On the persistence of p element in cultured lineages of Drosophila melanogaster

P transposon is known to have invaded the Drosophila melanogaster genome in the 1950s as a result of horizontal transmission from D. willistoni. Part of the evidence supporting the timing of its invasion comes from analyses of cultured drosophila lineages originating from wild flies cultivated long...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Цитология и генетика
Date:2012
Main Authors: Rozhok, A.I., Ievdokymenko, K.S., Kozeretska, I.A.
Format: Article
Language:English
Published: Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України 2012
Subjects:
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126482
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:On the persistence of p element in cultured lineages of Drosophila melanogaster / A.I. Rozhok, K.S. Ievdokymenko, I.A. Kozeretska // Цитология и генетика. — 2012. — Т. 46, № 4. — С. 55-58. — Бібліогр.: 15 назв. — англ.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-126482
record_format dspace
spelling Rozhok, A.I.
Ievdokymenko, K.S.
Kozeretska, I.A.
2017-11-24T18:45:04Z
2017-11-24T18:45:04Z
2012
On the persistence of p element in cultured lineages of Drosophila melanogaster / A.I. Rozhok, K.S. Ievdokymenko, I.A. Kozeretska // Цитология и генетика. — 2012. — Т. 46, № 4. — С. 55-58. — Бібліогр.: 15 назв. — англ.
0564-3783
DOI: 10.3103/S0095452712040123
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126482
577.391:576.312.33
P transposon is known to have invaded the Drosophila melanogaster genome in the 1950s as a result of horizontal transmission from D. willistoni. Part of the evidence supporting the timing of its invasion comes from analyses of cultured drosophila lineages originating from wild flies cultivated long time in laboratory before analysis. Such analyses have shown that P element was absent from the genomes of cultured lineages established from wild flies caught from the wild before the 1950s. Although the hypothesis of P element transmission has obtained multiple lines of evidence and is beyond doubt today, we decided to test whether analysis of cultured lineages can provide some temporal information on the P element population dynamics. In the present work we demonstrate that P element present the in wild­caught flies may be lost in the cultured fly lineages after some generations. This result is in accordance with the results of at least one published work and suggests that analysis of the cultured fly lineages may sometimes be unreliable in establishing historical trends in P element population dynamics, as the transposon may be occasionally lost, perhaps in the highly inbred lineages in which not all founding females carry it.
Известно, что Р транспозон попал в геном Drosophila melanogaster в 50-х годах прошлого столетия результате горизонтального переноса от D. willistoni. Частично время инвазии было рассчитано на основании анализа культивируемых линий дрозофилы, которые происходят от диких особей, культивируемых как изосамковые линии задолго до анализа. Такой анализ показал, что Р элемент отсутствовал в геномах культивируе-мых линий, которые основаны из особей, собранных в природе до 1950 г. Хотя гипотеза переноса Р элемента подтверждена различными доказательствами и ее достоверность не вызывает сомнений, мы решили проверить, дает ли анализ культивируемых линий информацию о временных факторах популяционной динамики Р элемента. В настоящей работе мы показываем, что Р элемент, присутствующий в диких особях, может быть утрачен в культивируемых линиях через некоторое количество поколений. Такие результаты согласуются с данными как минимум одной опубликованной работы и свидетельствуют о том, что анализ культивируемых линий дрозофилы не всегда надежен при воссоздании исторических трендов популяционной динамики Р элемента, поскольку этот транспозон может быть случайным образом утерян, очевидно, вследствие высокой инбредности линий, у которых геномы не всех самок-основателей содержали его.
Відомо, що Р транспозон потрапив до геному Drosophila melanogaster у 50-х роках минулого століття в результаті горизонтального переносу від D. willistoni. Частково час інвазії був розрахований на основі аналізу культивованих ліній дрозофіли, що походять від диких особин, котрі культивувались у лабораторії як ізосамкові лінії задовго до аналізу. Такий аналіз показав, що Р елемент був відсутній у геномах культивованих ліній, заснованих з особин, що зібрані у природі до 1950 р. Хоча гіпотеза переносу Р елемента підтверджується різноманітними доказами та її достовірність не викликає сумніву, ми вирішили перевірити, чи дає аналіз культивованих ліній інформацію щодо часового фактора популяційної динаміки Р елемента. В даній роботі ми показуємо, що Р елемент, присутній у диких особин, може втрачатись в культивованих лініях через певну кількість поколінь. Такі результати узгоджуються з даними щонайменше однієї опублікованої роботи та свідчать про те, що аналіз культивованих ліній дрозофіли може інколи бути ненадійним для відтворення історичних трендів популяційної динаміки Р елемента, оскільки цей транспозон може випадковим чином втрачатись, очевидно, через високу інбредність ліній, в яких геноми не всіх самиць-засновників містили його.
Authors thank Dr. G. Milinevskyi, the staff of Biology Department of Mechnikov National University of Odessa, and the staff of the National Institute of Viniculture and Wine Industry UAAS for their valuable help in material collection and Prof. T. Mousseau and S. Ostermiller for help with sequencing.
en
Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
Цитология и генетика
Оригинальные работы
On the persistence of p element in cultured lineages of Drosophila melanogaster
О персистировании р элемента в культивируемых линиях Drosophila melanogaster
Про персистування р елемента в культивованих лініях Drosophila melanogaster
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title On the persistence of p element in cultured lineages of Drosophila melanogaster
spellingShingle On the persistence of p element in cultured lineages of Drosophila melanogaster
Rozhok, A.I.
Ievdokymenko, K.S.
Kozeretska, I.A.
