DNA metabarcoding of microbial communities for healthcare

High-throughput sequencing allows obtaining DNA barcodes of multiple species of microorganisms from single environmental samples. Next Generation Sequencing (NGS)-based profiling provides new opportunities to evaluate the human health effect of microbial community members affiliated to probiotics. T...

Повний опис

Збережено в:
Бібліографічні деталі
Опубліковано в: :Вiopolymers and Cell
Дата:2016
Автори: Zaets, I.Ye., Podolich, O.V., Reva, O.N., Kozyrovska, N.O.
Формат: Стаття
Мова:Англійська
Опубліковано: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2016
Теми:
Онлайн доступ:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152749
Теги: Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:DNA metabarcoding of microbial communities for healthcare / I.Ye. Zaets, O.V. Podolich, O.N. Reva, N.O. Kozyrovska // Вiopolymers and Cell. — 2016. — Т. 32, № 1. — С. 3-8. — Бібліогр.: 34 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
_version_ 1862620774636978176
author Zaets, I.Ye.
Podolich, O.V.
Reva, O.N.
Kozyrovska, N.O.
author_facet Zaets, I.Ye.
Podolich, O.V.
Reva, O.N.
Kozyrovska, N.O.
citation_txt DNA metabarcoding of microbial communities for healthcare / I.Ye. Zaets, O.V. Podolich, O.N. Reva, N.O. Kozyrovska // Вiopolymers and Cell. — 2016. — Т. 32, № 1. — С. 3-8. — Бібліогр.: 34 назв. — англ.
collection DSpace DC
container_title Вiopolymers and Cell
description High-throughput sequencing allows obtaining DNA barcodes of multiple species of microorganisms from single environmental samples. Next Generation Sequencing (NGS)-based profiling provides new opportunities to evaluate the human health effect of microbial community members affiliated to probiotics. The DNA metabarcoding may serve to a quality control of microbial communities, comprising complex probiotics and other fermented foods. A detailed inventory of complex communities is a pre-requisite of understanding their functionality as whole entities that makes it possible to design more effective bio-products by precise replacement of one community member by others. The present paper illustrates how the NGS-based DNA metabarcoding aims at the profiling of both wild and hybrid multi-microbial communities with the example of kombucha probiotic beverage fermented by yeast-bacterial partners. Високопродуктивне секвенування дозволяє отримати штрих-коди ДНК декількох видів мікроорганізмів з однієї проби навколишнього середовища. Профілювання видів на основі технологій секвенування нового покоління (СНП) дає нові можливості для оцінки впливу членів мікробних угрупувань пробіотиків на здоров’я людини. Метабаркодинг ДНК може слугувати для контролю якості мікробних угрупувань, включаючи складні пробіотики та інші ферментовані продукти. Детальна інвентаризація складних угрупувань є передумовою розуміння їх функціональності як цілісного утворення, що дасть можливість створювати більш ефективні біо-продукти шляхом точної заміни одного з членів угрупування/спільноти іншими. Ця стаття показує, як можна застосувати метабаркодинг ДНК на основі СНП для профілювання диких і гібридних мульти-мікробних угрупувань на прикладі пробіотичного напою комбучі, ферментованого дріжджово-бактеріальними партнерами. Высокопродуктивное секвенирование позволяет получить штрих-коды ДНК нескольких видов микроорганизмов из одной пробы окружающей среды. Профилирование видов на основе технологий секвенирования нового поколения (СНП) дает новые возможности для оценки влияния микробных членов сообществ пробиотиков на здоровье человека. Метабаркодинг ДНК может служить для контроля качества микробных сообществ, включая сложные пробиотики и другие ферментированные продукты. Детальная инвентаризация сложных сообществ является предпосылкой понимания их функциональности как целостного образования, давая возмлжность создавать более эффективные био-продукты с помощью точной замены одного из членов сообщества другими. Эта статья показывает, как можно использовать метабаркодинг ДНК на основе СНП для профилирования диких и гибридных мульти-микробных сообществ на примере пробиотического напитка комбучи, ферментированного дрожжево-бактериальными партнерами.
first_indexed 2025-12-07T13:23:31Z
format Article
fulltext
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-152749
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
issn 0233-7657
language English
last_indexed 2025-12-07T13:23:31Z
publishDate 2016
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
record_format dspace
spelling Zaets, I.Ye.
Podolich, O.V.
Reva, O.N.
Kozyrovska, N.O.
2019-06-12T17:36:34Z
2019-06-12T17:36:34Z
2016
DNA metabarcoding of microbial communities for healthcare / I.Ye. Zaets, O.V. Podolich, O.N. Reva, N.O. Kozyrovska // Вiopolymers and Cell. — 2016. — Т. 32, № 1. — С. 3-8. — Бібліогр.: 34 назв. — англ.
