Microarray study of gene expression in uterine leiomyoma

Microarray study of gene expression in uterine leiomyoma

Uterine leiomyoma is a most common benign neoplasm in women of reproductive age. It arises from the myometrial compartment of the uterus and may transform in some cases to a malignant phenotype. Aim: To identify the genes involved in pathogenesis of uterine leiomyoma. Methods: We have studied differ...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Experimental Oncology
Date:2008
Main Authors: Litovkin, K.V., Ivanova, O.V., Bauer, A., Hoheisel, J.D., Bubnov, V.V., Zaporozhan, V.N.
Format: Article
Language:English
Published: Інститут експериментальної патології, онкології і радіобіології ім. Р.Є. Кавецького НАН України 2008
Subjects:
Original contributions
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/139212
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Microarray study of gene expression in uterine leiomyoma / K.V. Litovkin, O.V. Ivanova, A. Bauer, J.D. Hoheisel, V.V. Bubnov, V.N. Zaporozhan // Experimental Oncology. — 2008. — Т. 30, № 2. — С. 106–111. — Бібліогр.: 42 назв. — англ.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-139212
record_format dspace
spelling Litovkin, K.V.
Ivanova, O.V.
Bauer, A.
Hoheisel, J.D.
Bubnov, V.V.
Zaporozhan, V.N.
2018-06-19T20:18:29Z
2018-06-19T20:18:29Z
2008
Microarray study of gene expression in uterine leiomyoma / K.V. Litovkin, O.V. Ivanova, A. Bauer, J.D. Hoheisel, V.V. Bubnov, V.N. Zaporozhan // Experimental Oncology. — 2008. — Т. 30, № 2. — С. 106–111. — Бібліогр.: 42 назв. — англ.
1812-9269
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/139212
Uterine leiomyoma is a most common benign neoplasm in women of reproductive age. It arises from the myometrial compartment of the uterus and may transform in some cases to a malignant phenotype. Aim: To identify the genes involved in pathogenesis of uterine leiomyoma. Methods: We have studied differential gene expression in matched tissue samples of leiomyoma and normal myometrium from the very same people utilizing a cDNA microarray screening method. We also compared our results with previously published microarray data to identify the overlapping gene alterations. Results: Based on this comparison we can divide genes deregulated in our study into two groups. The first group comprises genes that to our knowledge have not been previously reported as deregulated in fibroids: CLDN1, FGF7 (KGF), HNRPM, ISOC1, MAGEC1 (CT7), MAPK12, RFC, TIE1, TNFRSF21 (DR6). The second group consists of genes identified also in previous studies: CCND1 (BCL1), CDKN1A (P21), CRABP2, FN1 and SOX4 (EVI16). In our study FN1 was the most up-regulated gene, occupying the place between the myometrium and fibroids ranging from 2.07 to 3.64, depending of the probe molecule used for detection. Conclusions: Newly identified genes may be regarded as potential diagnostic or prognostic markers of uterine leiomyoma and thus may be very useful as new therapeutic candidates.
Лейомиома матки является одним из наиболее распространенных доброкачественных новообразований женской репродуктивной сферы. В некоторых случаях отмечают злокачественную трансформацию данного новообразования. Цель: идентификация генов, вовлеченных в патогенез лейомиомы. Методы: проведен анализ дифференциальной экспрессии генов в образцах лейомиомы и нормального миометрия одних и тех же пациентов методом ДНК-биочип-гибридизации и проведено сравнение полученных результатов с данными, опубликованными ранее. Результаты: выявлены различия в экспрессии ряда генов, которые можно разделить на две группы. Впервые выявлена повышенная экспрессия генов CLDN1, FGF7 (KGF), HNRPM, ISOC1, MAGEC1 (CT7), MAPK12, RFC, TIE1 и TNFRSF21 (DR6) в ткани лейомиомы по сравнению с нормальным миометрием. Ко второй группе можно отнести гены CCND1 (BCL1), CDKN1A (P21), CRABP2, FN1 и SOX4 (EVI16), уже упоминавшиеся в связи с патогенезом лейомиомы в ряде предыдущих исследований. Наибольшим изменением уровня экспрессии (в 2,07–3,64 раз в зависимости от зонда) характеризовался ген фибронектина FN1. Выводы: идентифицированные гены могут рассматриваться в качестве потенциальных диагностических и прогностических маркеров лейомиомы матки.
This study was performed within the scopes of the Agreement about collaboration between the German Cancer Research Center, Heidelberg, Germany, and Odessa State Medical University, Odessa, Ukraine. We would like to thank Melanie Bier and Stefanie Kutschmann for technical assistance and helpful discussions.
en
Інститут експериментальної патології, онкології і радіобіології ім. Р.Є. Кавецького НАН України
Experimental Oncology
Original contributions
Microarray study of gene expression in uterine leiomyoma
Анализ экспрессии генов при лейомиоме матки
