Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании
Оптимизирована методика выделения суммарной ДНК для ряда растений Антарктики культивируемых in vitro. Изучена возможность использования применяемых в ДНК-штрихкодировании праймеров для амплификации участков хлоропластной и ядерной ДНК (trnH-psbA, rbcL, ITS2, ITS) растений Антарктики Decshampsia anta...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Український антарктичний журнал |
|---|---|
| Datum: | 2012 |
| Hauptverfasser: | , , , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Russisch |
| Veröffentlicht: |
Національний антарктичний науковий центр МОН України
2012
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/129459 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании / В.П. Дуплий, Н.А. Матвеева, А.М. Шаховский, Е.М. Кищенко, Л.Е. Курбатова // Український антарктичний журнал. — 2011-2012. — № 10-11. — С. 263-271. — Бібліогр.: 15 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862731734983901184 |
|---|---|
| author | Дуплий, В.П. Матвеева, Н.А. Шаховский, А.М. Кищенко, Е.М. Курбатова, Л.Е. |
| author_facet | Дуплий, В.П. Матвеева, Н.А. Шаховский, А.М. Кищенко, Е.М. Курбатова, Л.Е. |
| citation_txt | Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании / В.П. Дуплий, Н.А. Матвеева, А.М. Шаховский, Е.М. Кищенко, Л.Е. Курбатова // Український антарктичний журнал. — 2011-2012. — № 10-11. — С. 263-271. — Бібліогр.: 15 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Український антарктичний журнал |
| description | Оптимизирована методика выделения суммарной ДНК для ряда растений Антарктики культивируемых in vitro. Изучена возможность использования применяемых в ДНК-штрихкодировании праймеров для амплификации участков хлоропластной и ядерной ДНК (trnH-psbA, rbcL, ITS2, ITS) растений Антарктики Decshampsia antarctica E. Desv., Colobanthus quitensis (Kunth) Bartl., Warnstorfia fontinaliopsis (Müll.Hal.) Ochyra, Bryum pseudotriquetrum (Hedw.) G. Gaertn., B. Mey. & Scherb., Bryum archangelicum Bruch & Schimp. (2 образца), Pohlia nutans (Hedw.) Lindb. Показано, что праймеры, специфичные к гену rbcL и межгенному спейсеру ITS2, могут быть использованы в ДНК- штрихкодировании как для сосудистых растений, так и для мохообразных Антарктики. Секвенированы амплифицированные участки гена rbcL и межгенного спейсера ITS2, по сиквенсам этих участков один из исследуемых образцов был определен с точностью до вида, а три образца – с точностью до рода.
Оптимізовано методику виділення загальної ДНК для ряду рослин Антарктики, що культивуються in vitro. Вивчено можливість застосування відповідних праймерів для ампліфікації ділянок хлоропластної і ядерної ДНК (trnH-psbA, rbcL, ITS2, ITS) рослин Антарктики Decshampsia antarctica E. Desv., Colobanthus quitensis (Kunth) Bartl., Warnstorfia fontinaliopsis (Müll.Hal.) Ochyra, Bryum pseudotriquetrum (Hedw.) G. Gaertn., B. Mey. & Scherb., Bryum archangelicum Bruch & Schimp. (2 зразки), Pohlia nutans (Hedw.) Lindb. з метою подальшого використання цих ділянок для ДНК- штрихкодування. Показано, що зазначені праймери можуть бути використані для ампліфікації гена rbcL та міжгенного спейсера ITS2 як судинних рослин, так і мохоподібних Антарктики. Секвеновано ампліфіковані ділянки гена rbcL та міжгенного спейсера ITS2, за сіквенсами цих ділянок один з досліджуваних зразків було визначено до виду, а три – до роду.
