Efficiency of application of different DNA probes in identifying marker chromosomes

The presence of marker chromosomes in the human karyotype always requires a special diagnostic approach. Determination of the marker chromosome type and structure is of great diagnostic and prognostic importance. There are several methods of marker chromosomes identification, which differ in their i...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Вiopolymers and Cell
Date:2016
Main Authors: Tavokina, L.V., Brovko, A.O., Baronova, E.V., Moskalenko, E.P., Gorovenko, N.G.
Format: Article
Language:English
Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2016
Subjects:
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152767
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Efficiency of application of different DNA probes in identifying marker chromosomes / L.V. Tavokina, A.O. Brovko, E.V. Baronova, E.P. Moskalenko, N.G. Gorovenko // Вiopolymers and Cell. — 2016. — Т. 32, № 1. — С. 49-53. — Бібліогр.: 9 назв. — англ.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
_version_ 1862552861399842816
author Tavokina, L.V.
Brovko, A.O.
Baronova, E.V.
Moskalenko, E.P.
Gorovenko, N.G.
author_facet Tavokina, L.V.
Brovko, A.O.
Baronova, E.V.
Moskalenko, E.P.
Gorovenko, N.G.
citation_txt Efficiency of application of different DNA probes in identifying marker chromosomes / L.V. Tavokina, A.O. Brovko, E.V. Baronova, E.P. Moskalenko, N.G. Gorovenko // Вiopolymers and Cell. — 2016. — Т. 32, № 1. — С. 49-53. — Бібліогр.: 9 назв. — англ.
collection DSpace DC
container_title Вiopolymers and Cell
description The presence of marker chromosomes in the human karyotype always requires a special diagnostic approach. Determination of the marker chromosome type and structure is of great diagnostic and prognostic importance. There are several methods of marker chromosomes identification, which differ in their informative value. The paper presents the results of cytogenetic and FISH diagnostics of supernumerical marker chromosomes (SMC) cases in patients’ karyotype. Aim. To analyze the results of the cytogenetic and molecular cytogenetic diagnostics for patients with marker chromosomes, and to evaluate and compare the efficiency of the methods used. Methods. Karyotyping was done according to the standard methods. GTG, CBG, QFQ and NOR-Ag methods of differential staining were used. FISH was performed according to the manufacturer’s instructions for CEP, LSI and WCP DNA-probes. Results. Marker chromosome was found in 15 of 7989 patients. Application of standard staining methods was effective in 66.6 % of cases. Combination of differential staining and FISH allowed identifying a marker chromosome in 83.3 %. 90 % of all marker chromosomes were identified as isochromosomes and 60 % of them were derivative from chromosome 15. Conclusions. The use of WCP probes is a main step in the marker chromosome identification with further application of CEP/LSI probes. If a marker chromosome has nonspecific DNA sequences more sensitive methods should be use. Наявність маркерних хромосом в каріотипі людини завжди вимагає особливого діагностичного підходу. Визначення типу і структури маркерної хромосоми має велике діагностичне і прогностичне значення. Існує кілька методів ідентифікації маркерних хромосом, але різні методи мають різний рівень інформативності. В роботі наведені результати цитогенетичної та FISH діагностики випадків із надчисельними маркерними хромосомами в каріотипі пацієнтів. Мета. Аналіз результатів цитогенетичних і молекулярно-цитогенетичних досліджень каріотипів пацієнтів з маркерними хромосомами, а також оцінка і порівняння ефективності використаних методів. Методи. Каріотипування було виконано у відповідності до стандартних методів. Були використані GTG, CBG, QFQ і NOR-Ag методи диференціального фарбування. FISH була виконана відповідно до інструкцій виробника для CEP, LSI та WCP ДНК-проб. Результати. Маркерна хромосома була виявлена у 15 з 7989 пацієнтів. Застосування стандартних методів фарбування було ефективним у 66,6% випадків. Поєднання диференціального фарбування та FISH дозволило ідентифікувати маркерні хромосоми у 83,3 %. 90 % всіх маркерних хромосом були визначені як ізохромосоми і 60 % з них були похідними від хромосоми 15. Висновки. Використання WCP ДНК-проб є основним етапом ідентифікації маркерних хромосом з наступним застосуванням CEP та LSI ДНК-проб. Якщо маркерна хромосома має неспецифічні послідовності ДНК, то у таких випадках повинні бути застосовані більш чутливі методи. Наличие маркерных хромосом в кариотипе человека всегда требует особого диагностического подхода. Определение типа и структуры маркерной хромосомы имеет большое диагностическое и прогностическое значение. Существует несколько методов идентификации маркерных хромосом, но разные методы имеют разный уровень информативности. В работе приведены результаты цитогенетической и FISH диагностики случаев со сверхчисленными маркерными хромосомами в кариотипе пациентов. Цель. Анализ результатов цитогенетических и молекулярно-цитогенетических исследований кариотипов пациентов с маркерным хромосомами, а также оценка и сравнение эффективности использованных методов. Методы. Кариотипирование выполнено согласно стандартных методик. Использованы GTG, CBG, QFQ и NOR-Ag методы дифференциального окрашивания. FISH выполнена в соответствии с инструкциями производителя для CEP, LSI и WCP ДНК-проб. Результаты. Маркерная хромосома обнаружена у 15 из 7989 пациентов. Применение стандартных методов окрашивания было эффективным в 66,6 % случаев. Сочетание дифференциального окрашивания и FISH позволило идентифицировать маркерные хромосомы в 83,3 %. 90 % всех маркерных хромосом были определены как изохромосомы и 60 % из них были производными от хромосомы 15. Выводы. Использование WCP ДНК-проб является основным этапом идентификации маркерных хромосом с последующим применением CEP и LSI ДНК-проб. Если маркерная хромосома имеет неспецифические последовательности ДНК, то в таких случаях должны быть применены более чувствительные методы.
