Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer
Aim. The article presents the researches on the optimization of the DNA microarray data processing, which is aimed at improving the quality of object clustering. Methods. Data preprocessing was performed with program R using Bioconductor package. Modelling the clustering process was made in the soft...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Вiopolymers and Cell |
|---|---|
| Дата: | 2016 |
| Автори: | Babichev, S.A., Kornelyuk, A.I., Lytvynenko, V.I., Osypenko, V.V. |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Англійська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2016
|
| Теми: | |
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152773 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer / S.A. Babichev, A.I. Kornelyuk, V.I. Lytvynenko, V.V. Osypenko // Вiopolymers and Cell. — 2016. — Т. 32, № 1. — С. 70-79. — Бібліогр.: 16 назв. — англ. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of UkraineСхожі ресурси
Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer
за авторством: S. A. Babichev, та інші
Опубліковано: (2016)
за авторством: S. A. Babichev, та інші
Опубліковано: (2016)
Objective clustering inductive technology of gene expression profiles based on sota clustering algorithm
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2017)
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2017)
Creation of gene expression database on preeclampsia-affected human placenta
за авторством: Lykhenko, O., та інші
Опубліковано: (2017)
за авторством: Lykhenko, O., та інші
Опубліковано: (2017)
The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
за авторством: Mykuliak, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)
за авторством: Mykuliak, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)
Microarray based gene expression profiling of advanced gall bladder cancer
за авторством: Kumar, A., та інші
Опубліковано: (2023)
за авторством: Kumar, A., та інші
Опубліковано: (2023)
Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of the hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker
за авторством: Pydiura, N.A., та інші
Опубліковано: (2012)
за авторством: Pydiura, N.A., та інші
Опубліковано: (2012)
Computational approaches for parameterization of aminoacyl-tRNA synthetase substrates
за авторством: Rayevsky, O.V., та інші
Опубліковано: (2018)
за авторством: Rayevsky, O.V., та інші
Опубліковано: (2018)
Bioinformatics analysis of cis-regulatory elements in Mbl1 and Mbl2 genes in Rattus norvegicus
за авторством: Bondarenko, V.S., та інші
Опубліковано: (2015)
за авторством: Bondarenko, V.S., та інші
Опубліковано: (2015)
Microarray study of gene expression in uterine leiomyoma
за авторством: Litovkin, K.V., та інші
Опубліковано: (2008)
за авторством: Litovkin, K.V., та інші
Опубліковано: (2008)
Design of potentially active ligands for SH2 domains by molecular modeling methods
за авторством: Hurmach, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)
за авторством: Hurmach, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)
Similarity and dissimilarity of primary structures of some Streptomyces spp. genomes and the Streptomyces globisporus 1912-2 chromosomal DNA
за авторством: Polishchuk, L.V.
Опубліковано: (2017)
за авторством: Polishchuk, L.V.
Опубліковано: (2017)
Comparative analysis of nuclear localization signal (NLS) prediction methods
за авторством: Lisitsyna, O.M., та інші
Опубліковано: (2017)
за авторством: Lisitsyna, O.M., та інші
Опубліковано: (2017)
New technique of identifying the hierarchy of dynamic domains in proteins using a method of molecular dynamics simulations
за авторством: Yesylevskyy, S.O.
Опубліковано: (2010)
за авторством: Yesylevskyy, S.O.
Опубліковано: (2010)
Geometric filters for protein–ligand complexes based on phenomenological molecular models
за авторством: Sudakov, O.O., та інші
Опубліковано: (2013)
за авторством: Sudakov, O.O., та інші
Опубліковано: (2013)
Cobaltand nickel-containing enzyme constructs from the sequences of methanogens
за авторством: Chellapandi P., та інші
Опубліковано: (2012)
за авторством: Chellapandi P., та інші
Опубліковано: (2012)
Критерії оцінки результатів мікромасив-експерименту з дослідження транскриптому гепатоцитів щура під впливом інтерферону альфа
за авторством: Куклін, А.В., та інші
Опубліковано: (2013)
за авторством: Куклін, А.В., та інші
Опубліковано: (2013)
PROMETHEE filter-based method for microarray gene expression data
за авторством: T. Ouaderhman, та інші
Опубліковано: (2023)
за авторством: T. Ouaderhman, та інші
Опубліковано: (2023)
Technology of Wavelet-Filtra¬tion of the Gene Expression Profiles in Order to Remove the Background Noise
за авторством: S. A. Babichev
Опубліковано: (2017)
за авторством: S. A. Babichev
Опубліковано: (2017)
Expression of cancer-associated genes in prostate tumors
