Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 2. Dynamic self-organization model of the gating

The aim of this series of papers is to develop the semi-quantitative theory of the gating of KcsA channel. Methods. For this purpose available structural and electrophysiological data and the results of molecular dynamics simulations were used in the context of the concept of dynamical self-organiza...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Вiopolymers and Cell
Date:2009
Main Authors: Kharkyanen, V.N., Yesylevskyy, S.O., Berezetskaya, N.M., Boiteux, C., Ramseyer, Ch.
Format: Article
Language:English
Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2009
Subjects:
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153307
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 2. Dynamic self-organization model of the gating / V.N. Kharkyanen, S.O. Yesylevskyy, N.M. Berezetskaya, C. Boiteux, Ch. Ramseyer // Biopolymers and Cell. — 2009. — Т. 25, № 6. — С. 476-483. — Бібліогр.: 16 назв. — англ.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
_version_ 1862661248466812928
author Kharkyanen, V.N.
Yesylevskyy, S.O.
Berezetskaya, N.M.
Boiteux, C.
Ramseyer, Ch.
author_facet Kharkyanen, V.N.
Yesylevskyy, S.O.
Berezetskaya, N.M.
Boiteux, C.
Ramseyer, Ch.
citation_txt Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 2. Dynamic self-organization model of the gating / V.N. Kharkyanen, S.O. Yesylevskyy, N.M. Berezetskaya, C. Boiteux, Ch. Ramseyer // Biopolymers and Cell. — 2009. — Т. 25, № 6. — С. 476-483. — Бібліогр.: 16 назв. — англ.
collection DSpace DC
container_title Вiopolymers and Cell
description The aim of this series of papers is to develop the semi-quantitative theory of the gating of KcsA channel. Methods. For this purpose available structural and electrophysiological data and the results of molecular dynamics simulations were used in the context of the concept of dynamical self-organization. In the second paper we describe the principles of dynamic self-organization and develop the theory of KcsA channel gating based on this concept. Conclusions. Present work is the first successful attempt of combining the structure and dynamics of real protein and the general concept of dynamic self-organization. Мета даної серії робіт полягає у розробці напівкількісної теорії воротних процесів в іонному каналі KcsA. Методи. Для цього залучено доступні експериментальні дані, а також результати молекулярної динаміки у контексті концепції динамічної самоорганізації. Результати. У другій роботі серії описано принципи динамічної самоорганізації та розроблено теорію воротних процесів у каналі KcsA, що базується на цих принципах. Наведено першу успішну спробу об’єднання даних щодо структури та динаміки реального білка з концепцією динамічної самоорганізації. Целью данной серии работ является разработка полуколичественной теории воротных процессов в ионном канале KcsA. Методы. Для этого использованы доступные экспериментальные данные, а также результаты молекулярной динамики в контексте концепции динамической самоорганизации. Результаты. Во второй работе серии описаны принципы динамической самоорганизации и разработана теория воротных процессов в канале KcsA, базирующаяся на этих принципах. Представлена первая успешная попытка объединения данных о структуре и динамике реального белка с концепцией динамической самоорганизации.
first_indexed 2025-12-02T11:37:56Z
format Article
fulltext
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-153307
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
issn 0233-7657
language English
last_indexed 2025-12-02T11:37:56Z
publishDate 2009
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
record_format dspace
spelling Kharkyanen, V.N.
Yesylevskyy, S.O.
Berezetskaya, N.M.
Boiteux, C.
Ramseyer, Ch.
2019-06-13T17:56:28Z
2019-06-13T17:56:28Z
2009
Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 2. Dynamic self-organization model of the gating / V.N. Kharkyanen, S.O. Yesylevskyy, N.M. Berezetskaya, C. Boiteux, Ch. Ramseyer // Biopolymers and Cell. — 2009. — Т. 25, № 6. — С. 476-483. — Бібліогр.: 16 назв. — англ.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.0007FA
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153307
577.322
The aim of this series of papers is to develop the semi-quantitative theory of the gating of KcsA channel. Methods. For this purpose available structural and electrophysiological data and the results of molecular dynamics simulations were used in the context of the concept of dynamical self-organization. In the second paper we describe the principles of dynamic self-organization and develop the theory of KcsA channel gating based on this concept. Conclusions. Present work is the first successful attempt of combining the structure and dynamics of real protein and the general concept of dynamic self-organization.
Мета даної серії робіт полягає у розробці напівкількісної теорії воротних процесів в іонному каналі KcsA. Методи. Для цього залучено доступні експериментальні дані, а також результати молекулярної динаміки у контексті концепції динамічної самоорганізації. Результати. У другій роботі серії описано принципи динамічної самоорганізації та розроблено теорію воротних процесів у каналі KcsA, що базується на цих принципах. Наведено першу успішну спробу об’єднання даних щодо структури та динаміки реального білка з концепцією динамічної самоорганізації.
