Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании

Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании

Оптимизирована методика выделения суммарной ДНК для ряда растений Антарктики культивируемых in vitro. Изучена возможность использования применяемых в ДНК-штрихкодировании праймеров для амплификации участков хлоропластной и ядерной ДНК (trnH-psbA, rbcL, ITS2, ITS) растений Антарктики Decshampsia anta...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Опубліковано в: :Український антарктичний журнал
Дата:2012
Автори: Дуплий, В.П., Матвеева, Н.А., Шаховский, А.М., Кищенко, Е.М., Курбатова, Л.Е.
Формат: Стаття
Мова:Russian
Опубліковано: Національний антарктичний науковий центр МОН України 2012
Теми:
Біологічні дослідження
Онлайн доступ:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/129459
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании / В.П. Дуплий, Н.А. Матвеева, А.М. Шаховский, Е.М. Кищенко, Л.Е. Курбатова // Український антарктичний журнал. — 2011-2012. — № 10-11. — С. 263-271. — Бібліогр.: 15 назв. — рос.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-129459
record_format dspace
spelling Дуплий, В.П.
Матвеева, Н.А.
Шаховский, А.М.
Кищенко, Е.М.
Курбатова, Л.Е.
2018-01-19T17:22:23Z
2018-01-19T17:22:23Z
2012
Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании / В.П. Дуплий, Н.А. Матвеева, А.М. Шаховский, Е.М. Кищенко, Л.Е. Курбатова // Український антарктичний журнал. — 2011-2012. — № 10-11. — С. 263-271. — Бібліогр.: 15 назв. — рос.
1727-7485
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/129459
577.212.3+582
Оптимизирована методика выделения суммарной ДНК для ряда растений Антарктики культивируемых in vitro. Изучена возможность использования применяемых в ДНК-штрихкодировании праймеров для амплификации участков хлоропластной и ядерной ДНК (trnH-psbA, rbcL, ITS2, ITS) растений Антарктики Decshampsia antarctica E. Desv., Colobanthus quitensis (Kunth) Bartl., Warnstorfia fontinaliopsis (Müll.Hal.) Ochyra, Bryum pseudotriquetrum (Hedw.) G. Gaertn., B. Mey. & Scherb., Bryum archangelicum Bruch & Schimp. (2 образца), Pohlia nutans (Hedw.) Lindb. Показано, что праймеры, специфичные к гену rbcL и межгенному спейсеру ITS2, могут быть использованы в ДНК- штрихкодировании как для сосудистых растений, так и для мохообразных Антарктики. Секвенированы амплифицированные участки гена rbcL и межгенного спейсера ITS2, по сиквенсам этих участков один из исследуемых образцов был определен с точностью до вида, а три образца – с точностью до рода.
Оптимізовано методику виділення загальної ДНК для ряду рослин Антарктики, що культивуються in vitro. Вивчено можливість застосування відповідних праймерів для ампліфікації ділянок хлоропластної і ядерної ДНК (trnH-psbA, rbcL, ITS2, ITS) рослин Антарктики Decshampsia antarctica E. Desv., Colobanthus quitensis (Kunth) Bartl., Warnstorfia fontinaliopsis (Müll.Hal.) Ochyra, Bryum pseudotriquetrum (Hedw.) G. Gaertn., B. Mey. & Scherb., Bryum archangelicum Bruch & Schimp. (2 зразки), Pohlia nutans (Hedw.) Lindb. з метою подальшого використання цих ділянок для ДНК- штрихкодування. Показано, що зазначені праймери можуть бути використані для ампліфікації гена rbcL та міжгенного спейсера ITS2 як судинних рослин, так і мохоподібних Антарктики. Секвеновано ампліфіковані ділянки гена rbcL та міжгенного спейсера ITS2, за сіквенсами цих ділянок один з досліджуваних зразків було визначено до виду, а три – до роду.
