozheriedov, et al.
Published: (2024)
by: D. S. Ozheriedov, et al.
Published: (2024)
Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro
by: Карпов, П.А., et al.
Published: (2016)
by: Карпов, П.А., et al.
Published: (2016)
Использование технологии CUDA для ускорения вычислений в задачах химической кинетики
by: Сарсембаев, М.C., et al.
Published: (2020)
by: Сарсембаев, М.C., et al.
Published: (2020)
New Imidazole Inhibitors of Mycobacterial FtsZ: the Way from High-Throughput Molecular Screening in Grid up to in vitro Verification
by: P. A. Karpov, et al.
Published: (2016)
by: P. A. Karpov, et al.
Published: (2016)
Уравнение абсорбции паров низкомолекулярных веществ их растворами
by: Романкевич, О.В.
Published: (2007)
by: Романкевич, О.В.
Published: (2007)
Нитротирозилирование как посттрансляционная модификация растительного α-тубулина
by: Блюм, Я.Б., et al.
Published: (2011)
by: Блюм, Я.Б., et al.
Published: (2011)
Влияние избирательного связывания лигандов на молекулярное плавление ДНК
by: Фридман, А.С., et al.
Published: (1987)
by: Фридман, А.С., et al.
Published: (1987)
Creation of design methods for the CUDA hardware and software platform
by: Pogorilyy, S.D., et al.
Published: (2025)
by: Pogorilyy, S.D., et al.
Published: (2025)
Solving the problems of chemical kinetics by using the CUDA technology
by: M. C. Sarsembaev, et al.
Published: (2020)
by: M. C. Sarsembaev, et al.
Published: (2020)
Docking of lowmolecular ligands on the plant FtsZprotein with application of CUDAaccelerated calculations
by: O. N. Demchuk, et al.
Published: (2012)
by: O. N. Demchuk, et al.
Published: (2012)
Створення методики проектування застосувань для програмно-апаратної платформи CUDA
by: Погорілий, С.Д., et al.
Published: (2013)
by: Погорілий, С.Д., et al.
Published: (2013)
Реализация алгоритма Флойда-Уоршалла для программно-аппаратной платформы CUDA
by: Погорелый, С.Д., et al.
Published: (2011)
by: Погорелый, С.Д., et al.
Published: (2011)
Топливные брикеты из отходов растительного сырья
by: Барбаш, В.А., et al.
Published: (2011)
by: Барбаш, В.А., et al.
Published: (2011)
Вызванная адсорбцией лигандов инверсия относительной стабильности AT- и GC-пар оснований ДНК
by: Ландо, Д.Ю., et al.
Published: (1988)
by: Ландо, Д.Ю., et al.
Published: (1988)
Разработка алгоритмических методов ускорения вычислений
by: Криворуков, Е.В., et al.
Published: (1999)
by: Криворуков, Е.В., et al.
Published: (1999)
Электроразрядное экстрагирование целевых компонентов из растительного сырья
by: Рудобашта, С.П., et al.
Published: (2007)
by: Рудобашта, С.П., et al.
Published: (2007)
Огнестойкие прессованные строительные плиты из растительного сырья
by: Грабовский, О.В., et al.
Published: (2010)
by: Грабовский, О.В., et al.
Published: (2010)
Развитие безналичных расчетов в Украине
by: Хачатрян, А.А., et al.
Published: (2010)
by: Хачатрян, А.А., et al.
Published: (2010)
О форме градуировочных графиков при фотометрическом определении лигандов в виде комплексных соединений
by: Желтвай, И.И., et al.
Published: (2009)
by: Желтвай, И.И., et al.
Published: (2009)
Синхронный механизм ускорения электронов гауссовой волной
by: Милантьев, В.П., et al.
Published: (2000)
by: Милантьев, В.П., et al.
Published: (2000)
Энергия интеркаляции ароматических гетероциклических лигандов в ДНК и ее разделение на аддитивные составляющие
by: Костюков, В.В.
Published: (2011)
by: Костюков, В.В.
