рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК

рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК

С помощью двумерного электрофореза обнаружен структурный переход нового типа в гомопурин-гомопиримидиновом участке в сверхспиральной ДНК. В отличие от других исследованных переходов, этот переход сильно зависит от рН, что проявляется в уменьшении плотности отрицательной сверхспирализации, необходимо...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Биополимеры и клетка
Datum:1986
Hauptverfasser: Лямичев, В.И., Миркин, С.М., Франк-Каменецкий, М.Д.
Format: Artikel
Sprache:Russian
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1986
Schlagworte:
Структура и функции биополимеров
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152738
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК / В.И. Лямичев, С.М. Миркин, М.Д. Франк-Каменецкий // Биополимеры и клетка. — 1986. — Т. 2, № 3. — С. 115-124. — Бібліогр.: 57 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-152738
record_format dspace
spelling Лямичев, В.И.
Миркин, С.М.
Франк-Каменецкий, М.Д.
2019-06-12T17:04:53Z
2019-06-12T17:04:53Z
1986
рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК / В.И. Лямичев, С.М. Миркин, М.Д. Франк-Каменецкий // Биополимеры и клетка. — 1986. — Т. 2, № 3. — С. 115-124. — Бібліогр.: 57 назв. — рос.
0233-7657
DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.0001A6
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152738
577.323.4
С помощью двумерного электрофореза обнаружен структурный переход нового типа в гомопурин-гомопиримидиновом участке в сверхспиральной ДНК. В отличие от других исследованных переходов, этот переход сильно зависит от рН, что проявляется в уменьшении плотности отрицательной сверхспирализации, необходимой для структурного изменения, при уменьшении рН. Новая структура ДНК названа Н-формой.
За допомогою двовимірного електрофорезу виявлено структурний перехід нового типу в гомопурин-гомопіримідиновій ділянці в надспіральній ДНК. На відміну від інших досліджених переходів, цей перехід сильно залежить від рН, що проявляється у зменшенні щільності негативної надспіралізаціі, необхідної для структурної зміни, при зниженні рН. Нова структура ДНК названа Н-формою.
The 509-bp-long fragment of sea urchin P. miliaris histone gene spacer region was inserted into plasmid pUC19. The fragment contains the 60-bp-long homopurine-homopyrimidine tract that is known to be hypersensitive to the S1 endonuclease. Two-dimensional gel electrophoresis has permitted revealing a sharp structural transition in the insert with an increase in DNA superhelicity. As in the cases of cruciform and Z-form formation, the observed transition partially relaxes the superhelical stress. In contrast with the other two well documented transitions, the observed transition strongly depends on pH. At pH 7.0 and above the transition occurs at negative superhelicities which exceed the physiological range (– σ > 0.08) by the absolute value. For pH 6.0 the transition occurs at – σ = 0.055, whereas for pH 4.3 it takes place at – σ = 0.001. A comprehensive analysis of the data obtained has made it possible to define the nature of the observed transition. It is concluded that under the action of superhelical stress or/and at the low pH values the homopurine-homopyrimidine tracts form a novel spatial structure of DNA called the H-form.
Мы благодарим А. В. Вологодского за ценные критические замечания; В. И. Иванова — за советы и Ю. С. Лазуркина — за содействие в работе.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Биополимеры и клетка
Структура и функции биополимеров
рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК
рН-залежний структурний перехід у гомопурин-гомопіримідиновому блоці у надспіральній ДНК
A pH-dependent structural transition in the homopurine-homopyrimidine tract in superhelical DNA
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК
spellingShingle рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК
Лямичев, В.И.
Миркин, С.М.
Франк-Каменецкий, М.Д.
Структура и функции биополимеров
