Genetic diversity of Azotobacter strains isolated from soils by amplified ribosomal DNA restriction analysis

Genetic diversity of Azotobacter strains isolated from soils by amplified ribosomal DNA restriction analysis

Strains of Azotobacter mediate in the nitrogen fixation process by reducing of N2 to ammonia. In this study, 50 strains were isolated from different rhizospheric soil in central Iran, by using soil paste-plate method. These strains were biochemically identified and characterized on differential LG m...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Цитология и генетика
Datum:2014
Hauptverfasser: Mazinani, Z., Asgharzadeh, A.
Format: Artikel
Sprache:English
Veröffentlicht: Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України 2014
Schlagworte:
Оригинальные работы
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126660
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Genetic diversity of Azotobacter strains isolated from soils by amplified ribosomal DNA restriction analysis / Z. Mazinani, A. Asgharzadeh // Цитология и генетика. — 2014. — Т. 48, № 5. — С. 26-35. — Бібліогр.: 30 назв. — англ.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-126660
record_format dspace
spelling Mazinani, Z.
Asgharzadeh, A.
2017-11-30T18:49:37Z
2017-11-30T18:49:37Z
2014
Genetic diversity of Azotobacter strains isolated from soils by amplified ribosomal DNA restriction analysis / Z. Mazinani, A. Asgharzadeh // Цитология и генетика. — 2014. — Т. 48, № 5. — С. 26-35. — Бібліогр.: 30 назв. — англ.
0564-3783
DOI: 10.3103/S0095452714050041
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126660
Strains of Azotobacter mediate in the nitrogen fixation process by reducing of N2 to ammonia. In this study, 50 strains were isolated from different rhizospheric soil in central Iran, by using soil paste-plate method. These strains were biochemically identified and characterized on differential LG medium based on morphological and physiological properties. Results obtained showed that identified strains were belonging to three species, namely A. chroococcum, A. vinelandii and A. beijernckii. In order to molecular analysis, the 16S rRNA gene was amplified using 27f and 1495r primers and PCR products were subsequently restricted with RsaI, HpaII and HhaI. Cluster analysis based on amplified ribosomal DNA restriction analysis were revealed intraspecific polymorphism and differentiated strains into two mains clusters, clusters A and B. Cluster A strains were related to the A. vinelandii, whereas cluster B strains were related to the A. chroococcum and A. beijerinckii. The results show that amplified ribosomal DNA restriction analysis is a powerful and discriminatory tool for the identification of members of the genus Azotobacter.
Штаммы Azotobacter являются посредниками в проессах фиксации азота, восстанавливая N2 до аммония. Из разных ризосферных почв Ирана выделено 50 штаммов. Эти штаммы биохимически идентифицированы и охарактеризованы на дифференциальной среде LG на основе морфологических и физиологических свойств. Полученные результаты показали, что идентифицированные штаммы принадлежат трем видам – A. chroococcum, A. vinelandii и A. beijerinckii. Для молекулярного анализа ген 16S рРНК был амплифицирован с использованием 27f и 1495r праймеров, а продукты ПЦР расщеплены с помощью RsaI, HpaII и HhaI. Кластерный анализ, основанный на рестрикционном анализе амплифицированных рибосомальных ДНК (ARDRA), показал межвидовой полиморфизм и разделение штаммов на два основных кластера, A и B. Линии кластера А относятся к A. vinelandii, а кластера В – к A. chroococcum и A. beijerinckii. Результаты показывают, что ARDRA является эффективным методом идентификации видов рода Azotobacter.
We would like to express our special gratitude to Dr. M. Khosroshahli (Department of biotechnology) for his helpful support. This work was supported by Islamic Azad University, Science and Research Branch, Tehran, Iran.
en
Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
Цитология и генетика
Оригинальные работы
Genetic diversity of Azotobacter strains isolated from soils by amplified ribosomal DNA restriction analysis
Генетическое разнообразие линий Azotobacter, выделенных из почв, на основе рестрикционного анализа амплифицированных рибосомальных ДНК
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Genetic diversity of Azotobacter strains isolated from soils by amplified ribosomal DNA restriction analysis
