Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов
Приведен обзор и анализ возможностей применения технологии CUDA для ускорения расчетов в области структурной биологии и биоинформатики. На примере работы с программой HEX 6.1 выполнен сравнительный анализ прироста производительности и качества результатов жесткого докинга низкомолекулярных соединени...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Цитология и генетика |
|---|---|
| Datum: | 2012 |
| Hauptverfasser: | Демчук, О.Н., Карпов, П.А., Блюм, Я.Б. |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Russisch |
| Veröffentlicht: |
Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
2012
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126471 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов / О.Н. Демчук, П.А. Карпов, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2012. — Т. 46, № 3. — С. 55-64. — Бібліогр.: 54 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of UkraineÄhnliche Einträge
Построение трехмерных моделей FtsZ-белков Arabidopsis thaliana на основе кристаллической структуры архебактериального комплекса FtsZ-GDP
von: Демчук, О.Н., et al.
Veröffentlicht: (2006)
von: Демчук, О.Н., et al.
Veröffentlicht: (2006)
Сравнительный анализ вторичной структуры тубулинов и FtsZ-белков
von: Ныпорко, А.Ю., et al.
Veröffentlicht: (2001)
von: Ныпорко, А.Ю., et al.
Veröffentlicht: (2001)
Филогенетическое древо бактериальных и эукариотических FtsZ-белков на основании гомологии их первичных последовательностей
von: Демчук, О.Н., et al.
Veröffentlicht: (2005)
von: Демчук, О.Н., et al.
Veröffentlicht: (2005)
Structural profile of ligand-based inhibition of bacterial FtsZ
von: D. S. Ozheriedov, et al.
Veröffentlicht: (2023)
von: D. S. Ozheriedov, et al.
Veröffentlicht: (2023)
Ligand-induced variability of the FtsZ protein interdomain cleft site pocket
von: D. S. Ozheriedov, et al.
Veröffentlicht: (2024)
von: D. S. Ozheriedov, et al.
Veröffentlicht: (2024)
Нові імідазольні похідні як інгібітори FtsZ-білків мікобактерій: від високопропускного молекулярного скринінгу в Ґрід до експериментального аналізу in vitro
von: Карпов, П.А., et al.
Veröffentlicht: (2016)
von: Карпов, П.А., et al.
Veröffentlicht: (2016)
Использование технологии CUDA для ускорения вычислений в задачах химической кинетики
von: Сарсембаев, М.C., et al.
Veröffentlicht: (2020)
von: Сарсембаев, М.C., et al.
Veröffentlicht: (2020)
New Imidazole Inhibitors of Mycobacterial FtsZ: the Way from High-Throughput Molecular Screening in Grid up to in vitro Verification
von: P. A. Karpov, et al.
Veröffentlicht: (2016)
von: P. A. Karpov, et al.
Veröffentlicht: (2016)
Уравнение абсорбции паров низкомолекулярных веществ их растворами
von: Романкевич, О.В.
Veröffentlicht: (2007)
von: Романкевич, О.В.
Veröffentlicht: (2007)
Solving the problems of chemical kinetics by using the CUDA technology
von: M. C. Sarsembaev, et al.
Veröffentlicht: (2020)
von: M. C. Sarsembaev, et al.
Veröffentlicht: (2020)
Creation of design methods for the CUDA hardware and software platform
von: Pogorilyy, S.D., et al.
Veröffentlicht: (2025)
von: Pogorilyy, S.D., et al.
Veröffentlicht: (2025)
Нитротирозилирование как посттрансляционная модификация растительного α-тубулина
von: Блюм, Я.Б., et al.
Veröffentlicht: (2011)
von: Блюм, Я.Б., et al.
Veröffentlicht: (2011)
Влияние избирательного связывания лигандов на молекулярное плавление ДНК
von: Фридман, А.С., et al.
Veröffentlicht: (1987)
von: Фридман, А.С., et al.
Veröffentlicht: (1987)
Энергетика димеризации лигандов, связывающихся в малый желобок ДНК
von: Kostjukov, V. V., et al.
Veröffentlicht: (2018)
von: Kostjukov, V. V., et al.
Veröffentlicht: (2018)
Docking of lowmolecular ligands on the plant FtsZprotein with application of CUDAaccelerated calculations
von: O. N. Demchuk, et al.
Veröffentlicht: (2012)
von: O. N. Demchuk, et al.
Veröffentlicht: (2012)
Исследование влияния низкомолекулярных криопротекторов на дыхательную цепь митохондрий методом ЭПР спинового зонда
von: Нардид, О.А.
Veröffentlicht: (2009)
von: Нардид, О.А.
Veröffentlicht: (2009)
Реализация алгоритма Флойда-Уоршалла для программно-аппаратной платформы CUDA
von: Погорелый, С.Д., et al.
Veröffentlicht: (2011)
von: Погорелый, С.Д., et al.
Veröffentlicht: (2011)
Створення методики проектування застосувань для програмно-апаратної платформи CUDA
von: Погорілий, С.Д., et al.
Veröffentlicht: (2013)
von: Погорілий, С.Д., et al.
Veröffentlicht: (2013)
Гидрофобный вклад в свободную энергию комплексообразования ароматических лигандов с ДНК
von: Костюков, В.В., et al.
Veröffentlicht: (2009)
von: Костюков, В.В., et al.
Veröffentlicht: (2009)
Разработка алгоритмических методов ускорения вычислений
von: Криворуков, Е.В., et al.
Veröffentlicht: (1999)
von: Криворуков, Е.В., et al.