Целью данной серии работ является разработка полуколичественной теории воротных процессов в ионном канале KcsA. Методы. Для этого использованы доступные экспериментальные данные, а также результаты молекулярной динамики в контексте концепции динамической самоорганизации. Результаты. Во второй работе серии описаны принципы динамической самоорганизации и разработана теория воротных процессов в канале KcsA, базирующаяся на этих принципах. Представлена первая успешная попытка объединения данных о структуре и динамике реального белка с концепцией динамической самоорганизации.
en
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Вiopolymers and Cell
Молекулярна біофізика
Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 2. Dynamic self-organization model of the gating
Напівкількісна модель воротних процесів в іонному каналі KcsA. 2. Модель динамічної самоорганізації воротних процесів
Полуколичественная модель воротных процессов в ионном канале KcsA. 2. Модель динамической самоорганизации воротных процессов
Article
published earlier
spellingShingle Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 2. Dynamic self-organization model of the gating
Kharkyanen, V.N.
Yesylevskyy, S.O.
Berezetskaya, N.M.
Boiteux, C.
Ramseyer, Ch.
Молекулярна біофізика
title Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 2. Dynamic self-organization model of the gating
title_alt Напівкількісна модель воротних процесів в іонному каналі KcsA. 2. Модель динамічної самоорганізації воротних процесів
Полуколичественная модель воротных процессов в ионном канале KcsA. 2. Модель динамической самоорганизации воротных процессов
title_full Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 2. Dynamic self-organization model of the gating
title_fullStr Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 2. Dynamic self-organization model of the gating
title_full_unstemmed Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 2. Dynamic self-organization model of the gating
title_short Semi-quantitative model of the gating of KcsA ion channel. 2. Dynamic self-organization model of the gating
title_sort semi-quantitative model of the gating of kcsa ion channel. 2. dynamic self-organization model of the gating
topic Молекулярна біофізика
topic_facet Молекулярна біофізика
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153307
work_keys_str_mv AT kharkyanenvn semiquantitativemodelofthegatingofkcsaionchannel2dynamicselforganizationmodelofthegating
AT yesylevskyyso semiquantitativemodelofthegatingofkcsaionchannel2dynamicselforganizationmodelofthegating
AT berezetskayanm semiquantitativemodelofthegatingofkcsaionchannel2dynamicselforganizationmodelofthegating
AT boiteuxc semiquantitativemodelofthegatingofkcsaionchannel2dynamicselforganizationmodelofthegating
AT ramseyerch semiquantitativemodelofthegatingofkcsaionchannel2dynamicselforganizationmodelofthegating
AT kharkyanenvn napívkílʹkísnamodelʹvorotnihprocesívvíonnomukanalíkcsa2modelʹdinamíčnoísamoorganízacíívorotnihprocesív
AT yesylevskyyso napívkílʹkísnamodelʹvorotnihprocesívvíonnomukanalíkcsa2modelʹdinamíčnoísamoorganízacíívorotnihprocesív
AT berezetskayanm napívkílʹkísnamodelʹvorotnihprocesívvíonnomukanalíkcsa2modelʹdinamíčnoísamoorganízacíívorotnihprocesív
AT boiteuxc napívkílʹkísnamodelʹvorotnihprocesívvíonnomukanalíkcsa2modelʹdinamíčnoísamoorganízacíívorotnihprocesív
AT ramseyerch napívkílʹkísnamodelʹvorotnihprocesívvíonnomukanalíkcsa2modelʹdinamíčnoísamoorganízacíívorotnihprocesív
AT kharkyanenvn polukoličestvennaâmodelʹvorotnyhprocessovvionnomkanalekcsa2modelʹdinamičeskoisamoorganizaciivorotnyhprocessov
AT yesylevskyyso polukoličestvennaâmodelʹvorotnyhprocessovvionnomkanalekcsa2modelʹdinamičeskoisamoorganizaciivorotnyhprocessov
AT berezetskayanm polukoličestvennaâmodelʹvorotnyhprocessovvionnomkanalekcsa2modelʹdinamičeskoisamoorganizaciivorotnyhprocessov
AT boiteuxc polukoličestvennaâmodelʹvorotnyhprocessovvionnomkanalekcsa2modelʹdinamičeskoisamoorganizaciivorotnyhprocessov
AT ramseyerch polukoličestvennaâmodelʹvorotnyhprocessovvionnomkanalekcsa2modelʹdinamičeskoisamoorganizaciivorotnyhprocessov