Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК
Сайт-специфическая рекомбиназа Flp, кодируемая 2-мкм плазмидой из S. cerevisiae, имеет множественные точечные контакты с основаниями Flp-связывающего элемента ДНК. В настоящей работе проведен анализ относительного вклада контактов в прочность связывания белка Flp с ДНК и особенностей их распределени...
Збережено в:
| Опубліковано в: : | Биополимеры и клетка |
|---|---|
| Дата: | 1996 |
| Автор: | |
| Формат: | Стаття |
| Мова: | Російська |
| Опубліковано: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1996
|
| Онлайн доступ: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153792 |
| Теги: |
Додати тег
Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Цитувати: | Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК / Ю.А. Возиянов // Биополимеры и клетка. — 1996. — Т. 12, № 1. — С. 89-94. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. |
Репозитарії
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862543170016903168 |
|---|---|
| author | Возиянов, Ю.А. |
| author_facet | Возиянов, Ю.А. |
| citation_txt | Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК / Ю.А. Возиянов // Биополимеры и клетка. — 1996. — Т. 12, № 1. — С. 89-94. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Биополимеры и клетка |
| description | Сайт-специфическая рекомбиназа Flp, кодируемая 2-мкм плазмидой из S. cerevisiae, имеет множественные точечные контакты с основаниями Flp-связывающего элемента ДНК. В настоящей работе проведен анализ относительного вклада контактов в прочность связывания белка Flp с ДНК и особенностей их распределения в большом и малом желобке ДНК. Контакты белка Flp с Flp-связывающим элементом ДНК были подразделены на три группы в зависимости от их вклада в прочность связывания белка с ДНК. Предполагается, что белок Flp использует контакты третьей группы, которая вносит наименьший вклад в прочность связывания, наряду с контактами в малом желобке ДНК для первичной дискриминации между различными последовательностями ДНК Показано, что белок Flp имеет контакты с Flp-связывающим элементом ДНК в малом желобке с противоположных сторон двойной спирали ДНК, и, вероятно, белок Flp оплетает ДНК.
Сайт-специфічна рекомбіназа Flp, яка кодується 2-мкм плазмідою із S. cerevisiae, має множинні контакти з основами Flp-зв'язуюного елемента ДНК. В роботі здійснено аналіз відносного внеску контактів у міцність зв'язування білка Flp з ДНК та особливостей їх розподілу у великому та малому жолобках ДНК Контакти білка Flp з Flp-зв'язуючим елементом ДНК було підрозділено на три группи в залежності від їх внеску в міцність зв'язування білка з ДНК Припускається, що білок Flp використовує контакти третьої группи (котрі вносять найменший внесок у міцність зв'язування) поряд з контактами в малому жолобку ДНК для первинної дискримінації між різ ними послідовностями ДНК. Показано, що білок Flp має контакти з Flp-зв'язуючим элементом ДНК в малому жолобку з протилежних сторін подвійної спіралі ДНК і цілком імовірно, що білок Flp обплітає ДНК.
Site-specific recombinase Flp encoded by 2 micron plasmidfrom S. cerevisiae has multiple contacts with nucleic bases of Ftp-binding element of DNA. We present an analysis of relative contribution of these contacts to strength of Ftp-protein binding to DNA, and of the peculiarities of their distribution at major and minor grooves of DNA. The contacts of Flp-protein with Ftp-binding element of DNA have been divided into three groups depending on their contribution in strength of Flp-protein binding to DNA. It has been suggested that Flp-protein uses the third group of contacts (they make the least contribution to strength of Flp-protein binding to DNA) along with minor groove contacts for initial discrimination between different DNA sequences. It has been shown that Flp-protein has contacts with nucleic bases in minor groove at opposite sides of DNA, so Flp-protein probably wraps DNA.
