Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 1. Geometry and energetics of the gating
The aim of this series of papers is to develop the semi-quantitative theory of the gating of KcsA channel. For this purpose the available structural and electrophysiological data and the results of molecular dynamics simulations were used in the context of the concept of dynamical self-organization....
Saved in:
| Published in: | Вiopolymers and Cell |
|---|---|
| Date: | 2009 |
| Main Authors: | , , , , |
| Format: | Article |
| Language: | English |
| Published: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
2009
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153000 |
| Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
| Journal Title: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Cite this: | Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 1. Geometry and energetics of the gating / V.N. Kharkyanen, S.O. Yesylevskyy, N.M. Berezetskaya, C. Boiteux, Ch. Ramseyer 
 // Вiopolymers and Cell. — 2009. — Т. 25, № 5. — С. 390-397. — Бібліогр.: 13 назв. — англ. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862554686750457856 |
|---|---|
| author | Kharkyanen, V.N. Yesylevskyy, S.O. Berezetskaya, N.M. Boiteux, C. Ramseyer, Ch. |
| author_facet | Kharkyanen, V.N. Yesylevskyy, S.O. Berezetskaya, N.M. Boiteux, C. Ramseyer, Ch. |
| citation_txt | Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 1. Geometry and energetics of the gating / V.N. Kharkyanen, S.O. Yesylevskyy, N.M. Berezetskaya, C. Boiteux, Ch. Ramseyer 
 // Вiopolymers and Cell. — 2009. — Т. 25, № 5. — С. 390-397. — Бібліогр.: 13 назв. — англ. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Вiopolymers and Cell |
| description | The aim of this series of papers is to develop the semi-quantitative theory of the gating of KcsA channel. For this purpose the available structural and electrophysiological data and the results of molecular dynamics simulations were used in the context of the concept of dynamical self-organization. In the first paper we describe the simplified model of the geometry and energetics of the gating process. This work is the first successful attempt of combining the structure and dynamics of a real protein and the general concept of dynamic self-organization.
Мета даної серії робіт полягає у розробці напівкількісної теорії воротних процесів в іонному каналі KcsA. Для цього залучено доступні експериментальні дані, а також результати молекулярної динаміки у контексті концепції динамічної самоорганізації. У першій роботі серії представлено спрощену модель геометрії та енергетики воротних процесів. Наведено першу успішну спробу об’єднання даних щодо структури та динаміки реального білка з концепцією динамічної самоорганізації.
Целью данной серии работ является разработка полуколи- чественной теории воротных процессов в ионном канале KcsA. Для этого использованы доступные экспериментальные данные, а также результаты молекулярной динамики в контексте концепции динамической самоорганизации. В первой работе серии представлена упрощенная модель геометрии и энергетики воротных процессов. Приведена первая успешная попытка объединения данных о структуре и динамике реального белка с концепцией динамической самоорганизации.
|
| first_indexed | 2025-11-25T22:11:38Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-153000 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | English |
| last_indexed | 2025-11-25T22:11:38Z |
| publishDate | 2009 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Kharkyanen, V.N. Yesylevskyy, S.O. Berezetskaya, N.M. Boiteux, C. Ramseyer, Ch. 2019-06-13T12:12:14Z 2019-06-13T12:12:14Z 2009 Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 1. Geometry and energetics of the gating / V.N. Kharkyanen, S.O. Yesylevskyy, N.M. Berezetskaya, C. Boiteux, Ch. Ramseyer 