first_indexed 2025-11-25T21:08:29Z
format Article
fulltext
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-152767
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
issn 0233-7657
language English
last_indexed 2025-11-25T21:08:29Z
publishDate 2016
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
record_format dspace
spelling Tavokina, L.V.
Brovko, A.O.
Baronova, E.V.
Moskalenko, E.P.
Gorovenko, N.G.
2019-06-12T18:08:47Z
2019-06-12T18:08:47Z
2016
Efficiency of application of different DNA probes in identifying marker chromosomes / L.V. Tavokina, A.O. Brovko, E.V. Baronova, E.P. Moskalenko, N.G. Gorovenko // Вiopolymers and Cell. — 2016. — Т. 32, № 1. — С. 49-53. — Бібліогр.: 9 назв. — англ.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00090C
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152767
616-006.441
The presence of marker chromosomes in the human karyotype always requires a special diagnostic approach. Determination of the marker chromosome type and structure is of great diagnostic and prognostic importance. There are several methods of marker chromosomes identification, which differ in their informative value. The paper presents the results of cytogenetic and FISH diagnostics of supernumerical marker chromosomes (SMC) cases in patients’ karyotype. Aim. To analyze the results of the cytogenetic and molecular cytogenetic diagnostics for patients with marker chromosomes, and to evaluate and compare the efficiency of the methods used. Methods. Karyotyping was done according to the standard methods. GTG, CBG, QFQ and NOR-Ag methods of differential staining were used. FISH was performed according to the manufacturer’s instructions for CEP, LSI and WCP DNA-probes. Results. Marker chromosome was found in 15 of 7989 patients. Application of standard staining methods was effective in 66.6 % of cases. Combination of differential staining and FISH allowed identifying a marker chromosome in 83.3 %. 90 % of all marker chromosomes were identified as isochromosomes and 60 % of them were derivative from chromosome 15. Conclusions. The use of WCP probes is a main step in the marker chromosome identification with further application of CEP/LSI probes. If a marker chromosome has nonspecific DNA sequences more sensitive methods should be use.
Наявність маркерних хромосом в каріотипі людини завжди вимагає особливого діагностичного підходу. Визначення типу і структури маркерної хромосоми має велике діагностичне і прогностичне значення. Існує кілька методів ідентифікації маркерних хромосом, але різні методи мають різний рівень інформативності. В роботі наведені результати цитогенетичної та FISH діагностики випадків із надчисельними маркерними хромосомами в каріотипі пацієнтів. Мета. Аналіз результатів цитогенетичних і молекулярно-цитогенетичних досліджень каріотипів пацієнтів з маркерними хромосомами, а також оцінка і порівняння ефективності використаних методів. Методи. Каріотипування було виконано у відповідності до стандартних методів. Були використані GTG, CBG, QFQ і NOR-Ag методи диференціального фарбування. FISH була виконана відповідно до інструкцій виробника для CEP, LSI та WCP ДНК-проб. Результати. Маркерна хромосома була виявлена у 15 з 7989 пацієнтів. Застосування стандартних методів фарбування було ефективним у 66,6% випадків. Поєднання диференціального фарбування та FISH дозволило ідентифікувати маркерні хромосоми у 83,3 %. 90 % всіх маркерних хромосом були визначені як ізохромосоми і 60 % з них були похідними від хромосоми 15. Висновки. Використання WCP ДНК-проб є основним етапом ідентифікації маркерних хромосом з наступним застосуванням CEP та LSI ДНК-проб. Якщо маркерна хромосома має неспецифічні послідовності ДНК, то у таких випадках повинні бути застосовані більш чутливі методи.
