Біоінформатичний аналіз гена, що кодує гранулоасоційовану крохмальсинтазу, кукурудзи

• Published in: Цитология и генетика
• Date: 2014
• Main Authors: Баранов, Ю.О., Сліщук, Г.І., Волкова, Н.Е., Сиволап, Ю.М.
• Format: Article
• Language: Ukrainian
• Published: Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України 2014
• Subjects: Оригинальные работы
• Online Access: https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126633
• Journal Title: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Cite this: Біоінформатичний аналіз гена, що кодує гранулоасоційовану крохмальсинтазу, кукурудзи / Ю.О. Баранов, Г.І. Сліщук, Н.Е. Волкова, Ю.М. Сиволап // Цитология и генетика. — 2014. — Т. 48, № 3. — С. 18-23. — Бібліогр.: 17 назв. — укр.

Проведено вирівнювання нуклеотидних послідовностей гена Wx і його гомологів та побудовано дендрограму, яка у цілому відображає філогенетичні зв’язки родини Poaceae. Зроблено припущення щодо давнього горизонтального переносу гена Wx від Zea mays до Dimeria lawsonii. Розроблено праймери до поліморфного регіону екзонів 8–10. Проведено in silico ПЛР-аналіз. Проведено выравнивание нуклеотидних последовательностей гена Wx и его гомологов, по результатам которого построена филогенетическая дендрограмма, отображающая эволюционные связи между представителями Poaceae. Предполагается факт древнего горизонтального переноса гена Wx от Zea mays в Dimeria lawsonii. Разработаны праймеры к полиморфному региону экзонов 8–10. Проведен in silico ПЦР-анализ. Alignment of the Wx-gene and its homolog sequences has been conducted. A dendrogram displaying phylogenetic relationship between Poaceae family members has been built. Transfer of ancient Wx-gene from Zea mays to Dimeria lawsonii has been assumed. Primers for the exons 8–10 of polymorphic region have been designed. In silico PCR analysis has been conducted.