Heterozygous deletions are main cause of expression alterations of PPM1M and PRICLE2 genes in human clear cell renal cell carcinomas
Aim. To discover the mechanisms of the PPM1M and PRICKLE2 genes expression alterations in clear cell renal cell carcinomas. Methods. Study of the copy number was performed, using the quantitative PCR (Q-PCR). Results. Deletions of PPM1M were found in 55 % of cases, amplifications – in 17 % and in 28...
Збережено в:
| Дата: | 2015 |
|---|---|
| Автори: | , , , , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Англійська |
| Опубліковано: |
2015
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152430 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Heterozygous deletions are main cause of expression alterations of PPM1M and PRICLE2 genes in human clear cell renal cell carcinomas / E.E. Rudenko, Y.V. Lapska, G.V. Gerashchenko,
 E.O. Stakhovsky, M.V. Vikarchuk, V.I. Kashuba // Biopolymers and Cell. — 2015. — Т. 31, № 1. — С. 29-33 . — Бібліогр.: 21 назв. — англ. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862665025717534720 |
|---|---|
| author | Rudenko, E.E. Lapska, Y.V. Gerashchenko, G.V. Stakhovsky, E.O. Vikarchuk, M.V. Kashuba, V.I. |
| author_facet | Rudenko, E.E. Lapska, Y.V. Gerashchenko, G.V. Stakhovsky, E.O. Vikarchuk, M.V. Kashuba, V.I. |
| citation_txt | Heterozygous deletions are main cause of expression alterations of PPM1M and PRICLE2 genes in human clear cell renal cell carcinomas / E.E. Rudenko, Y.V. Lapska, G.V. Gerashchenko,
 E.O. Stakhovsky, M.V. Vikarchuk, V.I. Kashuba // Biopolymers and Cell. — 2015. — Т. 31, № 1. — С. 29-33 . — Бібліогр.: 21 назв. — англ. |
| collection | DSpace DC |
| description | Aim. To discover the mechanisms of the PPM1M and PRICKLE2 genes expression alterations in clear cell renal cell carcinomas. Methods. Study of the copy number was performed, using the quantitative PCR (Q-PCR). Results. Deletions of PPM1M were found in 55 % of cases, amplifications – in 17 % and in 28 % of samples there were no changes of the copy number. We found the deletions of PRICKLE2 in 50 % of samples, no changes of the copy number in 39 %, and amplifications in 11 % of cases. Conclusions. By the analysis of the gene copy number we have shown that homo- and heterozygous deletions are the main reason of changes in expression of the PPM1M and PRICKLE2 genes.
Мета. Знайти механізм, відповідальний за зміну експресії генів PPM1M і PRICKLE2 у світлоклітинних карциномах нирки людини. Методи. Вивчення змін кількості копій генів було проведено за допомогою кількісної ПЛР (Q- ПЛР). Результати. Делеції гена PPM1M були знайдені у 55,6 % випадків, ампліфікації – у 16,7 %, а у 27,8 % зразків не було змін кількості копій гена. Ми виявили делеции гена PRICKLE2 у 50 % зразків, зміни не виявлено у 38,9 % зразків, а ампліфікації спостерігалися у 11,1 % випадків. Висновки. За допомогою аналізу кількості копій гена ми показали, що гомо- та гетерозиготні делеції є головною причиною зміни експресії генів PPM1M і PRICKLE2.
Цель. Найти механизм, ответственный за изменение экспрессии генов PPM1M и PRICKLE2 в светлоклеточных карциномах почки человека. Методы. Изучение изменений количества копий проводили методом количественной ПЦР (Q-ПЦР). Результаты. Делеции гена PPM1M были найдены в 55,6 % случаев, амплификации – в 16,7 %, а в 27,8 % образцов не было изменений количества копий гена. Мы обнаружили делеции гена PRICKLE2 в 50 % образцов, в 38,9 % образцов изменений не обнаружено, амплификации наблюдались в 11,1 % случаев. Выводы. С помощью анализа количества копий гена мы показали, что гомо- и гетерозиготные делеции являются главной причиной изменения экспресии генов PPM1M и PRICKLE2.