Оригинальные работы
title_short On the persistence of p element in cultured lineages of Drosophila melanogaster
title_full On the persistence of p element in cultured lineages of Drosophila melanogaster
title_fullStr On the persistence of p element in cultured lineages of Drosophila melanogaster
title_full_unstemmed On the persistence of p element in cultured lineages of Drosophila melanogaster
title_sort on the persistence of p element in cultured lineages of drosophila melanogaster
author Rozhok, A.I.
Ievdokymenko, K.S.
Kozeretska, I.A.
author_facet Rozhok, A.I.
Ievdokymenko, K.S.
Kozeretska, I.A.
topic Оригинальные работы
topic_facet Оригинальные работы
publishDate 2012
language English
container_title Цитология и генетика
publisher Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
format Article
title_alt О персистировании р элемента в культивируемых линиях Drosophila melanogaster
Про персистування р елемента в культивованих лініях Drosophila melanogaster
description P transposon is known to have invaded the Drosophila melanogaster genome in the 1950s as a result of horizontal transmission from D. willistoni. Part of the evidence supporting the timing of its invasion comes from analyses of cultured drosophila lineages originating from wild flies cultivated long time in laboratory before analysis. Such analyses have shown that P element was absent from the genomes of cultured lineages established from wild flies caught from the wild before the 1950s. Although the hypothesis of P element transmission has obtained multiple lines of evidence and is beyond doubt today, we decided to test whether analysis of cultured lineages can provide some temporal information on the P element population dynamics. In the present work we demonstrate that P element present the in wild­caught flies may be lost in the cultured fly lineages after some generations. This result is in accordance with the results of at least one published work and suggests that analysis of the cultured fly lineages may sometimes be unreliable in establishing historical trends in P element population dynamics, as the transposon may be occasionally lost, perhaps in the highly inbred lineages in which not all founding females carry it. Известно, что Р транспозон попал в геном Drosophila melanogaster в 50-х годах прошлого столетия результате горизонтального переноса от D. willistoni. Частично время инвазии было рассчитано на основании анализа культивируемых линий дрозофилы, которые происходят от диких особей, культивируемых как изосамковые линии задолго до анализа. Такой анализ показал, что Р элемент отсутствовал в геномах культивируе-мых линий, которые основаны из особей, собранных в природе до 1950 г. Хотя гипотеза переноса Р элемента подтверждена различными доказательствами и ее достоверность не вызывает сомнений, мы решили проверить, дает ли анализ культивируемых линий информацию о временных факторах популяционной динамики Р элемента. В настоящей работе мы показываем, что Р элемент, присутствующий в диких особях, может быть утрачен в культивируемых линиях через некоторое количество поколений. Такие результаты согласуются с данными как минимум одной опубликованной работы и свидетельствуют о том, что анализ культивируемых линий дрозофилы не всегда надежен при воссоздании исторических трендов популяционной динамики Р элемента, поскольку этот транспозон может быть случайным образом утерян, очевидно, вследствие высокой инбредности линий, у которых геномы не всех самок-основателей содержали его. Відомо, що Р транспозон потрапив до геному Drosophila melanogaster у 50-х роках минулого століття в результаті горизонтального переносу від D. willistoni. Частково час інвазії був розрахований на основі аналізу культивованих ліній дрозофіли, що походять від диких особин, котрі культивувались у лабораторії як ізосамкові лінії задовго до аналізу. Такий аналіз показав, що Р елемент був відсутній у геномах культивованих ліній, заснованих з особин, що зібрані у природі до 1950 р. Хоча гіпотеза переносу Р елемента підтверджується різноманітними доказами та її достовірність не викликає сумніву, ми вирішили перевірити, чи дає аналіз культивованих ліній інформацію щодо часового фактора популяційної динаміки Р елемента. В даній роботі ми показуємо, що Р елемент, присутній у диких особин, може втрачатись в культивованих лініях через певну кількість поколінь. Такі результати узгоджуються з даними щонайменше однієї опублікованої роботи та свідчать про те, що аналіз культивованих ліній дрозофіли може інколи бути ненадійним для відтворення історичних трендів популяційної динаміки Р елемента, оскільки цей транспозон може випадковим чином втрачатись, очевидно, через високу інбредність ліній, в яких геноми не всіх самиць-засновників містили його.
issn 0564-3783
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126482
citation_txt On the persistence of p element in cultured lineages of Drosophila melanogaster / A.I. Rozhok, K.S. Ievdokymenko, I.A. Kozeretska // Цитология и генетика. — 2012. — Т. 46, № 4. — С. 55-58. — Бібліогр.: 15 назв. — англ.
work_keys_str_mv AT rozhokai onthepersistenceofpelementinculturedlineagesofdrosophilamelanogaster
AT ievdokymenkoks onthepersistenceofpelementinculturedlineagesofdrosophilamelanogaster
AT kozeretskaia onthepersistenceofpelementinculturedlineagesofdrosophilamelanogaster
AT rozhokai opersistirovaniirélementavkulʹtiviruemyhliniâhdrosophilamelanogaster
AT ievdokymenkoks opersistirovaniirélementavkulʹtiviruemyhliniâhdrosophilamelanogaster
AT kozeretskaia opersistirovaniirélementavkulʹtiviruemyhliniâhdrosophilamelanogaster
AT rozhokai propersistuvannârelementavkulʹtivovanihlíníâhdrosophilamelanogaster
AT ievdokymenkoks propersistuvannârelementavkulʹtivovanihlíníâhdrosophilamelanogaster
AT kozeretskaia propersistuvannârelementavkulʹtivovanihlíníâhdrosophilamelanogaster
first_indexed 2025-12-07T17:19:43Z
last_indexed 2025-12-07T17:19:43Z
_version_ 1850870840418107392