Structural and functional significance of microsatellites

• Published in: Вiopolymers and Cell
• Date: 2016
• Main Authors: Sjakste, T., Paramonova, N., Sjakste, N.
• Format: Article
• Language: English
• Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2016
• Subjects: Reviews
• Online Access: https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/152844
• Journal Title: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Cite this: Structural and functional significance of microsatellites / T. Sjakste, N. Paramonova, N. Sjakste // Вiopolymers and Cell. — 2016. — Т. 32, № 5. — С. 334-346. — Бібліогр.: 122 назв. — англ.

Here we review literature data on impact of microsatellite repeats on DNA and chromatin structure and the results of studies on association between the length of microsatellite repeats and predisposition to pathologies. The DNA secondary structure is modified in microsatellite sites, the repeats favor formation of Z-DNA, hairpins, triplexes and quadruplexes. The chromatin structure and chromatin loop organization are also modified in microsatellite sites. The data of association studies are classified according to the localization of the microsatellite: in the gene promoter, in exon 1 part coding the signal sequence, in the gene introns, coding areas and 3’-UTRs. Огляд узагальнює дані літератури про вплив мікросателітних повторів на структуру ДНК і хроматину та результати досліджень щодо зв'язку між довжиною мікросателітних повторів і схильныстю до патологій. У мікросателітних сайтах змінюється вторинна структура ДНК, загальна структура і організація петлі хроматину; повтори сприяють утворенню Z-ДНК, шпильок, триплексів і квадруплексов. Дані досліджень по асоціаціям класифікують по локалізації мікросателітів: у промоторі гена, в області першого екзона, що кодує сигнальну послідовність, в інтронній т частини, та в кодуючий в 3'-UTR ділянках гена. Обзор обобщает данные литературы о влиянии микросателлитных повторов на ДНК и структуру хроматина и положительные результаты исследований связи между длиной микросателлитных повторов и предрасположенности к патологиям. В микросателлитных сайтах изменяется вторичная структура ДНК, общая структура и организация петли хроматина; повторы способствуют образованию Z-ДНК, шпилек, триплексов и квадруплексов. Данные исследований по ассоциациям классифицируются по локализации микросателлитов: в промоторе гена, в области первого экзона кодирующей сигнальную последовательность, в интронной части, в кодирующих и в 3'-UTR областях гена.