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Microarray study of gene expression in uterine leiomyoma
spellingShingle Microarray study of gene expression in uterine leiomyoma
Litovkin, K.V.
Ivanova, O.V.
Bauer, A.
Hoheisel, J.D.
Bubnov, V.V.
Zaporozhan, V.N.
Original contributions
title_short Microarray study of gene expression in uterine leiomyoma
title_full Microarray study of gene expression in uterine leiomyoma
title_fullStr Microarray study of gene expression in uterine leiomyoma
title_full_unstemmed Microarray study of gene expression in uterine leiomyoma
title_sort microarray study of gene expression in uterine leiomyoma
author Litovkin, K.V.
Ivanova, O.V.
Bauer, A.
Hoheisel, J.D.
Bubnov, V.V.
Zaporozhan, V.N.
author_facet Litovkin, K.V.
Ivanova, O.V.
Bauer, A.
Hoheisel, J.D.
Bubnov, V.V.
Zaporozhan, V.N.
topic Original contributions
topic_facet Original contributions
publishDate 2008
language English
container_title Experimental Oncology
publisher Інститут експериментальної патології, онкології і радіобіології ім. Р.Є. Кавецького НАН України
format Article
title_alt Анализ экспрессии генов при лейомиоме матки
description Uterine leiomyoma is a most common benign neoplasm in women of reproductive age. It arises from the myometrial compartment of the uterus and may transform in some cases to a malignant phenotype. Aim: To identify the genes involved in pathogenesis of uterine leiomyoma. Methods: We have studied differential gene expression in matched tissue samples of leiomyoma and normal myometrium from the very same people utilizing a cDNA microarray screening method. We also compared our results with previously published microarray data to identify the overlapping gene alterations. Results: Based on this comparison we can divide genes deregulated in our study into two groups. The first group comprises genes that to our knowledge have not been previously reported as deregulated in fibroids: CLDN1, FGF7 (KGF), HNRPM, ISOC1, MAGEC1 (CT7), MAPK12, RFC, TIE1, TNFRSF21 (DR6). The second group consists of genes identified also in previous studies: CCND1 (BCL1), CDKN1A (P21), CRABP2, FN1 and SOX4 (EVI16). In our study FN1 was the most up-regulated gene, occupying the place between the myometrium and fibroids ranging from 2.07 to 3.64, depending of the probe molecule used for detection. Conclusions: Newly identified genes may be regarded as potential diagnostic or prognostic markers of uterine leiomyoma and thus may be very useful as new therapeutic candidates. Лейомиома матки является одним из наиболее распространенных доброкачественных новообразований женской репродуктивной сферы. В некоторых случаях отмечают злокачественную трансформацию данного новообразования. Цель: идентификация генов, вовлеченных в патогенез лейомиомы. Методы: проведен анализ дифференциальной экспрессии генов в образцах лейомиомы и нормального миометрия одних и тех же пациентов методом ДНК-биочип-гибридизации и проведено сравнение полученных результатов с данными, опубликованными ранее. Результаты: выявлены различия в экспрессии ряда генов, которые можно разделить на две группы. Впервые выявлена повышенная экспрессия генов CLDN1, FGF7 (KGF), HNRPM, ISOC1, MAGEC1 (CT7), MAPK12, RFC, TIE1 и TNFRSF21 (DR6) в ткани лейомиомы по сравнению с нормальным миометрием. Ко второй группе можно отнести гены CCND1 (BCL1), CDKN1A (P21), CRABP2, FN1 и SOX4 (EVI16), уже упоминавшиеся в связи с патогенезом лейомиомы в ряде предыдущих исследований. Наибольшим изменением уровня экспрессии (в 2,07–3,64 раз в зависимости от зонда) характеризовался ген фибронектина FN1. Выводы: идентифицированные гены могут рассматриваться в качестве потенциальных диагностических и прогностических маркеров лейомиомы матки.
issn 1812-9269
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/139212
citation_txt Microarray study of gene expression in uterine leiomyoma / K.V. Litovkin, O.V. Ivanova, A. Bauer, J.D. Hoheisel, V.V. Bubnov, V.N. Zaporozhan // Experimental Oncology. — 2008. — Т. 30, № 2. — С. 106–111. — Бібліогр.: 42 назв. — англ.
work_keys_str_mv AT litovkinkv microarraystudyofgeneexpressioninuterineleiomyoma
AT ivanovaov microarraystudyofgeneexpressioninuterineleiomyoma
AT bauera microarraystudyofgeneexpressioninuterineleiomyoma
AT hoheiseljd microarraystudyofgeneexpressioninuterineleiomyoma
AT bubnovvv microarraystudyofgeneexpressioninuterineleiomyoma
AT zaporozhanvn microarraystudyofgeneexpressioninuterineleiomyoma
AT litovkinkv analizékspressiigenovprileiomiomematki
AT ivanovaov analizékspressiigenovprileiomiomematki
AT bauera analizékspressiigenovprileiomiomematki
AT hoheiseljd analizékspressiigenovprileiomiomematki
AT bubnovvv analizékspressiigenovprileiomiomematki
AT zaporozhanvn analizékspressiigenovprileiomiomematki
first_indexed 2025-12-07T16:13:04Z
last_indexed 2025-12-07T16:13:04Z
_version_ 1850866646692921344

Similar Items