Количественное изучение взаимодействия деацилированной тРНК с Р-, А- и Е-сайтами 70 S рибосом Escherichia coli
В работе определены зависимости констант ассоциации деацилированной тРНК^Phe с Р-сайтом рибосом от концентрации ионов Mg²⁺ и температуры; измерена константа ассоциации тРНК^Phe с А-сайтом; показано, что с изменением концентрации Mg²⁺ и температуры взаимодействие тPHK^Phe с Е-сайтом остается кодоннез...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Биополимеры и клетка |
|---|---|
| Datum: | 1985 |
| Hauptverfasser: | , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Russisch |
| Veröffentlicht: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1985
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152284 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Количественное изучение взаимодействия деацилированной тРНК с Р-, А- и Е-сайтами 70 S рибосом Escherichia coli / Ю.П. Семенков, Е.М. Макаров, С.В. Кириллов // Биополимеры и клетка. — 1985. — Т. 1, № 4. — С. 183-193. — Бібліогр.: 38 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862580839147110400 |
|---|---|
| author | Семенков, Ю.П. Макаров, Е.М. Кириллов, С.В. |
| author_facet | Семенков, Ю.П. Макаров, Е.М. Кириллов, С.В. |
| citation_txt | Количественное изучение взаимодействия деацилированной тРНК с Р-, А- и Е-сайтами 70 S рибосом Escherichia coli / Ю.П. Семенков, Е.М. Макаров, С.В. Кириллов // Биополимеры и клетка. — 1985. — Т. 1, № 4. — С. 183-193. — Бібліогр.: 38 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Биополимеры и клетка |
| description | В работе определены зависимости констант ассоциации деацилированной тРНК^Phe с Р-сайтом рибосом от концентрации ионов Mg²⁺ и температуры; измерена константа ассоциации тРНК^Phe с А-сайтом; показано, что с изменением концентрации Mg²⁺ и температуры взаимодействие тPHK^Phe с Е-сайтом остается кодоннезависимым. На основе полученных и ранее нами опубликованных данных построены ряды относительного сродства аминоацил-тРНК, пептидил-тРНК и деацилированной тРНК к Р-, А- и Е-сайтам 70S рибосомы, а также предлагается термодинамически обоснованная модель транслокации с использованием Е-сайта как выходного.
Визначено залежності констант асоціації деацильованої тРНК^Phe з Р-сайтом рибосом від концентрації іонів Mg²⁺ і температури; виміряно константу асоціації тРНК^Phe з А-сайтом; показано, що із зміною концентрації Mg²⁺ і температури взаємодія тPHK^Phe з Е-сайтом залишається кодоннезалежною. На основі отриманих та опублікованих нами раніше даних побудовано ряди відносної спорідненості аміноацил-тРНК, пептидил-тРНК і деацильованої тРНК до Р-, А- та Е-сайтів 70S рибосоми, а також запропоновано термодинамічно обгрунтовану модель транслокації з використанням Е-сайта як вихідного.
The association constants of deacylated tRNA^Phe for the P site of 70S ribosomes were measured in the presence and absence of poly(U), and at different Mg²⁺ concentrations and temperatures. The numbers of Mg²⁺ ions involved in this interaction were determined: 4.4±0.3 (+poly(U) and 2.7±0.3 (–poly(U). The association constant of tRNA^Phe for the A site was found to be 5•10⁵M⁻¹, much lower than that for the P site (2•10⁹M⁻¹), at 15 mM Mg²⁺, 200 mM NH₄⁺ and 25 °C. The independence of the E-site binding of tRNA^Phe on the messenger RNA was confirmed under these medium conditions. Based on the data obtained the affinity orders of aminoacyl-, peptidyl-tRNA and deacylated tRNA for the P, A and E sites are determined, and a possible mechanism of involvement of the E site in the translocation process is discussed.
