Мережі генів регуляції вторинного метаболізму актиноміцетів: плейотропні регулятори

Зроблено огляд сучасних досягнень в дослідженні та практичному застосуванні плейотропних генів, які регулюють продукцію антибіотиків у актиноміцетів. Розглянуто основні регуляторні механізми за участі таких генів, що виявлені у цих бактерій. Наведені в огляді приклади демонструють, що маніпулювання...

Full description

Saved in:

Bibliographic Details
Published in:	Цитология и генетика
Date:	2014
Main Authors:	Рабик, М.В., Осташ, Б.О., Федоренко, В.О.
Format:	Article
Language:	Ukrainian
Published:	Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України 2014
Subjects:	Обзорные статьи
Online Access:	https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126619
Tags:	Add Tag No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:	Мережі генів регуляції вторинного метаболізму актиноміцетів: плейотропні регулятори / М.В. Рабик, Б.О. Осташ, В.О. Федоренко // Цитология и генетика. — 2014. — Т. 48, № 1. — С. 67-82. — Бібліогр.: 94 назв. — укр.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

id	nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-126619
record_format	dspace
spelling	Рабик, М.В. Осташ, Б.О. Федоренко, В.О. 2017-11-28T19:27:09Z 2017-11-28T19:27:09Z 2014 Мережі генів регуляції вторинного метаболізму актиноміцетів: плейотропні регулятори / М.В. Рабик, Б.О. Осташ, В.О. Федоренко // Цитология и генетика. — 2014. — Т. 48, № 1. — С. 67-82. — Бібліогр.: 94 назв. — укр. 0564-3783 DOI: 10.3103/S0095452714010083 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126619 615.33:577.182. Зроблено огляд сучасних досягнень в дослідженні та практичному застосуванні плейотропних генів, які регулюють продукцію антибіотиків у актиноміцетів. Розглянуто основні регуляторні механізми за участі таких генів, що виявлені у цих бактерій. Наведені в огляді приклади демонструють, що маніпулювання регуляторними системами, які впливають на синтез антибіотиків, є важливим напрямком метаболічної інженерії актиноміцетів. Крім того, вивчення цих генів є підґрунтям для розробки генно-інженерних підходів до активації «мовчазної» частини вторинного метаболому актиноміцетів, потенціал якого щодо продукції біологічно активних сполук значно перевищує той, що вивчено за допомогою традиційного скринінгу мікроорганізмів. Крім суто практичних завдань, дослідження плейотропних регуляторних генів дасть змогу краще зрозуміти шляхи еволюції складних регуляторних систем, що координують експресію генних оперонів, кластерів і регулонів, задіяних у контролі вторинного метаболізму та морфогенезу актиноміцетів. Дан обзор современных достижений в исследовании и практическом применении плейотропных регуляторных генов продукции антибиотиков у актиномицетов. Рассмотрены основные регуляторные механизмы, обнаруженные у этих бактерий. Приведенные в обзоре примеры показывают, что манипулирование регуляторными системами, влияющими на син-тез антибиотиков, является важным направлением метаболической инженерии актиномицетов. Кроме того, изучение этих генов служит основой для разработки генно-инженерных подходов к активации «молчащей» части вторичного метаболома актино-мицетов, потенциал которого в продуцировании биологически активных соединений значительно превышает тот, который изучен при помощи традиционного скрининга микроорганизмов. Помимо чисто практических задач, исследование генов регуляции биосинтеза антибиотиков позволит лучше понять пути эволюции сложных регуляторных систем, координирующих экспрессию генных оперонов, кластеров и регулонов, участвующих в контроле вторичного метаболизма и морфогенеза актиномицетов. Current advances in the research and practical application of pleiotropic regulatory genes for antibiotic production in actinomycetes are reviewed. The basic regulatory mechanisms discovered in these bacteria are outlined. The examples described in the review show the importance of the manipulation of regulatory systems that affect the synthesis of antibiotics for the metabolic engineering of actinomycetes. Also, the study of these genes is the basis for the development of genetic engineering approaches to the induction of the “cryptic” part of the actinomycetes secondary metabolome, the capacity of which for the production of biologically active compounds is much larger than the diversity of antibiotics underpinned by traditional microbiological screening. Besides practical problems, the study of regulatory genes for antibiotic biosynthesis will provide insights into the process of evolution of complex regulatory systems that coordinate the expression of gene operons, clusters, and regulons, involved in the control of the secondary metabolism and morphogenesis of actinomycetes. uk Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України Цитология и генетика Обзорные статьи Мережі генів регуляції вторинного метаболізму актиноміцетів: плейотропні регулятори Сети генов регуляции вторичного метаболизма актиномицетов : плейотропные регуляторы Gene networks regulating secondary metabolism in actinomycetes: Pleiotropic regulators Article published earlier
institution	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection	DSpace DC
title	Мережі генів регуляції вторинного метаболізму актиноміцетів: плейотропні регулятори
spellingShingle	Мережі генів регуляції вторинного метаболізму актиноміцетів: плейотропні регулятори Рабик, М.В. Осташ, Б.О. Федоренко, В.О. Обзорные статьи
title_short	Мережі генів регуляції вторинного метаболізму актиноміцетів: плейотропні регулятори
title_full	Мережі генів регуляції вторинного метаболізму актиноміцетів: плейотропні регулятори
title_fullStr	Мережі генів регуляції вторинного метаболізму актиноміцетів: плейотропні регулятори
title_full_unstemmed	Мережі генів регуляції вторинного метаболізму актиноміцетів: плейотропні регулятори
title_sort	мережі генів регуляції вторинного метаболізму актиноміцетів: плейотропні регулятори
author	Рабик, М.В. Осташ, Б.О. Федоренко, В.О.
author_facet	Рабик, М.В. Осташ, Б.О. Федоренко, В.О.
topic	Обзорные статьи
topic_facet	Обзорные статьи
publishDate	2014
language	Ukrainian
container_title	Цитология и генетика
publisher	Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
format	Article
title_alt	Сети генов регуляции вторичного метаболизма актиномицетов : плейотропные регуляторы Gene networks regulating secondary metabolism in actinomycetes: Pleiotropic regulators
description	Зроблено огляд сучасних досягнень в дослідженні та практичному застосуванні плейотропних генів, які регулюють продукцію антибіотиків у актиноміцетів. Розглянуто основні регуляторні механізми за участі таких генів, що виявлені у цих бактерій. Наведені в огляді приклади демонструють, що маніпулювання регуляторними системами, які впливають на синтез антибіотиків, є важливим напрямком метаболічної інженерії актиноміцетів. Крім того, вивчення цих генів є підґрунтям для розробки генно-інженерних підходів до активації «мовчазної» частини вторинного метаболому актиноміцетів, потенціал якого щодо продукції біологічно активних сполук значно перевищує той, що вивчено за допомогою традиційного скринінгу мікроорганізмів. Крім суто практичних завдань, дослідження плейотропних регуляторних генів дасть змогу краще зрозуміти шляхи еволюції складних регуляторних систем, що координують експресію генних оперонів, кластерів і регулонів, задіяних у контролі вторинного метаболізму та морфогенезу актиноміцетів. Дан обзор современных достижений в исследовании и практическом применении плейотропных регуляторных генов продукции антибиотиков у актиномицетов. Рассмотрены основные регуляторные механизмы, обнаруженные у этих бактерий. Приведенные в обзоре примеры показывают, что манипулирование регуляторными системами, влияющими на син-тез антибиотиков, является важным направлением метаболической инженерии актиномицетов. Кроме того, изучение этих генов служит основой для разработки генно-инженерных подходов к активации «молчащей» части вторичного метаболома актино-мицетов, потенциал которого в продуцировании биологически активных соединений значительно превышает тот, который изучен при помощи традиционного скрининга микроорганизмов. Помимо чисто практических задач, исследование генов регуляции биосинтеза антибиотиков позволит лучше понять пути эволюции сложных регуляторных систем, координирующих экспрессию генных оперонов, кластеров и регулонов, участвующих в контроле вторичного метаболизма и морфогенеза актиномицетов. Current advances in the research and practical application of pleiotropic regulatory genes for antibiotic production in actinomycetes are reviewed. The basic regulatory mechanisms discovered in these bacteria are outlined. The examples described in the review show the importance of the manipulation of regulatory systems that affect the synthesis of antibiotics for the metabolic engineering of actinomycetes. Also, the study of these genes is the basis for the development of genetic engineering approaches to the induction of the “cryptic” part of the actinomycetes secondary metabolome, the capacity of which for the production of biologically active compounds is much larger than the diversity of antibiotics underpinned by traditional microbiological screening. Besides practical problems, the study of regulatory genes for antibiotic biosynthesis will provide insights into the process of evolution of complex regulatory systems that coordinate the expression of gene operons, clusters, and regulons, involved in the control of the secondary metabolism and morphogenesis of actinomycetes.
issn	0564-3783
url	https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126619
citation_txt	Мережі генів регуляції вторинного метаболізму актиноміцетів: плейотропні регулятори / М.В. Рабик, Б.О. Осташ, В.О. Федоренко // Цитология и генетика. — 2014. — Т. 48, № 1. — С. 67-82. — Бібліогр.: 94 назв. — укр.
work_keys_str_mv	AT rabikmv merežígenívregulâcíívtorinnogometabolízmuaktinomícetívpleiotropníregulâtori AT ostašbo merežígenívregulâcíívtorinnogometabolízmuaktinomícetívpleiotropníregulâtori AT fedorenkovo merežígenívregulâcíívtorinnogometabolízmuaktinomícetívpleiotropníregulâtori AT rabikmv setigenovregulâciivtoričnogometabolizmaaktinomicetovpleiotropnyeregulâtory AT ostašbo setigenovregulâciivtoričnogometabolizmaaktinomicetovpleiotropnyeregulâtory AT fedorenkovo setigenovregulâciivtoričnogometabolizmaaktinomicetovpleiotropnyeregulâtory AT rabikmv genenetworksregulatingsecondarymetabolisminactinomycetespleiotropicregulators AT ostašbo genenetworksregulatingsecondarymetabolisminactinomycetespleiotropicregulators AT fedorenkovo genenetworksregulatingsecondarymetabolisminactinomycetespleiotropicregulators
