Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season
Aim. To perform the phylogenetic analysis of segments, encoding hemagglutinin and neuraminidase of A(H1N1) pdm influenza viruses, isolated in Ukraine. Methods. In this study the real-time polymerase chain reaction (RT-PCR), sequencing and phylogenetic analysis methods were used. Results. Key mutatio...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Вiopolymers and Cell |
|---|---|
| Datum: | 2013 |
| Hauptverfasser: | , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Englisch |
| Veröffentlicht: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2013
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152482 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season / L.V. Leibenko, V.P. Polischuk, A.P. Mironenko // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 2. — С. 143-149. — Бібліогр.: 24 назв. — англ. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862731745866022912 |
|---|---|
| author | Leibenko, L.V. Polischuk, V.P. Mironenko, A.P. |
| author_facet | Leibenko, L.V. Polischuk, V.P. Mironenko, A.P. |
| citation_txt | Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season / L.V. Leibenko, V.P. Polischuk, A.P. Mironenko // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 2. — С. 143-149. — Бібліогр.: 24 назв. — англ. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Вiopolymers and Cell |
| description | Aim. To perform the phylogenetic analysis of segments, encoding hemagglutinin and neuraminidase of A(H1N1) pdm influenza viruses, isolated in Ukraine. Methods. In this study the real-time polymerase chain reaction (RT-PCR), sequencing and phylogenetic analysis methods were used. Results. Key mutations in amino acid sequences of proteins of Ukrainian pandemic influenza isolates were analyzed. High genetic similarity of Ukrainian and foreign pandemic isolates (99 %) was observed. Conclusions. The stability of Ukrainian isolates genes during 2009–2010 pandemic season was shown.
Мета. Здійснити філогенетичний аналіз сегментів, кодуючих гемаглютинін та нейрамінідазу пандемічних вірусів грипу A(H1N1) pdm, виділених в Україні. Методи. Полімеразно-ланцюгова реакція у реальному часі (real-time RT-PCR), секвенування і філогенетичний аналіз. Результати. Проаналізовано ключові мутації в амінокислотних послідовностях поверхневих антигенів досліджуваних вірусів. Виявлено високу генетичну подібність (99 %) українських ізолятів до вірусів, виділених в інших країнах. Висновки. Показано стабільність генів українських ізолятів протягом пандемічного сезону 2009–2010 рр.
Цель. Осуществить филогенетический анализ сегментов, кодирующих гемагглютинин и нейраминидазу пандемических вирусов гриппа A(H1N1)pdm, выделенных в Украине. Методы. Полимеразная цепная реакция в реальном времени (real-time RT-PCR), секвенирование и филогенетический анализ. Результаты. Проанализированы ключевые мутации в аминокислотных последовательностях поверхностных антигенов исследуемых вирусов. Выявлено высокое генетическое сходство (99 %) украинского изолятов и вирусов, выделенных в других странах. Выводы. Показана стабильность генов украинских изолятов во время пандемического сезона 2009–2010 гг.
