Phylogenetic analysis of influenza A viruses (H1N1)pdm circulating during 2014–2015 epidemic season in Ukraine
Aim. To analyze the pandemic influenza A(H1N1) strains that circulated in Ukraine during 2014–2015 epidemic season. Methods. Real-time polymerase chain reaction (RT-PCR). The phylogenetic trees were constructed using MEGA 6 software. Results. The strains, that were circulating in Ukraine were simila...
Saved in:
| Date: | 2016 |
|---|---|
| Main Authors: | , , , |
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2016
|
| Series: | Вiopolymers and Cell |
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152841 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Phylogenetic analysis of influenza A viruses (H1N1)pdm circulating during 2014–2015 epidemic season in Ukraine / L.V. Radchenko, O.Yu. Smutko, A.Yu. Fesenko, A.P. Mironenko // Вiopolymers and Cell. — 2016. — Т. 32, № 5. — С. 377-380. — Бібліогр.: 11 назв. — англ. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| id |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-152841 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| fulltext |
|
| spelling |
nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-1528412025-02-09T12:31:45Z Phylogenetic analysis of influenza A viruses (H1N1)pdm circulating during 2014–2015 epidemic season in Ukraine Філогенетичний аналіз вірусів грипу A (H1N1) ДПМ, епідемії 2014-2015 в Україні Филогенетический анализ вирусов гриппа A (H1N1) ДПМ, эпидемии 2014-2015 в Украине Radchenko, L.V. Smutko, O.Yu. Fesenko, A.Yu. Mironenko, A.P. Viruses and Cell Aim. To analyze the pandemic influenza A(H1N1) strains that circulated in Ukraine during 2014–2015 epidemic season. Methods. Real-time polymerase chain reaction (RT-PCR). The phylogenetic trees were constructed using MEGA 6 software. Results. The strains, that were circulating in Ukraine were similar to those of the A/California/07/2009 (H1N1) vaccine strain. Most strains belonged to the clade 6B. The H275Y mutation in the neuraminidase (NA) gene was identified, that confers resistance to oseltamivir. Conclusions. Based on the nucleotide sequences of HA and NA genes, we constructed the influenza virus phylogenetic trees. The influenza virus isolated in 2014–2015 epidemic season had a specific mutation, associated with resistance to antiviral drugs such as oseltamivir. Мета. Молекулярний та філогенетичний аналіз пандемічних вірусів грипу A(H1N1), що циркулювали в Україні протягом сезо-ну 2014-2015 років. Методи. Зразки були проаналізовані методом полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР) в реальному часі. Філогенетичні дерева будували в програмі MEGA 6. Результати. Сиквенси українських ізолятів вірусів грипу A(H1N1)pdm були подібними до вакцинного штаму A/California/07/2009. Більшість штамів належали до кладу 6В. Серед досліджуваних ізолятів виявили мутацію H275Y в гені нейрамінідази, яка зумовлює стійкість до озельтамівіру. Висновки. Базуючись на сиквенсах генів HA і NA вірусів грипу побудували філогенетичні дерева. Український вірус, виділений в сезоні 2014-2015 років мав специфічну мутацію, яку асоціюють з стійкістю до противірусних препаратів, таких як озельтамівір. Цель. Молекулярный и филогенетический анализ пандемических вирусов гриппа A(H1N1), которые циркулировали в Украине на протяжении 2014-2015 годов. Методы. Образцы были проанализированы методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) в реальном времени. Филогенетические деревья построили в программе MEGA 6. Результаты. Сиквенсы украинских изолятов вирусов гриппа A(H1N1)pdm были подобными к вакцинному штамму A/California/07/2009. Большинство штаммов принадлежа-ли к клайду 6В. Среди исследованных изолятов обнаружили мутацию H275Y в гене нейраминидазы. Выводы. Основываясь на сиквенсах генов HA и NA вирусов гриппа, построили филогенетические деревья. Украинский вирус, изолированный в сезоне 2014-2015 годов имел специфическую мутацию, которую ассоциируют с устойчивостью к противовирусным препаратам, таким как осельтамивир. 2016 Article Phylogenetic analysis of influenza A viruses (H1N1)pdm circulating during 2014–2015 epidemic season in Ukraine / L.V. Radchenko, O.Yu. Smutko, A.Yu. Fesenko, A.P. Mironenko // Вiopolymers and Cell. — 2016. — Т. 32, № 5. — С. 377-380. — Бібліогр.: 11 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000931 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152841 575.86 + 578.832.1 en Вiopolymers and Cell application/pdf Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| institution |