Наличие маркерных хромосом в кариотипе человека всегда требует особого диагностического подхода. Определение типа и структуры маркерной хромосомы имеет большое диагностическое и прогностическое значение. Существует несколько методов идентификации маркерных хромосом, но разные методы имеют разный уровень информативности. В работе приведены результаты цитогенетической и FISH диагностики случаев со сверхчисленными маркерными хромосомами в кариотипе пациентов. Цель. Анализ результатов цитогенетических и молекулярно-цитогенетических исследований кариотипов пациентов с маркерным хромосомами, а также оценка и сравнение эффективности использованных методов. Методы. Кариотипирование выполнено согласно стандартных методик. Использованы GTG, CBG, QFQ и NOR-Ag методы дифференциального окрашивания. FISH выполнена в соответствии с инструкциями производителя для CEP, LSI и WCP ДНК-проб. Результаты. Маркерная хромосома обнаружена у 15 из 7989 пациентов. Применение стандартных методов окрашивания было эффективным в 66,6 % случаев. Сочетание дифференциального окрашивания и FISH позволило идентифицировать маркерные хромосомы в 83,3 %. 90 % всех маркерных хромосом были определены как изохромосомы и 60 % из них были производными от хромосомы 15. Выводы. Использование WCP ДНК-проб является основным этапом идентификации маркерных хромосом с последующим применением CEP и LSI ДНК-проб. Если маркерная хромосома имеет неспецифические последовательности ДНК, то в таких случаях должны быть применены более чувствительные методы.
en
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Вiopolymers and Cell
Biomedicine
Efficiency of application of different DNA probes in identifying marker chromosomes
Ефективність застосування різних типів ДНК-проб для ідентифікації маркерних хромосом
Эффективность применения различных типов ДНК-проба для идентификации маркерных хромосом
Article
published earlier
spellingShingle Efficiency of application of different DNA probes in identifying marker chromosomes
Tavokina, L.V.
Brovko, A.O.
Baronova, E.V.
Moskalenko, E.P.
Gorovenko, N.G.
Biomedicine
title Efficiency of application of different DNA probes in identifying marker chromosomes
title_alt Ефективність застосування різних типів ДНК-проб для ідентифікації маркерних хромосом
Эффективность применения различных типов ДНК-проба для идентификации маркерных хромосом
title_full Efficiency of application of different DNA probes in identifying marker chromosomes
title_fullStr Efficiency of application of different DNA probes in identifying marker chromosomes
title_full_unstemmed Efficiency of application of different DNA probes in identifying marker chromosomes
title_short Efficiency of application of different DNA probes in identifying marker chromosomes
title_sort efficiency of application of different dna probes in identifying marker chromosomes
topic Biomedicine
topic_facet Biomedicine
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152767
work_keys_str_mv AT tavokinalv efficiencyofapplicationofdifferentdnaprobesinidentifyingmarkerchromosomes
AT brovkoao efficiencyofapplicationofdifferentdnaprobesinidentifyingmarkerchromosomes
AT baronovaev efficiencyofapplicationofdifferentdnaprobesinidentifyingmarkerchromosomes
AT moskalenkoep efficiencyofapplicationofdifferentdnaprobesinidentifyingmarkerchromosomes
AT gorovenkong efficiencyofapplicationofdifferentdnaprobesinidentifyingmarkerchromosomes
AT tavokinalv efektivnístʹzastosuvannâríznihtipívdnkprobdlâídentifíkacíímarkernihhromosom
AT brovkoao efektivnístʹzastosuvannâríznihtipívdnkprobdlâídentifíkacíímarkernihhromosom
AT baronovaev efektivnístʹzastosuvannâríznihtipívdnkprobdlâídentifíkacíímarkernihhromosom
AT moskalenkoep efektivnístʹzastosuvannâríznihtipívdnkprobdlâídentifíkacíímarkernihhromosom
AT gorovenkong efektivnístʹzastosuvannâríznihtipívdnkprobdlâídentifíkacíímarkernihhromosom
AT tavokinalv éffektivnostʹprimeneniârazličnyhtipovdnkprobadlâidentifikaciimarkernyhhromosom
AT brovkoao éffektivnostʹprimeneniârazličnyhtipovdnkprobadlâidentifikaciimarkernyhhromosom
AT baronovaev éffektivnostʹprimeneniârazličnyhtipovdnkprobadlâidentifikaciimarkernyhhromosom
AT moskalenkoep éffektivnostʹprimeneniârazličnyhtipovdnkprobadlâidentifikaciimarkernyhhromosom
AT gorovenkong éffektivnostʹprimeneniârazličnyhtipovdnkprobadlâidentifikaciimarkernyhhromosom