 // Вiopolymers and Cell. — 2009. — Т. 25, № 5. — С. 390-397. — Бібліогр.: 13 назв. — англ. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0007F1 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153000 577.322 The aim of this series of papers is to develop the semi-quantitative theory of the gating of KcsA channel. For this purpose the available structural and electrophysiological data and the results of molecular dynamics simulations were used in the context of the concept of dynamical self-organization. In the first paper we describe the simplified model of the geometry and energetics of the gating process. This work is the first successful attempt of combining the structure and dynamics of a real protein and the general concept of dynamic self-organization. Мета даної серії робіт полягає у розробці напівкількісної теорії воротних процесів в іонному каналі KcsA. Для цього залучено доступні експериментальні дані, а також результати молекулярної динаміки у контексті концепції динамічної самоорганізації. У першій роботі серії представлено спрощену модель геометрії та енергетики воротних процесів. Наведено першу успішну спробу об’єднання даних щодо структури та динаміки реального білка з концепцією динамічної самоорганізації. Целью данной серии работ является разработка полуколи- чественной теории воротных процессов в ионном канале KcsA. Для этого использованы доступные экспериментальные данные, а также результаты молекулярной динамики в контексте концепции динамической самоорганизации. В первой работе серии представлена упрощенная модель геометрии и энергетики воротных процессов. Приведена первая успешная попытка объединения данных о структуре и динамике реального белка с концепцией динамической самоорганизации. en Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Вiopolymers and Cell Молекулярна біофізика Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 1. Geometry and energetics of the gating Напівкількісна модель воротних процесів в іонному каналі KcsA. 1. Геометрія та енергетика воротних процесів Полуколичественная модель воротных процессов в ионном канале KcsA. 1. Геометрия и энергетика воротных процессов Article published earlier |
| spellingShingle | Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 1. Geometry and energetics of the gating Kharkyanen, V.N. Yesylevskyy, S.O. Berezetskaya, N.M. Boiteux, C. Ramseyer, Ch. Молекулярна біофізика |
| title | Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 1. Geometry and energetics of the gating |
| title_alt | Напівкількісна модель воротних процесів в іонному каналі KcsA. 1. Геометрія та енергетика воротних процесів Полуколичественная модель воротных процессов в ионном канале KcsA. 1. Геометрия и энергетика воротных процессов |
| title_full | Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 1. Geometry and energetics of the gating |
| title_fullStr | Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 1. Geometry and energetics of the gating |
| title_full_unstemmed | Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 1. Geometry and energetics of the gating |
| title_short | Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 1. Geometry and energetics of the gating |
| title_sort | semi-quantitative model of the gating of kcsa ion channel. 1. geometry and energetics of the gating |
| topic | Молекулярна біофізика |
| topic_facet | Молекулярна біофізика |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153000 |
| work_keys_str_mv | AT kharkyanenvn semiquantitativemodelofthegatingofkcsaionchannel1geometryandenergeticsofthegating AT yesylevskyyso semiquantitativemodelofthegatingofkcsaionchannel1geometryandenergeticsofthegating AT berezetskayanm semiquantitativemodelofthegatingofkcsaionchannel1geometryandenergeticsofthegating AT boiteuxc semiquantitativemodelofthegatingofkcsaionchannel1geometryandenergeticsofthegating AT ramseyerch semiquantitativemodelofthegatingofkcsaionchannel1geometryandenergeticsofthegating AT kharkyanenvn napívkílʹkísnamodelʹvorotnihprocesívvíonnomukanalíkcsa1geometríâtaenergetikavorotnihprocesív AT yesylevskyyso napívkílʹkísnamodelʹvorotnihprocesívvíonnomukanalíkcsa1geometríâtaenergetikavorotnihprocesív AT berezetskayanm napívkílʹkísnamodelʹvorotnihprocesívvíonnomukanalíkcsa1geometríâtaenergetikavorotnihprocesív AT boiteuxc napívkílʹkísnamodelʹvorotnihprocesívvíonnomukanalíkcsa1geometríâtaenergetikavorotnihprocesív AT ramseyerch napívkílʹkísnamodelʹvorotnihprocesívvíonnomukanalíkcsa1geometríâtaenergetikavorotnihprocesív AT kharkyanenvn polukoličestvennaâmodelʹvorotnyhprocessovvionnomkanalekcsa1geometriâiénergetikavorotnyhprocessov AT yesylevskyyso polukoličestvennaâmodelʹvorotnyhprocessovvionnomkanalekcsa1geometriâiénergetikavorotnyhprocessov AT berezetskayanm polukoličestvennaâmodelʹvorotnyhprocessovvionnomkanalekcsa1geometriâiénergetikavorotnyhprocessov AT boiteuxc polukoličestvennaâmodelʹvorotnyhprocessovvionnomkanalekcsa1geometriâiénergetikavorotnyhprocessov AT ramseyerch polukoličestvennaâmodelʹvorotnyhprocessovvionnomkanalekcsa1geometriâiénergetikavorotnyhprocessov |