Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar
В инфракрасном диапазоне 3800–400 см⁻¹ с разрешением 0,3 см⁻¹
 получены ИК фурье-спектры молекул аденозина (Ado), изолированных в низкотемпературных матрицах Ar. Квантово-механическими методами MP2 и DFT/B3LYP проведены расчеты заселенности основных структурных изомеров Ado. Показано, что Ad...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Физика низких температур |
|---|---|
| Дата: | 2015 |
| Автори: | , , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Російська |
| Опубліковано: |
Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України
2015
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/128241 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar / А.Ю. Иванов, Ю.В. Рубин, С.А. Егупов, Л.Ф. Белоус, В.А. Карачевцев // Физика низких температур. — 2015. — Т. 41, № 11. — С. 1198–1205. — Бібліогр.: 31 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862610993293557760 |
|---|---|
| author | Иванов, А.Ю. Рубин, Ю.В. Егупов, С.А. Белоус, Л.Ф. Карачевцев, В.А. |
| author_facet | Иванов, А.Ю. Рубин, Ю.В. Егупов, С.А. Белоус, Л.Ф. Карачевцев, В.А. |
| citation_txt | Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar / А.Ю. Иванов, Ю.В. Рубин, С.А. Егупов, Л.Ф. Белоус, В.А. Карачевцев // Физика низких температур. — 2015. — Т. 41, № 11. — С. 1198–1205. — Бібліогр.: 31 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Физика низких температур |
| description | В инфракрасном диапазоне 3800–400 см⁻¹ с разрешением 0,3 см⁻¹
получены ИК фурье-спектры молекул аденозина (Ado), изолированных в низкотемпературных матрицах Ar. Квантово-механическими методами MP2 и DFT/B3LYP проведены расчеты заселенности основных структурных изомеров Ado. Показано, что Ado выдерживает длительное испарение при температуре 465 К без термического
разложения. Установлены структуры пяти основных конформеров, которые фиксируются в Ar матрицах
при 6 К. Обнаружены анти-конформеры Ado с внутримолекулярной водородной связью O2’H–N3. Заселенность этих анти-конформеров более чем в полтора раза превышает заселенность син-конформеров с
внутримолекулярной водородной связью O5’H–N3. В низкотемпературных матрицах большинство доминантных конформеров фиксируется с C2’-эндо структурой рибозного кольца. Подобно 2’-дезоксиаденозину (dA), конформеры Ado с внутримолекулярными водородными связями O3’H–O5’ или O5’H–
O3’ не были обнаружены.
У діапазоні 3800–400 см⁻¹ з розділенням 0,3 см⁻¹ отримані ІЧ фур’є-спектри молекул аденозину (Ado),
ізольованих у низькотемпературних матрицях Ar. Квантово-механічними методами MP2 та DFT/B3LYP
проведено розрахунки основних структурних ізомерів Ado. Показано, що Ado витримує тривале випаровування при температурі 465 К без термічного розкладу. Встановлено структури п’яти основних конформерів, які фіксуються у Ar матрицях при 6 К. Виявлено анті-конформери Ado з внутрішньомолекулярним водневим зв’язком O2’H–N3. Заселеність цих анті-конформерів Ado більш ніж у півтори рази
перевищує заселеність син-конформерів з внутрішньомолекулярним водневим зв’язком O5’H–N3. У низькотемпературних матрицях більшість домінантних конформерів фіксується з C2’-ендо структурою рибозного кільця. Подібно 2’-дезоксиаденозину (dA), конформери Ado з внутрішньомолекулярними водневими зв’язками O3’H–O5’або O5’H–O3’ не було виявлено.
The FTIR spectra of adenosine (Ado) molecules isolated
in low temperature Ar matrices were obtained in
the range of 3800–400 cm⁻¹ with resolution 0.3 cm⁻¹
.
The populations of main structural isomers of Ado
were estimated by using of the MP2 and DFT/B3LYP
methods of quantum-mechanical calculations. It was
shown that Ado may be evaporated over a long period
at 465 K without thermodestruction. The structures of
the five main Ado conformations were established.
The Ado anti-conformers with intramolecular H-bond
O2’H–N3 were found. The population of these Ado
anti-conformers is more by a factor of 1.5 than synconformers
intramolecular H-bond O5’H–N3. The
majority of Ado dominant conformers are frozen in
low temperature matrices with C2’-endo structure of
the ribose ring. Like the 2”-deoxyadenosine (dA), the
Ado conformers with the intramolecular H-bond
O3’H–O5’ or O5’H–O3’ were not found.
