рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК
С помощью двумерного электрофореза обнаружен структурный переход нового типа в гомопурин-гомопиримидиновом участке в сверхспиральной ДНК. В отличие от других исследованных переходов, этот переход сильно зависит от рН, что проявляется в уменьшении плотности отрицательной сверхспирализации, необходимо...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Биополимеры и клетка |
|---|---|
| Дата: | 1986 |
| Автори: | , , |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Російська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1986
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152738 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК / В.И. Лямичев, С.М. Миркин, М.Д. Франк-Каменецкий // Биополимеры и клетка. — 1986. — Т. 2, № 3. — С. 115-124. — Бібліогр.: 57 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862649847541137408 |
|---|---|
| author | Лямичев, В.И. Миркин, С.М. Франк-Каменецкий, М.Д. |
| author_facet | Лямичев, В.И. Миркин, С.М. Франк-Каменецкий, М.Д. |
| citation_txt | рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК / В.И. Лямичев, С.М. Миркин, М.Д. Франк-Каменецкий // Биополимеры и клетка. — 1986. — Т. 2, № 3. — С. 115-124. — Бібліогр.: 57 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Биополимеры и клетка |
| description | С помощью двумерного электрофореза обнаружен структурный переход нового типа в гомопурин-гомопиримидиновом участке в сверхспиральной ДНК. В отличие от других исследованных переходов, этот переход сильно зависит от рН, что проявляется в уменьшении плотности отрицательной сверхспирализации, необходимой для структурного изменения, при уменьшении рН. Новая структура ДНК названа Н-формой.
За допомогою двовимірного електрофорезу виявлено структурний перехід нового типу в гомопурин-гомопіримідиновій ділянці в надспіральній ДНК. На відміну від інших досліджених переходів, цей перехід сильно залежить від рН, що проявляється у зменшенні щільності негативної надспіралізаціі, необхідної для структурної зміни, при зниженні рН. Нова структура ДНК названа Н-формою.
The 509-bp-long fragment of sea urchin P. miliaris histone gene spacer region was inserted into plasmid pUC19. The fragment contains the 60-bp-long homopurine-homopyrimidine tract that is known to be hypersensitive to the S1 endonuclease. Two-dimensional gel electrophoresis has permitted revealing a sharp structural transition in the insert with an increase in DNA superhelicity. As in the cases of cruciform and Z-form formation, the observed transition partially relaxes the superhelical stress. In contrast with the other two well documented transitions, the observed transition strongly depends on pH. At pH 7.0 and above the transition occurs at negative superhelicities which exceed the physiological range (– σ > 0.08) by the absolute value. For pH 6.0 the transition occurs at – σ = 0.055, whereas for pH 4.3 it takes place at – σ = 0.001. A comprehensive analysis of the data obtained has made it possible to define the nature of the observed transition. It is concluded that under the action of superhelical stress or/and at the low pH values the homopurine-homopyrimidine tracts form a novel spatial structure of DNA called the H-form.