The extraction technique of total DNA of Antarctic plants cultivated in vitro was optimized. The possibility of application of used in DNA barcoding primers for amplification of chloroplast and nuclear DNA (trnH-psbA, rbcL, ITS2, ITS) of Antarctic plants such as Decshampsia antarctica E. Desv., Colobanthus quitensis (Kunth) Bartl., Warnstorfia fontinaliopsis (Müll.Hal.) Ochyra, Bryum pseudotriquetrum (Hedw.) G. Gaertn., B. Mey. & Scherb., Bryum archangelicum Bruch & Schimp. (2 samples), Pohlia nutans (Hedw.) Lindb. was investigated. It was shown that primers for rbcL gene and intergenic spacer ITS2 can be used in DNA barcoding both Vascular plants and Bryophyta of Antarctica. After the sequence analysis of rbcL and ITS2 one sample has been determined to within a species, and three samples to within a genus.
Работа выполнена при финансовой поддержке Национального антарктического научного центра.
ru
Національний антарктичний науковий центр МОН України
Український антарктичний журнал
Біологічні дослідження
Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании
Секвенування послідовностей rbcL та ITS2 антарктичних рослин для визначення можливості їх використання у ДНК-штрихкодуванні
Antarctic plant rbcL and ITS2 sequencing for determination of possibility in DNA barcoding
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании
spellingShingle Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании
Дуплий, В.П.
Матвеева, Н.А.
Шаховский, А.М.
Кищенко, Е.М.
Курбатова, Л.Е.
Біологічні дослідження
title_short Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании
title_full Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании
title_fullStr Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании
title_full_unstemmed Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании
title_sort секвенирование последовательностей rbcl и its2 антарктических растений для определения возможности их использования в днк-штрихкодировании
author Дуплий, В.П.
Матвеева, Н.А.
Шаховский, А.М.
Кищенко, Е.М.
Курбатова, Л.Е.
author_facet Дуплий, В.П.
Матвеева, Н.А.
Шаховский, А.М.
Кищенко, Е.М.
Курбатова, Л.Е.
topic Біологічні дослідження
topic_facet Біологічні дослідження
publishDate 2012
language Russian
container_title Український антарктичний журнал
publisher Національний антарктичний науковий центр МОН України
format Article
title_alt Секвенування послідовностей rbcL та ITS2 антарктичних рослин для визначення можливості їх використання у ДНК-штрихкодуванні
Antarctic plant rbcL and ITS2 sequencing for determination of possibility in DNA barcoding
description Оптимизирована методика выделения суммарной ДНК для ряда растений Антарктики культивируемых in vitro. Изучена возможность использования применяемых в ДНК-штрихкодировании праймеров для амплификации участков хлоропластной и ядерной ДНК (trnH-psbA, rbcL, ITS2, ITS) растений Антарктики Decshampsia antarctica E. Desv., Colobanthus quitensis (Kunth) Bartl., Warnstorfia fontinaliopsis (Müll.Hal.) Ochyra, Bryum pseudotriquetrum (Hedw.) G. Gaertn., B. Mey. & Scherb., Bryum archangelicum Bruch & Schimp. (2 образца), Pohlia nutans (Hedw.) Lindb. Показано, что праймеры, специфичные к гену rbcL и межгенному спейсеру ITS2, могут быть использованы в ДНК- штрихкодировании как для сосудистых растений, так и для мохообразных Антарктики. Секвенированы амплифицированные участки гена rbcL и межгенного спейсера ITS2, по сиквенсам этих участков один из исследуемых образцов был определен с точностью до вида, а три образца – с точностью до рода. Оптимізовано методику виділення загальної ДНК для ряду рослин Антарктики, що культивуються in vitro. Вивчено можливість застосування відповідних праймерів для ампліфікації ділянок хлоропластної і ядерної ДНК (trnH-psbA, rbcL, ITS2, ITS) рослин Антарктики Decshampsia antarctica E. Desv., Colobanthus quitensis (Kunth) Bartl., Warnstorfia fontinaliopsis (Müll.Hal.) Ochyra, Bryum pseudotriquetrum (Hedw.) G. Gaertn., B. Mey. & Scherb., Bryum archangelicum Bruch & Schimp. (2 зразки), Pohlia nutans (Hedw.) Lindb. з метою подальшого використання цих ділянок для ДНК- штрихкодування. Показано, що зазначені праймери можуть бути використані для ампліфікації гена rbcL та міжгенного спейсера ITS2 як судинних рослин, так і мохоподібних Антарктики. Секвеновано ампліфіковані ділянки гена rbcL та міжгенного спейсера ITS2, за сіквенсами цих ділянок один з досліджуваних зразків було визначено до виду, а три – до роду. The extraction technique of total DNA of Antarctic plants cultivated in vitro was optimized. The possibility of application of used in DNA barcoding primers for amplification of chloroplast and nuclear DNA (trnH-psbA, rbcL, ITS2, ITS) of Antarctic plants such as Decshampsia antarctica E. Desv., Colobanthus quitensis (Kunth) Bartl., Warnstorfia fontinaliopsis (Müll.Hal.) Ochyra, Bryum pseudotriquetrum (Hedw.) G. Gaertn., B. Mey. & Scherb., Bryum archangelicum Bruch & Schimp. (2 samples), Pohlia nutans (Hedw.) Lindb. was investigated. It was shown that primers for rbcL gene and intergenic spacer ITS2 can be used in DNA barcoding both Vascular plants and Bryophyta of Antarctica. After the sequence analysis of rbcL and ITS2 one sample has been determined to within a species, and three samples to within a genus.
