Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n

Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n

В модельной системе инициации биосинтеза белка показано, что деаци- лированная инициаторная тРНК (TPHKfMet или fMet-tPHKfMet – в случае образования дипептида) связывается на Р-сайт 30S субчастицы комплекса [30S+AUG(U)„]. Далее этот тройной комплекс способен связывать вторую молекулу тРНК – Рhе-тРНКP...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Veröffentlicht in:Биополимеры и клетка
Datum:1988
Hauptverfasser: Гобштис, Н.А., Одинцов, В.Б., Кириллов, С.В.
Format: Artikel
Sprache:Russian
Veröffentlicht: Інститут молекулярної біології і генетики НАН України 1988
Schlagworte:
Структура и функции биополимеров
Online Zugang:https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153808
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Назва журналу:Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
Zitieren:Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n / Η.А. Гобштис, В.Б. Одинцов, С.В. Кириллов // Биополимеры и клетка. — 1988. — Т. 4, № 1. — С. 3-7. — Бібліогр.: 16 назв. — рос.

Institution

Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
id nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-153808
record_format dspace
spelling Гобштис, Н.А.
Одинцов, В.Б.
Кириллов, С.В.
2019-06-14T16:45:53Z
2019-06-14T16:45:53Z
1988
Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n / Η.А. Гобштис, В.Б. Одинцов, С.В. Кириллов // Биополимеры и клетка. — 1988. — Т. 4, № 1. — С. 3-7. — Бібліогр.: 16 назв. — рос.
0233-7657
DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00020A
https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153808
577.217
В модельной системе инициации биосинтеза белка показано, что деаци- лированная инициаторная тРНК (TPHKfMet или fMet-tPHKfMet – в случае образования дипептида) связывается на Р-сайт 30S субчастицы комплекса [30S+AUG(U)„]. Далее этот тройной комплекс способен связывать вторую молекулу тРНК – Рhе-тРНКPhe на А-сайт, и при добавлении 50S субчастиц образовывается дипептид fMet-Phe. Таким образом, на 30S субчастице имеются два сайта связывания тРНК, которые реализуются как функциональные Р- и А-сайты 70S рибосомы не только в поли (U)-зависимой системе, но и в исследованной системе с матрицей, несущей инициаторный кодон AUG. Измерены константы ассоциации TPHKfMet с комплексом [30S +AUG(U)n] и Phe-тPHKphe с комплексом [30S+AUG(U)n+тPHKfMet] при разных температурах и концентрациях ионов магния, рассчитаны термодинамические параметры этих взаимодействий.
У модельній системі ініціації біосинтезу білка показано, що деаці-лированной инициаторного тРНК (TPHKfMet або fMet-tPHKfMet-в разі утворення дипептида) зв'язується на Р-сайт 30S субчастіци комплексу [30S + AUG (U) "]. Далі цей потрійний комплекс здатний зв'язувати другий молекулу тРНК-Рhе-тРНКPhe на А-сайт, і при додаванні 50S субчастиц утворюється дипептид fMet-Phe. Таким чином, на 30S субчастиц є два сайта зв'язування тРНК, які реалізуються як функціональні Р-і А-сайти 70S рибосоми не тільки в полі (U)-залежної системі, а й у дослідженій системі з матрицею, несучої инициаторного кодон AUG. Виміряні константи асоціації TPHKfMet з комплексом [30S + AUG (U) n] і Phe-тPHKPhe з комплексом [30S + AUG (U) n + тPHKfMet] при різних температурах і концентраціях іонів магнію, розраховані термодинамічні параметри цих взаємодій.
