Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии

Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии

Изучали вариации спектральных данных четырех представителей микроводорослей. Обнаружены существенные различия в составе их основных макромолекул. Scenedesmus obliquus (Turpin) Kütz. имеет сильные пики в областях липидов и белковых спектров, у Chlorella vulgaris Beij., Ch. pyrenedosa Chick и Euglena...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Альгология
Date:2017
Main Authors: Сурешкумар, П., Томас, Дж., Субраманян, Дж.
Format: Article
Language:Russian
Published: Інститут ботаніки ім. М.Г. Холодного НАН України 2017
Subjects:
Физиология, биохимия, биофизика
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/140270
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии / П. Сурешкумар, Дж. Томас, Дж. Субраманян // Альгология. — 2017. — Т. 27, № 4. — С. 403-414. — Бібліогр.: 16 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-140270
record_format dspace
spelling Сурешкумар, П.
Томас, Дж.
Субраманян, Дж.
2018-07-03T12:09:26Z
2018-07-03T12:09:26Z
2017
Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии / П. Сурешкумар, Дж. Томас, Дж. Субраманян // Альгология. — 2017. — Т. 27, № 4. — С. 403-414. — Бібліогр.: 16 назв. — рос.
0868-8540
DOI: 10.15407/alg27.04.403
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/140270
Изучали вариации спектральных данных четырех представителей микроводорослей. Обнаружены существенные различия в составе их основных макромолекул. Scenedesmus obliquus (Turpin) Kütz. имеет сильные пики в областях липидов и белковых спектров, у Chlorella vulgaris Beij., Ch. pyrenedosa Chick и Euglena gracilis Klebs наблюдались умеренные и менее интенсивные пики во всех пяти спектральных областях. Инфракрасная спектроскопия с преобразованием Фурье (ИК-ПФ) представляет собой спектроскопический метод высокого разрешения, способный выявить особенности макромолекулярного спектра в интактных клетках, что позволяет различать, классифицировать и идентифицировать микроорганизмы, поскольку состав их макромолекул специфичен. Иерархический кластерный анализ с использованием ИК-ПФ-спектров позволяет получить дендрограмму, отражающую четкие различия между исследуемыми штаммами в соответствии с вариациями их фенотипа. Проведен филогенетический анализ с использованием 16S рДНК этих микроагрегатных штаммов. Полученная филограмма показала ту же структуру кластеров, что и дендрограммы на основе ИК-ПФ. Сочетание филогенетического анализа и ИК-ПФ-спектров обеспечивает эффективный способ распознавания вида, а также преимущество одновременного определения биохимического состава видов.
Fourier-transform infrared (FT-IR) spectroscopy is a high-resolution spectroscopic method used in whole-organism molecular fingerprinting. This analysis helps for the characteristic determination of macromolecular spectrum in intact cells. Spectral analysis can discriminate, classify, and identify the microorganisms as composition of macromolecules is different between strains of the same species. In the present investigation, four different microalgae were studied for their variations in spectral data, which showed striking differences on their major macromolecules. Scenedesmus obliquus (Turp.) Kütz. have intense peaks in the lipids and protein spectral regions when compared to the other species. Chlorella vulgaris Beij., Ch. pyrenedosa Chick and Euglena gracilis Klebs possessed moderate and less intense peaks in sub sequential order in all the five spectral regions. Using FT-IR spectra, hierarchical clustering analyses resulted in a dendrogram with clear discrimination between species according to their phenotype variations. To support this, phylogenetic analysis using 16S rDNA microbial barcode sequences of these microalgal strains was evaluated and the resulting phylogram showed the same cluster pattern as revealed by FT-IR based dendrogram. Hence, this study concludes that the combination of phylogenetic analysis and the FT-IR spectra provides an effective way of distinguishing the species as well as the advantage of simultaneous determination of biochemical composition of the species.
Авторы благодарят Научно-исследовательский совет Департамента науки и техники при правительстве Индии за финансовую поддержку (грант SO:No/SB/FT/LS-389/2012) и Университет Карунья за предоставление условий для исследований. Также авторы хотели бы поблагодарить доцента Т. Р. Барат Кумара за критические замечания при подготовке рукописи.
ru
Інститут ботаніки ім. М.Г. Холодного НАН України
Альгология
Физиология, биохимия, биофизика
Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии
Rapid method for simultaneous discrimination of microalgae and determination on biochemical composition based on vibrational spectroscopy
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии
spellingShingle Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии
Сурешкумар, П.
Томас, Дж.
Субраманян, Дж.