|
| first_indexed | 2025-12-07T15:15:36Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-152430 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | English |
| last_indexed | 2025-12-07T15:15:36Z |
| publishDate | 2015 |
| record_format | dspace |
| spelling | Rudenko, E.E. Lapska, Y.V. Gerashchenko, G.V. Stakhovsky, E.O. Vikarchuk, M.V. Kashuba, V.I. 2019-06-11T17:14:06Z 2019-06-11T17:14:06Z 2015 Heterozygous deletions are main cause of expression alterations of PPM1M and PRICLE2 genes in human clear cell renal cell carcinomas / E.E. Rudenko, Y.V. Lapska, G.V. Gerashchenko,
 E.O. Stakhovsky, M.V. Vikarchuk, V.I. Kashuba // Biopolymers and Cell. — 2015. — Т. 31, № 1. — С. 29-33 . — Бібліогр.: 21 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0008C9 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152430 577.218; 616.006.6 Aim. To discover the mechanisms of the PPM1M and PRICKLE2 genes expression alterations in clear cell renal cell carcinomas. Methods. Study of the copy number was performed, using the quantitative PCR (Q-PCR). Results. Deletions of PPM1M were found in 55 % of cases, amplifications – in 17 % and in 28 % of samples there were no changes of the copy number. We found the deletions of PRICKLE2 in 50 % of samples, no changes of the copy number in 39 %, and amplifications in 11 % of cases. Conclusions. By the analysis of the gene copy number we have shown that homo- and heterozygous deletions are the main reason of changes in expression of the PPM1M and PRICKLE2 genes. Мета. Знайти механізм, відповідальний за зміну експресії генів PPM1M і PRICKLE2 у світлоклітинних карциномах нирки людини. Методи. Вивчення змін кількості копій генів було проведено за допомогою кількісної ПЛР (Q- ПЛР). Результати. Делеції гена PPM1M були знайдені у 55,6 % випадків, ампліфікації – у 16,7 %, а у 27,8 % зразків не було змін кількості копій гена. Ми виявили делеции гена PRICKLE2 у 50 % зразків, зміни не виявлено у 38,9 % зразків, а ампліфікації спостерігалися у 11,1 % випадків. Висновки. За допомогою аналізу кількості копій гена ми показали, що гомо- та гетерозиготні делеції є головною причиною зміни експресії генів PPM1M і PRICKLE2. Цель. Найти механизм, ответственный за изменение экспрессии генов PPM1M и PRICKLE2 в светлоклеточных карциномах почки человека. Методы. Изучение изменений количества копий проводили методом количественной ПЦР (Q-ПЦР). Результаты. Делеции гена PPM1M были найдены в 55,6 % случаев, амплификации – в 16,7 %, а в 27,8 % образцов не было изменений количества копий гена. Мы обнаружили делеции гена PRICKLE2 в 50 % образцов, в 38,9 % образцов изменений не обнаружено, амплификации наблюдались в 11,1 % случаев. Выводы. С помощью анализа количества копий гена мы показали, что гомо- и гетерозиготные делеции являются главной причиной изменения экспресии генов PPM1M и PRICKLE2. This work was partially supported by the project «Identification of molecular genetic markers for diagnostics of malignant neoplasms of epithelial origin», state registration N 0110U004744. en Structure and Function of Biopolymers Heterozygous deletions are main cause of expression alterations of PPM1M and PRICLE2 genes in human clear cell renal cell carcinomas Гетерозиготні делеції – основна причина змін експресії генів PPM1M та PRICKLE2 у світлоклітинних карциномах нирки людини Гетерозиготные делеции являются основной причиной изменения экспресии генов PPM1M и PRICKLE2 в светлоклеточных карциномах почки человека Article published earlier |
| spellingShingle | Heterozygous deletions are main cause of expression alterations of PPM1M and PRICLE2 genes in human clear cell renal cell carcinomas Rudenko, E.E. Lapska, Y.V. Gerashchenko, G.V. Stakhovsky, E.O. Vikarchuk, M.V. Kashuba, V.I. Structure and Function of Biopolymers |
