The start of systems biology in Ukraine

• Veröffentlicht in: Вiopolymers and Cell
• Datum: 2014
• Hauptverfasser: Obolenskaya, M.Yu., Tokovenko, B.T., Kuklin, A.V., Frolova, A.A., Rodriguez, R.R., Dotsenko, V.A., Dragushchenko, O.O.
• Format: Artikel
• Sprache: English
• Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2014
• Schlagworte: Reviews
• Online Zugang: https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153726
• Назва журналу: Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
• Zitieren: The start of systems biology in Ukraine / M.Yu. Obolenskaya, B.T. Tokovenko, A.V. Kuklin, A.A. Frolova, R.R. Rodriguez, V.A. Dotsenko, O.O. Dragushchenko // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 1. — С. 16-24. — Бібліогр.: 47 назв. — англ.

The first laboratory of Systems Biology in Ukraine (IMBIG NASU) represents a track record of its scientific results. They include the pioneered development of a web-based tool for genome-wide surveys of eukaryotic promoters for the presence of transcription factors binding sites (COTRASIF); the deciphered mechanisms of the fine-tuned and balanced response of primary hepatocytes to interferon alpha levels recorded after partial hepatectomy; the elaboration of a novel method of gene regulatory network inference compatible with GRID environment and the development of a stoichiometric model of folate-related one carbon unit metabolism in human placenta and its application for the characteristics of the system’s behavior as a whole at different human pathologies. Представлено наукові здобутки першої в Україні (ІМБіГ НАН України) лабораторії системної біології. Вони включають створення веб-інструменту для всегеномного пошуку сайтів зв’язування транскрипційних факторів у промоторах евкаріотних генів; розкриття тонко збалансованого механізму відповіді первинних гепатоцитів на дію інтерферону альфа в дозі, зареєстрованій на першому етапі регенерації печінки після часткової гепатектомії; розробку нового методу інференції мережі генної регуляції для його використання в середовищі ГРІД і створення стехіометричної моделі фолатного циклу у плаценті людини для характеристики поведінки системи за різних патологічних станів. Представлены научные наработки первой в Украине (ИМБиГ НАН Украины) лаборатории системной биологии. Они включают создание веб-инструмента для всегеномного поиска сайтов связывания транскрипционных факторов в промоторах эукариотических генов; раскрытие тонко сбалансированного механизма ответа первичных гепатоцитов на действие интерферона альфа в дозе, регистрируемой в печени на раннем этапе после частичной гепатэктомии; разработку нового метода инференции сетей генной регуляции для его использования в среде ГРИД и создание модели фолатного цикла в плаценте человека для характеристики поведения системы при разных патологических состояниях.