Влияние различной стабильности пар оснований на кинетику плавления ДНК

Влияние различной стабильности пар оснований на кинетику плавления ДНК

Рассматривается кинетика кооперативного выплавления участков ДНК, расположенных на границе спиральных областей. На основании точных расчетов, учитывающих реальную последовательность пар оснований в таких участках, показано, что внутренняя гетерогенность участков этого типа оказывает радикальное влия...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in:Биополимеры и клетка
Date:1987
Main Authors: Аншелевич, В.В., Вологодский, А.В.
Format: Article
Language:Russian
Published: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1987
Subjects:
Структура и функции биополимеров
Online Access:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153766
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
Journal Title:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Cite this:Влияние различной стабильности пар оснований на кинетику плавления ДНК / В.В. Аншелевич, А.В. Вологодский // Биополимеры и клетка. — 1987. — Т. 3, № 2. — С. 66-71. — Бібліогр.: 21 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-153766
record_format dspace
spelling Аншелевич, В.В.
Вологодский, А.В.
2019-06-14T15:54:07Z
2019-06-14T15:54:07Z
1987
Влияние различной стабильности пар оснований на кинетику плавления ДНК / В.В. Аншелевич, А.В. Вологодский // Биополимеры и клетка. — 1987. — Т. 3, № 2. — С. 66-71. — Бібліогр.: 21 назв. — рос.
0233-7657
DOI:http://dx.doi.org/10.7124/bc.0001D6
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153766
577.323.4
Рассматривается кинетика кооперативного выплавления участков ДНК, расположенных на границе спиральных областей. На основании точных расчетов, учитывающих реальную последовательность пар оснований в таких участках, показано, что внутренняя гетерогенность участков этого типа оказывает радикальное влияние на кинетику рассматриваемого процесса. Учет внутренней гетерогенности приводит к увеличению времени релаксации на несколько порядков по сравнению с моделью, в которой стабильность пар оснований внутри участка считается одинаковой. Получающиеся времена релаксации хорошо согласуются с экспериментальными данными. На основе проведенного анализа процесса удалось выделить простые характеристики последовательности, определяющие его скорость.
Розглянуто кінетику кооперативного виплавлення ділянок ДНК, розташованих на кордоні спіральних областей. На підставі точних розрахунків, які враховують реальну послідовність пар основ у таких ділянках, показано, що внутрішня гетерогенність ділянок цього типу чинить радикальний вплив на кінетику розглянутого процесу. Врахування внутрішньої гетерогенності призводить до збільшення часу релаксації на кілька порядків у порівнянні з моделлю, де стабільність пар основ усередині ділянки вважається однаковою. Отримувані часи релаксації добре узгоджуються з експериментальними даними. На основі проведеного аналізу процесу вдалося виокремити прості характеристики послідовності, що визначають його швидкість.
Kinetics of cooperative melting of DNA regions located at the edge of the helix is considered. Exact calculations show that a nucleotide sequence of such regions exerts a considerable effect on the process. Internal heterogeneity may increase the relaxation time by a few orders of magnitude as compared with the value when stability of base pairs throughout the region is assumed to be the same. Simple characteristics of the sequence which determine relaxation time of the process are presented.
Мы благодарим М. Д. Франк-Каменецкого и Б. Р. Амирикяна за полезные обсуждения и замечания.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Биополимеры и клетка
Структура и функции биополимеров
Влияние различной стабильности пар оснований на кинетику плавления ДНК
Вплив різної стабільності пар основ на кінетику плавлення ДНК
Effect of nucleotide sequence on kinetics of DNA melting
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Влияние различной стабильности пар оснований на кинетику плавления ДНК
spellingShingle Влияние различной стабильности пар оснований на кинетику плавления ДНК
Аншелевич, В.В.
Вологодский, А.В.
Структура и функции биополимеров
title_short Влияние различной стабильности пар оснований на кинетику плавления ДНК
title_full Влияние различной стабильности пар оснований на кинетику плавления ДНК
title_fullStr Влияние различной стабильности пар оснований на кинетику плавления ДНК
title_full_unstemmed Влияние различной стабильности пар оснований на кинетику плавления ДНК
title_sort влияние различной стабильности пар оснований на кинетику плавления днк
author Аншелевич, В.В.
Вологодский, А.В.
author_facet Аншелевич, В.В.
Вологодский, А.В.
topic Структура и функции биополимеров
topic_facet Структура и функции биополимеров
publishDate 1987
language Russian
container_title Биополимеры и клетка
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Вплив різної стабільності пар основ на кінетику плавлення ДНК
Effect of nucleotide sequence on kinetics of DNA melting
description Рассматривается кинетика кооперативного выплавления участков ДНК, расположенных на границе спиральных областей. На основании точных расчетов, учитывающих реальную последовательность пар оснований в таких участках, показано, что внутренняя гетерогенность участков этого типа оказывает радикальное влияние на кинетику рассматриваемого процесса. Учет внутренней гетерогенности приводит к увеличению времени релаксации на несколько порядков по сравнению с моделью, в которой стабильность пар оснований внутри участка считается одинаковой. Получающиеся времена релаксации хорошо согласуются с экспериментальными данными. На основе проведенного анализа процесса удалось выделить простые характеристики последовательности, определяющие его скорость. Розглянуто кінетику кооперативного виплавлення ділянок ДНК, розташованих на кордоні спіральних областей. На підставі точних розрахунків, які враховують реальну послідовність пар основ у таких ділянках, показано, що внутрішня гетерогенність ділянок цього типу чинить радикальний вплив на кінетику розглянутого процесу. Врахування внутрішньої гетерогенності призводить до збільшення часу релаксації на кілька порядків у порівнянні з моделлю, де стабільність пар основ усередині ділянки вважається однаковою. Отримувані часи релаксації добре узгоджуються з експериментальними даними. На основі проведеного аналізу процесу вдалося виокремити прості характеристики послідовності, що визначають його швидкість. Kinetics of cooperative melting of DNA regions located at the edge of the helix is considered. Exact calculations show that a nucleotide sequence of such regions exerts a considerable effect on the process. Internal heterogeneity may increase the relaxation time by a few orders of magnitude as compared with the value when stability of base pairs throughout the region is assumed to be the same. Simple characteristics of the sequence which determine relaxation time of the process are presented.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153766
citation_txt Влияние различной стабильности пар оснований на кинетику плавления ДНК / В.В. Аншелевич, А.В. Вологодский // Биополимеры и клетка. — 1987. — Т. 3, № 2. — С. 66-71. — Бібліогр.: 21 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT anšelevičvv vliânierazličnoistabilʹnostiparosnovaniinakinetikuplavleniâdnk
AT vologodskiiav vliânierazličnoistabilʹnostiparosnovaniinakinetikuplavleniâdnk
AT anšelevičvv vplivríznoístabílʹnostíparosnovnakínetikuplavlennâdnk
AT vologodskiiav vplivríznoístabílʹnostíparosnovnakínetikuplavlennâdnk
AT anšelevičvv effectofnucleotidesequenceonkineticsofdnamelting
AT vologodskiiav effectofnucleotidesequenceonkineticsofdnamelting
first_indexed 2025-12-07T18:33:50Z
last_indexed 2025-12-07T18:33:50Z
_version_ 1850875503740715008

Similar Items