Heterozygous deletions are main cause of expression alterations of PPM1M and PRICLE2 genes in human clear cell renal cell carcinomas

• Дата: 2015
• Автори: Rudenko, E.E., Lapska, Y.V., Gerashchenko, G.V., Stakhovsky, E.O., Vikarchuk, M.V., Kashuba, V.I.
• Формат: Стаття
• Мова: English
• Опубліковано: 2015
• Теми: Structure and Function of Biopolymers
• Онлайн доступ: https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152430
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Цитувати: Heterozygous deletions are main cause of expression alterations of PPM1M and PRICLE2 genes in human clear cell renal cell carcinomas / E.E. Rudenko, Y.V. Lapska, G.V. Gerashchenko, E.O. Stakhovsky, M.V. Vikarchuk, V.I. Kashuba // Biopolymers and Cell. — 2015. — Т. 31, № 1. — С. 29-33 . — Бібліогр.: 21 назв. — англ.

Aim. To discover the mechanisms of the PPM1M and PRICKLE2 genes expression alterations in clear cell renal cell carcinomas. Methods. Study of the copy number was performed, using the quantitative PCR (Q-PCR). Results. Deletions of PPM1M were found in 55 % of cases, amplifications – in 17 % and in 28 % of samples there were no changes of the copy number. We found the deletions of PRICKLE2 in 50 % of samples, no changes of the copy number in 39 %, and amplifications in 11 % of cases. Conclusions. By the analysis of the gene copy number we have shown that homo- and heterozygous deletions are the main reason of changes in expression of the PPM1M and PRICKLE2 genes. Мета. Знайти механізм, відповідальний за зміну експресії генів PPM1M і PRICKLE2 у світлоклітинних карциномах нирки людини. Методи. Вивчення змін кількості ко­пій генів було проведено за допомогою кількісної ПЛР (Q- ПЛР). Результати. Делеції гена PPM1M були знайдені у 55,6 % випадків, ампліфікації – у 16,7 %, а у 27,8 % зразків не було змін кількості копій гена. Ми виявили делеции гена PRICKLE2 у 50 % зразків, зміни не виявлено у 38,9 % зразків, а ампліфікації спостерігалися у 11,1 % випадків. Висновки. За допомогою аналізу кількості копій ге­на ми показали, що гомо- та гетерозиготні делеції є голов­ною причиною зміни експресії генів PPM1M і PRICKLE2. Цель. Найти механизм, ответственный за изменение эксп­рес­сии генов PPM1M и PRICKLE2 в светлоклеточных кар­циномах почки человека. Методы. Изучение изменений количества копий проводили методом количественной ПЦР (Q-ПЦР). Результаты. Делеции гена PPM1M были найдены в 55,6 % случаев, амплификации – в 16,7 %, а в 27,8 % образцов не было изменений количества копий гена. Мы обнаружили делеции гена PRICKLE2 в 50 % образцов, в 38,9 % образцов изменений не обнаружено, амплификации наблюдались в 11,1 % случаев. Выводы. С помощью анализа количества копий гена мы показали, что гомо- и гетерозиготные делеции являются главной причиной изменения экспресии генов PPM1M и PRICKLE2.