Зображення обкладинки

Molecular docking and molecular dynamics simulation studies on Thermus thermophilus leucyl-tRNA synthetase complexed with different amino acids and pre-transfer editing substrates

Aim. To investigate the structural bases for the amino acid selectivity of the Thermus thermophilus leucyl-tRNA synthetase (LeuRSTT) aminoacylation site and to disclose the binding pattern of pre-transfer editing substrates. Methods. Eight amino acids proposed as semi-cognate substrates for aminoacy...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Опубліковано в: :	Вiopolymers and Cell
Дата:	2016
Автори:	Rayevsky, A.V., Tukalo, M.A.
Формат:	Стаття
Мова:	Англійська
Опубліковано:	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2016
Теми:	Bioinformatics
Онлайн доступ:	https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152770
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:	Molecular docking and molecular dynamics simulation studies on Thermus thermophilus leucyl-tRNA synthetase complexed with different amino acids and pre-transfer editing substrates / A.V. Rayevsky, M.A. Tukalo // Вiopolymers and Cell. — 2016. — Т. 32, № 1. — С. 61-69. — Бібліогр.: 24 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

Схожі ресурси

Molecular docking and molecular dynamics simulation studies on Thermus thermophilus leucyl-tRNA synthetase complexed with different amino acids and pre-transfer editing substrates
за авторством: A. V. Rayevsky, та інші
Опубліковано: (2016)

Computational approaches for parameterization of aminoacyl-tRNA synthetase substrates
за авторством: Rayevsky, O.V., та інші
Опубліковано: (2018)

Leucyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus. Purification and some properties of the crystallizing enzyme
за авторством: Yaremchuk, A.D., та інші
Опубліковано: (2001)

The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
за авторством: Mykuliak, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)

Molecular cloning, sequencing and sequence analysis of Thermus thermophilus tyrosyl-tRNA synthetase
за авторством: Yaremchuk, A.D., та інші
Опубліковано: (2004)

Prolyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus is eukaryotic-like but aminoacylates prokaryotic tRNA Pro
за авторством: A. D. Yaremchuk, та інші
Опубліковано: (2012)

Prolyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus is eukaryotic-like but aminoacylates prokaryotic tRNAPro
за авторством: Yaremchuk, A.D., та інші
Опубліковано: (2012)

Expression and purification of full-length Alanyl-tRNA-synthetase from Thermus thermophilus HB27
за авторством: Rybak, M.Yu., та інші
Опубліковано: (2018)

Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of the hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker
за авторством: Pydiura, N.A., та інші
Опубліковано: (2012)

Cloning, expression and purification of D-Tyr-tRNA Tyr -deacylase from Thermus thermophilus
за авторством: Yu. Rybak, та інші
Опубліковано: (2015)

The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
за авторством: V. V. Mykuliak, та інші
Опубліковано: (2014)

Conformational flexibility of interdomain linker in bovine tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulation
за авторством: Pydiura, N.A., та інші
Опубліковано: (2006)

Geometric filters for protein–ligand complexes based on phenomenological molecular models
за авторством: Sudakov, O.O., та інші
Опубліковано: (2013)

Design of potentially active ligands for SH2 domains by molecular modeling methods
за авторством: Hurmach, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)

New technique of identifying the hierarchy of dynamic domains in proteins using a method of molecular dynamics simulations
за авторством: Yesylevskyy, S.O.
Опубліковано: (2010)

Recognition of tRNAs with a long variable arm by aminoacyl-tRNA synthetases
за авторством: M. A. Tukalo, та інші
Опубліковано: (2013)

Recognition of tRNAs with a long variable arm by aminoacyl-tRNA synthetases
за авторством: Tukalo, M.A., та інші
Опубліковано: (2013)

Computational modeling of molecular dynamics of G41R mutant form of human tyrosyl-tRNA synthetase, assosiated with Charcot-Marie-Tooth neuropathy
за авторством: O. V. Savytskyi, та інші
Опубліковано: (2015)

Molecular docking and assessment of thiacalix
за авторством: Yu. V. Shulha, та інші
Опубліковано: (2018)

Autoantibodies against tyrosyl-tRNA synthetase and its separated domains at essential hypertension
за авторством: Yu. Grom, та інші
Опубліковано: (2015)

Autoantibodies against tyrosyl-tRNA synthetase and its separated domains at essential hypertension
за авторством: Grom, M.Yu., та інші
Опубліковано: (2015)

The immunochemical cross-reactivity between cytoplasmic and mitochondrial mammalian lysyl-tRNA synthetases
за авторством: Sidorik, L.L., та інші
Опубліковано: (2000)

Structure and dynamics of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor
за авторством: V. V. Mykuliak, та інші
Опубліковано: (2014)

Cytokine activity of the non-catalytic EMAP-2-like domain of mammalian tyrosyl-tRNA synthetase
за авторством: Kornelyuk, A., та інші
Опубліковано: (1999)

Homology modeling of structure of NH₂-terminal module of mammalian (Bos taurus) tyrosyl-tRNA synthetase
за авторством: Odynets, K.A., та інші
Опубліковано: (2002)

Association of mitochondrial lysyl-tRNA synthetase with HIV-1 GagPol involves catalytic domain of the synthetase and transframe and integrase domains of Pol
за авторством: Kobbi, L., та інші
Опубліковано: (2011)

Molecular docking study of oligonucleotides with D-mannitol
за авторством: V. Shchodryi, та інші
Опубліковано: (2017)

Bioinformatics analysis of cis-regulatory elements in Mbl1 and Mbl2 genes in Rattus norvegicus
за авторством: Bondarenko, V.S., та інші
Опубліковано: (2015)

Creation of gene expression database on preeclampsia-affected human placenta
за авторством: Lykhenko, O., та інші
Опубліковано: (2017)

Objective clustering inductive technology of gene expression profiles based on sota clustering algorithm
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2017)

Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2016)

Cobaltand nickel-containing enzyme constructs from the sequences of methanogens
за авторством: Chellapandi P., та інші
Опубліковано: (2012)

Similarity and dissimilarity of primary structures of some Streptomyces spp. genomes and the Streptomyces globisporus 1912-2 chromosomal DNA
за авторством: Polishchuk, L.V.
Опубліковано: (2017)

Критерії оцінки результатів мікромасив-експерименту з дослідження транскриптому гепатоцитів щура під впливом інтерферону альфа
за авторством: Куклін, А.В., та інші
Опубліковано: (2013)

Comparative analysis of nuclear localization signal (NLS) prediction methods
за авторством: Lisitsyna, O.M., та інші
Опубліковано: (2017)

Mathematical modeling of folate-related processes in human placenta
за авторством: Dotsenko, V.A., та інші
Опубліковано: (2014)

Біоінформатичний аналіз вторинної структури тринскриптів інтрона 1 гена whp1 кукурудзи
за авторством: Сліщук, Г.І., та інші
Опубліковано: (2012)

PTI-1: novel way to oncogenicity
за авторством: Vislovukh, A.A., та інші
Опубліковано: (2012)

A link between β-catenin and hypertrophy: evaluation and meta-analysis
за авторством: Palchevska, O.L., та інші
Опубліковано: (2016)

Identification of hierarchy of dynamic domains in proteins: comparison of HDWA and HCCP techniques
за авторством: Yesylevskyy, S.O.
Опубліковано: (2010)