spellingShingle Genetic diversity of Azotobacter strains isolated from soils by amplified ribosomal DNA restriction analysis
Mazinani, Z.
Asgharzadeh, A.
Оригинальные работы
title_short Genetic diversity of Azotobacter strains isolated from soils by amplified ribosomal DNA restriction analysis
title_full Genetic diversity of Azotobacter strains isolated from soils by amplified ribosomal DNA restriction analysis
title_fullStr Genetic diversity of Azotobacter strains isolated from soils by amplified ribosomal DNA restriction analysis
title_full_unstemmed Genetic diversity of Azotobacter strains isolated from soils by amplified ribosomal DNA restriction analysis
title_sort genetic diversity of azotobacter strains isolated from soils by amplified ribosomal dna restriction analysis
author Mazinani, Z.
Asgharzadeh, A.
author_facet Mazinani, Z.
Asgharzadeh, A.
topic Оригинальные работы
topic_facet Оригинальные работы
publishDate 2014
language English
container_title Цитология и генетика
publisher Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України
format Article
title_alt Генетическое разнообразие линий Azotobacter, выделенных из почв, на основе рестрикционного анализа амплифицированных рибосомальных ДНК
description Strains of Azotobacter mediate in the nitrogen fixation process by reducing of N2 to ammonia. In this study, 50 strains were isolated from different rhizospheric soil in central Iran, by using soil paste-plate method. These strains were biochemically identified and characterized on differential LG medium based on morphological and physiological properties. Results obtained showed that identified strains were belonging to three species, namely A. chroococcum, A. vinelandii and A. beijernckii. In order to molecular analysis, the 16S rRNA gene was amplified using 27f and 1495r primers and PCR products were subsequently restricted with RsaI, HpaII and HhaI. Cluster analysis based on amplified ribosomal DNA restriction analysis were revealed intraspecific polymorphism and differentiated strains into two mains clusters, clusters A and B. Cluster A strains were related to the A. vinelandii, whereas cluster B strains were related to the A. chroococcum and A. beijerinckii. The results show that amplified ribosomal DNA restriction analysis is a powerful and discriminatory tool for the identification of members of the genus Azotobacter. Штаммы Azotobacter являются посредниками в проессах фиксации азота, восстанавливая N2 до аммония. Из разных ризосферных почв Ирана выделено 50 штаммов. Эти штаммы биохимически идентифицированы и охарактеризованы на дифференциальной среде LG на основе морфологических и физиологических свойств. Полученные результаты показали, что идентифицированные штаммы принадлежат трем видам – A. chroococcum, A. vinelandii и A. beijerinckii. Для молекулярного анализа ген 16S рРНК был амплифицирован с использованием 27f и 1495r праймеров, а продукты ПЦР расщеплены с помощью RsaI, HpaII и HhaI. Кластерный анализ, основанный на рестрикционном анализе амплифицированных рибосомальных ДНК (ARDRA), показал межвидовой полиморфизм и разделение штаммов на два основных кластера, A и B. Линии кластера А относятся к A. vinelandii, а кластера В – к A. chroococcum и A. beijerinckii. Результаты показывают, что ARDRA является эффективным методом идентификации видов рода Azotobacter. We would like to express our special gratitude to Dr. M. Khosroshahli (Department of biotechnology) for his helpful support. This work was supported by Islamic Azad University, Science and Research Branch, Tehran, Iran.
issn 0564-3783
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/126660
citation_txt Genetic diversity of Azotobacter strains isolated from soils by amplified ribosomal DNA restriction analysis / Z. Mazinani, A. Asgharzadeh // Цитология и генетика. — 2014. — Т. 48, № 5. — С. 26-35. — Бібліогр.: 30 назв. — англ.
work_keys_str_mv AT mazinaniz geneticdiversityofazotobacterstrainsisolatedfromsoilsbyamplifiedribosomaldnarestrictionanalysis
AT asgharzadeha geneticdiversityofazotobacterstrainsisolatedfromsoilsbyamplifiedribosomaldnarestrictionanalysis
AT mazinaniz genetičeskoeraznoobrazieliniiazotobactervydelennyhizpočvnaosnoverestrikcionnogoanalizaamplificirovannyhribosomalʹnyhdnk
AT asgharzadeha genetičeskoeraznoobrazieliniiazotobactervydelennyhizpočvnaosnoverestrikcionnogoanalizaamplificirovannyhribosomalʹnyhdnk
first_indexed 2025-11-29T09:18:28Z
last_indexed 2025-11-29T09:18:28Z
_version_ 1850854709888286720

Ähnliche Einträge