|
| first_indexed | 2025-11-29T00:12:25Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-128241 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0132-6414 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-11-29T00:12:25Z |
| publishDate | 2015 |
| publisher | Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Иванов, А.Ю. Рубин, Ю.В. Егупов, С.А. Белоус, Л.Ф. Карачевцев, В.А. 2018-01-07T14:21:14Z 2018-01-07T14:21:14Z 2015 Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar / А.Ю. Иванов, Ю.В. Рубин, С.А. Егупов, Л.Ф. Белоус, В.А. Карачевцев // Физика низких температур. — 2015. — Т. 41, № 11. — С. 1198–1205. — Бібліогр.: 31 назв. — рос. 0132-6414 PACS: 33.15.–e, 33.20.Ea https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/128241 В инфракрасном диапазоне 3800–400 см⁻¹ с разрешением 0,3 см⁻¹
 получены ИК фурье-спектры молекул аденозина (Ado), изолированных в низкотемпературных матрицах Ar. Квантово-механическими методами MP2 и DFT/B3LYP проведены расчеты заселенности основных структурных изомеров Ado. Показано, что Ado выдерживает длительное испарение при температуре 465 К без термического
 разложения. Установлены структуры пяти основных конформеров, которые фиксируются в Ar матрицах
 при 6 К. Обнаружены анти-конформеры Ado с внутримолекулярной водородной связью O2’H–N3. Заселенность этих анти-конформеров более чем в полтора раза превышает заселенность син-конформеров с
 внутримолекулярной водородной связью O5’H–N3. В низкотемпературных матрицах большинство доминантных конформеров фиксируется с C2’-эндо структурой рибозного кольца. Подобно 2’-дезоксиаденозину (dA), конформеры Ado с внутримолекулярными водородными связями O3’H–O5’ или O5’H–
 O3’ не были обнаружены. У діапазоні 3800–400 см⁻¹ з розділенням 0,3 см⁻¹ отримані ІЧ фур’є-спектри молекул аденозину (Ado),
 ізольованих у низькотемпературних матрицях Ar. Квантово-механічними методами MP2 та DFT/B3LYP
 проведено розрахунки основних структурних ізомерів Ado. Показано, що Ado витримує тривале випаровування при температурі 465 К без термічного розкладу. Встановлено структури п’яти основних конформерів, які фіксуються у Ar матрицях при 6 К. Виявлено анті-конформери Ado з внутрішньомолекулярним водневим зв’язком O2’H–N3. Заселеність цих анті-конформерів Ado більш ніж у півтори рази
 перевищує заселеність син-конформерів з внутрішньомолекулярним водневим зв’язком O5’H–N3. У низькотемпературних матрицях більшість домінантних конформерів фіксується з C2’-ендо структурою рибозного кільця. Подібно 2’-дезоксиаденозину (dA), конформери Ado з внутрішньомолекулярними водневими зв’язками O3’H–O5’або O5’H–O3’ не було виявлено. The FTIR spectra of adenosine (Ado) molecules isolated
 in low temperature Ar matrices were obtained in
 the range of 3800–400 cm⁻¹ with resolution 0.3 cm⁻¹
 .
 The populations of main structural isomers of Ado
 were estimated by using of the MP2 and DFT/B3LYP
 methods of quantum-mechanical calculations. It was
 shown that Ado may be evaporated over a long period
 at 465 K without thermodestruction. The structures of
 the five main Ado conformations were established.
 The Ado anti-conformers with intramolecular H-bond
 O2’H–N3 were found. The population of these Ado
 anti-conformers is more by a factor of 1.5 than synconformers
 intramolecular H-bond O5’H–N3. The
 majority of Ado dominant conformers are frozen in
 low temperature matrices with C2’-endo structure of
 the ribose ring. Like the 2”-deoxyadenosine (dA), the
 Ado conformers with the intramolecular H-bond
 O3’H–O5’ or O5’H–O3’ were not found. Работа выполнена при финансовой поддержке Национальной академии наук Украины (грант №0114U001070
 и частично грант №15/15H), а также Государственного фонда фундаментальных исследований Украины
 (грант N 54.1/044). Авторы благодарят C.Г. Степаньяна
 за обсуждение работы и полезные советы, а также кластеры ИСМ, ФТИНТ НАН Украины и виртуальной
 организации Gaussian польского грид за предоставленные программы и машинное время. ru Фізико-технічний інститут низьких температур ім. Б.І. Вєркіна НАН України Физика низких температур Низкотемпературная оптическая спектроскопия Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar The conformational structure of adenosine molecules isolated in the low temperature Ar matrices Article published earlier |
| spellingShingle | Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar Иванов, А.Ю. Рубин, Ю.В. Егупов, С.А. Белоус, Л.Ф. Карачевцев, В.А. Низкотемпературная оптическая спектроскопия |
| title | Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar |
| title_alt | The conformational structure of adenosine molecules isolated in the low temperature Ar matrices |
| title_full | Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar |
| title_fullStr | Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar |
| title_full_unstemmed | Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar |
| title_short | Конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах Ar |
| title_sort | конформационная структура молекул аденозина, изолированных в низкотемпературных матрицах ar |
| topic | Низкотемпературная оптическая спектроскопия |
| topic_facet | Низкотемпературная оптическая спектроскопия |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/128241 |
| work_keys_str_mv | AT ivanovaû konformacionnaâstrukturamolekuladenozinaizolirovannyhvnizkotemperaturnyhmatricahar AT rubinûv konformacionnaâstrukturamolekuladenozinaizolirovannyhvnizkotemperaturnyhmatricahar AT egupovsa konformacionnaâstrukturamolekuladenozinaizolirovannyhvnizkotemperaturnyhmatricahar AT belouslf konformacionnaâstrukturamolekuladenozinaizolirovannyhvnizkotemperaturnyhmatricahar AT karačevcevva konformacionnaâstrukturamolekuladenozinaizolirovannyhvnizkotemperaturnyhmatricahar AT ivanovaû theconformationalstructureofadenosinemoleculesisolatedinthelowtemperaturearmatrices AT rubinûv theconformationalstructureofadenosinemoleculesisolatedinthelowtemperaturearmatrices AT egupovsa theconformationalstructureofadenosinemoleculesisolatedinthelowtemperaturearmatrices AT belouslf theconformationalstructureofadenosinemoleculesisolatedinthelowtemperaturearmatrices AT karačevcevva theconformationalstructureofadenosinemoleculesisolatedinthelowtemperaturearmatrices |