The extraction technique of total DNA of Antarctic plants cultivated in vitro was optimized. The possibility of application of used in DNA barcoding primers for amplification of chloroplast and nuclear DNA (trnH-psbA, rbcL, ITS2, ITS) of Antarctic plants such as Decshampsia antarctica E. Desv., Colobanthus quitensis (Kunth) Bartl., Warnstorfia fontinaliopsis (Müll.Hal.) Ochyra, Bryum pseudotriquetrum (Hedw.) G. Gaertn., B. Mey. & Scherb., Bryum archangelicum Bruch & Schimp. (2 samples), Pohlia nutans (Hedw.) Lindb. was investigated. It was shown that primers for rbcL gene and intergenic spacer ITS2 can be used in DNA barcoding both Vascular plants and Bryophyta of Antarctica. After the sequence analysis of rbcL and ITS2 one sample has been determined to within a species, and three samples to within a genus.
|
| first_indexed | 2025-12-07T19:27:39Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-129459 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 1727-7485 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-12-07T19:27:39Z |
| publishDate | 2012 |
| publisher | Національний антарктичний науковий центр МОН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Дуплий, В.П. Матвеева, Н.А. Шаховский, А.М. Кищенко, Е.М. Курбатова, Л.Е. 2018-01-19T17:22:23Z 2018-01-19T17:22:23Z 2012 Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании / В.П. Дуплий, Н.А. Матвеева, А.М. Шаховский, Е.М. Кищенко, Л.Е. Курбатова // Український антарктичний журнал. — 2011-2012. — № 10-11. — С. 263-271. — Бібліогр.: 15 назв. — рос. 1727-7485 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/129459 577.212.3+582 Оптимизирована методика выделения суммарной ДНК для ряда растений Антарктики культивируемых in vitro. Изучена возможность использования применяемых в ДНК-штрихкодировании праймеров для амплификации участков хлоропластной и ядерной ДНК (trnH-psbA, rbcL, ITS2, ITS) растений Антарктики Decshampsia antarctica E. Desv., Colobanthus quitensis (Kunth) Bartl., Warnstorfia fontinaliopsis (Müll.Hal.) Ochyra, Bryum pseudotriquetrum (Hedw.) G. Gaertn., B. Mey. & Scherb., Bryum archangelicum Bruch & Schimp. (2 образца), Pohlia nutans (Hedw.) Lindb. Показано, что праймеры, специфичные к гену rbcL и межгенному спейсеру ITS2, могут быть использованы в ДНК- штрихкодировании как для сосудистых растений, так и для мохообразных Антарктики. Секвенированы амплифицированные участки гена rbcL и межгенного спейсера ITS2, по сиквенсам этих участков один из исследуемых образцов был определен с точностью до вида, а три образца – с точностью до рода. Оптимізовано методику виділення загальної ДНК для ряду рослин Антарктики, що культивуються in vitro. Вивчено можливість застосування відповідних праймерів для ампліфікації ділянок хлоропластної і ядерної ДНК (trnH-psbA, rbcL, ITS2, ITS) рослин Антарктики Decshampsia antarctica E. Desv., Colobanthus quitensis (Kunth) Bartl., Warnstorfia fontinaliopsis (Müll.Hal.) Ochyra, Bryum pseudotriquetrum (Hedw.) G. Gaertn., B. Mey. & Scherb., Bryum archangelicum Bruch & Schimp. (2 зразки), Pohlia nutans (Hedw.) Lindb. з метою подальшого використання цих ділянок для ДНК- штрихкодування. Показано, що зазначені праймери можуть бути використані для ампліфікації гена rbcL та міжгенного спейсера ITS2 як судинних рослин, так і мохоподібних Антарктики. Секвеновано ампліфіковані ділянки гена rbcL та міжгенного спейсера ITS2, за сіквенсами цих ділянок один з досліджуваних зразків було визначено до виду, а три – до роду. The extraction technique of total DNA of Antarctic plants cultivated in vitro was optimized. The possibility of application of used in DNA barcoding primers for amplification of chloroplast and nuclear DNA (trnH-psbA, rbcL, ITS2, ITS) of Antarctic plants such as Decshampsia antarctica E. Desv., Colobanthus quitensis (Kunth) Bartl., Warnstorfia fontinaliopsis (Müll.Hal.) Ochyra, Bryum pseudotriquetrum (Hedw.) G. Gaertn., B. Mey. & Scherb., Bryum archangelicum Bruch & Schimp. (2 samples), Pohlia nutans (Hedw.) Lindb. was investigated. It was shown that primers for rbcL gene and intergenic spacer ITS2 can be used in DNA barcoding both Vascular plants and Bryophyta of Antarctica. After the sequence analysis of rbcL and ITS2 one sample has been determined to within a species, and three samples to within a genus. Работа выполнена при финансовой поддержке Национального антарктического научного центра. ru Національний антарктичний науковий центр МОН України Український антарктичний журнал Біологічні дослідження Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании Секвенування послідовностей rbcL та ITS2 антарктичних рослин для визначення можливості їх використання у ДНК-штрихкодуванні Antarctic plant rbcL and ITS2 sequencing for determination of possibility in DNA barcoding Article published earlier |
| spellingShingle | Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании Дуплий, В.П. Матвеева, Н.А. Шаховский, А.М. Кищенко, Е.М. Курбатова, Л.Е. Біологічні дослідження |
| title | Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании |
| title_alt | Секвенування послідовностей rbcL та ITS2 антарктичних рослин для визначення можливості їх використання у ДНК-штрихкодуванні Antarctic plant rbcL and ITS2 sequencing for determination of possibility in DNA barcoding |
| title_full | Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании |
| title_fullStr | Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании |
| title_full_unstemmed | Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании |
| title_short | Секвенирование последовательностей rbcL и ITS2 антарктических растений для определения возможности их использования в ДНК-штрихкодировании |
| title_sort | секвенирование последовательностей rbcl и its2 антарктических растений для определения возможности их использования в днк-штрихкодировании |
| topic | Біологічні дослідження |
| topic_facet | Біологічні дослідження |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/129459 |
| work_keys_str_mv | AT dupliivp sekvenirovanieposledovatelʹnosteirbcliits2antarktičeskihrasteniidlâopredeleniâvozmožnostiihispolʹzovaniâvdnkštrihkodirovanii AT matveevana sekvenirovanieposledovatelʹnosteirbcliits2antarktičeskihrasteniidlâopredeleniâvozmožnostiihispolʹzovaniâvdnkštrihkodirovanii AT šahovskiiam sekvenirovanieposledovatelʹnosteirbcliits2antarktičeskihrasteniidlâopredeleniâvozmožnostiihispolʹzovaniâvdnkštrihkodirovanii AT kiŝenkoem sekvenirovanieposledovatelʹnosteirbcliits2antarktičeskihrasteniidlâopredeleniâvozmožnostiihispolʹzovaniâvdnkštrihkodirovanii AT kurbatovale sekvenirovanieposledovatelʹnosteirbcliits2antarktičeskihrasteniidlâopredeleniâvozmožnostiihispolʹzovaniâvdnkštrihkodirovanii AT dupliivp sekvenuvannâposlídovnosteirbcltaits2antarktičnihroslindlâviznačennâmožlivostííhvikoristannâudnkštrihkoduvanní AT matveevana sekvenuvannâposlídovnosteirbcltaits2antarktičnihroslindlâviznačennâmožlivostííhvikoristannâudnkštrihkoduvanní AT šahovskiiam sekvenuvannâposlídovnosteirbcltaits2antarktičnihroslindlâviznačennâmožlivostííhvikoristannâudnkštrihkoduvanní AT kiŝenkoem sekvenuvannâposlídovnosteirbcltaits2antarktičnihroslindlâviznačennâmožlivostííhvikoristannâudnkštrihkoduvanní AT kurbatovale sekvenuvannâposlídovnosteirbcltaits2antarktičnihroslindlâviznačennâmožlivostííhvikoristannâudnkštrihkoduvanní AT dupliivp antarcticplantrbclandits2sequencingfordeterminationofpossibilityindnabarcoding AT matveevana antarcticplantrbclandits2sequencingfordeterminationofpossibilityindnabarcoding AT šahovskiiam antarcticplantrbclandits2sequencingfordeterminationofpossibilityindnabarcoding AT kiŝenkoem antarcticplantrbclandits2sequencingfordeterminationofpossibilityindnabarcoding AT kurbatovale antarcticplantrbclandits2sequencingfordeterminationofpossibilityindnabarcoding |