title_short рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК
title_full рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК
title_fullStr рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК
title_full_unstemmed рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК
title_sort рн-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной днк
author Лямичев, В.И.
Миркин, С.М.
Франк-Каменецкий, М.Д.
author_facet Лямичев, В.И.
Миркин, С.М.
Франк-Каменецкий, М.Д.
topic Структура и функции биополимеров
topic_facet Структура и функции биополимеров
publishDate 1986
language Russian
container_title Биополимеры и клетка
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt рН-залежний структурний перехід у гомопурин-гомопіримідиновому блоці у надспіральній ДНК
A pH-dependent structural transition in the homopurine-homopyrimidine tract in superhelical DNA
description С помощью двумерного электрофореза обнаружен структурный переход нового типа в гомопурин-гомопиримидиновом участке в сверхспиральной ДНК. В отличие от других исследованных переходов, этот переход сильно зависит от рН, что проявляется в уменьшении плотности отрицательной сверхспирализации, необходимой для структурного изменения, при уменьшении рН. Новая структура ДНК названа Н-формой. За допомогою двовимірного електрофорезу виявлено структурний перехід нового типу в гомопурин-гомопіримідиновій ділянці в надспіральній ДНК. На відміну від інших досліджених переходів, цей перехід сильно залежить від рН, що проявляється у зменшенні щільності негативної надспіралізаціі, необхідної для структурної зміни, при зниженні рН. Нова структура ДНК названа Н-формою. The 509-bp-long fragment of sea urchin P. miliaris histone gene spacer region was inserted into plasmid pUC19. The fragment contains the 60-bp-long homopurine-homopyrimidine tract that is known to be hypersensitive to the S1 endonuclease. Two-dimensional gel electrophoresis has permitted revealing a sharp structural transition in the insert with an increase in DNA superhelicity. As in the cases of cruciform and Z-form formation, the observed transition partially relaxes the superhelical stress. In contrast with the other two well documented transitions, the observed transition strongly depends on pH. At pH 7.0 and above the transition occurs at negative superhelicities which exceed the physiological range (– σ > 0.08) by the absolute value. For pH 6.0 the transition occurs at – σ = 0.055, whereas for pH 4.3 it takes place at – σ = 0.001. A comprehensive analysis of the data obtained has made it possible to define the nature of the observed transition. It is concluded that under the action of superhelical stress or/and at the low pH values the homopurine-homopyrimidine tracts form a novel spatial structure of DNA called the H-form.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152738
citation_txt рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК / В.И. Лямичев, С.М. Миркин, М.Д. Франк-Каменецкий // Биополимеры и клетка. — 1986. — Т. 2, № 3. — С. 115-124. — Бібліогр.: 57 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT lâmičevvi rnzavisimyistrukturnyiperehodvgomopuringomopirimidinovomblokevsverhspiralʹnoidnk
AT mirkinsm rnzavisimyistrukturnyiperehodvgomopuringomopirimidinovomblokevsverhspiralʹnoidnk
AT frankkameneckiimd rnzavisimyistrukturnyiperehodvgomopuringomopirimidinovomblokevsverhspiralʹnoidnk
AT lâmičevvi rnzaležniistrukturniiperehídugomopuringomopírimídinovomublocíunadspíralʹníidnk
AT mirkinsm rnzaležniistrukturniiperehídugomopuringomopírimídinovomublocíunadspíralʹníidnk
AT frankkameneckiimd rnzaležniistrukturniiperehídugomopuringomopírimídinovomublocíunadspíralʹníidnk
AT lâmičevvi aphdependentstructuraltransitioninthehomopurinehomopyrimidinetractinsuperhelicaldna
AT mirkinsm aphdependentstructuraltransitioninthehomopurinehomopyrimidinetractinsuperhelicaldna
AT frankkameneckiimd aphdependentstructuraltransitioninthehomopurinehomopyrimidinetractinsuperhelicaldna
first_indexed 2025-12-01T15:53:46Z
last_indexed 2025-12-01T15:53:46Z
_version_ 1850860639304548352

Ähnliche Einträge