issn 1727-7485
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/129459
citation_txt Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании / В.П. Дуплий, Н.А. Матвеева, А.М. Шаховский, Е.М. Кищенко, Л.Е. Курбатова // Український антарктичний журнал. — 2011-2012. — № 10-11. — С. 263-271. — Бібліогр.: 15 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT dupliivp sekvenirovanieposledovatelʹnosteirbcliits2antarktičeskihrasteniidlâopredeleniâvozmožnostiihispolʹzovaniâvdnkštrihkodirovanii
AT matveevana sekvenirovanieposledovatelʹnosteirbcliits2antarktičeskihrasteniidlâopredeleniâvozmožnostiihispolʹzovaniâvdnkštrihkodirovanii
AT šahovskiiam sekvenirovanieposledovatelʹnosteirbcliits2antarktičeskihrasteniidlâopredeleniâvozmožnostiihispolʹzovaniâvdnkštrihkodirovanii
AT kiŝenkoem sekvenirovanieposledovatelʹnosteirbcliits2antarktičeskihrasteniidlâopredeleniâvozmožnostiihispolʹzovaniâvdnkštrihkodirovanii
AT kurbatovale sekvenirovanieposledovatelʹnosteirbcliits2antarktičeskihrasteniidlâopredeleniâvozmožnostiihispolʹzovaniâvdnkštrihkodirovanii
AT dupliivp sekvenuvannâposlídovnosteirbcltaits2antarktičnihroslindlâviznačennâmožlivostííhvikoristannâudnkštrihkoduvanní
AT matveevana sekvenuvannâposlídovnosteirbcltaits2antarktičnihroslindlâviznačennâmožlivostííhvikoristannâudnkštrihkoduvanní
AT šahovskiiam sekvenuvannâposlídovnosteirbcltaits2antarktičnihroslindlâviznačennâmožlivostííhvikoristannâudnkštrihkoduvanní
AT kiŝenkoem sekvenuvannâposlídovnosteirbcltaits2antarktičnihroslindlâviznačennâmožlivostííhvikoristannâudnkštrihkoduvanní
AT kurbatovale sekvenuvannâposlídovnosteirbcltaits2antarktičnihroslindlâviznačennâmožlivostííhvikoristannâudnkštrihkoduvanní
AT dupliivp antarcticplantrbclandits2sequencingfordeterminationofpossibilityindnabarcoding
AT matveevana antarcticplantrbclandits2sequencingfordeterminationofpossibilityindnabarcoding
AT šahovskiiam antarcticplantrbclandits2sequencingfordeterminationofpossibilityindnabarcoding
AT kiŝenkoem antarcticplantrbclandits2sequencingfordeterminationofpossibilityindnabarcoding
AT kurbatovale antarcticplantrbclandits2sequencingfordeterminationofpossibilityindnabarcoding
first_indexed 2025-12-07T19:27:39Z
last_indexed 2025-12-07T19:27:39Z
_version_ 1850878889290629120

Схожі ресурси