Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar

• Published in: Физика низких температур
• Date: 2015
• Main Authors: Иванов, А.Ю., Рубин, Ю.В., Егупов, С.А., Белоус, Л.Ф., Карачевцев, В.А.
• Format: Article
• Language: Russian
• Published: Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України 2015
• Subjects: Низкотемпературная оптическая спектроскопия
• Online Access: https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/128241
• Journal Title: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Cite this: Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar / А.Ю. Иванов, Ю.В. Рубин, С.А. Егупов, Л.Ф. Белоус, В.А. Карачевцев // Физика низких температур. — 2015. — Т. 41, № 11. — С. 1198–1205. — Бібліогр.: 31 назв. — рос.

В инфракрасном диапазоне 3800–400 см⁻¹ с разрешением 0,3 см⁻¹
 получены ИК фурье-спектры молекул аденозина (Ado), изолированных в низкотемпературных матрицах Ar. Квантово-механическими методами MP2 и DFT/B3LYP проведены расчеты заселенности основных структурных изомеров Ado. Показано, что Ado выдерживает длительное испарение при температуре 465 К без термического
 разложения. Установлены структуры пяти основных конформеров, которые фиксируются в Ar матрицах
 при 6 К. Обнаружены анти-конформеры Ado с внутримолекулярной водородной связью O2’H–N3. Заселенность этих анти-конформеров более чем в полтора раза превышает заселенность син-конформеров с
 внутримолекулярной водородной связью O5’H–N3. В низкотемпературных матрицах большинство доминантных конформеров фиксируется с C2’-эндо структурой рибозного кольца. Подобно 2’-дезоксиаденозину (dA), конформеры Ado с внутримолекулярными водородными связями O3’H–O5’ или O5’H–
 O3’ не были обнаружены. У діапазоні 3800–400 см⁻¹ з розділенням 0,3 см⁻¹ отримані ІЧ фур’є-спектри молекул аденозину (Ado),
 ізольованих у низькотемпературних матрицях Ar. Квантово-механічними методами MP2 та DFT/B3LYP
 проведено розрахунки основних структурних ізомерів Ado. Показано, що Ado витримує тривале випаровування при температурі 465 К без термічного розкладу. Встановлено структури п’яти основних конформерів, які фіксуються у Ar матрицях при 6 К. Виявлено анті-конформери Ado з внутрішньомолекулярним водневим зв’язком O2’H–N3. Заселеність цих анті-конформерів Ado більш ніж у півтори рази
 перевищує заселеність син-конформерів з внутрішньомолекулярним водневим зв’язком O5’H–N3. У низькотемпературних матрицях більшість домінантних конформерів фіксується з C2’-ендо структурою рибозного кільця. Подібно 2’-дезоксиаденозину (dA), конформери Ado з внутрішньомолекулярними водневими зв’язками O3’H–O5’або O5’H–O3’ не було виявлено. The FTIR spectra of adenosine (Ado) molecules isolated
 in low temperature Ar matrices were obtained in
 the range of 3800–400 cm⁻¹ with resolution 0.3 cm⁻¹
 .
 The populations of main structural isomers of Ado
 were estimated by using of the MP2 and DFT/B3LYP
 methods of quantum-mechanical calculations. It was
 shown that Ado may be evaporated over a long period
 at 465 K without thermodestruction. The structures of
 the five main Ado conformations were established.
 The Ado anti-conformers with intramolecular H-bond
 O2’H–N3 were found. The population of these Ado
 anti-conformers is more by a factor of 1.5 than synconformers
 intramolecular H-bond O5’H–N3. The
 majority of Ado dominant conformers are frozen in
 low temperature matrices with C2’-endo structure of
 the ribose ring. Like the 2”-deoxyadenosine (dA), the
 Ado conformers with the intramolecular H-bond
 O3’H–O5’ or O5’H–O3’ were not found.