0233-7657
1993-6842
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000906
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152749
577.25 + 579.61
High-throughput sequencing allows obtaining DNA barcodes of multiple species of microorganisms from single environmental samples. Next Generation Sequencing (NGS)-based profiling provides new opportunities to evaluate the human health effect of microbial community members affiliated to probiotics. The DNA metabarcoding may serve to a quality control of microbial communities, comprising complex probiotics and other fermented foods. A detailed inventory of complex communities is a pre-requisite of understanding their functionality as whole entities that makes it possible to design more effective bio-products by precise replacement of one community member by others. The present paper illustrates how the NGS-based DNA metabarcoding aims at the profiling of both wild and hybrid multi-microbial communities with the example of kombucha probiotic beverage fermented by yeast-bacterial partners.
Високопродуктивне секвенування дозволяє отримати штрих-коди ДНК декількох видів мікроорганізмів з однієї проби навколишнього середовища. Профілювання видів на основі технологій секвенування нового покоління (СНП) дає нові можливості для оцінки впливу членів мікробних угрупувань пробіотиків на здоров’я людини. Метабаркодинг ДНК може слугувати для контролю якості мікробних угрупувань, включаючи складні пробіотики та інші ферментовані продукти. Детальна інвентаризація складних угрупувань є передумовою розуміння їх функціональності як цілісного утворення, що дасть можливість створювати більш ефективні біо-продукти шляхом точної заміни одного з членів угрупування/спільноти іншими. Ця стаття показує, як можна застосувати метабаркодинг ДНК на основі СНП для профілювання диких і гібридних мульти-мікробних угрупувань на прикладі пробіотичного напою комбучі, ферментованого дріжджово-бактеріальними партнерами.
Высокопродуктивное секвенирование позволяет получить штрих-коды ДНК нескольких видов микроорганизмов из одной пробы окружающей среды. Профилирование видов на основе технологий секвенирования нового поколения (СНП) дает новые возможности для оценки влияния микробных членов сообществ пробиотиков на здоровье человека. Метабаркодинг ДНК может служить для контроля качества микробных сообществ, включая сложные пробиотики и другие ферментированные продукты. Детальная инвентаризация сложных сообществ является предпосылкой понимания их функциональности как целостного образования, давая возмлжность создавать более эффективные био-продукты с помощью точной замены одного из членов сообщества другими. Эта статья показывает, как можно использовать метабаркодинг ДНК на основе СНП для профилирования диких и гибридных мульти-микробных сообществ на примере пробиотического напитка комбучи, ферментированного дрожжево-бактериальными партнерами.
en
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Вiopolymers and Cell
Reviews
DNA metabarcoding of microbial communities for healthcare
ДНК-метабаркодинг мікробних угрупувань для підтримки здоров'я
ДНК-метабаркодинг микробных сообществ для поддержания здоровья
Article
published earlier
spellingShingle DNA metabarcoding of microbial communities for healthcare
Zaets, I.Ye.
Podolich, O.V.
Reva, O.N.
Kozyrovska, N.O.
Reviews
title DNA metabarcoding of microbial communities for healthcare
title_alt ДНК-метабаркодинг мікробних угрупувань для підтримки здоров'я
ДНК-метабаркодинг микробных сообществ для поддержания здоровья
title_full DNA metabarcoding of microbial communities for healthcare
title_fullStr DNA metabarcoding of microbial communities for healthcare
title_full_unstemmed DNA metabarcoding of microbial communities for healthcare
title_short DNA metabarcoding of microbial communities for healthcare
title_sort dna metabarcoding of microbial communities for healthcare
topic Reviews
topic_facet Reviews
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152749
work_keys_str_mv AT zaetsiye dnametabarcodingofmicrobialcommunitiesforhealthcare
AT podolichov dnametabarcodingofmicrobialcommunitiesforhealthcare
AT revaon dnametabarcodingofmicrobialcommunitiesforhealthcare
AT kozyrovskano dnametabarcodingofmicrobialcommunitiesforhealthcare
AT zaetsiye dnkmetabarkodingmíkrobnihugrupuvanʹdlâpídtrimkizdorovâ
AT podolichov dnkmetabarkodingmíkrobnihugrupuvanʹdlâpídtrimkizdorovâ
AT revaon dnkmetabarkodingmíkrobnihugrupuvanʹdlâpídtrimkizdorovâ
AT kozyrovskano dnkmetabarkodingmíkrobnihugrupuvanʹdlâpídtrimkizdorovâ
AT zaetsiye dnkmetabarkodingmikrobnyhsoobŝestvdlâpodderžaniâzdorovʹâ
AT podolichov dnkmetabarkodingmikrobnyhsoobŝestvdlâpodderžaniâzdorovʹâ
AT revaon dnkmetabarkodingmikrobnyhsoobŝestvdlâpodderžaniâzdorovʹâ
AT kozyrovskano dnkmetabarkodingmikrobnyhsoobŝestvdlâpodderžaniâzdorovʹâ