Design and study of telomerase inhibitors based on G-quadruplex ligands

In this review we have summarized the results of our recent research on telomerase inhibitors and G-quadruplex DNA ligands. A series of potential enzyme inhibitors were synthesized and studied. These compounds were based on tricyclic heteroaromatic systems (thiazolobenzimidazoles phenazines, acridon...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Опубліковано в: :Вiopolymers and Cell
Дата:2013
Автори: Negrutska, V.V., Dubey, L.V., Ilchenko, M.M., Dubey, I.Ya.
Формат: Стаття
Мова:English
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2013
Теми:
Онлайн доступ:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152572
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:Design and study of telomerase inhibitors based on G-quadruplex ligands / V.V. Negrutska, L.V. Dubey, M.M. Ilchenko, I.Ya. Dubey // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 3. — С. 169-176. — Бібліогр.: 39 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-152572
record_format dspace
spelling Negrutska, V.V.
Dubey, L.V.
Ilchenko, M.M.
Dubey, I.Ya.
2019-06-12T12:43:19Z
2019-06-12T12:43:19Z
2013
Design and study of telomerase inhibitors based on G-quadruplex ligands / V.V. Negrutska, L.V. Dubey, M.M. Ilchenko, I.Ya. Dubey // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 3. — С. 169-176. — Бібліогр.: 39 назв. — англ.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000817
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152572
615.277.3 + 577.151.042 + 547.8
In this review we have summarized the results of our recent research on telomerase inhibitors and G-quadruplex DNA ligands. A series of potential enzyme inhibitors were synthesized and studied. These compounds were based on tricyclic heteroaromatic systems (thiazolobenzimidazoles phenazines, acridones), amino-substituted cyanines and natural and synthetic porphyrins and their metalocomplexes. A number of compounds, including cyanines and especially porphyrin derivatives and conjugates, were found to efficiently inhibit telomerase at low micromolar concentrations in the in vitro TRAP assay. Porphyrins demonstrated antiproliferative activity in tumor cell cultures at micro- and nanomolar concentrations. Spectral-fluorescent and electrophoretic experiments were performed to investigate the interaction of ligands with duplex and quadruplex DNA, and in many cases binding mode was established. Convenient G-octet model of G-quadruplex was developed to study the ligand-target binding using quantum-chemical methods. QM/MM hybrid approach ONIUM2 was employed to model the interaction of small molecules with Tel22 quadruplex DNA.
В огляді підсумувано основні результати наших недавніх досліджень інгібіторів теломерази та лігандів G-квадруплексної ДНК. Синтезовано й вивчено серію потенційних інгібіторів ферменту на основі трициклічних гетероароматичних систем (тіазолобенз- імідазоли, феназини, акридони), амінозаміщених ціанінів та природних і синтетичних порфіринів і їхніх металокомплексів. Знайдено низку сполук – ціанінів та особливо похідних і кон’югатів порфіринів, що ефективно інгібують теломеразу in vitro за умов тесту TRAP у мікромолярних концентраціях. Порфірини у мікро- та наномолярних концентраціях демонструють антипроліферативну дію в культурах пухлинних клітин. Спектрофлуоресцентними та електрофоретичними методами досліджено взаємодію лігандів з дуплексною та квадруплексною ДНК, у багатьох випадках визначено тип зв’язування. Взаємодію ліганд–мішень вивчено методами квантової хімії за використання G-октету як зручної моделі G-квадруплексу. Для моделювання зв’язування малих молекул з квадруплексною ДНК Tel22 застосовано гібридний QM/MM- підхід ONIOM2.
В обзоре суммированы основные результаты наших недавних исследований ингибиторов теломеразы и лигандов G-квадруплексной ДНК. Синтезирована и изучена серия потенциальных ингибиторов фермента на основе трициклических гетероароматических систем (тиазолобензимидазолы, феназины, акридоны), амино-за- мещенных цианинов, природных и синтетических порфиринов и их металлокомплексов. Обнаружен ряд соединений – цианинов и особенно производных и конъюгатов порфиринов, эффективно ингибирующих теломеразу in vitro в условиях теста TRAP в микромолярных концентрациях. Порфирины в микро- и наномолярных концентрациях демонстрируют антипролиферативное действие в культурах опухолевых клеток. Спектрофлуоресцентными и электрофоретическими методами исследовано взаимодействие лигандов с дуплексной и квадруплексной ДНК, во многих случаях определен тип связывания. Взаимодействие лиганд–мишень изучено методами квантовой химии с использованием G-октета как удобной модели G-квадруплекса. Для моделирования связывания малых молекул с квадруплексной ДНК Tel22 применен гибридный QM/MM-подход ONIOM2.
en
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Вiopolymers and Cell
Reviews
Design and study of telomerase inhibitors based on G-quadruplex ligands
Дизайн і вивчення інгібіторів теломерази на основі лігандів G-квадруплексів
Дизайн и исследование ингибиторов теломеразы на основе лигандов G-квадруплексов
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Design and study of telomerase inhibitors based on G-quadruplex ligands
spellingShingle Design and study of telomerase inhibitors based on G-quadruplex ligands
Negrutska, V.V.
Dubey, L.V.
Ilchenko, M.M.
Dubey, I.Ya.
Reviews
title_short Design and study of telomerase inhibitors based on G-quadruplex ligands
title_full Design and study of telomerase inhibitors based on G-quadruplex ligands
title_fullStr Design and study of telomerase inhibitors based on G-quadruplex ligands
title_full_unstemmed Design and study of telomerase inhibitors based on G-quadruplex ligands
title_sort design and study of telomerase inhibitors based on g-quadruplex ligands
author Negrutska, V.V.