|
| first_indexed | 2025-12-07T19:28:21Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-152482 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | English |
| last_indexed | 2025-12-07T19:28:21Z |
| publishDate | 2013 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Leibenko, L.V. Polischuk, V.P. Mironenko, A.P. 2019-06-11T19:18:07Z 2019-06-11T19:18:07Z 2013 Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season / L.V. Leibenko, V.P. Polischuk, A.P. Mironenko // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 2. — С. 143-149. — Бібліогр.: 24 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000812 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152482 575.22 + 578.53 Aim. To perform the phylogenetic analysis of segments, encoding hemagglutinin and neuraminidase of A(H1N1) pdm influenza viruses, isolated in Ukraine. Methods. In this study the real-time polymerase chain reaction (RT-PCR), sequencing and phylogenetic analysis methods were used. Results. Key mutations in amino acid sequences of proteins of Ukrainian pandemic influenza isolates were analyzed. High genetic similarity of Ukrainian and foreign pandemic isolates (99 %) was observed. Conclusions. The stability of Ukrainian isolates genes during 2009–2010 pandemic season was shown. Мета. Здійснити філогенетичний аналіз сегментів, кодуючих гемаглютинін та нейрамінідазу пандемічних вірусів грипу A(H1N1) pdm, виділених в Україні. Методи. Полімеразно-ланцюгова реакція у реальному часі (real-time RT-PCR), секвенування і філогенетичний аналіз. Результати. Проаналізовано ключові мутації в амінокислотних послідовностях поверхневих антигенів досліджуваних вірусів. Виявлено високу генетичну подібність (99 %) українських ізолятів до вірусів, виділених в інших країнах. Висновки. Показано стабільність генів українських ізолятів протягом пандемічного сезону 2009–2010 рр. Цель. Осуществить филогенетический анализ сегментов, кодирующих гемагглютинин и нейраминидазу пандемических вирусов гриппа A(H1N1)pdm, выделенных в Украине. Методы. Полимеразная цепная реакция в реальном времени (real-time RT-PCR), секвенирование и филогенетический анализ. Результаты. Проанализированы ключевые мутации в аминокислотных последовательностях поверхностных антигенов исследуемых вирусов. Выявлено высокое генетическое сходство (99 %) украинского изолятов и вирусов, выделенных в других странах. Выводы. Показана стабильность генов украинских изолятов во время пандемического сезона 2009–2010 гг. en Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вiopolymers and Cell Viruses and Cell Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season Філогенетичний аналіз вірусів грипу A(H1N1)pdm, виділених в Україні протягом пандемічного сезону 2009–2010 років Филогенетический анализ вирусов гриппа A(H1N1)pdm, выделенных в Украине в период пандемии 2009–2010 годов Article published earlier |
| spellingShingle | Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season Leibenko, L.V. Polischuk, V.P. Mironenko, A.P. Viruses and Cell |
| title | Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season |
| title_alt | Філогенетичний аналіз вірусів грипу A(H1N1)pdm, виділених в Україні протягом пандемічного сезону 2009–2010 років Филогенетический анализ вирусов гриппа A(H1N1)pdm, выделенных в Украине в период пандемии 2009–2010 годов |
| title_full | Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season |
| title_fullStr | Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season |
| title_full_unstemmed | Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season |
| title_short | Phylogenetic analysis of influenza A(H1N1)pdm viruses isolated in Ukraine during the 2009–2010 pandemic season |
| title_sort | phylogenetic analysis of influenza a(h1n1)pdm viruses isolated in ukraine during the 2009–2010 pandemic season |
| topic | Viruses and Cell |
| topic_facet | Viruses and Cell |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152482 |
| work_keys_str_mv | AT leibenkolv phylogeneticanalysisofinfluenzaah1n1pdmvirusesisolatedinukraineduringthe20092010pandemicseason AT polischukvp phylogeneticanalysisofinfluenzaah1n1pdmvirusesisolatedinukraineduringthe20092010pandemicseason AT mironenkoap phylogeneticanalysisofinfluenzaah1n1pdmvirusesisolatedinukraineduringthe20092010pandemicseason AT leibenkolv fílogenetičniianalízvírusívgripuah1n1pdmvidílenihvukraíníprotâgompandemíčnogosezonu20092010rokív AT polischukvp fílogenetičniianalízvírusívgripuah1n1pdmvidílenihvukraíníprotâgompandemíčnogosezonu20092010rokív AT mironenkoap fílogenetičniianalízvírusívgripuah1n1pdmvidílenihvukraíníprotâgompandemíčnogosezonu20092010rokív AT leibenkolv filogenetičeskiianalizvirusovgrippaah1n1pdmvydelennyhvukrainevperiodpandemii20092010godov AT polischukvp filogenetičeskiianalizvirusovgrippaah1n1pdmvydelennyhvukrainevperiodpandemii20092010godov AT mironenkoap filogenetičeskiianalizvirusovgrippaah1n1pdmvydelennyhvukrainevperiodpandemii20092010godov |