| title | Heterozygous deletions are main cause of expression alterations of PPM1M and PRICLE2 genes in human clear cell renal cell carcinomas |
| title_alt | Гетерозиготні делеції – основна причина змін експресії генів PPM1M та PRICKLE2 у світлоклітинних карциномах нирки людини Гетерозиготные делеции являются основной причиной изменения экспресии генов PPM1M и PRICKLE2 в светлоклеточных карциномах почки человека |
| title_full | Heterozygous deletions are main cause of expression alterations of PPM1M and PRICLE2 genes in human clear cell renal cell carcinomas |
| title_fullStr | Heterozygous deletions are main cause of expression alterations of PPM1M and PRICLE2 genes in human clear cell renal cell carcinomas |
| title_full_unstemmed | Heterozygous deletions are main cause of expression alterations of PPM1M and PRICLE2 genes in human clear cell renal cell carcinomas |
| title_short | Heterozygous deletions are main cause of expression alterations of PPM1M and PRICLE2 genes in human clear cell renal cell carcinomas |
| title_sort | heterozygous deletions are main cause of expression alterations of ppm1m and pricle2 genes in human clear cell renal cell carcinomas |
| topic | Structure and Function of Biopolymers |
| topic_facet | Structure and Function of Biopolymers |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152430 |
| work_keys_str_mv | AT rudenkoee heterozygousdeletionsaremaincauseofexpressionalterationsofppm1mandpricle2genesinhumanclearcellrenalcellcarcinomas AT lapskayv heterozygousdeletionsaremaincauseofexpressionalterationsofppm1mandpricle2genesinhumanclearcellrenalcellcarcinomas AT gerashchenkogv heterozygousdeletionsaremaincauseofexpressionalterationsofppm1mandpricle2genesinhumanclearcellrenalcellcarcinomas AT stakhovskyeo heterozygousdeletionsaremaincauseofexpressionalterationsofppm1mandpricle2genesinhumanclearcellrenalcellcarcinomas AT vikarchukmv heterozygousdeletionsaremaincauseofexpressionalterationsofppm1mandpricle2genesinhumanclearcellrenalcellcarcinomas AT kashubavi heterozygousdeletionsaremaincauseofexpressionalterationsofppm1mandpricle2genesinhumanclearcellrenalcellcarcinomas AT rudenkoee geterozigotnídelecííosnovnapričinazmínekspresíígenívppm1mtaprickle2usvítloklítinnihkarcinomahnirkilûdini AT lapskayv geterozigotnídelecííosnovnapričinazmínekspresíígenívppm1mtaprickle2usvítloklítinnihkarcinomahnirkilûdini AT gerashchenkogv geterozigotnídelecííosnovnapričinazmínekspresíígenívppm1mtaprickle2usvítloklítinnihkarcinomahnirkilûdini AT stakhovskyeo geterozigotnídelecííosnovnapričinazmínekspresíígenívppm1mtaprickle2usvítloklítinnihkarcinomahnirkilûdini AT vikarchukmv geterozigotnídelecííosnovnapričinazmínekspresíígenívppm1mtaprickle2usvítloklítinnihkarcinomahnirkilûdini AT kashubavi geterozigotnídelecííosnovnapričinazmínekspresíígenívppm1mtaprickle2usvítloklítinnihkarcinomahnirkilûdini AT rudenkoee geterozigotnyedeleciiâvlâûtsâosnovnoipričinoiizmeneniâékspresiigenovppm1miprickle2vsvetlokletočnyhkarcinomahpočkičeloveka AT lapskayv geterozigotnyedeleciiâvlâûtsâosnovnoipričinoiizmeneniâékspresiigenovppm1miprickle2vsvetlokletočnyhkarcinomahpočkičeloveka AT gerashchenkogv geterozigotnyedeleciiâvlâûtsâosnovnoipričinoiizmeneniâékspresiigenovppm1miprickle2vsvetlokletočnyhkarcinomahpočkičeloveka AT stakhovskyeo geterozigotnyedeleciiâvlâûtsâosnovnoipričinoiizmeneniâékspresiigenovppm1miprickle2vsvetlokletočnyhkarcinomahpočkičeloveka AT vikarchukmv geterozigotnyedeleciiâvlâûtsâosnovnoipričinoiizmeneniâékspresiigenovppm1miprickle2vsvetlokletočnyhkarcinomahpočkičeloveka AT kashubavi geterozigotnyedeleciiâvlâûtsâosnovnoipričinoiizmeneniâékspresiigenovppm1miprickle2vsvetlokletočnyhkarcinomahpočkičeloveka |