Published: (2011)
Инновационные тепломассообменные технологии производства биотоплива из растительного сырья
by: Долинский, А.А., et al.
Published: (2006)
by: Долинский, А.А., et al.
Published: (2006)
Гигиеническая оценка загрязнения продуктов растительного происхождения выбросами автотранспорта
by: Казимов, М.А., et al.
Published: (2008)
by: Казимов, М.А., et al.
Published: (2008)
Проблемы и перспективы развития украинского рынка растительного масла
by: Черепанова, Н.А.
Published: (2012)
by: Черепанова, Н.А.
Published: (2012)
Ингибирование биокоррозии стали композициями на основе растительного сырья
by: Бондарь, Е.С., et al.
Published: (2012)
by: Бондарь, Е.С., et al.
Published: (2012)
Генетическая, эпигенетическая и гормональная регуляция развития растительного организма
by: Медведев, С.С.
Published: (2010)
by: Медведев, С.С.
Published: (2010)
Application of the opportunities of tool system ”CUDA” for graphic processors programming in scientific and technical calculation tasks
by: Dudnik, V.A., et al.
Published: (2009)
by: Dudnik, V.A., et al.
Published: (2009)
СОВРЕМЕННЫЕ СПОСОБЫ ПЛЕНОЧНОГО ОХЛАЖДЕНИЯ: ВЛИЯНИЕ УСКОРЕНИЯ ПОТОКА
by: Khalatov, А.А., et al.
Published: (2018)
by: Khalatov, А.А., et al.
Published: (2018)
Численное исследование возможности ускорения ионов виртуальным катодом
by: Лымарь, А.Г., et al.
Published: (2012)
by: Лымарь, А.Г., et al.
Published: (2012)
Современные способы пленочного охлаждения: влияние ускорения потока
by: Халатов, А.А., et al.
Published: (2018)
by: Халатов, А.А., et al.
Published: (2018)
Контроль и ревизия расчетов с подотчетными лицами
by: Бурак, И.В.
Published: (2007)
by: Бурак, И.В.
Published: (2007)
Использование метода классификационных деревьев для анализа связи структура аффинитет лигандов 5-НТ1A рецепторов
by: Полищук, П.Г., et al.
Published: (2008)
by: Полищук, П.Г., et al.
Published: (2008)
Стабилизация сингулярно возмущенных систем силами, зависящими от ускорения
by: Жечев, М.М.
Published: (2009)
by: Жечев, М.М.
Published: (2009)
О возможности ускорения ионов пространственно-периодическим виртуальным катодом
by: Лымарь, А.Г.
Published: (2004)
by: Лымарь, А.Г.
Published: (2004)
Использование карт Кохонена для ускорения фрактального сжатия изображений
by: Прохоров, В.Г.
Published: (2009)
by: Прохоров, В.Г.
Published: (2009)
Равновесная динамика белка. Изучение собственной флюоресценции мелиттина
by: Ладохин, А.С.
Published: (1990)
by: Ладохин, А.С.
Published: (1990)
Выделение и кристаллизация рибосомного белка TS9
by: Агаларов, С.Ч., et al.
Published: (1989)
by: Агаларов, С.Ч., et al.
Published: (1989)
Защитная эффективность летучих ингибиторов коррозии на основе отходов растительного сырья
by: Воробьева, В.И., et al.
Published: (2014)
by: Воробьева, В.И., et al.
Published: (2014)
Similar Items
-
Сравнительный анализ вторичной структуры тубулинов и FtsZ-белков
by: Ныпорко, А.Ю., et al.
Published: (2001) -
Structural profile of ligand-based inhibition of bacterial FtsZ
by: D. S. Ozheriedov, et al.
Published: (2023) -
Ligand-induced variability of the FtsZ protein interdomain cleft site pocket
by: D. S. Ozheriedov, et al.
Published: (2024) -
Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro
by: Карпов, П.А., et al.
Published: (2016) -
Использование технологии CUDA для ускорения вычислений в задачах химической кинетики
by: Сарсембаев, М.C., et al.
Published: (2020)