first_indexed	2025-11-26T03:04:06Z
last_indexed	2025-11-26T03:04:06Z
_version_	1850609763913564160
fulltext	67ISSN 0564–3783. Öèòîëîãèÿ è ãåíåòèêà. 2014. Ò. 48. ¹ 1 Çðîáëåíî îãëÿä ñó÷àñíèõ äîñÿãíåíü â äîñë³äæåíí³ òà ïðàêòè÷íîìó çàñòîñóâàíí³ ïëåéîòðîïíèõ ãåí³â, ÿê³ ðåãóëþþòü ïðîäóêö³þ àíòèá³îòèê³â ó àêòèíîì³öåò³â. Ðîçãëÿíóòî îñíîâí³ ðåãóëÿòîðí³ ìåõàí³çìè çà ó÷àñò³ òàêèõ ãåí³â, ùî âèÿâëåí³ ó öèõ áàêòåð³é. Íàâåäåí³ â îãëÿä³ ïðèêëàäè äåìîíñòðóþòü, ùî ìàí³ïóëþâàííÿ ðå- ãóëÿòîðíèìè ñèñòåìàìè, ÿê³ âïëèâàþòü íà ñèíòåç àíòèá³îòèê³â, º âàæëèâèì íàïðÿìêîì ìåòàáîë³÷íî¿ ³íæåíåð³¿ àêòèíîì³öåò³â. Êð³ì òîãî, âèâ÷åííÿ öèõ ãåí³â º ï³ä´ðóíòÿì äëÿ ðîçðîáêè ãåííî-³íæåíåðíèõ ï³ä- õîä³â äî àêòèâàö³¿ «ìîâ÷àçíî¿» ÷àñòèíè âòîðèííîãî ìåòàáîëîìó àêòèíîì³öåò³â, ïîòåíö³àë ÿêîãî ùîäî ïðî- äóêö³¿ á³îëîã³÷íî àêòèâíèõ ñïîëóê çíà÷íî ïåðåâèùóº òîé, ùî âèâ÷åíî çà äîïîìîãîþ òðàäèö³éíîãî ñêðèí³íãó ì³êðîîðãàí³çì³â. Êð³ì ñóòî ïðàêòè÷íèõ çàâäàíü, äîñ- ë³äæåííÿ ïëåéîòðîïíèõ ðåãóëÿòîðíèõ ãåí³â äàñòü çìîãó êðàùå çðîçóì³òè øëÿõè åâîëþö³¿ ñêëàäíèõ ðåãóëÿòîðíèõ ñèñòåì, ùî êîîðäèíóþòü åêñïðåñ³þ ãåííèõ îïåðîí³â, êëàñòåð³â ³ ðåãóëîí³â, çàä³ÿíèõ ó êîíòðîë³ âòîðèííîãî ìåòàáîë³çìó òà ìîðôîãåíåçó àêòèíîì³öåò³â. Êëþ÷îâ³ ñëîâà: ïëåéîòðîïí³ ðåãóëÿòîðè, äâîêîìïî- íåíòí³ ñèãíàëüí³ ñèñòåìè, âòîðèííèé ìåòàáîë³çì, - áóòèðîëàêòîíè, Streptomyces. Вступ Àêòèíîì³öåòè ïðîäóêóþòü áàãàòî ïðîìèñëîâî âàæëèâèõ ñïîëóê, îäíàê âîíè â³äîì³ íàñàì- ïåðåä ÿê ïðîäóöåíòè äâîõ òðåòèí îïèñàíèõ àíòèá³îòèê³â [1]. Á³îñèíòåç àíòèá³îòèê³â ó öèõ áàêòåð³é çá³ãàºòüñÿ â ÷àñ³ òà êîîðäèíîâàíî ðå- ãóëþºòüñÿ ³ç ôîðìóâàííÿì ïîâ³òðÿíîãî ì³öå- ë³þ ³ ñïîð [2]. Àíòèá³îòèêè òîêñè÷í³ äëÿ ñàìèõ ïðîäóöåíò³â, ¿õí³é ñèíòåç íàêëàäàº çíà÷íèé ìåòàáîë³÷íèé òÿãàð ³ â³ä³ãðàº âàæëèâó ðîëü ó âçàºìîä³¿ ç ³íøèìè îðãàí³çìàìè. Òîìó á³îñèí- òåç àíòèá³îòèê³â ï³äëÿãàº ñóâîðîìó ãåíåòè÷íî- ìó êîíòðîëþ [3, 4]. Àíàë³ç ãåíîìó ìîäåëüíîãî îá’ºêòà Streptomyces coelicolor âèÿâèâ 965 á³ëê³â (êîäóþòüñÿ 12,3 % ãåíîìó), á³ëüø³ñòü ç ÿêèõ ïîòåíö³éíî çàä³ÿíà ó òðàíñêðèïö³éí³é ðåãóëÿ- ö³¿ âòîðèííîãî ìåòàáîëîìó [5]. Âïëèâàþ÷è íà âòîðèííèé ìåòàáîë³çì â ö³ëîìó, âîíè ä³þòü íà äâîõ ð³âíÿõ ðåãóëÿö³¿: 1) ñïåöèô³÷íîìó äëÿ øëÿõó á³îñèíòåçó ïåâíîãî àíòèá³îòèêà; 2) ãëî- áàëüíîìó (ïëåéîòðîïíîìó). Cåðåä ïëåéîòðîï- íèõ ðåãóëÿòîð³â º ÷èìàëî òàêèõ, ùî âïëè- âàþòü ³ íà ìîðôîãåíåç àêòèíîì³öåò³â. Øëÿõ- ñïåöèô³÷í³ ðåãóëÿòîðí³ ãåíè çàçâè÷àé çíàõî- äÿòüñÿ ó êëàñòåðàõ ñòðóêòóðíèõ ãåí³â á³îñèíòå- çó àíòèá³îòèê³â [6]. Ïëåéîòðîïí³ ðåãóëÿòîðè ÷àñòî ì³ñòÿòüñÿ ïîçà öèìè êëàñòåðàìè ³ ìî- äóëþþòü åêñïðåñ³þ øëÿõ-ñïåöèô³÷íèõ ãåí³â, îïîñåðåäêîâàíî âïëèâàþ÷è íà ïðîäóêö³þ àíòè- á³îòèêà. Îäíàê º é òàê³ ãëîáàëüí³ ðåãóëÿòîðè, ùî áåçïîñåðåäíüî ä³þòü íà ñòðóêòóðí³ ãåíè á³î- ñèíòåçó àíòèá³îòèê³â [7]. Âèâ÷åííÿ ïðîöåñ³â ðåãóëÿö³¿ á³îñèíòåçó àíòèá³îòèê³â ìàº ÿê òåî- ðåòè÷íå, òàê ³ ïðèêëàäíå çíà÷åííÿ. Çðîçóì³âøè âçàºìîä³þ ì³æ ðåãóëÿòîðíèìè ãåíàìè ³ äæåðå- ëàìè æèâëåííÿ, ìîæíà ñòâîðþâàòè ñïåö³àëüí³ ñåðåäîâèùà äëÿ ³íäóêóâàííÿ åêñïðåñ³¿ «ìîâ- ÷àçíèõ» êëàñòåð³â ãåí³â á³îñèíòåçó âòîðèííèõ ìåòàáîë³ò³â – òèõ, ùî íå åêñïðåñóþòüñÿ çà ñòàí- äàðòíèõ óìîâ ôåðìåíòàö³¿ [8]. Ãåíîìè àêòèíî- ОБЗОРНЫЕ СТАТЬИ УДК 615.33:577.182. М.В. РАБИК, Б.О. ОСТАШ, В.О. ФЕДОРЕНКО Львівський національний університет імені Івана Франка E-mail: v_fedorenko@franko.lviv.ua МЕРЕЖІ ГЕНІВ РЕГУЛЯЦІЇ ВТОРИННОГО МЕТАБОЛІЗМУ АКТИНОМІЦЕТІВ: ПЛЕЙОТРОПНІ РЕГУЛЯТОРИ © Ì.Â. ÐÀÁÈÊ, Á.Î. ÎÑÒÀØ, Â.Î. ÔÅÄÎÐÅÍÊÎ, 2014 ISSN 0564–3783. Öèòîëîãèÿ è ãåíåòèêà. 2014. Ò. 48. ¹ 168 Ì.Â. Ðàáèê, Á.Î. Îñòàø, Â.Î. Ôåäîðåíêî ì³öåò³â ì³ñòÿòü ÷èìàëî òàêèõ êëàñòåð³â [5, 9], ³ âàæëèâèì çàâäàííÿì á³îòåõíîëîã³¿ ñòàº á³ëüø ïîâíå ðîçêðèòòÿ ¿õíüîãî á³îñèíòåòè÷íîãî ïî- òåíö³àëó. Ìàí³ïóëþâàííÿ ðåãóëÿòîðíèìè ãåíà- ìè º îäíèì ³ç ñïîñîá³â àêòèâàö³¿ ìîâ÷àçíèõ êëàñòåð³â. Êð³ì òîãî, âîíè íàáóâàþòü âàæëè- âîãî çíà÷åííÿ ó ñòâîðåíí³ ïðîìèñëîâèõ íàä- ïðîäóöåíò³â â³äîìèõ àíòèá³îòèê³â. ²íøèé àñïåêò âèâ÷åííÿ ðåãóëÿö³¿ – ÷è ìîæíà ò³ çàêîíîì³ðíîñò³ ðåãóëÿö³¿, ùî äîñë³äæåí³ ó S. coelicolor òà ³í- øèõ ìîäåëüíèõ îá’ºêò³â, ïåðåíîñèòè íà ðåãó- ëÿö³þ ïðîäóêö³¿ âòîðèííèõ ìåòàáîë³ò³â â óñ³õ ñòðåïòîì³öåò³â, à òàêîæ âèêîðèñòîâóâàòè äëÿ ï³äâèùåííÿ ïðîäóêö³¿ â³äîìèõ ñïîëóê òà âèÿâ- ëåííÿ íîâèõ. Çîêðåìà öå ñòîñóºòüñÿ ì³êðîîð- ãàí³çì³â, ó ÿêèõ êëàñòåðè ãåí³â ñèíòåçó àíòè- á³îòèê³â íå ì³ñòÿòü øëÿõ-ñïåöèô³÷íèõ ðåãóëÿ- òîð³â, ÿê ó âèïàäêó êëàñòåðà ãåí³â á³îñèíòåçó ìîåíîì³öèíó À (ÌìÀ; moe-êëàñòåð) S. ghanaen- sis, åðèòðîì³öèíó (ery-êëàñòåð) ó Sañcharopoly- spora erythraea [7, 10]. Äëÿ äîñë³äæåííÿ ðåãóëÿö³¿ òàêèõ íåòèïîâèõ êëàñòåð³â äîö³ëüíî äîñë³äè- òè âïëèâ ïëåéîòðîïíèõ ðåãóëÿòîð³â íà ñèíòåç. Ùîá îö³íèòè ¿õíþ ìîæëèâó ðîëü ó ðåãóëÿö³¿ âòîðèííîãî ìåòàáîë³çìó, âèêîðèñòîâóþòü ìåòîä òèòðóâàííÿ ïðîìîòîð³â äëÿ äîñë³äæåííÿ òîãî, ÷è ãåíè òàêèõ êëàñòåð³â ï³äëÿãàþòü âïëèâó òðàíñêðèïö³éíèõ ðåãóëÿòîð³â. Íàïðèêëàä, çà äîïîìîãîþ ìåòîäó òèòðóâàííÿ âèâ÷åíî ïðîìî- òîðè äâîõ êëþ÷îâèõ ãåí³â á³îñèíòåçó ÌìÀ – moeO5 òà moeE, ÿê³ êîíòðîëþþòü ïåðø³ êðîêè á³îñèíòåçó ìîåíîì³öèíó A ó S. ghanaensis [10]. Òèòðóâàííÿ çãàäàíèõ ïðîìîòîð³â ïîêàçàëî, ùî ö³ ãåíè ï³äëÿãàþòü òðàíñêðèïö³éí³é ðåãóëÿö³¿, äå ïàí³âíà ðîëü íàëåæèòü ïîçèòèâíèì ðåãó- ëÿòîðàì, îñê³ëüêè ââåäåííÿ âåëèêî¿ ê³ëüêîñò³ êîï³é ïðîìîòîð³â ïðèçâîäèòü äî ïàä³ííÿ ð³âíÿ ïðîäóêö³¿ ìîåíîì³öèí³â [11]. Îòæå âèÿâèâøè, ùî ãåíè ó êëàñòåð³ ðåãóëþþòüñÿ ïåâíèìè ðå- ãóëÿòîðàìè, ìîæíà âèêîðèñòîâóâàòè ãåíåòè÷í³ ìàí³ïóëÿö³¿ ç öèìè ðåãóëÿòîðíèìè ãåíàìè äëÿ ñòâîðåííÿ øòàì³â íàäïðîäóöåíò³â. Плейотропні гени-регулятори, які координують морфогенез і синтез антибіотиків Ïåðøèìè ñåðåä ïëåéîòðîïíèõ ãåí³â, ìóòàö³¿ ÿêèõ çóìîâëþþòü ïðèïèíåííÿ ñèíòåçó àíòè- á³îòèê³â ³ âòðàòó çäàòíîñò³ óòâîðþâàòè ïîâ³ò- ðÿíèé ì³öåë³é, îïèñàí³ bld-ãåíè (â³ä àíãë. bald – ëèñèé) ó S. coelicolor [12]. ²äåíòèô³êîâàíî ïîíàä 10 bld-ëîêóñ³â S. coelicolor, çîêðåìà, bldA-D, bldF-H, bld², bld261(J), bldM ³ bldN [13, 14]. Ö³ ãåíè êîäóþòü ð³çíîìàí³òí³ ïðîäóêòè, âêëþ÷àþ- ÷è òÐÍÊ (bldA), ìåìáðàííèé òðàíñïîðòåð (bldK), -ôàêòîð (bldN), àíòè-àíòè- -ôàêòîð (bldG) ³ ÷èñëåíí³ òðàíñêðèïö³éí³ ôàêòîðè (bldH; bldB; bldD) [15–20]. Ãîìîëîãè bld-ãåí³â âèÿâëåíî â ãåíîìàõ ³íøèõ àêòèíîì³öåò³â [11, 21, 22]. Íà- ïðèêëàä, ó S. erythraea BldD ðåãóëþº á³îñèíòåç åðèòðîì³öèíó, âçàºìîä³þ÷è ç ïðîìîòîðàìè ãå- í³â ery-êëàñòåðà [7]. Ñï³ëüíîþ ðèñîþ âñ³õ bld-ìóòàíò³â º âòðàòà çäàòíîñò³ ñèíòåçóâàòè òà ñåêðåòóâàòè ã³äðîôîá- íèé ïåïòèä SapB – ñóðôàêòàíò, ÿêèé çàáåçïå÷óº ïîäîëàííÿ ïîâåðõíåâîãî íàòÿãó òà ï³äíÿòòÿ ïî- â³òðÿíèõ ã³ô³â íàä ïîâåðõíåþ òâåðäîãî ñåðå- äîâèùà [23]. Ôîðìóâàííÿ ïîâ³òðÿíîãî ì³öåë³þ ìîæå â³äíîâëþâàòèñÿ ó Bld–-êîëîí³é, ÿê³ ðîñ- òóòü ïîáëèçó òèõ êîëîí³é, ùî ïðîäóêóþòü SapB. Öå ÿâèùå òàêîæ ñïîñòåð³ãàºòüñÿ ïðè ðîñò³ ó áåçïîñåðåäí³é áëèçüêîñò³ ïåâíèõ ïàð bld-ìó- òàíò³â ³ ñâ³ä÷èòü ïðî òå, ùî bld-ãåíè ïðÿìî ÷è îïîñåðåäêîâàíî ðåãóëþþòü ïðîäóêö³þ á³ëêà SapB [14, 22]. Çà äîïîìîãîþ êîìïëåìåíòàö³é- íèõ òåñò³â âñòàíîâëåíî ³ºðàðõ³þ bld-ãåí³â, ÿêà ´ðóíòóºòüñÿ íà çäàòíîñò³ îäíèõ bld-ìóòàíò³â â³äíîâëþâàòè ôîðìóâàííÿ ïîâ³òðÿíîãî ì³öåë³þ â ³íøèõ bld-ìóòàíò³â – bldJ < bldK/bldL < bldA/ bldH < bldG < bldC < bldD/bldM, ïðîòå äåÿê³ ãåíè, çîêðåìà bldB ³ bldN, íå íàëåæàòü äî æîä- íî¿ ç öèõ ãðóï êîìïëåìåíòàö³¿ [22]. BldK – îäèí ç ïåðøèõ á³ëê³â ó ñèãíàëüíîìó êàñêàä³, ùî ðåãóëþº ôîðìóâàííÿ SapB [15]. Éîãî ïðîäóêòîì º ABC-òðàíñïîðòåð, ùî ïåðåíîñèòü â êë³òèíè ñèãíàëüíó ìîëåêóëó – îë³ãîïåïòèä, ÿêèé «âìèêàº» åêñïðåñ³þ êàñêàäó bld-ãåí³â [24]. Ëîêóñ bldG ì³ñòèòü äâà ãåíè – bldG ³ orf3, ÿê³ êîäóþòü â³äïîâ³äíî àíòè-àíòè- -ôàêòîð òà àíòè- -ôàêòîð, ùî çàä³ÿí³ ó òðàíñêðèïö³þ ãå- í³â á³îñèíòåçó àíòèá³îòèê³â ³ ñïîðóëÿö³¿ [17]. Ãåí bldD êîäóº á³ëîê, ðîçì³ùåíèé ó ê³íö³ ñèã- íàëüíîãî êàñêàäó. Éîãî ïðîäóêò – êëþ÷îâèé ðåïðåñîð ãåí³â ìîðôîëîã³÷íî¿ äèôåðåíö³àö³¿ òà àíòèá³îòèêîóòâîðåííÿ ïðîòÿãîì âåãåòàòèâíîãî ðîçâèòêó. Ðåãóëîí, ÿêèé «îáñëóãîâóþº» BldD, âêëþ÷àº 167 òðàíñêðèïö³éíèõ îäèíèöü, ñåðåä ÿêèõ á³ëüøå 20 â³ä³ãðàþòü âàæëèâó ðîëü ó ìîðôîëîã³÷íîìó ðîçâèòêó àêòèíîì³öåò³â (bldA, bldC, bldH/adpA, bldM, bldN, ssgA, ssgB, ftsZ, whiB, whiG) ³ âòîðèííîìó ìåòàáîë³çì³ (nsdA, bldA, bldC) ISSN 0564–3783. Öèòîëîãèÿ è ãåíåòèêà. 2014. Ò. 48. ¹ 1 69 Ìåðåæ³ ãåí³â ðåãóëÿö³¿ âòîðèííîãî ìåòàáîë³çìó àêòèíîì³öåò³â: ïëåéîòðîïí³ ðåãóëÿòîðè [25]. Ãåí bldN êîäóº -ôàêòîð, ÿêèé íàëåæèòü äî ñóáðîäèíè ECF -ôàêòîð³â ÐÍÊ-ïîë³ìåðàç. Åêñïðåñ³ÿ ãåíà bldN çàëåæèòü â³ä ïðîäóêò³â ãå- í³â bldG, bldH ³ bldD. Éîãî òðàíñêðèïö³ÿ ïðàê- òè÷íî íå â³äáóâàºòüñÿ ïðîòÿãîì âåãåòàòèâíîãî ðîñòó, àëå äîñÿãàº íàéâèùîãî ð³âíÿ ï³ä ÷àñ ôîðìóâàííÿ ïîâ³òðÿíîãî ì³öåë³þ [20]. Òàêèì ÷èíîì, öåé -ôàêòîð çàáåçïå÷óº åêñïðåñ³þ ãå- í³â, íåîáõ³äíèõ äëÿ ìîðôîëîã³÷íî¿ äèôåðåí- ö³àö³¿ àêòèíîì³öåò³â ³ âòîðèííîãî ìåòàáîë³çìó â ñòàö³îíàðí³é ôàç³ ðîçâèòêó. Íàéá³ëüø âèâ÷åíèì ç bld-ãåí³â º bldÀ, ÿêèé êîäóº ëåéöèë-òÐÍÊ, ùî ç÷èòóº êîäîí UUA ìÐÍÊ [16, 26]. UUA º îäíèì ³ç øåñòè ëåéöè- íîâèõ êîäîí³â. Äëÿ àêòèíîì³öåò³â â³í îñîá- ëèâèé, áî â G+C-áàãàò³é ÄÍÊ öèõ áàêòåð³é êîäîíè TTA çóñòð³÷àþòüñÿ ð³äêî [27–29]. Ò³ëü- êè 145 ç 7825 õðîìîñîìíèõ ãåí³â S. coelicolor ì³ñòÿòü TTA-êîäîíè. Á³ëüø³ñòü ç öèõ ãåí³â ì³ñòÿòü ò³ëüêè îäèí TTA-êîäîí, íàòîì³ñòü â 10 ãåíàõ º äâà òàêèõ êîäîíè. Ââàæàþòü, ùî ãåí bldA ðåãóëþº òðàíñëÿö³þ ìÐÍÊ ãåí³â, ÿê³ ì³ñòÿòü ÒÒÀ-êîäîí ³, î÷åâèäíî, êîíòðîëþþòü ìîðôîãåíåç òà àíòèá³îòèêîóòâîðåííÿ [30]. Îä- íàê ðîëü ó ïåðâèííîìó òà âòîðèííîìó ìåòà- áîë³çì³ S. coelicolor äîñë³äæåíî ëèøå â äå- ê³ëüêîõ TTA-âì³ñíèõ ãåí³â. Ãåí bldH òàêîæ ì³ñòèòü TTA-êîäîí. Êîëè æ éîãî çàì³íèëè íà ³íøèé ëåéöèíîâèé êîäîí, òî bldA-ìóòàíò ôîð- ìóâàâ ïîâ³òðÿíèé ì³öåë³é ³ ñïîðè. Íåùîäàâíî âèÿâëåíî âçàºìîä³þ ì³æ bldH òà ãåíîì absB, ÿêèé ó S. coelicolor êîäóº ÐÍÊàçó ²²². Âîíà ã³äðîë³çóº òðàíñêðèïòè ãåíà bldH, çìåíøóþ÷è éîãî åêñïðåñ³þ. Ó ñâîþ ÷åðãó BldH âïëèâàº íà ôóíêö³îíóâàííÿ AbsB, ñòèìóëþþ÷è éîãî äåãðàäàö³þ ³, éìîâ³ðíî, àêòèâóþ÷è åêñïðåñ³þ íå³äåíòèô³êîâàíèõ ãåí³â ïðîòåàç [45]. Ãåí adpA S. griseus, ãîìîëîã bldH, êîäóº êëþ÷îâèé ðåãó- ëÿòîð ³ç ìíîæèííèìè ôóíêö³ÿìè [31]. Éîãî ðåãóëîí íàë³÷óº ïîíàä 500 ãåí³â, ³ ãåí bldA S. griseus òàêîæ º ì³øåííþ AdpA [32]. Ìàëî âèâ÷åíîþ îñîáëèâ³ñòþ bld-ìóòàíò³â º ¿õíÿ çäàòí³ñòü â³äíîâëþâàòè ìîðôîëîã³÷í³ ³ ô³- ç³îëîã³÷í³ îçíàêè äèêîãî òèïó ïðè ðîñò³ íà ð³çíèõ äæåðåëàõ âóãëåöþ. Ìóòàíòè bldA, bldD, bldG óòâîðþþòü íîðìàëüíèé ïîâ³òðÿíèé ì³öå- ë³é, àëå íå ñèíòåçóþòü àíòèá³îòèêè ïðè äîäà- âàíí³ â ñåðåäîâèùå ìàí³òîëó çàì³ñòü ãëþêîçè [18]. Âîäíî÷àñ çà öèõ óìîâ ìóòàíò bldH ïîâ- í³ñòþ â³äíîâëþº îáèäâà ôåíîòèïè. Îäíàê ìó- òàö³ÿ â ãåí³ bldB áëîêóº ôîðìóâàííÿ ïîâ³òðÿ- íîãî ì³öåë³þ ³ ñèíòåç àíòèá³îòèê³â íåçàëåæíî â³ä óìîâ êóëüòèâóâàííÿ. Ìóòàíòàì çà ãåíîì bldB âëàñòèâ³ ïîðóøåííÿ âóãëåöåâî¿ êàòàáî- ë³òíî¿ ðåïðåñ³¿ – â íèõ åêñïðåñóþòüñÿ ãåíè, ÿê³ ó íîðì³ ïðèãí³÷åí³ çà íàÿâíîñò³ ãëþêîçè. Ö³êàâèì ôàêòîì º òå, ùî ãîìîëîãè ãåíà bldB âèÿâëÿþòüñÿ ò³ëüêè ó àêòèíîì³öåò³â, ÿê³ ôîð- ìóþòü ïîâ³òðÿíèé ì³öåë³é [33]. Ïëåéîòðîï- í³ñòü ìóòàö³é ãåíà bldB, à òàêîæ íàÿâí³ñòü ÄÍÊ-çâ’ÿçóâàëüíîãî ìîòèâó òèïó «ñï³ðàëü – ïî- âîðîò – ñï³ðàëü» ó á³ëêà BldB íàøòîâõóº íà äóì- êó, ùî â³í êîíòðîëþº åêñïðåñ³þ ãåí³â [18, 33]. Îòæå, â êàñêàä³ bld-ãåí³â S. coelicolor îäèí êîäóº ñèíòåç ñïåöèô³÷íî¿ ñèãíàëüíî¿ ìîëåêóëè (³ìîâ³ðíî, îë³ãîïåïòèä), à ³íø³ – á³ëêîâ³ ïðî- äóêòè, çàä³ÿí³ ó éîãî ñïðèéìàíí³ òà ïåðåäà÷³ ñèãíàëó, íåîáõ³äíîãî äëÿ êîîðäèíîâàíîãî ïåðå- õîäó ó ñòàö³îíàðíó ôàçó ³ äàëüøîãî ìîðôîëî- ã³÷íîãî ðîçâèòêó òà ñèíòåçó âòîðèííèõ ìåòà- áîë³ò³â. Ââàæàþòü, ùî bld-êàñêàä äàº çìîãó ñòðåïòîì³öåòàì àäàïòóâàòèñü äî ì³íëèâèõ óìîâ ñåðåäîâèùà, çîêðåìà, íàÿâí³ñòþ ð³çíèõ ïîæèâ- íèõ ðå÷îâèí [34]. Çä³éñíþþ÷è ãåíåòè÷í³ ìàí³ïóëÿö³¿ ç bld-ãå- íàìè, ìîæíà äîñÿãòè ï³äâèùåííÿ ð³âíÿ ïðî- äóêö³¿ àíòèá³îòèê³â ó àêòèíîì³öåò³â. Íàïðèê- ëàä, íàäåêñïðåñ³ÿ bldAgh ó S. ghanaensis ñïðè- ÷èíÿº çá³ëüøåííÿ ïðîäóêö³¿ ìåíîì³öèí³â ó òðè ðàçè ïîð³âíÿíî ç âèõ³äíèì øòàìîì [35]. Регуляція синтезу антибіотиків за допомогою бактерійних гормонів Ñåðåä ôàêòîð³â, ùî ðåãóëþþòü ñèíòåç àíòè- á³îòèê³â ³ ìîðôîãåíåç â àêòèíîì³öåò³â, âàæëèâó ðîëü â³ä³ãðàþòü -áóòèðîëàêòîíí³ àâòîðåãóëÿ- òîðè, ÿê³ ä³þòü ÿê çîâí³øíüîêë³òèíí³ ñèãíàëüí³ ìîëåêóëè. Çàëåæíî â³ä ñòðóêòóðíèõ â³äì³ííîñ- òåé Ñ-2 áîêîâîãî ëàíöþãà ñïîëóêè ¿õ êëàñè- ô³êóâàëè ó òðè òèïè: 1) â³ðäæèí³àáóòàíîë³äè S. virginiae (VB-A, B, C, D, E) ç -ã³äðîêñèëüíîþ ãðóïîþ; 2) IÌ2-ïîä³áí³ ñïîëóêè S. lavendulae, ùî ì³ñòÿòü -ã³äðîêñèë ó øîñòîìó ïîëîæåíí³; 3) À-ôàêòîð-ïîä³áí³ ðå÷îâèíè, ÿê³ ì³ñòÿòü 6- êåòî-ãðóïó (À-ôàêòîð ³ç S. griseus ³ ñïîëóêè S. coelicolor SCB1 ³ SCB2) (ðèñ. 1) [36, 37]. Ö³ àâòîðåãóëÿòîðè âèðîáëÿþòüñÿ ã³ôàìè ó â³äïî- â³äü íà ñèãíàëè ³ç çîâí³øíüîãî ñåðåäîâèùà. Ñèãíàëüí³ ìîëåêóëè ìîæóòü ïîøèðþâàòèñÿ ïî îäí³é ã³ô³ àáî ïðîíèêàòè ó ñóñ³äí³ ã³ôè. Îòæå, ISSN 0564–3783. Öèòîëîãèÿ è ãåíåòèêà. 2014. Ò. 48. ¹ 170 Ì.Â. Ðàáèê, Á.Î. Îñòàø, Â.Î. Ôåäîðåíêî àêòèíîì³öåòè ðîçâèíóëè ñèñòåìó íèçüêîìîëå- êóëÿðíèõ ðåãóëÿòîð³â, çäàòíèõ äî äèôóç³¿, ùî ñïðèÿº êîìóí³êàö³¿ ó ìåæàõ îäí³º¿ ã³ôè àáî ì³æ ð³çíèìè ã³ôàìè [36]. Ïåðøèé òàêèé àâòîðå- ãóëÿòîð – À-ôàêòîð (2-³çîêàïðèëî¿ë-3R-ã³äðî- êñèìåòèë- -áóòèðîëàêòîí) âèÿâëåíî ó S. griseus ÿê ³íäóêòîð ñèíòåçó ñòðåïòîì³öèíó ³ ôîðìó- âàííÿ ïîâ³òðÿíîãî ì³öåë³þ [36]. À-ôàêòîð òà- êîæ êîíòðîëþº ñèíòåç ï³ãìåíò³â – æîâòîãî ãð³êñàçîíó ³ ìåëàí³í-ïîä³áíîãî ãåêñàã³äðîêñè- ïåðèëåíåõ³íîíó. AfsA çä³éñíþº ñèíòåç À-ôàê- òîðà øëÿõîì êîíäåíñàö³¿ ïîõ³äíèõ ãë³öåðîëó òà -êåòîêèñëîò [38, 39]. Ãåí afsA çíàõîäèòüñÿ íà â³äñòàí³ 272 ï.í. â³ä îäíîãî ç ê³íö³â ë³í³éíî¿ õðîìîñîìè S. griseus, ùî çóìîâëþº âèñîêó íå- ñòàá³ëüí³ñòü ñèíòåçó À-ôàêòîðà [36]. Íà ê³íöÿõ õðîìîñîì àêòèíîì³öåò³â ÷àñòî â³äáóâàþòüñÿ äå- ëåö³¿ âíàñë³äîê ðåêîìá³íàö³¿ ì³æ ðîçì³ùåíè- ìè òàì ïîâòîðåííÿìè íóêëåîòèäíèõ ïîñë³äîâ- íîñòåé. Ìóòàíòè afsA S. griseus íå óòâîðþþòü ïîâ³òðÿíîãî ì³öåë³þ ³ íå ñèíòåçóþòü âòîðèííèõ ìåòàáîë³ò³â [40]. Ðîëü êëþ÷îâîãî «ãðàâöÿ» ó ðåãóëÿòîðíîìó êàñêàä³, çàëåæíîìó â³ä À-ôàêòîðà, âèêîíóº á³- ëîê ArpA, ùî çâ’ÿçóº éîãî. ArpA ðåïðåñóº ïðî- ìîòîð ãåíà adpA çà â³äñóòíîñò³ À-ôàêòîðà. Ãåí adpA êîäóº òðàíñêðèïö³éíèé ôàêòîð ç ðîäè- íè AraC/XylS, ÿêèé àêòèâóº ãåí strR øëÿõ-ñïå- öèô³÷íîãî ðåãóëÿòîðà á³îñèíòåçó ñòðåïòîì³öèíó. Ïîçèòèâíèé ðåãóëÿòîð SrtR ó ñâîþ ÷åðãó àêòèâóº òðàíñêðèïö³þ ãåí³â á³îñèíòåçó ñòðåïòîì³öèíó [36]. Çâ’ÿçóþ÷èñü ç ÀrpA, À-ôàêòîð çóìîâëþº äåðåïðåñ³þ ãåíà adpA. Îñê³ëüêè ÀrpA ðåïðå- ñóº ãåíè, ùî êîíòðîëþþòü ôîðìóâàííÿ ïîâ³ò- ðÿíîãî ì³öåë³þ ³ âòîðèííèé ìåòàáîë³çì, arpA- ìóòàíòè øâèäøå, í³æ äèêèé òèï, ïåðåõîäÿòü äî óòâîðåííÿ ïîâ³òðÿíèõ ã³ô ³ ñèíòåçóþòü ï³ä- âèùåí³ ê³ëüêîñò³ àíòèá³îòèêà [41, 42]. Ìóòàí- òè ç³ çðóéíîâàíèì ãåíîì adpA íå ñèíòåçóþòü àíòèá³îòèê, à éîãî íàäåêñïðåñ³ÿ ñïðè÷èíÿº á³ëüø ðàíí³é ïî÷àòîê ñèíòåçó ³ íàãðîìàäæåí- íÿ á³ëüøî¿ ê³ëüêîñò³ àíòèá³îòèêà [43]. Ïðè- ïóñêàþòü, ùî À-ôàêòîð º îñíîâíèì àêòèâàòî- ðîì ïðîäóêö³¿ á³ëüøîñò³, ÿêùî íå óñ³õ, âòîðèííèõ ìåòàáîë³ò³â ³ ôîðìóâàííÿ ïîâ³òðÿíîãî ì³öåë³þ ó S. griseus [44]. Â ³íøèõ ñòðåïòîì³öåò³â òàêèé çâ’ÿçîê âòðà÷åíèé, íàïðèêëàä bldH, ãîìîëîã ãå- íà adpA ó S. coelicolor, òàêîæ ðåãóëþº ìîðôîãåíåç ³ âòîðèííèé ìåòàáîë³çì, àëå íå ðåãóëþºòüñÿ - áóòèðîëàêòîíîì [28]. Øòàì S. coelicolor A3(2) ïðîäóêóº äåê³ëüêà -áóòèðîëàêòîí³â [46, 47], ÿê³ ìîæóòü â³äíîâ- ëþâàòè ñèíòåç ñòðåïòîì³öèíó ó ìóòàíò³â S. griseus, äåôåêòíèõ çà ñèíòåçîì À-ôàêòîðà, ïðî- òå æîäíà ç öèõ ñïîëóê íå ³íäóêóº ìîðôî- ëîã³÷íî¿ äèôåðåíö³àö³¿. Ïðîäóêò ãåíà scbA, ÿêèé çàä³ÿíèé â ñèíòåç³ íåùîäàâíî âèÿâëåíîãî - áóòèðîëàêòîíà S. coelicolor – SCB1, ãîìîëîã³÷- íèé äî ³íøèõ á³ëê³â ñèíòåçó áóòèðîëàêòîí³â (AfsA S. griseus, BarX S. virginiae ³ FarX S. lavendulae FRI-5) [48]. ²ìîâ³ðíî, êð³ì ó÷àñò³ ó ñèíòåç³ ãîðìîíó, â³í âèêîíóº î÷åâèäíî ³ ðå- ãóëÿòîðíó ôóíêö³þ [48, 49]. Äèâåðãåíòíî ðîç- ì³ùåíèé ãåí scbR êîäóº á³ëîê-ãîìîëîã ArpA. ScbR âëàñòèâà ÄÍÊ- ³ SCB1-çâ’ÿçóâàëüíà àê- òèâí³ñòü. Â³í òàêîæ, ³ìîâ³ðíî, çàä³ÿíèé ó á³ëîê- á³ëêîâèõ âçàºìîä³ÿõ. Öåé ðåãóëÿòîð çâ’ÿçóºòüñÿ ç ïðîìîòîðíèìè ä³ëÿíêàìè ãåí³â scbA ³ scbR, ó òàêèé ñïîñ³á çä³éñíþþ÷è ñâîþ ðåïðåñîðíó ôóíêö³þ. Çàïðîïîíîâàíî ìîäåëü ðåãóëÿö³¿ çà ó÷àñò³ áóòèðîëàêòîíà SCB1 (ðèñ. 2). ScbR ï³ä ÷àñ åêñ- ïîíåíö³éíî¿ ôàçè ðîñòó S. coelicolor ðåïðåñóº òðàíñêðèïö³þ scbA òà âëàñíîãî ãåíà. Ïðîòå, åêñ- ïðåñ³ÿ scbA íà áàçàëüíîìó ð³âí³ âñå æ â³äáóâàº- òüñÿ, ³ äî ìîìåíòó ïåðåõîäó ó ñòàö³îíàðíó ôàçó ðîñòó íàêîïè÷óºòüñÿ äîñòàòíüî ScbA. Â³äáó- âàºòüñÿ ôîðìóâàííÿ á³ëêîâîãî êîìïëåêñó ScbA – ScbR, ÿêèé àêòèâóº òðàíñêðèïö³þ ãåíà scbA. Íà- ãðîìàäèâøèñü, SCB1 ïðèºäíóºòüñÿ äî ScbR, ïå- ðåøêîäæàþ÷è éîãî çâ’ÿçóâàííþ ³ç âëàñíèì ïðî- ìîòîðîì, òà ³íàêòèâóº êîìïëåêñ ScbA – ScbR. Öå çóìîâëþº çìåíøåííÿ ð³âíÿ òðàíñêðèïö³¿ ãåíà scbA. ²ìîâ³ðíî, ScbR çä³éñíþº ðåïðåñ³þ Ðèñ. 1. Ñòðóêòóðí³ ôîðìóëè ïðåäñòàâíèê³â òðüîõ ãðóï -áóòèðîëàêòîí³â, âèÿâëåíèõ ó ð³çíèõ øòàì³â ñòðåïòîì³öåò³â – ïðîäóöåíò³â àíòèá³îòèê³â: à – À- ôàêòîð S. griseus; á – ²Ì-2 S. lavendulae; â – ôàêòîð 1 S. viridochromogenes; ã – â³ðäæèí³àáóòàíîë³äè S. vir- giniae ISSN 0564–3783. Öèòîëîãèÿ è ãåíåòèêà. 2014. Ò. 48. ¹ 1 71 Ìåðåæ³ ãåí³â ðåãóëÿö³¿ âòîðèííîãî ìåòàáîë³çìó àêòèíîì³öåò³â: ïëåéîòðîïí³ ðåãóëÿòîðè Ðèñ. 2. Ñõåìàòè÷íà ìîäåëü ðåãóëÿö³¿ âòîðèííîãî ìåòàáîë³çìó S. coelicolor çà äîïîìîãîþ SCB1-áóòè- ðîëàêòîíó (äåòàë³ ó òåêñò³): ScbR – êîëî, ScbA – á³ëèé êâàäðàò, -áóòèðîëàêòîí – òðèêóòíèê, êîìïëåêñ ScbR–SCB1 – ÷îðíå êîëî ³ç òðèêóòíèêîì, scbRp, scbAp òà kasOp – ïðîìîòîðè ãåí³â scbR, scbA, kasO â³äïîâ³äíî ISSN 0564–3783. Öèòîëîãèÿ è ãåíåòèêà. 2014. Ò. 48. ¹ 172 Ì.Â. Ðàáèê, Á.Î. Îñòàø, Â.Î. Ôåäîðåíêî íàðàç³ íå³äåíòèô³êîâàíîãî ðåïðåñîðà ïðîäóêö³¿ àíòèá³îòèê³â ó S. coelicolor. Îòæå ïàä³ííÿ ð³â- íÿ SCB1, î÷åâèäíî âíàñë³äîê äèôóç³¿, à òàêîæ âèñîêèé ð³âåíü á³ëêà ScbR ïðèçâîäÿòü äî äå- ðåïðåñ³¿ ñèíòåçó àíòèá³îòèê³â [37]. Âèõîäÿ÷è ç ö³º¿ çàïðîïîíîâàíî¿ ìîäåë³ ñòàº çðîçóì³ëî, ùî äåëåö³ÿ scbA çóìîâëþº ïåðåä÷àñíó íàäïðîäóê- ö³þ óíäåöèëïðîäèã³îçèíó ³ àêòèíîðîäèíó, îñ- ê³ëüêè ó ìóòàíò³â scbA áàçàëüíèé ð³âåíü ScbR äîñòàòí³é äëÿ òîãî, ùîá â³äáóâàâñÿ íàäñèíòåç öèõ ñïîëóê [48]. Â³äïîâ³äíî, äåëåö³ÿ scbR ïðèç- âîäèòü äî çàòðèìàííÿ ¿õíüîãî ñèíòåçó [37]. ²äåíòèô³êîâàíî ùå îäíó ì³øåíü ä³¿ á³ëêà ScbR – ãåí kasO, ïðîäóêò ÿêîãî º ãîìîëîãîì øëÿõ-ñïåöèô³÷íèõ ðåãóëÿòîðíèõ á³ëê³â SARP- ðîäèíè (â³ä Streptomyces antibiotic regulatory pro- tein) ³ àêòèâóº åêñïðåñ³þ êðèïòè÷íîãî êëàñòåðà ãåí³â ñèíòåçó ïîë³êåòèäó. Îòæå, -áóòèðîëàê- òîíè ìîæóòü òàêîæ áåçïîñåðåäíüî âïëèâàòè é íà øëÿõ-ñïåöèô³÷í³ ðåãóëÿòîðí³ ãåíè ó êëàñòå- ðàõ ãåí³â á³îñèíòåçó àíòèá³îòèê³â [50]. Роль гуанозинтетрафосфату (ppGpp) в ініціації вторинного метаболізму у стрептоміцетів ²ñíóº çâ’ÿçîê ì³æ øâèäê³ñòþ ðîñòó àêòèíî- ì³öåò³â òà á³îñèíòåçîì âòîðèííèõ ìåòàáîë³ò³â. Çàòðèìêà ðîñòó º ñèãíàëîì äëÿ ïî÷àòêó ñèíòå- çó àíòèá³îòèê³â. Ó S. coelicolor òðàíñêðèïö³ÿ øëÿõ-ñïåöèô³÷íèõ ðåãóëÿòîðíèõ ãåí³â redD ³ actII-ORF4 êîðåëþº ³ç ïîÿâîþ ppGpp. Â E. coli (ð)ppGpp ñèíòåçóºòüñÿ ç ÀÒÔ ³ ÃÒÔ çà ó÷àñò³ ppGpp-ñèíòåòàçè RelA, çâ’ÿçàíî¿ ³ç ðèáîñîìà- ìè, ÿêà àêòèâóºòüñÿ, êîëè íåàöèëüîâàíà òÐÍÊ ïîòðàïëÿº â À-ñàéò ðèáîñîìè [51]. Äëÿ àêòè- âàö³¿ RelA íåîáõ³äíèé á³ëîê L11 (RelC) 50S ñóáîäèíèö³ ðèáîñîìè. Ïîÿâà (p)ppGpp êîðå- ëþº ç³ çìåíøåííÿì ð³âíÿ òðàíñêðèïö³¿ áàãà- òüîõ ãåí³â, íåîáõ³äíèõ äëÿ øâèäêîãî ðîñòó, ³ çðîñòàííÿì ð³âíÿ òðàíñêðèïö³¿ òèõ, ùî àêòèâ- í³ ó ñòàö³îíàðí³é ôàç³ ðîñòó òà ïðè ³íøèõ ô³ç³îëîã³÷íèõ ñòðåñàõ. Ïðèïóñêàþòü, ùî ppGpp ìîæå âïëèâàòè íà ñïîð³äíåí³ñòü ÐÍÊ-ïîë³ìå- ðàçè äî ïðîìîòîð³â öèõ ãåí³â [51]. Çíèæåííÿ ð³âíÿ ñèíòåçó àíòèá³îòèê³â, ÿêå ÷àñòî ñïîñòå- ð³ãàºòüñÿ ó relC-ìóòàíò³â äåÿêèõ ñòðåïòîì³öåò³â, ³ìîâ³ðíî, º ðåçóëüòàòîì ñèíòåçó äåôåêòíîãî á³ë- êà L11. Ó S. coelicolor relA-ìóòàíòè ³ç íåïîø- êîäæåíèì äîìåíîì, ùî â³äïîâ³äàº çà ñèíòåç ppGpð, íå ñèíòåçóþòü àíòèá³îòèêè, àëå çáåð³- ãàþòü çàëèøêîâó àêòèâí³ñòü RelA. Äåëåö³ÿ relA ìàº âèá³ðêîâèé âïëèâ íà ñèíòåç àíòèá³îòèê³â çàëåæíî â³ä ñêëàäó ïîæèâíîãî ñåðåäîâèùà, çî- êðåìà ppGpp íåîáõ³äíèé äëÿ àêòèâàö³¿ ñèíòåçó âòîðèííèõ ìåòàáîë³ò³â ó â³äïîâ³äü íà àçîòíå ãî- ëîäóâàííÿ [52–54]. ²íàêòèâàö³ÿ ãåíà relA ó S. clavuligerus çóìîâëþº çðîñòàííÿ ñèíòåçó êëà- âóëàíîâî¿ êèñëîòè òà öåôàì³öèíó Ñ. Ìóòàíòè relA S. clavuligerus íå ìîæóòü ôîðìóâàòè ïîâ³- òðÿíèé ì³öåë³é ³ ñïîðóëþâàòè [55]. Íàòîì³ñòü íàäåêñïðåñ³ÿ relA ó S. ghanaensis âåäå äî çðîñ- òàííÿ ïðîäóêö³¿ ìîåíîì³öèíó À [11]. Îòæå, ppGpp âèÿâëÿº ÿê ïîçèòèâíèé, òàê ³ íåãàòèâ- íèé âïëèâ íà ñèíòåç àíòèá³îòèê³â. Ó S. coelicol- or ³ S. antibioticus, àëå íå â E. coli, (ð)ppGpp ³í- ã³áóº ïîë³íóêëåîòèäôîñôîðèëàçó, ÿêà ðîçùåï- ëþº ÐÍÊ, ï³äâèùóþ÷è ñòàá³ëüí³ñòü êë³òèííèõ ìÐÍÊ [56]. Регуляція біосинтезу антибіотиків в актиноміцетів за участі джерел живлення Ñèíòåç âòîðèííèõ ìåòàáîë³ò³â, ÿê ïðàâèëî, â³äáóâàºòüñÿ ó ñòàö³îíàðí³é ôàç³ ðîñòó àêòèíî- ì³öåò³â ³ çóìîâëåíèé âèñíàæåííÿì äæåðåë æèâ- ëåííÿ àáî çìåíøåííÿì øâèäêîñò³ ðîñòó [3, 28, 57–60]. Ãëóòàìàò òà N-àöåòèëãëþêîçàì³í – âàæëèâ³ äæåðåëà êàðáîíó òà í³òðîãåíó äëÿ àêòèíîì³öå- ò³â, çîêðåìà ó S. coelicolor âîíè çàñâîþþòüñÿ øâèäøå, í³æ ãëþêîçà [8]. Ãëþêîçàì³í-6-ôîñ- ôàò – îäèí ç ìåòàáîë³ò³â, ùî óòâîðþºòüñÿ ïðè çàñâîºíí³ N-àöåòèëãëþêîçàì³íó, º îñíîâíèì ïîïåðåäíèêîì ñèíòåçó êë³òèííî¿ ñò³íêè ³ âîä- íî÷àñ ìîíîìåðîì õ³òèíó. Ïðè äîäàâàíí³ N- àöåòèëãëþêîçàì³íó ó êîíöåíòðàö³ÿõ 5–10 ìM ³íã³áóþòüñÿ ìîðôîëîã³÷íà äèôåðåíö³àö³ÿ òà á³î- ñèíòåç àíòèá³îòèê³â çà íàÿâíîñò³ ³íøèõ äæåðåë êàðáîíó. Çà ¿õ â³äñóòíîñò³ ñïîñòåð³ãàºòüñÿ çâî- ðîòíèé åôåêò. N-àöåòèëãëþêîçàì³í ïî-ð³çíîìó âïëèâàº íà ìîðôîëîã³÷íèé ðîçâèòîê òà âòî- ðèííèé ìåòàáîë³çì çàëåæíî â³ä éîãî ïîõîä- æåííÿ. Êîëè äæåðåëîì N-àöåòèëãëþêîçàì³íó º õ³òèí (íà áàãàòèõ ñåðåäîâèùàõ), òî ñèíòåç àíòèá³îòèê³â ³ ñïîðóëÿö³ÿ ïðèãí³÷óºòüñÿ. Íà- òîì³ñòü çà äåô³öèòó ïîæèâíèõ ðå÷îâèí ó ñå- ðåäîâèù³ N-àöåòèëãëþêîçàì³í, ùî óòâîðèâñÿ âíàñë³äîê ë³çèñó êë³òèííî¿ ñò³íêè, ñòèìóëþº ðîçâèòîê ïîâ³òðÿíîãî ì³öåë³þ ³ ïðîäóêö³þ âòî- ðèííèõ ìåòàáîë³ò³â. Âàæëèâó ðîëü ó öüîìó ïðî- öåñ³ â³ä³ãðàº ãëîáàëüíèé ðåãóëÿòîð DasR, ùî íàëåæèòü äî GntR-ðîäèíè ðåãóëÿòîðíèõ á³ëê³â. ISSN 0564–3783. Öèòîëîãèÿ è ãåíåòèêà. 