|
| first_indexed | 2025-11-24T20:42:13Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-153792 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-11-24T20:42:13Z |
| publishDate | 1996 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Возиянов, Ю.А. 2019-06-14T16:15:35Z 2019-06-14T16:15:35Z 1996 Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК / Ю.А. Возиянов // Биополимеры и клетка. — 1996. — Т. 12, № 1. — С. 89-94. — Бібліогр.: 21 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.000418 https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153792 577.151.45 Сайт-специфическая рекомбиназа Flp, кодируемая 2-мкм плазмидой из S. cerevisiae, имеет множественные точечные контакты с основаниями Flp-связывающего элемента ДНК. В настоящей работе проведен анализ относительного вклада контактов в прочность связывания белка Flp с ДНК и особенностей их распределения в большом и малом желобке ДНК. Контакты белка Flp с Flp-связывающим элементом ДНК были подразделены на три группы в зависимости от их вклада в прочность связывания белка с ДНК. Предполагается, что белок Flp использует контакты третьей группы, которая вносит наименьший вклад в прочность связывания, наряду с контактами в малом желобке ДНК для первичной дискриминации между различными последовательностями ДНК Показано, что белок Flp имеет контакты с Flp-связывающим элементом ДНК в малом желобке с противоположных сторон двойной спирали ДНК, и, вероятно, белок Flp оплетает ДНК. Сайт-специфічна рекомбіназа Flp, яка кодується 2-мкм плазмідою із S. cerevisiae, має множинні контакти з основами Flp-зв'язуюного елемента ДНК. В роботі здійснено аналіз відносного внеску контактів у міцність зв'язування білка Flp з ДНК та особливостей їх розподілу у великому та малому жолобках ДНК Контакти білка Flp з Flp-зв'язуючим елементом ДНК було підрозділено на три группи в залежності від їх внеску в міцність зв'язування білка з ДНК Припускається, що білок Flp використовує контакти третьої группи (котрі вносять найменший внесок у міцність зв'язування) поряд з контактами в малому жолобку ДНК для первинної дискримінації між різ ними послідовностями ДНК. Показано, що білок Flp має контакти з Flp-зв'язуючим элементом ДНК в малому жолобку з протилежних сторін подвійної спіралі ДНК і цілком імовірно, що білок Flp обплітає ДНК. Site-specific recombinase Flp encoded by 2 micron plasmidfrom S. cerevisiae has multiple contacts with nucleic bases of Ftp-binding element of DNA. We present an analysis of relative contribution of these contacts to strength of Ftp-protein binding to DNA, and of the peculiarities of their distribution at major and minor grooves of DNA. The contacts of Flp-protein with Ftp-binding element of DNA have been divided into three groups depending on their contribution in strength of Flp-protein binding to DNA. It has been suggested that Flp-protein uses the third group of contacts (they make the least contribution to strength of Flp-protein binding to DNA) along with minor groove contacts for initial discrimination between different DNA sequences. It has been shown that Flp-protein has contacts with nucleic bases in minor groove at opposite sides of DNA, so Flp-protein probably wraps DNA. Автор благодарен А. И. Корнелюку и Д. М. Говоруну за критические замечания, высказанные при обсуждении работы. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Биополимеры и клетка Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК Можлива роль індивідуальних ДНК-білкових контактів сайт-специфічної рекомбінази Flp з Saccharomyces cerevisiae з азотистими основами Flp-зв'язуючого елемента ДНК Possible role of individual protein-DNA contacts of Flp site-specific recombinase from Saccharomyces cerevisiae with nucleic bases of Flp-binding element of DNA Article published earlier |
| spellingShingle | Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК Возиянов, Ю.А. |
| title | Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК |
| title_alt | Можлива роль індивідуальних ДНК-білкових контактів сайт-специфічної рекомбінази Flp з Saccharomyces cerevisiae з азотистими основами Flp-зв'язуючого елемента ДНК Possible role of individual protein-DNA contacts of Flp site-specific recombinase from Saccharomyces cerevisiae with nucleic bases of Flp-binding element of DNA |
| title_full | Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК |
| title_fullStr | Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК |
| title_full_unstemmed | Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК |
| title_short | Возможная роль индивидуальных ДНК-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы Flp из Saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями Flp-связывающего элемента ДНК |
| title_sort | возможная роль индивидуальных днк-белковых контактов сайт-специфической рекомбиназы flp из saccharomyces cerevisiae с азотистыми основаниями flp-связывающего элемента днк |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153792 |
| work_keys_str_mv | AT voziânovûa vozmožnaârolʹindividualʹnyhdnkbelkovyhkontaktovsaitspecifičeskoirekombinazyflpizsaccharomycescerevisiaesazotistymiosnovaniâmiflpsvâzyvaûŝegoélementadnk AT voziânovûa možlivarolʹíndivídualʹnihdnkbílkovihkontaktívsaitspecifíčnoírekombínaziflpzsaccharomycescerevisiaezazotistimiosnovamiflpzvâzuûčogoelementadnk AT voziânovûa possibleroleofindividualproteindnacontactsofflpsitespecificrecombinasefromsaccharomycescerevisiaewithnucleicbasesofflpbindingelementofdna |