Физиология, биохимия, биофизика
title_short Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии
title_full Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии
title_fullStr Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии
title_full_unstemmed Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии
title_sort быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии
author Сурешкумар, П.
Томас, Дж.
Субраманян, Дж.
author_facet Сурешкумар, П.
Томас, Дж.
Субраманян, Дж.
topic Физиология, биохимия, биофизика
topic_facet Физиология, биохимия, биофизика
publishDate 2017
language Russian
container_title Альгология
publisher Інститут ботаніки ім. М.Г. Холодного НАН України
format Article
title_alt Rapid method for simultaneous discrimination of microalgae and determination on biochemical composition based on vibrational spectroscopy
description Изучали вариации спектральных данных четырех представителей микроводорослей. Обнаружены существенные различия в составе их основных макромолекул. Scenedesmus obliquus (Turpin) Kütz. имеет сильные пики в областях липидов и белковых спектров, у Chlorella vulgaris Beij., Ch. pyrenedosa Chick и Euglena gracilis Klebs наблюдались умеренные и менее интенсивные пики во всех пяти спектральных областях. Инфракрасная спектроскопия с преобразованием Фурье (ИК-ПФ) представляет собой спектроскопический метод высокого разрешения, способный выявить особенности макромолекулярного спектра в интактных клетках, что позволяет различать, классифицировать и идентифицировать микроорганизмы, поскольку состав их макромолекул специфичен. Иерархический кластерный анализ с использованием ИК-ПФ-спектров позволяет получить дендрограмму, отражающую четкие различия между исследуемыми штаммами в соответствии с вариациями их фенотипа. Проведен филогенетический анализ с использованием 16S рДНК этих микроагрегатных штаммов. Полученная филограмма показала ту же структуру кластеров, что и дендрограммы на основе ИК-ПФ. Сочетание филогенетического анализа и ИК-ПФ-спектров обеспечивает эффективный способ распознавания вида, а также преимущество одновременного определения биохимического состава видов. Fourier-transform infrared (FT-IR) spectroscopy is a high-resolution spectroscopic method used in whole-organism molecular fingerprinting. This analysis helps for the characteristic determination of macromolecular spectrum in intact cells. Spectral analysis can discriminate, classify, and identify the microorganisms as composition of macromolecules is different between strains of the same species. In the present investigation, four different microalgae were studied for their variations in spectral data, which showed striking differences on their major macromolecules. Scenedesmus obliquus (Turp.) Kütz. have intense peaks in the lipids and protein spectral regions when compared to the other species. Chlorella vulgaris Beij., Ch. pyrenedosa Chick and Euglena gracilis Klebs possessed moderate and less intense peaks in sub sequential order in all the five spectral regions. Using FT-IR spectra, hierarchical clustering analyses resulted in a dendrogram with clear discrimination between species according to their phenotype variations. To support this, phylogenetic analysis using 16S rDNA microbial barcode sequences of these microalgal strains was evaluated and the resulting phylogram showed the same cluster pattern as revealed by FT-IR based dendrogram. Hence, this study concludes that the combination of phylogenetic analysis and the FT-IR spectra provides an effective way of distinguishing the species as well as the advantage of simultaneous determination of biochemical composition of the species.
issn 0868-8540
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/140270
citation_txt Быстрый метод одновременной дискриминации микроводорослей и определения их биохимического состава на основе вибрационной спектроскопии / П. Сурешкумар, Дж. Томас, Дж. Субраманян // Альгология. — 2017. — Т. 27, № 4. — С. 403-414. — Бібліогр.: 16 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT sureškumarp bystryimetododnovremennoidiskriminaciimikrovodorosleiiopredeleniâihbiohimičeskogosostavanaosnovevibracionnoispektroskopii
AT tomasdž bystryimetododnovremennoidiskriminaciimikrovodorosleiiopredeleniâihbiohimičeskogosostavanaosnovevibracionnoispektroskopii
AT subramanândž bystryimetododnovremennoidiskriminaciimikrovodorosleiiopredeleniâihbiohimičeskogosostavanaosnovevibracionnoispektroskopii
AT sureškumarp rapidmethodforsimultaneousdiscriminationofmicroalgaeanddeterminationonbiochemicalcompositionbasedonvibrationalspectroscopy
AT tomasdž rapidmethodforsimultaneousdiscriminationofmicroalgaeanddeterminationonbiochemicalcompositionbasedonvibrationalspectroscopy
AT subramanândž rapidmethodforsimultaneousdiscriminationofmicroalgaeanddeterminationonbiochemicalcompositionbasedonvibrationalspectroscopy
first_indexed 2025-12-07T16:34:02Z
last_indexed 2025-12-07T16:34:02Z
_version_ 1850867965931552768

Similar Items