2014. Ò. 48. ¹ 1 73 Ìåðåæ³ ãåí³â ðåãóëÿö³¿ âòîðèííîãî ìåòàáîë³çìó àêòèíîì³öåò³â: ïëåéîòðîïí³ ðåãóëÿòîðè Â³í ðåãóëþº ãåíè òðàíñïîðòóâàííÿ ³ ìåòà- áîë³çìó N-àöåòèëãëþêîçàì³íó, à òàêîæ ïðî- äóêö³¿ àíòèá³îòèê³â [58, 61]. DasR çâ’ÿçóºòüñÿ ç ïðîìîòîðîì øëÿõ-ñïåöèô³÷íîãî ðåãóëÿòîð- íîãî ãåíà á³îñèíòåçó àêòèíîðîäèíó actII-ORF4 ³ âïëèâàº íà òðàíñêðèïö³þ ãåí³â á³îñèíòåçó óíäåöèëïðîäåã³îçèíó òà êàëüö³é-çàëåæíîãî àíòè- á³îòèêà â S. coelicolor A3(2). Íà ì³í³ìàëüíî- ìó ñåðåäîâèù³ ó dasR-ìóòàíò³â S. coelicolor ñïî- ñòåð³ãàºòüñÿ çá³ëüøåííÿ ð³âíÿ òðàíñêðèïö³¿ ãå- í³â óñ³õ â³äîìèõ êëàñòåð³â âòîðèííîãî ìåòàáî- ë³çìó (act-, cda-, red- òà êðèïòè÷íèõ cpk-ãåí³â). Ãëþêîçàì³í-6-ôîñôàò – ïðîäóêò ìåòàáîë³çìó N- àöåòèëãëþêîçàì³íó, çâ’ÿçóþ÷èñü ç DasR, çìåí- øóº éîãî ñïîð³äíåí³ñòü äî ÄÍÊ ³ ó òàêèé ñïîñ³á ³íàêòèâóº ðåïðåñîðíó ôóíêö³þ öüîãî á³ëêà [61]. Åêñïðåñ³ÿ ãåí³â á³îñèíòåçó àíòèá³îòèê³â íå- ãàòèâíî ðåãóëþºòüñÿ ôîñôàòîì: òðàíñêðèïö³ÿ â³äïîâ³äíèõ ãåí³â çä³éñíþºòüñÿ çà óìîâ éîãî îáìåæåíî¿ ê³ëüêîñò³ [62]. Êëþ÷îâó ðîëü ó ôîñ- ôàòí³é ðåãóëÿö³¿ â³ä³ãðàº äâîêîìïîíåíòíà ñèã- íàëüíà ñèñòåìà PhoR/P. PhoR – öå òðàíñ- ìåìáðàííèé ñåíñîðíèé á³ëîê, à PhoP íàëå- æèòü äî OmpR-ðîäèíè á³ëê³â ³ç òèïîâèì äî- ìåíîì çâ’ÿçóâàííÿ ÄÍÊ «ñï³ðàëü – ïîâîðîò – ñï³ðàëü» íà Ñ-ê³íö³ [62]. Ìóòàíòè phoR-phoP S. lividans íå çäàòí³ ñèíòåçóâàòè ëóæíó ôîñôàòàçó, ÿêà êîäóºòü- ñÿ ãåíîì phoÀ, òà íå ðîñòóòü íà ì³í³ìàëü- íîìó ñåðåäîâèù³ ç 10 ìêÌ íåîðãàí³÷íîãî ôîñ- ôàòó, òîä³ ÿê çà òàêî¿ íèçüêî¿ êîíöåíòðàö³¿ äèêèé òèï S. lividans ðîñòå äîáðå. S. lividans ì³ñòèòü êëàñòåð act, àëå íà â³äì³íó â³ä S. coe- licolor íå ñèíòåçóº àêòèíîðîäèíó. Êîëè ìó- òàíòè phoP òà phoRP âèðîùóâàëè ó ð³äêî- ìó ñåðåäîâèù³ ç íèçüêîþ êîíöåíòðàö³ºþ ôîñ- ôîðó, âîíè ñèíòåçóâàëè çá³ëüøåí³ ê³ëüêîñò³ àêòèíîðîäèíó. Çà íàäëèøêó ôîñôîðó ó ñåðå- äîâèù³ á³îñèíòåç àêòèíîðîäèíó çìåíøóâàâ- ñÿ, îòæå ïðè âèñîê³é êîíöåíòðàö³¿ ôîñôîðó ðåãóëÿòîðíèé åôåêò PhoR-PhoP îìèíàºòüñÿ [62]. ßê óæå çàçíà÷àëîñÿ, á³ëîê PhoP º êî- àêòèâàòîðîì òðàíñêðèïö³¿ ãåíà afsS, ÿêèé ó ñâîþ ÷åðãó àêòèâóº á³îñèíòåç àêòèíîðîäèíó òà óíäåöèëïðîäåã³îçèíó. Îòæå, ñèñòåìà phoR- phoP â³ä³ãðàº âàæëèâó ðîëü ó ðåãóëÿö³¿ á³îñèí- òåçó âòîðèííèõ ìåòàáîë³ò³â, âèêîíóþ÷è ðîëü ïîñåðåäíèêà ì³æ çîâí³øí³ì ³ âíóòð³øíüîêë³- òèííèì ñåðåäîâèùåì (ðèñ. 3). Ó S. lividans ãåí ppk êîäóº ïîë³ôîñôàòê³íàçó. Éîãî ãîìîëîãè âèÿâëåíî ³ ó S. coelicolor òà ³íøèõ àêòèíîì³öåò³â. Êîëè S. lividans ðîñòå íà áàãàòîìó ñåðåäîâèù³, òî ïðîòÿãîì ðîçâèòêó ñóáñòðàòíîãî ì³öåë³þ ìåòàáîë³çì äóæå àêòèâ- íèé ³ ñèíòåçóºòüñÿ íàäëèøîê ÀÒÔ. Ïðè öüîìó Ppk ïåðåòâîðþº ÀÒÔ ó ïîë³ôîñôàò. Â³í ìîæå ðîçêëàäàòèñÿ äî ôîñôàòíèõ ìîíîìåð³â ï³ä ä³ºþ åêçîïîë³ôîñôàòàçè ³ ñëóãóº äæåðåëîì ôîñôàòó ïðîòÿãîì ðîçâèòêó ïîâ³òðÿíîãî ì³öåë³þ. Öåé ôåðìåíò òàêîæ çäàòíèé êàòàë³çóâàòè ñèíòåç ÀÒÔ çà íàäëèøêó ÀÄÔ [63]. Ïðè ðîñò³ S. li- vidans TK24 çà óìîâ íàäëèøêó ôîñôîðó åêñ- ïðåñ³ÿ ppk ñëàáêà. Çà òàêèõ óìîâ åêñïðåñ³ÿ ppk ìîæå ðåïðåñóâàòèñÿ. Åêñïðåñ³ÿ ãåíà ³ìîâ³ðíî- ãî ðåïðåñîðà ñòèìóëþºòüñÿ ÀÒÔ, îòæå ÀÒÔ º êîðåïðåñîðîì ppk. Â³äïîâ³äíî, êîëè êîíöåíò- ðàö³ÿ ôîñôîðó â ñåðåäîâèù³ çìåíøóºòüñÿ, âíóòð³øíüîêë³òèííà êîíöåíòðàö³ÿ ÀÒÔ òåæ çìåíøóºòüñÿ. Öå ñïðè÷èíÿº ÷àñòêîâó äåðåïðåñ³þ ppk. Ñèí- òåç åíäîãåííîãî ôîñôàòó î÷åâèäíî çàòðèìóº åêñïðåñ³þ ãåí³â Pho-ðåãóëîíà. Ìóòàíòè çà ãå- íîì ðpk íå ñèíòåçóþòü ïîë³ôîñôàòó, ìàþòü á³ëüøó íåñòà÷ó ôîñôàòó, í³æ äèêèé òèï. Íå- ñòà÷à ôîñôîðó çóìîâëþº çðîñòàííÿ ñèíòåçó âòîðèííèõ ìåòàáîë³ò³â, íàïðèêëàä àêòèíîðî- äèíó, ïðè öüîìó çðîñòàº åêñïðåñ³ÿ øëÿõ-ñïå- öèô³÷íîãî ïîçèòèâíîãî ðåãóëÿòîðà act-ãåí³â actII-ORF4, õî÷à òî÷íèé ìåõàí³çì öüîãî ÿâèùà íå âñòàíîâëåíèé [64, 65]. Äæåðåëà í³òðîãåíó òàêîæ º âàæëèâèìè äëÿ ïî÷àòêó ñèíòåçó âòîðèííèõ ìåòàáîë³ò³â ó àê- òèíîì³öåò³â. Îñíîâíó ðîëü ó ìåòàáîë³çì³ í³òðî- ãåíó ó S. ñoelicolor â³ä³ãðàþòü äâà ãåíè ãëóòà- ìàòñèíòåòàçè: glnA, ùî êîäóº ãëóòàìàòñèíòå- òàçó òèïó ² òà glnII – òèïó ²² [66]. Ðåãóëÿö³ÿ àêòèâíîñò³ åíçèìó òèïó ² â³äáóâàºòüñÿ íà òðàíñ- êðèïö³éíîìó òà ïîñòòðàíñëÿö³éíîìó ð³âíÿõ [67]. Öåé ôåðìåíò áåðå ó÷àñòü ó ñèíòåç³ ãëóòàìàòó òà ãëóòàì³íó – îñíîâíèõ äæåðåë àçîòó ó êë³òèí³. Àäåí³ëòðàíñôåðàçà GlnE çà óìîâ âèñîêî¿ êîí- öåíòðàö³¿ àìîí³þ àäåí³ëþº ãëóòàìàòñèíòåòàçó GlnA, ³íàêòèâóþ÷è ¿¿. GlnE ìîæå çä³éñíþâàòè òàêîæ çâîðîòíó ðåàêö³þ. Òðàíñêðèïö³ÿ glnA çä³éñíþºòüñÿ ðåãóëÿòîðîì GlnR, ÿêèé íàëåæèòü äî ðîäèíè OmpR-ðåãóëÿòîð³â. GlnR àêòèâóº åêñïðåñ³þ glnA, glnII, ãåí³â òðàíñïîðòåðà àìî- í³þ amtB òà í³òðèòðåäóêòàçè nirB çà óìîâ íåñòà÷³ í³òðîãåíó [68]. ISSN 0564–3783. Öèòîëîãèÿ è ãåíåòèêà. 2014. Ò. 48. ¹ 174 Ì.Â. Ðàáèê, Á.Î. Îñòàø, Â.Î. Ôåäîðåíêî Ðèñ. 3. Ðåãóëÿòîðí³ ìåðåæ³ S. coelicolor PhoP-PhoR òà AfsK-AfsR-AfsS òà ¿õí³é âçàºìîçâ’ÿçîê. Ïîêàçàíî âçàºìîïîâ’ÿçàí³ñòü ôîñôàòíîãî òà àçîòíîãî ìåòàáîë³çìó, âïëèâ ðåãóëÿòîðà ScbR òà êëþ÷îâó ðîëü AfsS ó ñïðèéíÿòò³ òà ïåðåäà÷³ ñèãíàë³â ³ç çîâí³øíüîãî ñåðåäîâèùà íà øëÿõ-ñïåöèô³÷í³ ðåãóëÿòîðí³ ãåíè, çîêðåìà actII-ORF4 (äåòàë³ ó òåêñò³). PHO-áîêñè ïðåäñòàâëåí³ íà ñõåì³ êâàäðàòàìè, à ñàéòè çâ’ÿçóâàííÿ AfsR – ðîìáàìè, ñòð³ëêè ñèìâîë³çóþòü àêòèâàòîðíó ôóíêö³þ, ë³í³¿ ³ç ïîïåðå÷íèìè ïåðåãîðîäêàìè – ðåïðåñîðíó. Ìîäèô³êîâàíî íà îñíîâ³ [77] ISSN 0564–3783. Öèòîëîãèÿ è ãåíåòèêà. 2014. Ò. 48. ¹ 1 75 Ìåðåæ³ ãåí³â ðåãóëÿö³¿ âòîðèííîãî ìåòàáîë³çìó àêòèíîì³öåò³â: ïëåéîòðîïí³ ðåãóëÿòîðè Ìåòàáîë³çì í³òðîãåíó ï³äëÿãàº íåãàòèâí³é ðå- ãóëÿö³¿ ç áîêó ôîñôàòó [59]. Öåé êîíòðîëü çä³éñ- íþºòüñÿ çàâäÿêè áåçïîñåðåäíüîìó çâ’ÿçóâàí- íþ êëþ÷îâîãî ðåãóëÿòîðà ìåòàáîë³çìó ôîñôà- òó PhoP ³ç ïðîìîòîðîì glnR, òàê âïëèâàþ÷è íà åêñïðåñ³þ ãåí³â ìåòàáîë³çìó í³òðîãåíó. Інші гени, що мають плейотропний вплив на біосинтез вторинних метаболітів Íåçâàæàþ÷è íà âåëèêó ð³çíîìàí³òí³ñòü çîâ- í³øíüîêë³òèííèõ ñèãíàë³â, äëÿ ¿õíüî¿ ïåðåäà÷³ ó êë³òèíó âèêîðèñòîâóºòüñÿ ïîð³âíÿíî íåâåëè- êà ê³ëüê³ñòü ìåõàí³çì³â. Îäíèì ³ç ôóíäàìåí- òàëüíèõ ìåõàí³çì³â º ôîñôîðèëþâàííÿ á³ëê³â [69]. Ó ïðîêàð³îòè÷íèõ ñèñòåìàõ òèïîâèì º ìå- õàí³çì ñèãíàëüíî¿ òðàíñäóêö³¿, ïðè ÿêîìó â³ä- áóâàºòüñÿ ôîñôîðèëþâàííÿ çàëèøê³â ã³ñòèäèíó òà àñïàðàã³íó [69, 70]. Äåÿê³ áàêòåð³¿ (Streptomy- ces, Mycobacterium, îêðåì³ ïðåäñòàâíèêè ö³àíî- áàêòåð³é) òàêîæ âîëîä³þòü ìåõàí³çìîì ôîñôî- ðèëþâàííÿ çàëèøê³â ñåðèíó, òðåîí³íó òà òè- ðîçèíó, ÿêèé õàðàêòåðíèé äëÿ åóêàð³îò³â [71]. Íàÿâí³ñòü ÷èñëåííèõ ÄÑÑ, ÿê³ âèêîðèñòîâóþòü äâà ìåõàí³çìè ñèãíàëüíî¿ òðàíñäóêö³¿, ó öèõ áàê- òåð³é ïîÿñíþºòüñÿ ¿õí³ì ñêëàäíèì æèòòºâèì öèêëîì (ùî âêëþ÷àº ìîðôîëîã³÷íó òà ô³ç³îëî- ã³÷íó äèôåðåíö³àö³þ), ðîçâèíóòîþ ì³æêë³òèí- íîþ êîìóí³êàö³ºþ. Îäí³ºþ ³ç ïåðøèõ, âèÿâëåíèõ ó S. coelicolor, áóëà ÄÑÑ AbsA1/2, ÿêà ñêëàäàºòüñÿ ç ñåíñîðíî¿ ê³íàçè (CÊ) AbsA1 – ðåãóëÿòîðíîãî á³ëêà-åôåê- òîðà (ÐÁÅ) AbsA2. Ãåíè absA1 òà absA2 çíà- õîäÿòüñÿ â ìåæàõ êëàñòåðà ãåí³â ñèíòåçó êàëü- ö³é-çàëåæíîãî àíòèá³îòèêà (CDA), àëå âîíè âïëèâàþòü íà ñèíòåç ÷îòèðüîõ àíòèá³îòèê³â, õî÷à íå çàä³ÿí³ â ìîðôîãåíåç³. Ó ôîñôîðèëüî- âàí³é ôîðì³ AbsA2 ðåïðåñóº á³îñèíòåç àíòè- á³îòèê³â, îñê³ëüêè äåëåö³ÿ absA1 ÷è absA2 çó- ìîâëþâàëà ï³äâèùåíó ïðîäóêö³þ àíòèá³îòèêà [72]. Îïèñàíî òî÷êîâ³ ìóòàö³¿ â ãåí³ absA1, ùî ï³äâèùóþòü ê³íàçíó àáî ôîñôàòàçíó àêòèâíîñ- ò³ AbsA1, çóìîâëþþ÷è ã³ïåððåïðåñ³þ àáî àêòè- âàö³þ ñèíòåçó àíòèá³îòèêà â³äïîâ³äíî. ²äåíòè- ô³êîâàíî òðè ì³øåí³ á³ëêà AbsA2, öå ïðîìîòîðè ãåí³â redZ, cdaR, actII-ORF4. Çâ’ÿçóâàííÿ AbsA2 ³ç ì³øåíÿìè ïîñèëþâàëîñÿ, êîëè á³ëîê áóâ ó ôîñôîðèëüîâàí³é ôîðì³ [72]. Òîä³ ÿê ó S. coe- licolor öÿ ÄÑÑ º îäíèì ç êëþ÷îâèõ ðåïðåñî- ð³â ïðîäóêö³¿ àíòèá³îòèê³â, ó S. ghanaensis ãåíè absAgh1/2 íåîáîâ’ÿçêîâ³ äëÿ ðåãóëÿö³¿ ïðîäóê- ö³¿ ÌìÀ. Íåãàòèâíèé åôåêò íà ñèíòåç àíòè- á³îòèê³â ñïîñòåð³ãàºòüñÿ ïðè íàäåêñïðåñ³¿ ãåíà absA2gh, à ïðè éîãî ðóéíóâàíí³ íå âèÿâëåíî æîä- íèõ çì³í ó ïðîäóêö³¿ ÌìÀ òà ìîðôîëîã³¿ (Ì. Ðàáèê, íåîïóáë³êîâàí³ äàí³). Ó S. coelicolor ³ S. griseus ñåðèí/òðåîí³í-ê³íàçà AfsK ³ ¿¿ ì³øåíü – á³ëîê AfsR – êîíòðîëþþòü âòîðèííèé ìåòàáîë³çì ³ ìîðôîãåíåç. Íàäåêñ- ïðåñ³ÿ afsR çóìîâëþº íàäïðîäóêö³þ àêòèíîðî- äèíó, óíäåöèëïðîäèã³îçèíó òà À-ôàêòîðà ó S. lividans, ÿêèé íå íàêîïè÷óº ¿õ çà çâè÷àéíèõ ëàáîðàòîðíèõ óìîâ [36]. Íîêàóò afsR âèêëèêàº çíà÷íó, ïðîòå íå ïîâíó âòðàòó ïðîäóêö³¿ àíòè- á³îòèê³â. Âàðòî çàçíà÷èòè, ùî ïîçèòèâíèé åôåêò AfsR íà ïðîäóêö³þ àíòèá³îòèê³â ñïîñòå- ð³ãàºòüñÿ çà óìîâ îáìåæåíî¿ ³ äîñòàòíüî¿ êîí- öåíòðàö³¿ ôîñôàòó [73]. Çà N-ê³íöåâîþ ÷àñòè- íîþ AfsR ïîä³áíèé äî øëÿõ-ñïåöèô³÷íèõ àêòè- âàòîð³â òðàíñêðèïö³¿ ActII-ORF4, RedD, DnrI òà CcaR [74]. Á³ëÿ afsR âèÿâëåíî ãåí afsK, ùî êîäóº ãîìîëîã åóêàð³îòè÷íèõ ïðîòå¿íê³íàç. Ê³- íàçà AfsK ôîñôîðèëþº çàëèøîê òðåîí³íó â AfsR [36]. Ôîñôîðèëþâàííÿ âàæëèâå äëÿ ôóíê- ö³îíóâàííÿ AfsR, îñê³ëüêè äåëåö³ÿ afsK ïðèç- âîäèòü äî çíà÷íîãî ïàä³ííÿ ñèíòåçó àêòèíî- ðîäèíó, ïðîòå âîíî íå òàêå ñèëüíå, ÿê ó ìó- òàíò³â afsR. Öå ìîæíà ïîÿñíèòè íàÿâí³ñòþ äîäàòêîâèõ ïðîòå¿íê³íàç (ÐkaG, ÀfsL), ÿê³ ôîñôîðèëþþòü ÀfsR çà â³äñóòíîñò³ ÀfsK [75]. Ïðèïóñêàþòü, ùî àâòîôîñôîðèëþâàííÿ AfsK çàëåæèòü â³ä ð³âíÿ S-àäåíîçèë-L-ìåò³îí³íó – ³ìîâ³ðíîãî ì³æêë³- òèííîãî ñèãíàëüíîãî ôàêòîðà [76]. Âñòàíîâ- ëåíî, ùî KbpA (â³ä àíãë. AfsK-binding protein A) çâ’ÿçóºòüñÿ ³ç êàòàë³òè÷íèì äîìåíîì íå- ôîñôîðèëüîâàíîãî AfsK ³ òàê ³íã³áóº àâòîôîñ- ôîðèëþâàííÿ AfsK. Îñê³ëüêè ïðîòÿãîì ðîñòó êóëüòóðè afsK òðàíñêðèáóºòüñÿ êîíñòèòóòèâíî, KbpA, â³äïîâ³äíî, çóïèíÿº íåîáìåæåíèé ñèí- òåç àíòèá³îòèêà, ÿêèé çàïóñêàºòüñÿ ñèñòåìîþ AfsK–AfsR [36]. Ãîëîâíîþ ì³øåííþ ä³¿ AfsR º ãåí afsS. Â³í êîäóº íåâåëèêèé (63 à/ê) á³ëîê, íàäåêñïðåñ³ÿ ÿêîãî ï³äâèùóº ïðîäóêö³þ àíòèá³îòèê³â ó S. coe- licolor ³ S. lividans. Ó S. ghanaensis afsS òàêîæ çàä³ÿíèé ó ïîçèòèâí³é ðåãóëÿö³¿ ñèíòåçó ìîåíî- ì³öèíó À – ãåòåðîëîã³÷íà íàäåêñïðåñ³ÿ öüîãî ãåíà ³ç S. coelicolor ñïðè÷èíÿº çðîñòàííÿ ïðî- äóêö³¿ àíòèá³îòèêà [11]. Òî÷íèé ìåõàí³çì ôóíê- ö³îíóâàííÿ AfsS äîñ³ íåâ³äîìèé. Ïðèïóñêàþòü, ISSN 0564–3783. Öèòîëîãèÿ è ãåíåòèêà. 