|
| first_indexed | 2025-11-26T21:35:47Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-152284 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-11-26T21:35:47Z |
| publishDate | 1985 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Семенков, Ю.П. Макаров, Е.М. Кириллов, С.В. 2019-06-09T15:24:56Z 2019-06-09T15:24:56Z 1985 Количественное изучение взаимодействия деацилированной тРНК с Р-, А- и Е-сайтами 70 S рибосом Escherichia coli / Ю.П. Семенков, Е.М. Макаров, С.В. Кириллов // Биополимеры и клетка. — 1985. — Т. 1, № 4. — С. 183-193. — Бібліогр.: 38 назв. — рос. 0233-7657 DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.000180 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152284 577.217 В работе определены зависимости констант ассоциации деацилированной тРНК^Phe с Р-сайтом рибосом от концентрации ионов Mg²⁺ и температуры; измерена константа ассоциации тРНК^Phe с А-сайтом; показано, что с изменением концентрации Mg²⁺ и температуры взаимодействие тPHK^Phe с Е-сайтом остается кодоннезависимым. На основе полученных и ранее нами опубликованных данных построены ряды относительного сродства аминоацил-тРНК, пептидил-тРНК и деацилированной тРНК к Р-, А- и Е-сайтам 70S рибосомы, а также предлагается термодинамически обоснованная модель транслокации с использованием Е-сайта как выходного. Визначено залежності констант асоціації деацильованої тРНК^Phe з Р-сайтом рибосом від концентрації іонів Mg²⁺ і температури; виміряно константу асоціації тРНК^Phe з А-сайтом; показано, що із зміною концентрації Mg²⁺ і температури взаємодія тPHK^Phe з Е-сайтом залишається кодоннезалежною. На основі отриманих та опублікованих нами раніше даних побудовано ряди відносної спорідненості аміноацил-тРНК, пептидил-тРНК і деацильованої тРНК до Р-, А- та Е-сайтів 70S рибосоми, а також запропоновано термодинамічно обгрунтовану модель транслокації з використанням Е-сайта як вихідного. The association constants of deacylated tRNA^Phe for the P site of 70S ribosomes were measured in the presence and absence of poly(U), and at different Mg²⁺ concentrations and temperatures. The numbers of Mg²⁺ ions involved in this interaction were determined: 4.4±0.3 (+poly(U) and 2.7±0.3 (–poly(U). The association constant of tRNA^Phe for the A site was found to be 5•10⁵M⁻¹, much lower than that for the P site (2•10⁹M⁻¹), at 15 mM Mg²⁺, 200 mM NH₄⁺ and 25 °C. The independence of the E-site binding of tRNA^Phe on the messenger RNA was confirmed under these medium conditions. Based on the data obtained the affinity orders of aminoacyl-, peptidyl-tRNA and deacylated tRNA for the P, A and E sites are determined, and a possible mechanism of involvement of the E site in the translocation process is discussed. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Биополимеры и клетка Структура и функции биополимеров Количественное изучение взаимодействия деацилированной тРНК с Р-, А- и Е-сайтами 70 S рибосом Escherichia coli Кількісне вивчення взаємодії деацильованої тРНК з Р-, А- і Е-сайтами 70S рибосом Escherichia coli Quantitative study of interaction of deacylated tRNA with the P, A and E sites of Escherichia coli ribosomes Article published earlier |
| spellingShingle | Количественное изучение взаимодействия деацилированной тРНК с Р-, А- и Е-сайтами 70 S рибосом Escherichia coli Семенков, Ю.П. Макаров, Е.М. Кириллов, С.В. Структура и функции биополимеров |
| title | Количественное изучение взаимодействия деацилированной тРНК с Р-, А- и Е-сайтами 70 S рибосом Escherichia coli |
| title_alt | Кількісне вивчення взаємодії деацильованої тРНК з Р-, А- і Е-сайтами 70S рибосом Escherichia coli Quantitative study of interaction of deacylated tRNA with the P, A and E sites of Escherichia coli ribosomes |
| title_full | Количественное изучение взаимодействия деацилированной тРНК с Р-, А- и Е-сайтами 70 S рибосом Escherichia coli |
| title_fullStr | Количественное изучение взаимодействия деацилированной тРНК с Р-, А- и Е-сайтами 70 S рибосом Escherichia coli |
| title_full_unstemmed | Количественное изучение взаимодействия деацилированной тРНК с Р-, А- и Е-сайтами 70 S рибосом Escherichia coli |
| title_short | Количественное изучение взаимодействия деацилированной тРНК с Р-, А- и Е-сайтами 70 S рибосом Escherichia coli |
| title_sort | количественное изучение взаимодействия деацилированной трнк с р-, а- и е-сайтами 70 s рибосом escherichia coli |
| topic | Структура и функции биополимеров |
| topic_facet | Структура и функции биополимеров |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152284 |
| work_keys_str_mv | AT semenkovûp količestvennoeizučenievzaimodeistviâdeacilirovannoitrnksraiesaitami70sribosomescherichiacoli AT makarovem količestvennoeizučenievzaimodeistviâdeacilirovannoitrnksraiesaitami70sribosomescherichiacoli AT kirillovsv količestvennoeizučenievzaimodeistviâdeacilirovannoitrnksraiesaitami70sribosomescherichiacoli AT semenkovûp kílʹkísnevivčennâvzaêmodíídeacilʹovanoítrnkzraíesaitami70sribosomescherichiacoli AT makarovem kílʹkísnevivčennâvzaêmodíídeacilʹovanoítrnkzraíesaitami70sribosomescherichiacoli AT kirillovsv kílʹkísnevivčennâvzaêmodíídeacilʹovanoítrnkzraíesaitami70sribosomescherichiacoli AT semenkovûp quantitativestudyofinteractionofdeacylatedtrnawiththepaandesitesofescherichiacoliribosomes AT makarovem quantitativestudyofinteractionofdeacylatedtrnawiththepaandesitesofescherichiacoliribosomes AT kirillovsv quantitativestudyofinteractionofdeacylatedtrnawiththepaandesitesofescherichiacoliribosomes |