Зображення обкладинки

The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations

Aim. To study the mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase (MtTyrRS). Methods. Complexes of MtTyrRS with tyrosine, ATP and tyrosyl adenylate were constructed by superposition of the MtTyrRS structure and crystallographic structur...

Повний опис

Збережено в:

Бібліографічні деталі
Опубліковано в: :	Вiopolymers and Cell
Дата:	2014
Автори:	Mykuliak, V.V., Kornelyuk, A.I.
Формат:	Стаття
Мова:	Англійська
Опубліковано:	Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 2014
Теми:	Bioinformatics
Онлайн доступ:	https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153798
Теги:	Додати тег Немає тегів, Будьте першим, хто поставить тег для цього запису!
Назва журналу:	Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Цитувати:	The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations / V.V. Mykuliak, A.I. Kornelyuk // Вiopolymers and Cell. — 2014. — Т. 30, № 2. — С. 157-162. — Бібліогр.: 39 назв. — англ.

Репозитарії

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine

Схожі ресурси

The mechanisms of substrates interaction with the active site of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulations
за авторством: V. V. Mykuliak, та інші
Опубліковано: (2014)

Computational approaches for parameterization of aminoacyl-tRNA synthetase substrates
за авторством: Rayevsky, O.V., та інші
Опубліковано: (2018)

Structure and dynamics of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor
за авторством: V. V. Mykuliak, та інші
Опубліковано: (2014)

Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of the hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker
за авторством: Pydiura, N.A., та інші
Опубліковано: (2012)

MD simulations of Mycobacterium tuberculosis tyrosyl-tRNA synthetase in complex with SB-219383 inhibitor using QM/MM approach
за авторством: V. V. Mykuliak, та інші
Опубліковано: (2016)

Conformational flexibility of interdomain linker in bovine tyrosyl-tRNA synthetase studied by molecular dynamics simulation
за авторством: Pydiura, N.A., та інші
Опубліковано: (2006)

Molecular cloning, sequencing and sequence analysis of Thermus thermophilus tyrosyl-tRNA synthetase
за авторством: Yaremchuk, A.D., та інші
Опубліковано: (2004)

Autoantibodies against tyrosyl-tRNA synthetase and its separated domains at essential hypertension
за авторством: Grom, M.Yu., та інші
Опубліковано: (2015)

Homology modeling of structure of NH₂-terminal module of mammalian (Bos taurus) tyrosyl-tRNA synthetase
за авторством: Odynets, K.A., та інші
Опубліковано: (2002)

Autoantibodies against tyrosyl-tRNA synthetase and its separated domains at essential hypertension
за авторством: Yu. Grom, та інші
Опубліковано: (2015)

Cytokine activity of the non-catalytic EMAP-2-like domain of mammalian tyrosyl-tRNA synthetase
за авторством: Kornelyuk, A., та інші
Опубліковано: (1999)

Flexible 3D structure of Bos taurus tyrosyl-tRNA synthetase suggests the existence of hinge mechanism provided by conservative Gly353 at interdomain linker
за авторством: N. A. Pydiura, та інші
Опубліковано: (2012)

Molecular docking and molecular dynamics simulation studies on Thermus thermophilus leucyl-tRNA synthetase complexed with different amino acids and pre-transfer editing substrates
за авторством: A. V. Rayevsky, та інші
Опубліковано: (2016)

Computational modeling of molecular dynamics of G41R mutant form of human tyrosyl-tRNA synthetase, assosiated with Charcot-Marie-Tooth neuropathy
за авторством: O. V. Savytskyi, та інші
Опубліковано: (2015)

New technique of identifying the hierarchy of dynamic domains in proteins using a method of molecular dynamics simulations
за авторством: Yesylevskyy, S.O.
Опубліковано: (2010)

Prolyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus is eukaryotic-like but aminoacylates prokaryotic tRNA Pro
за авторством: A. D. Yaremchuk, та інші
Опубліковано: (2012)

Objective clustering inductive technology of gene expression profiles based on sota clustering algorithm
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2017)

Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer
за авторством: Babichev, S.A., та інші
Опубліковано: (2016)

Geometric filters for protein–ligand complexes based on phenomenological molecular models
за авторством: Sudakov, O.O., та інші
Опубліковано: (2013)

Design of potentially active ligands for SH2 domains by molecular modeling methods
за авторством: Hurmach, V.V., та інші
Опубліковано: (2014)

Recognition of tRNAs with a long variable arm by aminoacyl-tRNA synthetases
за авторством: Tukalo, M.A., та інші
Опубліковано: (2013)

Recognition of tRNAs with a long variable arm by aminoacyl-tRNA synthetases
за авторством: M. A. Tukalo, та інші
Опубліковано: (2013)

Molecular technologies in detecting sensitive and isoniazidresistant mycobacterium tuberculosis
за авторством: Yu. Lymanska, та інші
Опубліковано: (2011)

Leucyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus. Purification and some properties of the crystallizing enzyme
за авторством: Yaremchuk, A.D., та інші
Опубліковано: (2001)

Prolyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus is eukaryotic-like but aminoacylates prokaryotic tRNAPro
за авторством: Yaremchuk, A.D., та інші
Опубліковано: (2012)

Creation of gene expression database on preeclampsia-affected human placenta
за авторством: Lykhenko, O., та інші
Опубліковано: (2017)

Bioinformatics analysis of cis-regulatory elements in Mbl1 and Mbl2 genes in Rattus norvegicus
за авторством: Bondarenko, V.S., та інші
Опубліковано: (2015)

Comparative analysis of nuclear localization signal (NLS) prediction methods
за авторством: Lisitsyna, O.M., та інші
Опубліковано: (2017)

Similarity and dissimilarity of primary structures of some Streptomyces spp. genomes and the Streptomyces globisporus 1912-2 chromosomal DNA
за авторством: Polishchuk, L.V.
Опубліковано: (2017)

Cobaltand nickel-containing enzyme constructs from the sequences of methanogens
за авторством: Chellapandi P., та інші
Опубліковано: (2012)

Критерії оцінки результатів мікромасив-експерименту з дослідження транскриптому гепатоцитів щура під впливом інтерферону альфа
за авторством: Куклін, А.В., та інші
Опубліковано: (2013)

Prediction of chemoresistant pulmonary tuberculosis severity depending on Mycobacterium Tuberculosis genotypes
за авторством: A. V. Rogozhin
Опубліковано: (2018)

In silico determination of T-epitopes of Mycobacterium tuberculosis proteins
за авторством: O. I. Krynina, та інші
Опубліковано: (2014)

Clusters of Mycobacterium tuberculosis genotypes in Odesa region
за авторством: P. B. Antonenko, та інші
Опубліковано: (2016)

Identification of modern and ancient Beijing strain sublineages in Kyiv&#039;s population of Mycobacterium tuberculosis
за авторством: Yu. O. Cherednyk, та інші
Опубліковано: (2015)

Виявлення сучасних та предкових субліній штамів родини Beijing у київській популяції Mycobacterium tuberculosis
за авторством: Чередник, Ю.О., та інші
Опубліковано: (2015)

Recognition of Mycobacterium tuberculosis antigens MPT63 and MPT83 by murine polyclonal and scFv antibodies
за авторством: A. A. Siromolot, та інші
Опубліковано: (2018)

Immunogenicity assay of KatG protein from Mycobacterium tuberculosis in mice: preliminary screening of TB vaccine
за авторством: P. Purkan, та інші
Опубліковано: (2018)

Obtaining of transgenic carrot (Daucus carota L.) plants expressing the genes of secretory Mycobacterium tuberculosis proteins
за авторством: Ju. S. Luchakivskaja, та інші
Опубліковано: (2011)

Микст−инфекция Mycobacterium tuberculosis, Epstein−Barr virus, Herpes human virus VI у детей
за авторством: Нелюбин, В.Н., та інші
Опубліковано: (2005)