2014. Ò. 48. ¹ 176 Ì.Â. Ðàáèê, Á.Î. Îñòàø, Â.Î. Ôåäîðåíêî ùî â³í â³ä³ãðàº ðîëü ñâîºð³äíîãî øàïåðîíà, ÿêèé âçàºìîä³º ç ³íøèìè ðåãóëÿòîðàìè [36]. Ó ïðîìîòîð³ ãåíà afsS âèÿâëåíî ä³ëÿíêè çâ’ÿçóâàííÿ ãîëîâíîãî ðåãóëÿòîðà ìåòàáîë³çìó ôîñôàò³â PhoP, ÿê³ ïåðåêðèâàþòüñÿ ç ñàéòîì çâ’ÿçóâàííÿ AfsR. Íåùîäàâí³ äîñë³äæåííÿ ïî- êàçàëè, ùî ö³ äâà ðåãóëÿòîðè º êîíêóðåíòíèìè àêòèâàòîðàìè òðàíñêðèïö³¿ afsS. Î÷åâèäíî, ùî òàêèì ÷èíîì çä³éñíþºòüñÿ ³íòåãðàö³ÿ ð³çíèõ ñèãíàë³â ³ç çîâí³øíüîãî ñåðåäîâèùà íà êëþ- ÷îâèé ðåãóëÿòîðíèé ãåí [77]. Ïåðåõðåñíó ðå- ãóëÿö³þ ñèñòåì PhoR–PhoP òà AfsK–AfsR–AfsS äåòàëüíî äîñë³äæåíî íåùîäàâíî. Àâòîðè ïîð³â- íÿëè òðàíñêðèïòîìí³ ïðîô³ë³ äèêîãî òèïó òà ìóòàíòíèõ øòàì³â afsS ó ð³äê³é êóëüòóð³ ³ âèÿâèëè, ùî AfsS ïîçèòèâíî êîíòðîëþº äåÿê³ ãåíè PHO-ðåãóëîíà, âêëþ÷àþ÷è ñèñòåìó phoRP [78]. Îòæå, AfsS âèÿâëÿº ïðîòèëåæíèé åôåêò íà åêñïðåñ³þ ãåí³â PHO-ðåãóëîíà, í³æ AfsR, ÿêèé ðåïðåñóº ãåíè PHO-ðåãóëîíà (ðèñ. 3). Íèçêà ìóòàíò³â S. coelicolor çà ñèíòåçîì àí- òèá³îòèê³â ì³ñòÿòü ìóòàö³¿ ó ëîêóñ³ absB. Ãåí absB S. coelicolor – ãîìîëîã rnc E. coli, ùî êî- äóº ÐÍÊàçó III, ÿêà çä³éñíþº ïðîöåñèíã ïåâ- íèõ äâîëàíöþãîâèõ ÐÍÊ ³ òàê ðåãóëþº åêñ- ïðåñ³þ áàêòåð³éíèõ òà ôàãîâèõ ãåí³â [79]. Ì³- ñåíñ-ìóòàö³ÿ absB120 ñèëüíî çíèæóº ð³âåíü òðàíñêðèïö³¿ act- ³ red-ãåí³â S. coelicolor [79, 80]. Äîäàòêîâ³ êîï³¿ ãåí³â øëÿõ-ñïåöèô³÷íî¿ ðåãóëÿö³¿ actII-orf4 ³ redD â³äíîâëþâàëè á³î- ñèíòåç â³äïîâ³äíèõ ñïîëóê. Ùå íå âñòàíîâëå- íî, ÷è AbsB áåçïîñåðåäíüî ðåãóëþº åêñïðåñ³þ ñòðóêòóðíèõ ãåí³â çà äîïîìîãîþ ñïåöèô³÷íîãî ïðîöåñèíãó ÐÍÊ, ÷è äåôåêò åêñïðåñ³¿ ãåí³â º íåïðÿìèì íàñë³äêîì. Ó absB-ìóòàíò³â S. coeli- color íàêîïè÷óþòüñÿ ïîïåðåäíèêè 30S ðÐÍÊ, ÿê³ íå âèÿâëÿþòüñÿ â øòàìàõ äèêîãî òèïó [79]. Îòæå, ÐÍÊàçà III çàä³ÿíà íå ëèøå â ïðîöåñèí- ãó ìÐÍÊ, à é ðÐÍÊ. Â E. coli òà S. coelicolor âîíà ïðîöåñóº âëàñíó 5 -ë³äåðíó ïîñë³äîâí³ñòü [81]. AbsB òàêîæ íåçíà÷íî âïëèâàº íà ìîðôî- ãåíåç [45]. Â³äêðèòòÿ íîâèõ ïëåéîòðîïíèõ ðåãóëÿòîð³â ó S. coelicolor òðèâàº. Íàïðèêëàä, âèÿâëåíî TetR- ïîä³áíèé ðåãóëÿòîð AtrA, ùî ñïåöèô³÷íî àê- òèâóº á³îñèíòåç àêòèíîðîäèíó, áåçïîñåðåäíüî çâ’ÿçóþ÷èñü ³ç ïðîìîòîðîì actII-orf4 [82]. Ñàé- òè çâ’ÿçóâàííÿ AtrA âèÿâëåí³ ó cda-êëàñòåð³ ñèíòåçó ÊÇÀ [8], ó ïðîìîòîð³ ãåíà ïåðìåàçè nagE2 [83], à íàäåêñïðåñ³ÿ àtrA ñóïðåñóº ³í- ã³áóþ÷èé åôåêò ìóòàíòíèõ àëåë³â absA1 [8]. Éîãî ãîìîëîã â S. avermitilis, AveI, ôóíêö³îíóº ÿê íåãàòèâíèé ðåãóëÿòîð. Â³äîìî, ùî á³ëêè ðîäèíè TetR ìîæóòü ôóíêö³îíóâàòè ³ ÿê àêòè- âàòîðè, ³ ÿê ðåïðåñîðè [84]. AtrA-ïîä³áí³ á³ë- êè âèêîíóþòü ö³ ôóíêö³¿ çàëåæíî â³ä âèäó ñòðåïòîì³öåòà, ùî âêàçóº íà ãíó÷ê³ñòü ¿õíüî¿ ôóíêö³¿ [85]. Ïðîòå ââåäåííÿ äîäàòêîâèõ êîï³é ãåíà atrAgh íå ïðèâîäèòü äî çì³í â ïðîäóêö³¿ ÌìÀ ó S. ghanaensis ³ â éîãî ìîðôîëîã³÷í³é äèôåðåíö³àö³¿ [86]. Æîäíèõ çì³í ó ïðîäóêö³¿ àíòèá³îòèê³â íå ñïîñòåð³ãàºòüñÿ ³ ïðè ãåòåðî- ëîã³÷í³é íàäåêñïðåñ³¿ öüîãî ãåíà ó S. coelicolor. Íåçâàæàþ÷è íà çíà÷íèé ð³âåíü ³äåíòè÷íîñò³ AtrAgh òà AtrA, éìîâ³ðíî, ùî â öèõ øòàìàõ âîíè çàä³ÿí³ ó ðåãóëÿö³¿ ð³çíèõ ïðîöåñ³â àáî ðåãóëÿö³¿ òîãî æ ïðîöåñó, àëå çà ð³çíèõ óìîâ. Ñåðåä íåùîäàâíî âèÿâëåíèõ ïëåéîòðîïíèõ ðå- ãóëÿòîð³â ó S. coelicolor ñë³ä â³äçíà÷èòè nsdA òà nsdB, ùî êîäóþòü ðåïðåñîðè á³îñèíòåçó àíòè- á³îòèê³â. Âîíè íå ä³þòü ÿê òðàíñêðèïö³éí³ ôàêòîðè ³, éìîâ³ðíî, ôóíêö³îíóþòü çà ðàõó- íîê á³ëîê-á³ëêîâèõ âçàºìîä³é ó çâ’ÿçêó ³ç ïðè- ñóòí³ñòþ òåòðàòð³êîïåïòèäíèõ ïîâòîð³â (TPR). Â³äîìî, ùî TPR – öå ñòðóêòóðíèé ìîòèâ, ùî ïðåäñòàâëåíèé ó âåëèêî¿ ê³ëüêîñò³ á³ëê³â òà áå- ðå ó÷àñòü ó ôîðìóâàíí³ á³ëîê-á³ëêîâèõ âçàº- ìîä³é, ôîðìóâàíí³ ìóëüòèïðîòå¿íîâèõ êîìï- ëåêñ³â [87]. Ãåí nsdA íàëåæèòü äî BldD-ðå- ãóëîíà [25]. Âîäíî÷àñ íàäåêñïðåñ³ÿ îðòîëîãà nsdA ó S. ghanaensis íå âèÿâëÿº æîäíîãî åôåê- òó íà ïðîäóêö³þ àíòèá³îòèê³â [86]. Î÷åâèäíî, ùî ó ð³çíèõ øòàì³â àêòèíîì³öåò³â NsdA-á³ëêè ìîæóòü áóòè ïî-ð³çíîìó çàä³ÿí³ ó ðåãóëÿö³¿ ïðî- öåñ³â âòîðèííîãî ìåòàáîë³çìó òà ñïîðóëÿö³¿ àáî âïëèâàòè íà ³íø³ êë³òèíí³ ïðîöåñè. Óâàãó äîñë³äíèê³â ïðèâåðòàº ðîäèíà WhiB- ïîä³áíèõ á³ëê³â, ÿêó âèÿâëåíî ò³ëüêè â àêòèíî- ì³öåò³â. Ñüîãîäí³ â³äîìî, ùî ãåíîìè àêòèíî- ì³öåò³â ì³ñòÿòü ÷èñëåíí³ whiB-ïîä³áí³ ãåíè, òîìó äëÿ ö³º¿ ðîäèíè çàïðîïîíîâàíî íîâó íàçâó – Wbl (â³ä àíãë. whiB-like) [87], ïðîòå äëÿ ³íøèõ îðãàí³çì³â ïðèéíÿò³ ³íø³ íàçâè ö³º¿ ðîäèíè: WhiB1-7 äëÿ Mycobacterium tuberculosis òà M. leprae; WhmA-E ó M. smegmatis òà Whc ó Co- rynebacterium glutamicum. Àáñîëþòíà á³ëüø³ñòü öèõ á³ëê³â ïîð³âíÿíî íåâåëèê³ (81–122 à/ê), âîíè ì³ñòÿòü ÷îòèðè êîíñåðâàòèâíèõ çàëèøêè öèñòå¿íó, ç ÿêèõ äâà öåíòðàëüíèõ ôîðìóþòü ìîòèâ CXXC [89]. Öèñòå¿íîâ³ çàëèøêè çâ’ÿçó- ISSN 0564–3783. Öèòîëîãèÿ è ãåíåòèêà. 2014. Ò. 48. ¹ 1 77 Ìåðåæ³ ãåí³â ðåãóëÿö³¿ âòîðèííîãî ìåòàáîë³çìó àêòèíîì³öåò³â: ïëåéîòðîïí³ ðåãóëÿòîðè þòü ðåäîêñ-÷óòëèâèé Fe-S êëàñòåð [90]. Äàí³ ùîäî á³îõ³ì³÷íî¿ ðîë³ Wbl ñóïåðå÷ëèâ³. ¥ðóí- òóþ÷èñü íà íåïðÿìèõ äîêàçàõ, äîñë³äíèêè ïðèïóñêàþòü, ùî á³ëêè Wbl ôóíêö³îíóþòü ÿê òðàíñêðèïö³éí³ ôàêòîðè [91]. ²ìîâ³ðíî, âîíè ðåàãóþòü íà ïåâí³ ñèãíàëè, ó ñïðèéìàíí³ ÿêèõ âàæëèâó ôóíêö³þ â³ä³ãðàº êëàñòåð Fe-S [89]. Çâàæàþ÷è íà ïðèñóòí³ñòü ÷îòèðüîõ êîíñåðâà- òèâíèõ çàëèøê³â öèñòå¿íó, ³íø³ äîñë³äíèêè ââà- æàþòü, ùî á³ëêè Wbl âèÿâëÿþòü äèñóëüô³ä- ðåäóêòàçíó àêòèâí³ñòü. Â Mycobacterium tuber- culosis ¿¿ âèÿâëåíî ïðàêòè÷íî ó âñ³õ á³ëê³â WhiB [89]. Òàêèì ÷èíîì, ó äèñóëüô³äðåäóêòàçí³é ìî- äåë³ ôóíêö³îíóâàííÿ á³ëê³â Wbl ðîëü êëàñòåðà Fe-S º çðîçóì³ëîþ [92] – êëàñòåð óòðèìóº á³ëîê â íåàêòèâíîìó ñòàí³, ïîêè îêñèäàòèâíèé ñòðåñ íå ðóéíóº éîãî, ³ öå ïðèçâîäèòü äî âèÿâëåííÿ á³ëêîì ôåðìåíòàòèâíî¿ àêòèâíîñò³. Äîñë³äæå- íî, ùî ó S. ghanaensis WblAgh – íåãàòèâíèé ðåãóëÿòîð ñèíòåçó ÌìÀ òà çàä³ÿíèé ó ðåãóëÿö³¿ ïðîöåñ³â ìîðôîëîã³÷íîãî ðîçâèòêó [93]. Äåëå- ö³ÿ ãåíà wblAgh áëîêóº ñèíòåç ñïîðîâîãî ï³ã- ìåíòó, ³ ãàçîíè ìóòàíòíîãî øòàìó ìàþòü á³ëå çàáàðâëåííÿ. Ì³êðîñêîï³÷íèé àíàë³ç ìóòàíò- íîãî øòàìó äàº çìîãó çðîáèòè ïðèïóùåííÿ, ùî WblAgh íåîáõ³äíèé íà ïî÷àòêîâèõ åòàïàõ ðîçâèòêó ïîâ³òðÿíîãî ì³öåë³þ ó S. ghanaensis [93]. Òàê³ æ ðåçóëüòàòè ïîêàçàíî äëÿ wblA S. coelicolor, äå WblA º ãëîáàëüíèì ïëåéîòðîïíèì ðåãóëÿòîðîì. Éîãî ðóéíóâàííÿ ïðèçâîäèòü äî Ðèñ. 4. Ìåðåæà ïëåéîòðîïíèõ ðåãóëÿòîð³â S. coelicolor A3(2), ùî ðåãóëþº á³îñèíòåç àêòèíîðîäèíó (äåòàë³ ó òåêñò³). Ñòð³ëêè ñèìâîë³çóþòü àêòèâàòîðíó ôóíêö³þ, ë³í³¿ ³ç ïîïåðå÷íèìè ïåðåãîðîäêàìè – ðåïðåñîðíó ISSN 0564–3783. Öèòîëîãèÿ è ãåíåòèêà. 2014. Ò. 48. ¹ 178 Ì.Â. Ðàáèê, Á.Î. Îñòàø, Â.Î. Ôåäîðåíêî íàäïðîäóêö³¿ àíòèá³îòèê³â ³ â³ä³ãðàº âàæëèâó ôóíêö³þ ó ïåðåòâîðåíí³ ïî÷àòêîâèõ êë³òèí ïî- â³òðÿíèõ ã³ô³â íà ñóáàï³êàëüí³ ïðîðîñòêè òà àï³êàëüí³ êîìïàðòìåíòè [94]. Îòæå, Wbl-á³ëêè º ôàêòîðàìè àêòèíîáàêòåð³é, ÿê³ êîíòðîëþþòü íèçêó ïðîöåñ³â, òàêèõ ÿê ìîðôîãåíåç, ñò³éê³ñòü äî àíòèá³îòèê³â, â³äïîâ³äü íà îêñèäàòèâíèé ñòðåñ [89], ³, çâàæàþ÷è íà ñâîþ âàæëèâó òà íåïåðåñ³÷- íó ðîëü, âèìàãàþòü äåòàëüí³øèõ äîñë³äæåíü äëÿ âñòàíîâëåííÿ òî÷íîãî ìåõàí³çìó ¿õíüîãî ôóíê- ö³îíóâàííÿ. Ó÷àñòü îïèñàíèõ ó öüîìó ðîçä³ë³ ðåãóëÿòîð³â íà åêñïðåñ³þ ãåíà øëÿõ-ñïåöèô³÷íî¿ ðåãóëÿö³¿ á³îñèíòåçó àêòèíîðîäèíó actII-ORF4 S. coelicolor ï³äñóìîâàíî íà ðèñ. 4. Ñüîãîäí³ â³äîìà ëèøå ÷àñòèíà óñ³õ ðåãóëÿ- òîðíèõ ìåõàí³çì³â, ùî êîíòðîëþþòü âòîðèííèé ìåòàáîë³çì àêòèíîì³öåò³â. Íàéá³ëüøèõ óñï³õ³â äîñÿãíóòî ó äîñë³äæåíí³ øëÿõ-ñïåöèô³÷íèõ ðå- ãóëÿòîð³â, ïðîòå ùå çàëèøàºòüñÿ âåëèêà ê³ëü- ê³ñòü ³íøèõ ðåãóëÿòîðíèõ ïðîöåñ³â, ùî ïîòðå- áóþòü äîêëàäí³øîãî äîñë³äæåííÿ. ª âåëèê³ ïðî- ãàëèíè ó ðîçóì³íí³ ðåãóëÿòîðíèõ êàñêàä³â, ùî çâ’ÿçóþòü ñèãíàëè ³ç çîâí³øíüîãî ñåðåäîâèùà òà ïðîöåñè ðîçâèòêó àêòèíîì³öåò³â. Öå ñòîñó- ºòüñÿ òàêîæ ³ á³îñèíòåçó âòîðèííèõ ìåòàáîë³- ò³â, â ÿêèõ çàä³ÿí³ ïëåéîòðîïí³ òà øëÿõ-ñïå- öèô³÷í³ ðåãóëÿòîðè. Çàðàç äîñë³äíèêè â³äêðè- âàþòü äåäàë³ á³ëüøå íîâèõ ïëåéîòðîïíèõ ðåãó- ëÿòîð³â, ïðîòå ó á³ëüøîñò³ âèïàäê³â íåçðîçóì³ëî, ÿê âîíè âçàºìîä³þòü ³ç óæå âèâ÷åíèìè ðå- ãóëÿòîðàìè, ùî ³íäóêóþòü ¿õíþ åêñïðåñ³þ òîùî. Îäíàê íàÿâí³ äàí³ âæå ñüîãîäí³ äàþòü çìîãó ìàí³ïóëþâàòè ðåãóëÿòîðàìè äëÿ ïîêðàùåííÿ ïðîäóêö³¿ àíòèá³îòèê³â ÷è àêòèâàö³¿ «ìîâ÷àç- íèõ» êëàñòåð³â á³îñèíòåçó öèõ ñïîëóê. Ñåðåä îïðàöüîâàíèõ ï³äõîä³â äî ñòâîðåííÿ øòàì³â- íàäïðîäóöåíò³â ìîæíà âèä³ëèòè òàê³: íàäåêñ- ïðåñ³ÿ ïîçèòèâíèõ ðåãóëÿòîð³â, ñïðÿìîâàíà ³í- àêòèâàö³ÿ ãåí³â íåãàòèâíèõ ðåãóëÿòîð³â, äóïë³- êàö³¿ êëàñòåð³â ãåí³â á³îñèíòåçó àíòèá³îòèê³â, äåëåö³¿ ãåí³â êîíêóðåíòíèõ øëÿõ³â á³îñèíòåçó, ãåòåðîëîã³÷íà åêñïðåñ³ÿ êëàñòåð³â, â³äá³ð ìóòà- ö³é, ùî çá³ëüøóþòü ð³âåíü òðàíñêðèïö³¿ ãåí³â âòîðèííîãî ìåòàáîë³çìó òà òðàíñëÿö³¿ ¿õí³õ ìÐÍÊ ó ñòàö³îíàðí³é ôàç³. Äàëüøèé ðîçâèòîê ñòðóêòóðíî¿ òà ôóíêö³îíàëüíî¿ ãåíîì³êè àêòè- íîì³öåò³â ñïðèÿòèìå äåäàë³ ïîâí³øîìó ðîçó- ì³ííþ ³ âèêîðèñòàííþ ðåãóëÿòîð³â âòîðèííî- ãî ìåòàáîë³çìó. M.V. Rabyk, B.O. Ostash, V.O. Fedorenko Ivan Franko National University of Lviv E-mail: v_fedorenko@franko.lviv.ua GENE NETWORKS THAT REGULATE SECONDARY METABOLISM IN ACTINOMYCETES: PLEIOTROPIC REGULATORS Current advances in the research and practical applications of pleiotropic regulatory genes for antibiotic production in actinomycetes are reviewed. The basic regulatory me- chanisms found in these bacteria are outlined. Examples described in the review show the importance of the manipulation of regulatory systems that affect the synt- hesis of antibiotics for the metabolic engineering of the actinomycetes. Also, the study of these genes is the basis for the development of genetic engineering ap- proaches towards the induction of «cryptic» part of the actinomycetes secondary metabolome, which capacity for production of biologically active compounds is much bigger than the diversity of antibiotics underpinned by traditional microbiological screening. Besides the prac- tical problems, the study of regulatory genes for antibio- tic biosynthesis will provide insights into the process of evolution of complex regulatory systems that coordinate the expression of gene operons, clusters and regulons, involved in the control of secondary metabolism and morphogenesis of actinomycetes. Ì.Â. Ðàáûê, Á.Å. Îñòàø, Â.