Small ribosomal subunit of E. coli ribosome programmed by AUG(U)n is capable to bind two molecules of tRNA (tRNA,Met or fMet-tRNAfMet plus Phe-tRNAPhe). tRNAfMet is bound to P-site of SOS subunit of the complex [30S+AUG(U)n] (or to the site overlapped with P-site). Phe-tRNAphe is bound to A-site of 30S subunits of the complex [30S + 4-AUG(U)n+tRNAfMet] and its binding is inhibited by tetracycline. The association constants tRNAfMet with the complex [30S+AUG(U)n] and Phe-tRNAphe with the complex [30S+AUG(U)n+tRNAfMet] are measured at different temperatures and magnesium concentrations and thermodynamic parameters of these interactions are calculated. When fMet-tRNAfMet is bound instead of tRNAtMet, dipeptide (fMet-Phe) formation is observed after addition of SOS subunits. Thus, there are two tRNA binding sites on 30 S subunits which are realized as functional P- and A-sites of 70S ribosome not only in the poly(U)-dependent system but in the studied system with matrix carrying an initiator codon AUG.
ru
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
Биополимеры и клетка
Структура и функции биополимеров
Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n
Термодинаміка взаємодії деацильованої ініціаторної тРНК і аміноацил-тРНК з Р- і А-сайтами 30S субчастинок рибосом Escherichia coli на матриці AUG(U)n
Thermodynamics of interaction of deacylated initiator tRNA and aminoacyl-tRNA with P- and A-sites of 30S subunits of Escherichia coli ribosomes programmed by AUG(U)n
Article
published earlier
institution Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine
collection DSpace DC
title Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n
spellingShingle Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n
Гобштис, Н.А.
Одинцов, В.Б.
Кириллов, С.В.
Структура и функции биополимеров
title_short Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n
title_full Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n
title_fullStr Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n
title_full_unstemmed Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n
title_sort термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной трнк и аминоацил-трнк с р- и а-сайтами 30s субчастиц рибосом escherichia coli на матрице aug(u)n
author Гобштис, Н.А.
Одинцов, В.Б.
Кириллов, С.В.
author_facet Гобштис, Н.А.
Одинцов, В.Б.
Кириллов, С.В.
topic Структура и функции биополимеров
topic_facet Структура и функции биополимеров
publishDate 1988
language Russian
container_title Биополимеры и клетка
publisher Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
format Article
title_alt Термодинаміка взаємодії деацильованої ініціаторної тРНК і аміноацил-тРНК з Р- і А-сайтами 30S субчастинок рибосом Escherichia coli на матриці AUG(U)n
Thermodynamics of interaction of deacylated initiator tRNA and aminoacyl-tRNA with P- and A-sites of 30S subunits of Escherichia coli ribosomes programmed by AUG(U)n
description В модельной системе инициации биосинтеза белка показано, что деаци- лированная инициаторная тРНК (TPHKfMet или fMet-tPHKfMet – в случае образования дипептида) связывается на Р-сайт 30S субчастицы комплекса [30S+AUG(U)„]. Далее этот тройной комплекс способен связывать вторую молекулу тРНК – Рhе-тРНКPhe на А-сайт, и при добавлении 50S субчастиц образовывается дипептид fMet-Phe. Таким образом, на 30S субчастице имеются два сайта связывания тРНК, которые реализуются как функциональные Р- и А-сайты 70S рибосомы не только в поли (U)-зависимой системе, но и в исследованной системе с матрицей, несущей инициаторный кодон AUG. Измерены константы ассоциации TPHKfMet с комплексом [30S +AUG(U)n] и Phe-тPHKphe с комплексом [30S+AUG(U)n+тPHKfMet] при разных температурах и концентрациях ионов магния, рассчитаны термодинамические параметры этих