за авторством: Rosenberg, E.E., та інші
Опубліковано: (2017)
за авторством: Rosenberg, E.E., та інші
Опубліковано: (2017)
Genetic and epigenetic alterations of human chromosome 3, investigated by NotI-microarrays in seven types of epithelial cancers
за авторством: Gerashchenko, G.V., та інші
Опубліковано: (2018)
за авторством: Gerashchenko, G.V., та інші
Опубліковано: (2018)
TRP genes family expression in colorectal cancer
за авторством: Sozucan, Y., та інші
Опубліковано: (2015)
за авторством: Sozucan, Y., та інші
Опубліковано: (2015)
TRP genes family expression in colorectal cancer
за авторством: Y. Sozucan, та інші
Опубліковано: (2015)
за авторством: Y. Sozucan, та інші
Опубліковано: (2015)
Development of gene expression panels to determine prostate cancer
за авторством: G. V. Gerashchenko, та інші
Опубліковано: (2019)
за авторством: G. V. Gerashchenko, та інші
Опубліковано: (2019)
Expression pattern of genes associated with tumor microenvironment in prostate cancer
за авторством: Gerashchenko, G.V., та інші
Опубліковано: (2018)
за авторством: Gerashchenko, G.V., та інші
Опубліковано: (2018)
Recurrent neural network usage for computer-aided lung cancer detection system
за авторством: B. V. Chapaliuk, та інші
Опубліковано: (2019)
за авторством: B. V. Chapaliuk, та інші
Опубліковано: (2019)
Paraneoplastic syndrome in lung cancer
за авторством: Dumansky, Yu.V., та інші
Опубліковано: (2018)
за авторством: Dumansky, Yu.V., та інші
Опубліковано: (2018)
Paraneoplastic syndrome in lung cancer
за авторством: Dumansky, Yu.V., та інші
Опубліковано: (2018)
за авторством: Dumansky, Yu.V., та інші
Опубліковано: (2018)
Expression profiling of plac1 in murine cancer cell lines
за авторством: Mahmoudian, J., та інші
Опубліковано: (2023)
за авторством: Mahmoudian, J., та інші
Опубліковано: (2023)
Expression profiling of SCN8A and NDUFC2 genes in colorectal carcinoma
за авторством: Igci, Y.Z., та інші
Опубліковано: (2015)
за авторством: Igci, Y.Z., та інші
Опубліковано: (2015)
Heterogeneity of premetastatic niches gene expression in breast cancer cells
за авторством: L. A. Tashireva, та інші
Опубліковано: (2015)
за авторством: L. A. Tashireva, та інші
Опубліковано: (2015)
Endothelial dysfunction of vessels at lung cancer
за авторством: Yu. V. Dumanskiy, та інші
Опубліковано: (2015)
за авторством: Yu. V. Dumanskiy, та інші
Опубліковано: (2015)
Endothelial dysfunction of vessels at lung cancer
за авторством: Dumanskiy, Yu.V., та інші
Опубліковано: (2015)
за авторством: Dumanskiy, Yu.V., та інші
Опубліковано: (2015)
Gene expression profiling of B-CLL in Ukrainian patients in post-Chernobyl period
за авторством: Savli, H., та інші
Опубліковано: (2012)
за авторством: Savli, H., та інші
Опубліковано: (2012)
Influence of UV-B on expression profiles of genes involved in the development of autophagy by means of microtubules
за авторством: V. D. Olenieva, та інші
Опубліковано: (2018)
за авторством: V. D. Olenieva, та інші
Опубліковано: (2018)
Application of DNA microarrays in modern fish-farming
за авторством: I. A. Zaloilo, та інші
Опубліковано: (2015)
за авторством: I. A. Zaloilo, та інші
Опубліковано: (2015)
Expression profile of miR¬200 family members and their targets in prostate cancer
за авторством: M. Khorasani, та інші
Опубліковано: (2021)
за авторством: M. Khorasani, та інші
Опубліковано: (2021)
The state of bone metabolism in lung cancer patients
за авторством: Dumansky, Y.V., та інші
Опубліковано: (2018)
за авторством: Dumansky, Y.V., та інші
Опубліковано: (2018)
Analysis of the expression and products accumulation of CD-marker genes in cultures of lung and skin rats fibroblasts in ontogenesis
за авторством: M. Gritsenko
Опубліковано: (2018)
за авторством: M. Gritsenko
Опубліковано: (2018)
The dynamics of element content in patients with lung cancer during radiotherapy
за авторством: Dikiy, N.P., та інші
Опубліковано: (2009)
за авторством: Dikiy, N.P., та інші
Опубліковано: (2009)
Treatment of patients with kidney cancer metastases to the lungs
за авторством: A. G. Kudrjashov, та інші
Опубліковано: (2012)
за авторством: A. G. Kudrjashov, та інші
Опубліковано: (2012)
Схожі ресурси
-
Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer
за авторством: S. A. Babichev, та інші
Опубліковано: (2016) -
Objective clustering inductive technology of gene expression profiles based on sota clustering algorithm
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2017) -
Creation of gene expression database on preeclampsia-affected human placenta
за авторством: Lykhenko, O., та інші
Опубліковано: (2017) -
The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
за авторством: Mykuliak, V.V., та інші
Опубліковано: (2014) -
Microarray based gene expression profiling of advanced gall bladder cancer
за авторством: Kumar, A., та інші
Опубліковано: (2023)