À. Ôåäîðåíêî ÑÅÒÈ ÃÅÍÎÂ ÐÅÃÓËßÖÈÈ ÂÒÎÐÈ×ÍÎÃÎ ÌÅÒÀÁÎËÈÇÌÀ ÀÊÒÈÍÎÌÈÖÅÒÎÂ : ÏËÅÉÎÒÐÎÏÍÛÅ ÐÅÃÓËßÒÎÐÛ Äàí îáçîð ñîâðåìåííûõ äîñòèæåíèé â èññëåäîâàíèè è ïðàêòè÷åñêîì ïðèìåíåíèè ïëåéîòðîïíûõ ðåãó- ëÿòîðíûõ ãåíîâ ïðîäóêöèè àíòèáèîòèêîâ ó àêòèíî- ìèöåòîâ. Ðàññìîòðåíû îñíîâíûå ðåãóëÿòîðíûå ìåõà- íèçìû, îáíàðóæåííûå ó ýòèõ áàêòåðèé. Ïðèâåäåííûå â îáçîðå ïðèìåðû ïîêàçûâàþò, ÷òî ìàíèïóëèðîâà- íèå ðåãóëÿòîðíûìè ñèñòåìàìè, âëèÿþùèìè íà ñèí- òåç àíòèáèîòèêîâ, ÿâëÿåòñÿ âàæíûì íàïðàâëåíèåì ìåòàáîëè÷åñêîé èíæåíåðèè àêòèíîìèöåòîâ. Êðîìå òîãî, èçó÷åíèå ýòèõ ãåíîâ ñëóæèò îñíîâîé äëÿ ðàç- ðàáîòêè ãåííî-èíæåíåðíûõ ïîäõîäîâ ê àêòèâàöèè «ìîë÷àùåé» ÷àñòè âòîðè÷íîãî ìåòàáîëîìà àêòèíî- ìèöåòîâ, ïîòåíöèàë êîòîðîãî â ïðîäóöèðîâàíèè áèîëîãè÷åñêè àêòèâíûõ ñîåäèíåíèé çíà÷èòåëüíî ïðåâûøàåò òîò, êîòîðûé èçó÷åí ïðè ïîìîùè òðà- äèöèîííîãî ñêðèíèíãà ìèêðîîðãàíèçìîâ. Ïîìèìî ÷èñòî ïðàêòè÷åñêèõ çàäà÷, èññëåäîâàíèå ãåíîâ ðå- ãóëÿöèè áèîñèíòåçà àíòèáèîòèêîâ ïîçâîëèò ëó÷øå ïîíÿòü ïóòè ýâîëþöèè ñëîæíûõ ðåãóëÿòîðíûõ ñèñ- òåì, êîîðäèíèðóþùèõ ýêñïðåññèþ ãåííûõ îïåðîíîâ, êëàñòåðîâ è ðåãóëîíîâ, ó÷àñòâóþùèõ â êîíòðîëå âòîðè÷íîãî ìåòàáîëèçìà è ìîðôîãåíåçà àêòèíîìè- öåòîâ. ISSN 0564–3783. Öèòîëîãèÿ è ãåíåòèêà. 2014. Ò. 48. ¹ 1 79 Ìåðåæ³ ãåí³â ðåãóëÿö³¿ âòîðèííîãî ìåòàáîë³çìó àêòèíîì³öåò³â: ïëåéîòðîïí³ ðåãóëÿòîðè ÈÑÎÊ Ë²ÒÅÐÀÒÓÐÈ 1. Goodfellow M., Fiedler H.P. A guide to successful bio- prospecting: informed by actinobacterial systematics // Antonie van Leeuwenhoek. – 2010. – 98, ¹ 2. – P. 119–142. 2. Van Wezel G.P., McDowall K.J. The regulation of the secondary metabolism of Streptomyces: new links and experimental advances // Nat. Prod. Rep. – 2011. – 28, ¹ 7. – P. 1311–1333. 3. Bibb M.J. Regulation of secondary metabolism in streptomycetes // Curr. Opin. Microbiol. – 2005. – 8, ¹ 2. – P. 208–215. 4. Martin J.F., Liras P. Engineering of regulatory cas- cades and networks controlling antibiotic biosynthesis in Streptomyces // Curr. Opin. Microbiol. – 2010. – 13, ¹ 3. – P. 263–273. 5. Bentley S.D., Chater K.F., Cerdeño-Tárraga A.M. et al. Complete genome sequence of the model ac- tinomycete Streptomyces coelicolor A3(2) // Nature. – 2002. – 417, ¹ 6885. – P. 141–147. 6. Horbal L., Rebets Y., Rabyk M. et al. Characterization and analysis of the regulatory network involved in control of lipomycin biosynthesis in Streptomyces aureofaciens Tü117 // Appl. Microbiol. Biotechnol. – 2010. – 85, ¹ 4. – P. 1069–1079. 7. Chng C., Lum A.M., Vroom J.A., Kao C.M. A key de- velopmental regulator controls the synthesis of the antibiotic erythromycin in Saccharopolyspora eryt- hraea // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. – 2008. – 105, ¹ 11. – P. 11346–11351. 8. Van Wezel G.P., McKenzie N.L., Nodwell J.R. Chap- ter 5. Applying the genetics of secondary metabolism in model actinomycetes to the discovery of new antibio- tics // Meth. Enzymol. – 2009. – 458. – P. 117–141. 9. Gross H. Strategies to unravel the function of orphan biosynthesis pathways: recent examples and future prospects // Appl. Microbiol. Biotechnol. – 2007. – 75, ¹ 2. – P. 267–277. 10. Ostash B., Doud E.H., Lin C. et al. Complete characterization of the seventeen step moenomycin biosynthetic pathway // Biochemistry. – 2009. – 48, ¹ 37. – P. 8830–8841. 11. Makitrynskyy R., Rebets Y., Ostash B. et al. Genetic factors that influence moenomycin production in streptomycetes // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. – 2010. – 37, ¹ 6. – P. 559–566. 12. Hopwood D.A. Genetic analysis and genome structure in Streptomyces coelicolor // Bacteriol. Rev. – 1967. – 31, ¹ 4. – P. 373–403. 13. Nodwell J.R., Yang M., Kuo D., Losick R. Extracellular complementation and the identification of additional genes involved in aerial mycelium formation in Streptomyces coelicolor // Genetics. – 1999. – 151, ¹ 2. – P. 569–584. 14. Elliot M.A., Bibb M.J., Buttner M.J., Leskiw B.K. BldD is a direct regulator of key developmental genes in Streptomyces coelicolor A3(2) // Mol. Microbiol. – 2001. – 40, ¹ 1. – P. 257–269. 15. Nodwell J.R., McGovern K., Losick R. An oligopeptide permease responsible for the import of an extracellular signal governing aerial mycelium formation in Streptomyces coelicolor // Mol. Microbiol. – 1996. – 22, ¹ 5. – P. 881–893. 16. Lawlor E.J., Baylis H.A., Chater K.F. Pleiotropic morphological and antibiotic deficiencies result from mutations in a gene encoding a tRNA-like product in Streptomyces coelicolor A3(2) // Genes. Dev. – 1987. – 1, ¹ 10. – P. 1305–1310. 17. Bignell D.R., Warawa J.L., Strap J.L. et al. Study of the bldG locus suggests that an anti-anti-sigma fac- tor and an anti-sigma factor may be involved in Streptomyces coelicolor antibiotic production and spo- rulation // Microbiol. – 2000. – 146. – P. 2161–2173. 18. Pope M.K., Green B., Westpheling J. The bldB gene encodes a small protein required for morphogenesis, antibiotic production, and catabolite control in Streptomyces coelicolor // J. Bacteriol. – 1998. – 180, ¹ 6. – P. 1556–1562. 19. Molle V., Buttner M.J. Different alleles of the response regulator gene bldM arrest Streptomyces coelicolor development at distinct stages // Mol. Microbiol. – 2000. – 36, ¹ 6. – P. 1265–1278. 20. Bibb M.J., Molle V., Buttner M.J. Sigma(BldN), an extracytoplasmic function RNA polymerase sigma factor required for aerial mycelium formation in Streptomyces coelicolor A3(2) // J. Bacteriol. – 2000. – 182, ¹ 16. – P. 4606–4616. 21. Ohnishi Y., Ishikawa J., Hara H. et al. Genome sequence of the streptomycin-producing microorga- nism Streptomyces griseus IFO 13350 // J. Bacteriol. – 2008. – 190. – P. 4050–4060. 22. Elliot M., Damji F., Passantino R. et al. The bldD gene of Streptomyces coelicolor A3(2): a regulatory gene involved in morphogenesis and antibiotic pro- duction // J. Bacteriol. – 1998. – 180, ¹ 6. – P. 1549–1555. 23. Kodani S., Hudson M.E., Durrant M.C. et al. The SapB morphogen is a antibiotic-like peptide derived from the product of the developmental gene ramS in Streptomyces coelicolor // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. – 2004. – 101, ¹ 31. – P. 11448–11453. 24. Nodwell J.R., Losick R. Purification of an extracellular signaling molecule involved in production of aerial mycelium by Streptomyces coelicolor // J. Bacteriol. – 1998. – 180, ¹ 5. – P. 1334–1337. 25. Den Hengst C.D., Tran N.T., Bibb M.J. et al. Genes essential for morphological development and anti- biotic production in Streptomyces coelicolor are targets of BldD during vegetative growth // Mol. Microbiol. – 2010. – 78, ¹ 2. – P. 361–379. ISSN 0564–3783. Öèòîëîãèÿ è ãåíåòèêà. 2014. Ò. 48. ¹ 180 Ì.Â. Ðàáèê, Á.Î. Îñòàø, Â.Î. Ôåäîðåíêî 26. Chater K.F., Chandra G. The use of the rare UUA codon to define «expression space» for genes involved in secondary metabolism, development and environmental adaptation in Streptomyces // J. Microbiol. – 2008. – 46, ¹ 1. – P. 1–11. 27. Zaburannyy N., Ostash B., Fedorenko V. TTA Lynx: a web-based service for analysis of actinomycete genes containing rare TTA codon // Bioinformatics. – 2009. – 25, ¹ 18. – P. 2432–2433. 28. Chater K.F. Streptomyces inside-out: a new perspective on the bacteria that provide us with antibiotics // Philos. Trans. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. – 2006. – 361, ¹ 1469. – P. 761–768. 29. Li W., Wu J., Tao W. et al. A genetic and bio- informatic analysis of Streptomyces coelicolor genes containing TTA codons, possible targets for regu- lation by a developmentally significant tRNA // FEMS Microbiol. Lett. – 2007. – 266, ¹ 1. – P. 20–28. 30. Rebets Y.V., Ostash B.O., Fukuhara M. et al. Ex- pression of the regulatory protein LndI for lan- domycin E production in Streptomyces globisporus 1912 is controlled by the availability of tRNA for the rare UUA codon // FEMS Microbiol. Lett. – 2006. – 256, ¹ 1. – P. 30–37. 31. Kim D.W., Chater K., Lee K.J., Hesketh A. Changes in the extracellular proteome caused by the absence of the bldA gene product, a developmentally significant tRNA, reveal a new target for the pleiotropic regulator AdpA in Streptomyces coelicolor // J. Bacteriol. – 2005. – 187, ¹ 9. – P. 2957–2966. 32. Higo A., Hara H., Horinouchi S., Ohnishi Y. Ge- nome-wide distribution of AdpA, a global regulator for secondary metabolism and morphological dif- ferentiation in Streptomyces, revealed the extent and complexity of the AdpA regulatory network // DNA Res. – 2012. – [Epub ahead of print]. 33. Eccleston M., Willems A., Beveridge A., Nodwell J.R. Critical residues and novel effects of overexpression of the Streptomyces coelicolor developmental protein BldB: evidence for a critical interacting partner // J. Bacteriol. – 2006. – 188, ¹ 23. – P. 8189–8195. 34. Pope M.K., Green B.D., Westpheling J. The bld mu- tants of Streptomyces coelicolor are defective in the regulation of carbon utilization, morphogenesis and cell-cell signalling // Mol. Microbiol. – 1996. – 19, ¹ 4. – P. 747–756. 35. Ïàò. ¹ 63820 Óêðà¿íè. Ñïîñ³á ï³äâèùåííÿ á³î- ñèíòåçó ôîñôîãë³êîë³ï³äíèõ àíòèá³îòèê³â / Îñ- òàø Á.Î., Ôåäîðåíêî Â.Î., Ãðîìèêî Î.Ì., Óîêåð- Êàíå Ñ. Îïóáë. 25.10.11. Áþë. ¹ 20. 36. Horinouchi S. Mining and polishing of the treasure trove in the bacterial genus Streptomyces // Biosci. Biotechnol. Biochem. – 2007. – 71, ¹ 2. – P. 283– 299. 37. Takano E. Gamma-butyrolactones: Streptomyces sig- nalling molecules regulating antibiotic production and differentiation // Curr. Opin. Microbiol. – 2006. – 9, ¹ 3. – P. 287–294. 38. Ando N., Matsumori N., Sakuda S. et al. Involvement of afsA in A-factor biosynthesis as a key enzyme // J. Antibiot. – 1997. – 50, ¹ 10. – P. 847–852. 39. Horinouchi S., Ohnishi Y., Kang D.K. The A-factor regulatory cascade and cAMP in the regulation of physiological and morphological development in Streptomyces griseus // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. – 2001. – 27, ¹ 3. – P. 177–182. 40. Hara O., Beppu T. Mutants blocked in streptomycin production in Streptomyces griseus – the role of A- factor // J. Antibiot. – 1982. – 35, ¹ 3. – P. 349– 358. 41. Kato J.Y., Miyahisa I., Mashiko M. et al. A single target is sufficient to account for the biological effects of the A-factor receptor protein of Streptomyces gri- seus // J. Bacteriol. – 2004. – 186, ¹ 7. – P. 2206– 2211. 42. Onaka H., Ando N., Nihira T. et al. Cloning and characterization of the A-factor receptor gene from Streptomyces griseus // J. Bacteriol. – 1995. – 177, ¹ 21. – P. 6083–6092. 43. Ohnishi Y., Kameyama S., Onaka H., Horinouchi S. The A-factor regulatory cascade leading to strep- tomycin biosynthesis in Streptomyces griseus: iden- tification of a target gene of the A-factor receptor // Mol. Microbiol. – 1999. – 34, ¹ 1. – P. 102–111. 