Veröffentlicht: (1999)
Программно-аппаратная поддержка ускорения вычислений
von: Буза, М.К.
Veröffentlicht: (2018)
von: Буза, М.К.
Veröffentlicht: (2018)
Содержание низкомолекулярных органических соединений в почвах под Deschampsia antarctica и D. cespitosa (Poaceae)
von: Бедерничек, Т.Ю., et al.
Veröffentlicht: (2017)
von: Бедерничек, Т.Ю., et al.
Veröffentlicht: (2017)
Топливные брикеты из отходов растительного сырья
von: Барбаш, В.А., et al.
Veröffentlicht: (2011)
von: Барбаш, В.А., et al.
Veröffentlicht: (2011)
Проблемы изучения гепатотоксичности средств растительного происхождения
von: Матвеев, А.В.
Veröffentlicht: (2012)
von: Матвеев, А.В.
Veröffentlicht: (2012)
Вызванная адсорбцией лигандов инверсия относительной стабильности AT- и GC-пар оснований ДНК
von: Ландо, Д.Ю., et al.
Veröffentlicht: (1988)
von: Ландо, Д.Ю., et al.
Veröffentlicht: (1988)
Влияние двух способов связывания лигандов на параметры перехода спираль - клубок ДНК
von: Карапетян, А.Т., et al.
Veröffentlicht: (1989)
von: Карапетян, А.Т., et al.
Veröffentlicht: (1989)
Синхронный механизм ускорения электронов гауссовой волной
von: Милантьев, В.П., et al.
Veröffentlicht: (2000)
von: Милантьев, В.П., et al.
Veröffentlicht: (2000)
Электроразрядное экстрагирование целевых компонентов из растительного сырья
von: Рудобашта, С.П., et al.
Veröffentlicht: (2007)
von: Рудобашта, С.П., et al.
Veröffentlicht: (2007)
Огнестойкие прессованные строительные плиты из растительного сырья
von: Грабовский, О.В., et al.
Veröffentlicht: (2010)
von: Грабовский, О.В., et al.
Veröffentlicht: (2010)
Развитие безналичных расчетов в Украине
von: Хачатрян, А.А., et al.
Veröffentlicht: (2010)
von: Хачатрян, А.А., et al.
Veröffentlicht: (2010)
О форме градуировочных графиков при фотометрическом определении лигандов в виде комплексных соединений
von: Желтвай, И.И., et al.
Veröffentlicht: (2009)
von: Желтвай, И.И., et al.
Veröffentlicht: (2009)
Application of the opportunities of tool system ”CUDA” for graphic processors programming in scientific and technical calculation tasks
von: Dudnik, V.A., et al.
Veröffentlicht: (2009)
von: Dudnik, V.A., et al.
Veröffentlicht: (2009)
СОВРЕМЕННЫЕ СПОСОБЫ ПЛЕНОЧНОГО ОХЛАЖДЕНИЯ: ВЛИЯНИЕ УСКОРЕНИЯ ПОТОКА
von: Khalatov, А.А., et al.
Veröffentlicht: (2018)
von: Khalatov, А.А., et al.
Veröffentlicht: (2018)
Численное исследование возможности ускорения ионов виртуальным катодом
von: Лымарь, А.Г., et al.
Veröffentlicht: (2012)
von: Лымарь, А.Г., et al.
Veröffentlicht: (2012)
Современные способы пленочного охлаждения: влияние ускорения потока
von: Халатов, А.А., et al.
Veröffentlicht: (2018)
von: Халатов, А.А., et al.
Veröffentlicht: (2018)
Гигиеническая оценка загрязнения продуктов растительного происхождения выбросами автотранспорта
von: Казимов, М.А., et al.
Veröffentlicht: (2008)
von: Казимов, М.А., et al.
Veröffentlicht: (2008)
Генетическая, эпигенетическая и гормональная регуляция развития растительного организма
von: Медведев, С.С.
Veröffentlicht: (2010)
von: Медведев, С.С.
Veröffentlicht: (2010)
Ингибирование биокоррозии стали композициями на основе растительного сырья
von: Бондарь, Е.С., et al.
Veröffentlicht: (2012)
von: Бондарь, Е.С., et al.
Veröffentlicht: (2012)
Проблемы и перспективы развития украинского рынка растительного масла
von: Черепанова, Н.А.
Veröffentlicht: (2012)
von: Черепанова, Н.А.
Veröffentlicht: (2012)
Инновационные тепломассообменные технологии производства биотоплива из растительного сырья
von: Долинский, А.А., et al.
Veröffentlicht: (2006)
von: Долинский, А.А., et al.
Veröffentlicht: (2006)
Ähnliche Einträge
-
Построение трехмерных моделей FtsZ-белков Arabidopsis thaliana на основе кристаллической структуры архебактериального комплекса FtsZ-GDP
von: Демчук, О.Н., et al.
Veröffentlicht: (2006) -
Сравнительный анализ вторичной структуры тубулинов и FtsZ-белков
von: Ныпорко, А.Ю., et al.
Veröffentlicht: (2001) -
Филогенетическое древо бактериальных и эукариотических FtsZ-белков на основании гомологии их первичных последовательностей
von: Демчук, О.Н., et al.
Veröffentlicht: (2005) -
Structural profile of ligand-based inhibition of bacterial FtsZ
von: D. S. Ozheriedov, et al.
Veröffentlicht: (2023) -
Ligand-induced variability of the FtsZ protein interdomain cleft site pocket
von: D. S. Ozheriedov, et al.
Veröffentlicht: (2024)