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| collection |
DSpace DC |
| language |
English |
| topic |
Viruses and Cell Viruses and Cell |
| spellingShingle |
Viruses and Cell Viruses and Cell Radchenko, L.V. Smutko, O.Yu. Fesenko, A.Yu. Mironenko, A.P. Phylogenetic analysis of influenza A viruses (H1N1)pdm circulating during 2014–2015 epidemic season in Ukraine Вiopolymers and Cell |
| description |
Aim. To analyze the pandemic influenza A(H1N1) strains that circulated in Ukraine during 2014–2015 epidemic season. Methods. Real-time polymerase chain reaction (RT-PCR). The phylogenetic trees were constructed using MEGA 6 software. Results. The strains, that were circulating in Ukraine were similar to those of the A/California/07/2009 (H1N1) vaccine strain. Most strains belonged to the clade 6B. The H275Y mutation in the neuraminidase (NA) gene was identified, that confers resistance to oseltamivir. Conclusions. Based on the nucleotide sequences of HA and NA genes, we constructed the influenza virus phylogenetic trees. The influenza virus isolated in 2014–2015 epidemic season had a specific mutation, associated with resistance to antiviral drugs such as oseltamivir. |
| format |
Article |
| author |
Radchenko, L.V. Smutko, O.Yu. Fesenko, A.Yu. Mironenko, A.P. |
| author_facet |
Radchenko, L.V. Smutko, O.Yu. Fesenko, A.Yu. Mironenko, A.P. |
| author_sort |
Radchenko, L.V. |
| title |
Phylogenetic analysis of influenza A viruses (H1N1)pdm circulating during 2014–2015 epidemic season in Ukraine |
| title_short |
Phylogenetic analysis of influenza A viruses (H1N1)pdm circulating during 2014–2015 epidemic season in Ukraine |
| title_full |
Phylogenetic analysis of influenza A viruses (H1N1)pdm circulating during 2014–2015 epidemic season in Ukraine |
| title_fullStr |
Phylogenetic analysis of influenza A viruses (H1N1)pdm circulating during 2014–2015 epidemic season in Ukraine |
| title_full_unstemmed |
Phylogenetic analysis of influenza A viruses (H1N1)pdm circulating during 2014–2015 epidemic season in Ukraine |
| title_sort |
phylogenetic analysis of influenza a viruses (h1n1)pdm circulating during 2014–2015 epidemic season in ukraine |
| publisher |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| publishDate |
2016 |
| topic_facet |
Viruses and Cell |
| url |
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152841 |
| citation_txt |
Phylogenetic analysis of influenza A viruses (H1N1)pdm circulating during 2014–2015 epidemic season in Ukraine / L.V. Radchenko, O.Yu. Smutko, A.Yu. Fesenko, A.P. Mironenko // Вiopolymers and Cell. — 2016. — Т. 32, № 5. — С. 377-380. — Бібліогр.: 11 назв. — англ. |
| series |
Вiopolymers and Cell |
| work_keys_str_mv |
AT radchenkolv phylogeneticanalysisofinfluenzaavirusesh1n1pdmcirculatingduring20142015epidemicseasoninukraine AT smutkooyu phylogeneticanalysisofinfluenzaavirusesh1n1pdmcirculatingduring20142015epidemicseasoninukraine AT fesenkoayu phylogeneticanalysisofinfluenzaavirusesh1n1pdmcirculatingduring20142015epidemicseasoninukraine AT mironenkoap phylogeneticanalysisofinfluenzaavirusesh1n1pdmcirculatingduring20142015epidemicseasoninukraine AT radchenkolv fílogenetičnijanalízvírusívgripuah1n1dpmepídemíí20142015vukraíní AT smutkooyu fílogenetičnijanalízvírusívgripuah1n1dpmepídemíí20142015vukraíní AT fesenkoayu fílogenetičnijanalízvírusívgripuah1n1dpmepídemíí20142015vukraíní AT mironenkoap fílogenetičnijanalízvírusívgripuah1n1dpmepídemíí20142015vukraíní AT radchenkolv filogenetičeskijanalizvirusovgrippaah1n1dpmépidemii20142015vukraine AT smutkooyu filogenetičeskijanalizvirusovgrippaah1n1dpmépidemii20142015vukraine AT fesenkoayu filogenetičeskijanalizvirusovgrippaah1n1dpmépidemii20142015vukraine AT mironenkoap filogenetičeskijanalizvirusovgrippaah1n1dpmépidemii20142015vukraine |
| first_indexed |
2025-11-25T23:55:27Z |
| last_indexed |
2025-11-25T23:55:27Z |
| _version_ |
1849808573815586816 |