44. Yamazaki H., Ohnishi Y., Horinouchi S. An A-factor- dependent extracytoplasmic function sigma factor (sigma(AdsA)) that is essential for morphological development in Streptomyces griseus // J. Bacteriol. – 2000. – 182, ¹ 16. – P. 4596–4605. 45. Xu W., Huang J., Lin R. et al. Regulation of mor- phological differentiation in S. coelicolor by RNase III (AbsB) cleavage of mRNA encoding the AdpA transcription factor // Mol. Microbiol. – 2010. – 75, ¹ 3. – P. 781–791. 46. Takano E., Nihira T., Hara Y. et al. Purification and structural determination of SCB1, a gamma- butyrolactone that elicits antibiotic production in Streptomyces coelicolor A3(2) // J. Biol. Chem. – 2000. – 275, ¹ 15. – P. 11010–11016. 47. Hsiao N.H., Nakayama S., Merlo M.E. et al. Analysis of two additional signaling molecules in Streptomyces coelicolor and the development of a butyrolactone- specific reporter system // Chem. Biol. – 2009. – 16, ¹ 9. – P. 951–960. 48. Takano E., Chakraburtty R., Nihira T. et al. A complex role for the gamma-butyrolactone SCB1 in regulating antibiotic production in Streptomyces coelicolor A3(2) // Mol. Microbiol. – 2001. – 41, ¹ 5. – P. 1015–1028. 49. Hsiao N.H., Söding J., Linke D. et al. ScbA from ISSN 0564–3783. Öèòîëîãèÿ è ãåíåòèêà. 2014. Ò. 48. ¹ 1 81 Ìåðåæ³ ãåí³â ðåãóëÿö³¿ âòîðèííîãî ìåòàáîë³çìó àêòèíîì³öåò³â: ïëåéîòðîïí³ ðåãóëÿòîðè Streptomyces coelicolor A3(2) has homology to fatty acid synthases and is able to synthesize gamma- butyrolactones // Microbiology. – 2007. – 153. – P. 1394–1404. 50. Takano E., Kinoshita H., Mersinias V. et al. A bac- terial hormone (the SCB1) directly controls the ex- pression of a pathway-specific regulatory gene in the cryptic type I polyketide biosynthetic gene cluster of Streptomyces coelicolor // Mol. Microbiol. – 2005. – 56, ¹ 2. – P. 465–479. 51. Hesketh A., Chen W.J., Ryding J., Chang S., Bibb M. The global role of ppGpp synthesis in morphological differentiation and antibiotic production in Strep- tomyces coelicolor A3(2) // Genome Biol. – 2007. – 8, ¹ 8. – P. 1–18. 52. Chakraburtty R., Bibb M. The ppGpp synthetase gene (relA) of Streptomyces coelicolor A3(2) plays a con- ditional role in antibiotic production and mor- phological differentiation // J. Bacteriol. – 1997. – 179, ¹ 18. – P. 5854–5861. 53. Hesketh A., Sun J., Bibb M. Induction of ppGpp synthesis in Streptomyces coelicolor A3(2) grown under conditions of nutritional sufficiency elicits actII- ORF4 transcription and actinorhodin biosynthesis // Mol. Microbiol. – 2001. – 39, ¹ 1. – P. 136– 144. 54. Ryu Y.G., Kim E.S., Kim D.W. et al. Differential stringent responses of Streptomyces coelicolor M600 to starvation of specific nutrients // J. Microbiol. Biotechnol. – 2007. – 17, ¹ 2. – P. 305–312. 55. Gomez-Escribano J.P., Martin J.F., Hesketh A. et al. Streptomyces clavuligerus relA-null mutants overpro- duce clavulanic acid and cephamycin C: negative regulation of secondary metabolism by (p)ppGpp // Microbiol. – 2008. – 154. – P. 744–755. 56. Gatewood M.L., Jones G.H. (p)ppGpp inhibits poly- nucleotide phosphorylase from streptomyces but not from Escherichia coli and increases the stability of bulk mRNA in Streptomyces coelicolor // J. Bacte- riol. – 2010. – 192, ¹ 17. – P. 4275–4280. 57. Angell S., Lewis C.G., Buttner M.J., Bibb M.J. Glu- cose repression in Streptomyces coelicolor A3(2): a likely regulatory role for glucose kinase // Mol. Gen. Genet. – 1994. – 244, ¹ 2. – P. 135–143. 58. Rigali S., Titgemeyer F., Barends S. et al. Feast or famine: the global regulator DasR links nutrient stress to antibiotic production by Streptomyces // EMBO Rep. – 2008. – 9, ¹ 7. – P. 670–675. 59. Rodriguez-Garcia A., Sola-Landa A. et al. Phosphate control over nitrogen metabolism in Streptomyces coelicolor: direct and indirect negative control of glnR, glnA, glnII and amtB expression by the response regulator PhoP // Nucl. Acids Res. – 2009. – 37, ¹ 10. – P. 3230–3242. 60. Hopwood D.A. Soil to genomics: the Streptomyces chromosome // Annu. Rev. Genet. – 2006. – 40. – P. 1–23. 61. Rigali S., Nothaft H., Noens E.E. et al. The sugar phosphotransferase system of Streptomyces coelicolor is regulated by the GntR-family regulator DasR and links N-acetylglucosamine metabolism to the control of development // Mol. Microbiol. – 2006. – 61, ¹ 5. – P. 1237–1251. 62. Sola-Landa A., Moura R.S., Martin J.F. The two- component PhoR-PhoP system controls both primary metabolism and secondary metabolite biosynthesis in Streptomyces lividans // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. – 2003. – 100, ¹ 10. – P. 6133–6138. 63. Ghorbel S., Smirnov A., Chouayekh H. et al. Regulation of ppk expression and in vivo function of Ppk in Streptomyces lividans TK24 // J. Bacteriol. – 2006. – 188, ¹ 17. – P. 6269–6276. 64. Chouayekh H., Virolle M.J. The polyphosphate kinase plays a negative role in the control of antibiotic pro- duction in Streptomyces lividans // Mol. Microbiol. – 2002. – 43, ¹ 4. – P. 919–930. 65. Ghorbel S., Kormanec J., Artus A., Virolle M.J. Trans- criptional studies and regulatory interactions between the phoR-phoP operon and the phoU, mtpA, and ppk genes of Streptomyces lividans TK24 // J. Bacteriol. – 2006. – 188, ¹ 2. – P. 677–686. 66. Weisschuh N., Fink D., Vierling S. et al. Transcriptio- nal analysis of the gene for glutamine synthetase II and two upstream genes in Streptomyces coelicolor A3(2) // Mol. Gen. Genet. – 2000. – 264, ¹ 4. – P. 461–469. 67. Reuther J., Wohlleben W. Nitrogen metabolism in Streptomyces coelicolor: transcriptional and post-trans- lational regulation // J. Mol. Microbiol. Biotech- nol. – 2007. – 12. – P. 139–146. 68. Tiffert Y., Supra P., Wurm R. et al. The Streptomyces coelicolor GlnR regulon: identification of new GlnR targets and evidence for a central role of GlnR in nitrogen metabolism in actinomycetes // Mol. Micro- biol. – 2008. – 67, ¹ 4. – P. 861–870. 69. West A.H., Stock A.M. Histidine kinases and response regulator proteins in two-component signaling systems // Trends. Biochem. Sci. – 2001. – 26, ¹ 6. – P. 369–376. 70. Hutchings M.I., Hoskisson P.A., Chandra G., Butt- ner M.J. Sensing and responding to diverse extra- cellular signals? Analysis of the sensor kinases and response regulators of Streptomyces coelicolor A3(2) // Microbiology. – 2004. – 150. – P. 2795–2806. 71. Pet í ková K., Pet í ek M. Eukaryotic-type protein kinases in Streptomyces coelicolor: variations on a common theme // Microbiology. – 2003. – 149. – P. 1609–1621. 72. McKenzie N.L., Nodwell J.R. Phosphorylated AbsA2 negatively regulates antibiotic production in Strep- Ì.Â. Ðàáèê, Á.Î. Îñòàø, Â.Î. Ôåäîðåíêî tomyces coelicolor through interactions with pathway- specific regulatory gene promoters // J. Bacteriol. – 2007. – 189, ¹ 14. – P. 5284–5292. 73. Floriano B., Bibb M. afsR is a pleiotropic but conditionally required regulatory gene for antibiotic production in Streptomyces coelicolor A3(2) // Mol. Microbiol. – 1996. – 21, ¹ 2. – P. 385–396. 74. Wietzorrek A., Bibb M. A novel family of proteins that regulates antibiotic production in streptomycetes ap- pears to contain an OmpR-like DNA-binding fold // Mol. Microbiol. – 1997. – 25, ¹ 6. – P. 1181–1184. 75. Sawai R., Suzuki A., Takano Y. et al. Phosphorylation of AfsR by multiple serine/threonine kinases in Streptomyces coelicolor A3(2) // Gene. – 2004. – 334. – P. 53–61. 76. Lee Y., Kim K., Suh J.W. et al. Binding study of AfsK, a Ser/Thr kinase from Streptomyces coelicolor A3(2) and S-adenosyl-L-methionine // FEMS Microbiol. Lett. – 2007. – 266, ¹ 2. – P. 236–240. 77. Santos-Beneit F., Rodriguez-Garcia A., Sola-Landa A., Martin J.F. Cross-talk between two global regulators in Streptomyces: PhoP and AfsR interact in the control of afsS, pstS and phoRP transcription // Mol. Microbiol. – 2009. – 72, ¹ 2. – P. 53–68. 78. Lian W., Jayapal K.P., Charaniya S. et al. Genome- wide transcriptome analysis reveals that a pleiotropic antibiotic regulator, AfsS, modulates nutritional stress response in Streptomyces coelicolor A3(2) // BMC Genom. – 2008. – 9. – P. 1–14. 79. Price B., Adamidis T., Kong R., Champness W. A Strep- tomyces coelicolor antibiotic regulatory gene, absB, encodes an RNase III homolog // J. Bacteriol. – 1999. – 181, ¹ 19. – P. 6142–6151. 80. Adamidis T., Champness W. Genetic analysis of absB, a Streptomyces coelicolor locus involved in global antibiotic regulation // J. Bacteriol. – 1992. – 174, ¹ 14. – P. 4622–4628. 81. Xu W., Huang J., Cohen S.N. Autoregulation of AbsB (RNase III) expression in Streptomyces coelicolor by endoribonucleolytic cleavage of absB operon transcripts // J. Bacteriol. – 2008. – 190, ¹ 15. – P. 5526–5530. 82. Uguru G.C., Stephens K.E., Stead J.A. et al. Transcriptional activation of the pathway-specific regulator of the actinorhodin biosynthetic genes in Streptomyces coelicolor // Mol. Microbiol. – 2005. – 58, ¹ 1. – P. 131–150. 83. Nothaft H., Rigali S., Boomsma B. et al. The permease gene nagE2 is the key to N-acetylglucosamine sensing and utilization in Streptomyces coelicolor and is subject to multilevel control // Mol. Microbiol. – 2010. – 75, ¹ 5. – P. 1133–1144. 84. Hillen W., Berens C. Mechanisms underlying exp- ression of Tn10 encoded tetracycline resistance // Annu. Rev. Microbiol. – 1994. – 48. – P. 345–369. 85. McAdams H.H., Srinivasan B., Arkin A.P. The evo- lution of genetic regulatory systems in bacteria // Nat. Rev. Genet. – 2004. – 5, ¹ 3. – P. 169–178. 86. Rabyk M., Ostash B., Walker S., Fedorenko V. Identification and characterization of Streptomyces ghanaensis ATCC 14672 regulatory genes nsdAgh and atrAgh // Â³ñí. Ëüâ³â. óí-òó. Ñåð. á³îë. – 2010. – Âèï. 53. – C. 41–48. 87. Li W., Ying X., Guo Y. et al. Identification of a gene negatively affecting antibiotic production and morphological differentiation in Streptomyces coeli- color A3(2) // J. Bacteriol. – 2006. – 188, ¹ 24. – P. 8368–8375. 88. Soliveri J., Vijgenboom E., Granozzi C. et al. Functional and evolutionary implications of a survey of various actinomycetes for homologues of two Streptomyces coelicolor sporulation genes // J. Gen. Microbiol. – 1993. – 139, ¹ 11. – P. 2569–2578. 89. Den Hengst C.D., Buttner M.J. Redox control in actinobacteria // Biochim. biophys. acta. – 2008. – 1780, ¹ 11. – P. 1201–1216. 