взаимодействий. У модельній системі ініціації біосинтезу білка показано, що деаці-лированной инициаторного тРНК (TPHKfMet або fMet-tPHKfMet-в разі утворення дипептида) зв'язується на Р-сайт 30S субчастіци комплексу [30S + AUG (U) "]. Далі цей потрійний комплекс здатний зв'язувати другий молекулу тРНК-Рhе-тРНКPhe на А-сайт, і при додаванні 50S субчастиц утворюється дипептид fMet-Phe. Таким чином, на 30S субчастиц є два сайта зв'язування тРНК, які реалізуються як функціональні Р-і А-сайти 70S рибосоми не тільки в полі (U)-залежної системі, а й у дослідженій системі з матрицею, несучої инициаторного кодон AUG. Виміряні константи асоціації TPHKfMet з комплексом [30S + AUG (U) n] і Phe-тPHKPhe з комплексом [30S + AUG (U) n + тPHKfMet] при різних температурах і концентраціях іонів магнію, розраховані термодинамічні параметри цих взаємодій. Small ribosomal subunit of E. coli ribosome programmed by AUG(U)n is capable to bind two molecules of tRNA (tRNA,Met or fMet-tRNAfMet plus Phe-tRNAPhe). tRNAfMet is bound to P-site of SOS subunit of the complex [30S+AUG(U)n] (or to the site overlapped with P-site). Phe-tRNAphe is bound to A-site of 30S subunits of the complex [30S + 4-AUG(U)n+tRNAfMet] and its binding is inhibited by tetracycline. The association constants tRNAfMet with the complex [30S+AUG(U)n] and Phe-tRNAphe with the complex [30S+AUG(U)n+tRNAfMet] are measured at different temperatures and magnesium concentrations and thermodynamic parameters of these interactions are calculated. When fMet-tRNAfMet is bound instead of tRNAtMet, dipeptide (fMet-Phe) formation is observed after addition of SOS subunits. Thus, there are two tRNA binding sites on 30 S subunits which are realized as functional P- and A-sites of 70S ribosome not only in the poly(U)-dependent system but in the studied system with matrix carrying an initiator codon AUG.
issn 0233-7657
url https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153808
citation_txt Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n / Η.А. Гобштис, В.Б. Одинцов, С.В. Кириллов // Биополимеры и клетка. — 1988. — Т. 4, № 1. — С. 3-7. — Бібліогр.: 16 назв. — рос.
work_keys_str_mv AT gobštisna termodinamikavzaimodeistviâdeacilirovannoiiniciatornoitrnkiaminoaciltrnksriasaitami30ssubčasticribosomescherichiacolinamatriceaugun
AT odincovvb termodinamikavzaimodeistviâdeacilirovannoiiniciatornoitrnkiaminoaciltrnksriasaitami30ssubčasticribosomescherichiacolinamatriceaugun
AT kirillovsv termodinamikavzaimodeistviâdeacilirovannoiiniciatornoitrnkiaminoaciltrnksriasaitami30ssubčasticribosomescherichiacolinamatriceaugun
AT gobštisna termodinamíkavzaêmodíídeacilʹovanoíínícíatornoítrnkíamínoaciltrnkzríasaitami30ssubčastinokribosomescherichiacolinamatricíaugun
AT odincovvb termodinamíkavzaêmodíídeacilʹovanoíínícíatornoítrnkíamínoaciltrnkzríasaitami30ssubčastinokribosomescherichiacolinamatricíaugun
AT kirillovsv termodinamíkavzaêmodíídeacilʹovanoíínícíatornoítrnkíamínoaciltrnkzríasaitami30ssubčastinokribosomescherichiacolinamatricíaugun
AT gobštisna thermodynamicsofinteractionofdeacylatedinitiatortrnaandaminoacyltrnawithpandasitesof30ssubunitsofescherichiacoliribosomesprogrammedbyaugun
AT odincovvb thermodynamicsofinteractionofdeacylatedinitiatortrnaandaminoacyltrnawithpandasitesof30ssubunitsofescherichiacoliribosomesprogrammedbyaugun
AT kirillovsv thermodynamicsofinteractionofdeacylatedinitiatortrnaandaminoacyltrnawithpandasitesof30ssubunitsofescherichiacoliribosomesprogrammedbyaugun
first_indexed 2025-11-28T12:16:30Z
last_indexed 2025-11-28T12:16:30Z
_version_ 1850853754262257664

Ähnliche Einträge