|
| first_indexed | 2025-12-01T15:53:46Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-152738 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-12-01T15:53:46Z |
| publishDate | 1986 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Лямичев, В.И. Миркин, С.М. Франк-Каменецкий, М.Д. 2019-06-12T17:04:53Z 2019-06-12T17:04:53Z 1986 рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК / В.И. Лямичев, С.М. Миркин, М.Д. Франк-Каменецкий // Биополимеры и клетка. — 1986. — Т. 2, № 3. — С. 115-124. — Бібліогр.: 57 назв. — рос. 0233-7657 DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.0001A6 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152738 577.323.4 С помощью двумерного электрофореза обнаружен структурный переход нового типа в гомопурин-гомопиримидиновом участке в сверхспиральной ДНК. В отличие от других исследованных переходов, этот переход сильно зависит от рН, что проявляется в уменьшении плотности отрицательной сверхспирализации, необходимой для структурного изменения, при уменьшении рН. Новая структура ДНК названа Н-формой. За допомогою двовимірного електрофорезу виявлено структурний перехід нового типу в гомопурин-гомопіримідиновій ділянці в надспіральній ДНК. На відміну від інших досліджених переходів, цей перехід сильно залежить від рН, що проявляється у зменшенні щільності негативної надспіралізаціі, необхідної для структурної зміни, при зниженні рН. Нова структура ДНК названа Н-формою. The 509-bp-long fragment of sea urchin P. miliaris histone gene spacer region was inserted into plasmid pUC19. The fragment contains the 60-bp-long homopurine-homopyrimidine tract that is known to be hypersensitive to the S1 endonuclease. Two-dimensional gel electrophoresis has permitted revealing a sharp structural transition in the insert with an increase in DNA superhelicity. As in the cases of cruciform and Z-form formation, the observed transition partially relaxes the superhelical stress. In contrast with the other two well documented transitions, the observed transition strongly depends on pH. At pH 7.0 and above the transition occurs at negative superhelicities which exceed the physiological range (– σ > 0.08) by the absolute value. For pH 6.0 the transition occurs at – σ = 0.055, whereas for pH 4.3 it takes place at – σ = 0.001. A comprehensive analysis of the data obtained has made it possible to define the nature of the observed transition. It is concluded that under the action of superhelical stress or/and at the low pH values the homopurine-homopyrimidine tracts form a novel spatial structure of DNA called the H-form. Мы благодарим А. В. Вологодского за ценные критические замечания; В. И. Иванова — за советы и Ю. С. Лазуркина — за содействие
 в работе. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Биополимеры и клетка Структура и функции биополимеров рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК рН-залежний структурний перехід у гомопурин-гомопіримідиновому блоці у надспіральній ДНК A pH-dependent structural transition in the homopurine-homopyrimidine tract in superhelical DNA Article published earlier |
| spellingShingle | рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК Лямичев, В.И. Миркин, С.М. Франк-Каменецкий, М.Д. Структура и функции биополимеров |
| title | рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК |
| title_alt | рН-залежний структурний перехід у гомопурин-гомопіримідиновому блоці у надспіральній ДНК A pH-dependent structural transition in the homopurine-homopyrimidine tract in superhelical DNA |
| title_full | рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК |
| title_fullStr | рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК |
| title_full_unstemmed | рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК |
| title_short | рН-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной ДНК |
| title_sort | рн-зависимый структурный переход в гомопурин-гомопиримидиновом блоке в сверхспиральной днк |
| topic | Структура и функции биополимеров |
| topic_facet | Структура и функции биополимеров |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152738 |
| work_keys_str_mv | AT lâmičevvi rnzavisimyistrukturnyiperehodvgomopuringomopirimidinovomblokevsverhspiralʹnoidnk AT mirkinsm rnzavisimyistrukturnyiperehodvgomopuringomopirimidinovomblokevsverhspiralʹnoidnk AT frankkameneckiimd rnzavisimyistrukturnyiperehodvgomopuringomopirimidinovomblokevsverhspiralʹnoidnk AT lâmičevvi rnzaležniistrukturniiperehídugomopuringomopírimídinovomublocíunadspíralʹníidnk AT mirkinsm rnzaležniistrukturniiperehídugomopuringomopírimídinovomublocíunadspíralʹníidnk AT frankkameneckiimd rnzaležniistrukturniiperehídugomopuringomopírimídinovomublocíunadspíralʹníidnk AT lâmičevvi aphdependentstructuraltransitioninthehomopurinehomopyrimidinetractinsuperhelicaldna AT mirkinsm aphdependentstructuraltransitioninthehomopurinehomopyrimidinetractinsuperhelicaldna AT frankkameneckiimd aphdependentstructuraltransitioninthehomopurinehomopyrimidinetractinsuperhelicaldna |