Dubey, L.V.
Ilchenko, M.M.
Dubey, I.Ya.
author_facet Negrutska, V.V.
Dubey, L.V.
Ilchenko, M.M.
Dubey, I.Ya.
topic Reviews
topic_facet Reviews
publishDate 2013
language English
container_title Вiopolymers and Cell
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Дизайн і вивчення інгібіторів теломерази на основі лігандів G-квадруплексів
Дизайн и исследование ингибиторов теломеразы на основе лигандов G-квадруплексов
description In this review we have summarized the results of our recent research on telomerase inhibitors and G-quadruplex DNA ligands. A series of potential enzyme inhibitors were synthesized and studied. These compounds were based on tricyclic heteroaromatic systems (thiazolobenzimidazoles phenazines, acridones), amino-substituted cyanines and natural and synthetic porphyrins and their metalocomplexes. A number of compounds, including cyanines and especially porphyrin derivatives and conjugates, were found to efficiently inhibit telomerase at low micromolar concentrations in the in vitro TRAP assay. Porphyrins demonstrated antiproliferative activity in tumor cell cultures at micro- and nanomolar concentrations. Spectral-fluorescent and electrophoretic experiments were performed to investigate the interaction of ligands with duplex and quadruplex DNA, and in many cases binding mode was established. Convenient G-octet model of G-quadruplex was developed to study the ligand-target binding using quantum-chemical methods. QM/MM hybrid approach ONIUM2 was employed to model the interaction of small molecules with Tel22 quadruplex DNA. В огляді підсумувано основні результати наших недавніх досліджень інгібіторів теломерази та лігандів G-квадруплексної ДНК. Синтезовано й вивчено серію потенційних інгібіторів ферменту на основі трициклічних гетероароматичних систем (тіазолобенз- імідазоли, феназини, акридони), амінозаміщених ціанінів та природних і синтетичних порфіринів і їхніх металокомплексів. Знайдено низку сполук – ціанінів та особливо похідних і кон’югатів порфіринів, що ефективно інгібують теломеразу in vitro за умов тесту TRAP у мікромолярних концентраціях. Порфірини у мікро- та наномолярних концентраціях демонструють антипроліферативну дію в культурах пухлинних клітин. Спектрофлуоресцентними та електрофоретичними методами досліджено взаємодію лігандів з дуплексною та квадруплексною ДНК, у багатьох випадках визначено тип зв’язування. Взаємодію ліганд–мішень вивчено методами квантової хімії за використання G-октету як зручної моделі G-квадруплексу. Для моделювання зв’язування малих молекул з квадруплексною ДНК Tel22 застосовано гібридний QM/MM- підхід ONIOM2. В обзоре суммированы основные результаты наших недавних исследований ингибиторов теломеразы и лигандов G-квадруплексной ДНК. Синтезирована и изучена серия потенциальных ингибиторов фермента на основе трициклических гетероароматических систем (тиазолобензимидазолы, феназины, акридоны), амино-за- мещенных цианинов, природных и синтетических порфиринов и их металлокомплексов. Обнаружен ряд соединений – цианинов и особенно производных и конъюгатов порфиринов, эффективно ингибирующих теломеразу in vitro в условиях теста TRAP в микромолярных концентрациях. Порфирины в микро- и наномолярных концентрациях демонстрируют антипролиферативное действие в культурах опухолевых клеток. Спектрофлуоресцентными и электрофоретическими методами исследовано взаимодействие лигандов с дуплексной и квадруплексной ДНК, во многих случаях определен тип связывания. Взаимодействие лиганд–мишень изучено методами квантовой химии с использованием G-октета как удобной модели G-квадруплекса. Для моделирования связывания малых молекул с квадруплексной ДНК Tel22 применен гибридный QM/MM-подход ONIOM2.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152572
citation_txt Design and study of telomerase inhibitors based on G-quadruplex ligands / V.V. Negrutska, L.V. Dubey, M.M. Ilchenko, I.Ya. Dubey // Вiopolymers and Cell. — 2013. — Т. 29, №. 3. — С. 169-176. — Бібліогр.: 39 назв. — англ.
work_keys_str_mv AT negrutskavv designandstudyoftelomeraseinhibitorsbasedongquadruplexligands
AT dubeylv designandstudyoftelomeraseinhibitorsbasedongquadruplexligands
AT ilchenkomm designandstudyoftelomeraseinhibitorsbasedongquadruplexligands
AT dubeyiya designandstudyoftelomeraseinhibitorsbasedongquadruplexligands
AT negrutskavv dizainívivčennâíngíbítorívtelomerazinaosnovílígandívgkvadrupleksív
AT dubeylv dizainívivčennâíngíbítorívtelomerazinaosnovílígandívgkvadrupleksív
AT ilchenkomm dizainívivčennâíngíbítorívtelomerazinaosnovílígandívgkvadrupleksív
AT dubeyiya dizainívivčennâíngíbítorívtelomerazinaosnovílígandívgkvadrupleksív
AT negrutskavv dizainiissledovanieingibitorovtelomerazynaosnoveligandovgkvadrupleksov
AT dubeylv dizainiissledovanieingibitorovtelomerazynaosnoveligandovgkvadrupleksov
AT ilchenkomm dizainiissledovanieingibitorovtelomerazynaosnoveligandovgkvadrupleksov
AT dubeyiya dizainiissledovanieingibitorovtelomerazynaosnoveligandovgkvadrupleksov
first_indexed 2025-12-01T14:53:03Z
last_indexed 2025-12-01T14:53:03Z
_version_ 1850860467244761088