90. Crack J.C., den Hengst C.D., Jakimowicz P. et al. Characterization of [4Fe-4S]-containing and cluster- free forms of Streptomyces WhiD // Biochemistry. – 2009. – 48, ¹ 51. – P. 12252–12264. 91. Steyn A.J.C., Collins D.M., Hondalus M.K. et al. Mycobacterium tuberculosis WhiB3 interacts with RpoV to affect host survival but is dispensable for in vivo growth // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. – 2002. – 99, ¹ 5. – P. 3149–3152. 92. Alam M.S., Garg S.K., Agrawal P. Molecular function of WhiB4/Rv3681c of Mycobacterium tuberculosis H37Rv: a [4Fe-4S] cluster co-ordinating protein disulphide reductase // Mol. Microbiol. – 2007. – 63, ¹ 5. – P. 1414–1431. 93. Rabyk M., Ostash B., Rebets Y. et al. Streptomyces ghanaensis pleiotropic regulatory gene wblAgh influen- ces morphogenesis and moenomycin production // Biotechnol. Lett. – 2011. – 33, ¹ 12. – P. 2481–2486. 94. Fowler-Goldsworthy K., Gust B., Mouz S. et al. The actinobacteria-specific gene wblA controls major developmental transitions in Streptomyces coelicolor A3(2) // Microbiology. – 2011. – 157. – P. 1312– 1328. Íàä³éøëà 27.07.12 << /ASCII85EncodePages false /AllowTransparency false /AutoPositionEPSFiles true /AutoRotatePages /None /Binding /Left /CalGrayProfile (Dot Gain 20%) /CalRGBProfile (sRGB IEC61966-2.1) /CalCMYKProfile (U.S. Web Coated \050SWOP\051 v2) /sRGBProfile (sRGB IEC61966-2.1) /CannotEmbedFontPolicy /Error /CompatibilityLevel 1.4 /CompressObjects /Tags /CompressPages true /ConvertImagesToIndexed true /PassThroughJPEGImages true /CreateJobTicket false /DefaultRenderingIntent /Default /DetectBlends true /DetectCurves 0.0000 /ColorConversionStrategy /CMYK /DoThumbnails false /EmbedAllFonts true /EmbedOpenType false /ParseICCProfilesInComments true /EmbedJobOptions true /DSCReportingLevel 0 /EmitDSCWarnings false /EndPage -1 /ImageMemory 1048576 /LockDistillerParams false /MaxSubsetPct 100 /Optimize true /OPM 1 /ParseDSCComments true /ParseDSCCommentsForDocInfo true /PreserveCopyPage true /PreserveDICMYKValues true /PreserveEPSInfo true /PreserveFlatness true /PreserveHalftoneInfo false /PreserveOPIComments false /PreserveOverprintSettings true /StartPage 1 /SubsetFonts true /TransferFunctionInfo /Apply /UCRandBGInfo /Preserve /UsePrologue false /ColorSettingsFile () /AlwaysEmbed [ true ] /NeverEmbed [ true ] /AntiAliasColorImages false /CropColorImages true /ColorImageMinResolution 300 /ColorImageMinResolutionPolicy /OK /DownsampleColorImages true /ColorImageDownsampleType /Bicubic /ColorImageResolution 1200 /ColorImageDepth -1 /ColorImageMinDownsampleDepth 1 /ColorImageDownsampleThreshold 1.50000 /EncodeColorImages false /ColorImageFilter /DCTEncode /AutoFilterColorImages true /ColorImageAutoFilterStrategy /JPEG /ColorACSImageDict << /QFactor 0.15 /HSamples [1 1 1 1] /VSamples [1 1 1 1] >> /ColorImageDict << /QFactor 0.15 /HSamples [1 1 1 1] /VSamples [1 1 1 1] >> /JPEG2000ColorACSImageDict << /TileWidth 256 /TileHeight 256 /Quality 30 >> /JPEG2000ColorImageDict << /TileWidth 256 /TileHeight 256 /Quality 30 >> /AntiAliasGrayImages false /CropGrayImages true /GrayImageMinResolution 300 /GrayImageMinResolutionPolicy /OK /DownsampleGrayImages true /GrayImageDownsampleType /Bicubic /GrayImageResolution 1200 /GrayImageDepth -1 /GrayImageMinDownsampleDepth 2 /GrayImageDownsampleThreshold 1.50000 /EncodeGrayImages false /GrayImageFilter /DCTEncode /AutoFilterGrayImages true /GrayImageAutoFilterStrategy /JPEG /GrayACSImageDict << /QFactor 0.15 /HSamples [1 1 1 1] /VSamples [1 1 1 1] >> /GrayImageDict << /QFactor 0.15 /HSamples [1 1 1 1] /VSamples [1 1 1 1] >> /JPEG2000GrayACSImageDict << /TileWidth 256 /TileHeight 256 /Quality 30 >> /JPEG2000GrayImageDict << /TileWidth 256 /TileHeight 256 /Quality 30 >> /AntiAliasMonoImages false /CropMonoImages true /MonoImageMinResolution 1200 /MonoImageMinResolutionPolicy /OK /DownsampleMonoImages true /MonoImageDownsampleType /Bicubic /MonoImageResolution 1200 /MonoImageDepth -1 /MonoImageDownsampleThreshold 1.50000 /EncodeMonoImages false /MonoImageFilter /CCITTFaxEncode /MonoImageDict << /K -1 >> /AllowPSXObjects false /CheckCompliance [ /None ] /PDFX1aCheck false /PDFX3Check false /PDFXCompliantPDFOnly false /PDFXNoTrimBoxError true /PDFXTrimBoxToMediaBoxOffset [ 0.00000 0.00000 0.00000 0.00000 ] /PDFXSetBleedBoxToMediaBox true /PDFXBleedBoxToTrimBoxOffset [ 0.00000 0.00000 0.00000 0.00000 ] /PDFXOutputIntentProfile (None) /PDFXOutputConditionIdentifier () /PDFXOutputCondition () /PDFXRegistryName () /PDFXTrapped /False /CreateJDFFile false /Description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> /CHS <FEFF4f7f75288fd94e9b8bbe5b9a521b5efa7684002000410064006f006200650020005000440046002065876863900275284e8e9ad88d2891cf76845370524d53705237300260a853ef4ee54f7f75280020004100630072006f0062006100740020548c002000410064006f00620065002000520065006100640065007200200035002e003000204ee553ca66f49ad87248672c676562535f00521b5efa768400200050004400460020658768633002> /CHT <FEFF4f7f752890194e9b8a2d7f6e5efa7acb7684002000410064006f006200650020005000440046002065874ef69069752865bc9ad854c18cea76845370524d5370523786557406300260a853ef4ee54f7f75280020004100630072006f0062006100740020548c002000410064006f00620065002000520065006100640065007200200035002e003000204ee553ca66f49ad87248672c4f86958b555f5df25efa7acb76840020005000440046002065874ef63002> /CZE <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> /DAN <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> /DEU <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> /ESP <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> /ETI <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> /FRA <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> /GRE <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a stvaranje Adobe PDF dokumenata najpogodnijih za visokokvalitetni ispis prije tiskanja koristite ove postavke. Stvoreni PDF dokumenti mogu se otvoriti Acrobat i Adobe Reader 5.0 i kasnijim verzijama.) /HUN <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> /ITA <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> /JPN <FEFF9ad854c18cea306a30d730ea30d730ec30b951fa529b7528002000410064006f0062006500200050004400460020658766f8306e4f5c6210306b4f7f75283057307e305930023053306e8a2d5b9a30674f5c62103055308c305f0020005000440046002030d530a130a430eb306f3001004100630072006f0062006100740020304a30883073002000410064006f00620065002000520065006100640065007200200035002e003000204ee5964d3067958b304f30533068304c3067304d307e305930023053306e8a2d5b9a306b306f30d530a930f330c8306e57cb30818fbc307f304c5fc59808306730593002> /KOR <FEFFc7740020c124c815c7440020c0acc6a9d558c5ec0020ace0d488c9c80020c2dcd5d80020c778c1c4c5d00020ac00c7a50020c801d569d55c002000410064006f0062006500200050004400460020bb38c11cb97c0020c791c131d569b2c8b2e4002e0020c774b807ac8c0020c791c131b41c00200050004400460020bb38c11cb2940020004100630072006f0062006100740020bc0f002000410064006f00620065002000520065006100640065007200200035002e00300020c774c0c1c5d0c11c0020c5f40020c2180020c788c2b5b2c8b2e4002e> /LTH <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> /LVI <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> /NLD (Gebruik deze instellingen om Adobe PDF-documenten te maken die zijn geoptimaliseerd voor prepress-afdrukken van hoge kwaliteit. De gemaakte PDF-documenten kunnen worden geopend met Acrobat en Adobe Reader 5.0 en hoger.) /NOR <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> /POL <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> /PTB <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> /RUM <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> /RUS <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> /SKY <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> /SLV <FEFF005400650020006e006100730074006100760069007400760065002000750070006f0072006100620069007400650020007a00610020007500730074007600610072006a0061006e006a006500200064006f006b0075006d0065006e0074006f0076002000410064006f006200650020005000440046002c0020006b006900200073006f0020006e0061006a007000720069006d00650072006e0065006a016100690020007a00610020006b0061006b006f0076006f00730074006e006f0020007400690073006b0061006e006a00650020007300200070007200690070007200610076006f0020006e00610020007400690073006b002e00200020005500730074007600610072006a0065006e006500200064006f006b0075006d0065006e0074006500200050004400460020006a00650020006d006f0067006f010d00650020006f0064007000720065007400690020007a0020004100630072006f00620061007400200069006e002000410064006f00620065002000520065006100640065007200200035002e003000200069006e0020006e006f00760065006a01610069006d002e> /SUO <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> /SVE <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> /TUR <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> /UKR <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> /ENU (Use these settings to create Adobe PDF documents best suited for high-quality prepress printing. Created PDF documents can be opened with Acrobat and Adobe Reader 5.0 and later.) >> /Namespace [ (Adobe) (Common) (1.0) ] /OtherNamespaces [ << /AsReaderSpreads false /CropImagesToFrames true /ErrorControl /WarnAndContinue /FlattenerIgnoreSpreadOverrides false /IncludeGuidesGrids false /IncludeNonPrinting false /IncludeSlug false /Namespace [ (Adobe) (InDesign) (4.0) ] /OmitPlacedBitmaps false /OmitPlacedEPS false /OmitPlacedPDF false /SimulateOverprint /Legacy >> << /AddBleedMarks false /AddColorBars false /AddCropMarks false /AddPageInfo false /AddRegMarks false /ConvertColors /ConvertToCMYK /DestinationProfileName () /DestinationProfileSelector /DocumentCMYK /Downsample16BitImages true /FlattenerPreset << /PresetSelector /MediumResolution >> /FormElements false /GenerateStructure false /IncludeBookmarks false /IncludeHyperlinks false /IncludeInteractive false /IncludeLayers false /IncludeProfiles false /MultimediaHandling /UseObjectSettings /Namespace [ (Adobe) (CreativeSuite) (2.0) ] /PDFXOutputIntentProfileSelector /DocumentCMYK /PreserveEditing true /UntaggedCMYKHandling /LeaveUntagged /UntaggedRGBHandling /UseDocumentProfile /UseDocumentBleed false >> ] >> setdistillerparams << /HWResolution [2400 2400] /PageSize [612.000 792.000] >> setpagedevice

Мережі генів регуляції вторинного метаболізму актиноміцетів: плейотропні регулятори

Institution

Similar Items