Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n
В модельной системе инициации биосинтеза белка показано, что деаци- лированная инициаторная тРНК (TPHKfMet или fMet-tPHKfMet – в случае образования дипептида) связывается на Р-сайт 30S субчастицы комплекса [30S+AUG(U)„]. Далее этот тройной комплекс способен связывать вторую молекулу тРНК – Рhе-тРНКP...
Gespeichert in:
| Veröffentlicht in: | Биополимеры и клетка |
|---|---|
| Datum: | 1988 |
| Hauptverfasser: | , , |
| Format: | Artikel |
| Sprache: | Russisch |
| Veröffentlicht: |
Інститут молекулярної біології і генетики НАН України
1988
|
| Schlagworte: | |
| Online Zugang: | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153808 |
| Tags: |
Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
|
| Назва журналу: | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| Zitieren: | Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n / Η.А. Гобштис, В.Б. Одинцов, С.В. Кириллов // Биополимеры и клетка. — 1988. — Т. 4, № 1. — С. 3-7. — Бібліогр.: 16 назв. — рос. |
Institution
Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine| _version_ | 1862606392177721344 |
|---|---|
| author | Гобштис, Н.А. Одинцов, В.Б. Кириллов, С.В. |
| author_facet | Гобштис, Н.А. Одинцов, В.Б. Кириллов, С.В. |
| citation_txt | Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n / Η.А. Гобштис, В.Б. Одинцов, С.В. Кириллов // Биополимеры и клетка. — 1988. — Т. 4, № 1. — С. 3-7. — Бібліогр.: 16 назв. — рос. |
| collection | DSpace DC |
| container_title | Биополимеры и клетка |
| description | В модельной системе инициации биосинтеза белка показано, что деаци- лированная инициаторная тРНК (TPHKfMet или fMet-tPHKfMet – в случае образования дипептида) связывается на Р-сайт 30S субчастицы комплекса [30S+AUG(U)„]. Далее этот тройной комплекс способен связывать вторую молекулу тРНК – Рhе-тРНКPhe на А-сайт, и при добавлении 50S субчастиц образовывается дипептид fMet-Phe. Таким образом, на 30S субчастице имеются два сайта связывания тРНК, которые реализуются как функциональные Р- и А-сайты 70S рибосомы не только в поли (U)-зависимой системе, но и в исследованной системе с матрицей, несущей инициаторный кодон AUG. Измерены константы ассоциации TPHKfMet с комплексом [30S +AUG(U)n] и Phe-тPHKphe с комплексом [30S+AUG(U)n+тPHKfMet] при разных температурах и концентрациях ионов магния, рассчитаны термодинамические параметры этих взаимодействий.
У модельній системі ініціації біосинтезу білка показано, що деаці-лированной инициаторного тРНК (TPHKfMet або fMet-tPHKfMet-в разі утворення дипептида) зв'язується на Р-сайт 30S субчастіци комплексу [30S + AUG (U) "]. Далі цей потрійний комплекс здатний зв'язувати другий молекулу тРНК-Рhе-тРНКPhe на А-сайт, і при додаванні 50S субчастиц утворюється дипептид fMet-Phe. Таким чином, на 30S субчастиц є два сайта зв'язування тРНК, які реалізуються як функціональні Р-і А-сайти 70S рибосоми не тільки в полі (U)-залежної системі, а й у дослідженій системі з матрицею, несучої инициаторного кодон AUG. Виміряні константи асоціації TPHKfMet з комплексом [30S + AUG (U) n] і Phe-тPHKPhe з комплексом [30S + AUG (U) n + тPHKfMet] при різних температурах і концентраціях іонів магнію, розраховані термодинамічні параметри цих взаємодій.
Small ribosomal subunit of E. coli ribosome programmed by AUG(U)n is capable to bind two molecules of tRNA (tRNA,Met or fMet-tRNAfMet plus Phe-tRNAPhe). tRNAfMet is bound to P-site of SOS subunit of the complex [30S+AUG(U)n] (or to the site overlapped with P-site). Phe-tRNAphe is bound to A-site of 30S subunits of the complex [30S + 4-AUG(U)n+tRNAfMet] and its binding is inhibited by tetracycline. The association constants tRNAfMet with the complex [30S+AUG(U)n] and Phe-tRNAphe with the complex [30S+AUG(U)n+tRNAfMet] are measured at different temperatures and magnesium concentrations and thermodynamic parameters of these interactions are calculated. When fMet-tRNAfMet is bound instead of tRNAtMet, dipeptide (fMet-Phe) formation is observed after addition of SOS subunits. Thus, there are two tRNA binding sites on 30 S subunits which are realized as functional P- and A-sites of 70S ribosome not only in the poly(U)-dependent system but in the studied system with matrix carrying an initiator codon AUG.
|
| first_indexed | 2025-11-28T12:16:30Z |
| format | Article |
| fulltext | |
| id | nasplib_isofts_kiev_ua-123456789-153808 |
| institution | Digital Library of Periodicals of National Academy of Sciences of Ukraine |
| issn | 0233-7657 |
| language | Russian |
| last_indexed | 2025-11-28T12:16:30Z |
| publishDate | 1988 |
| publisher | Інститут молекулярної біології і генетики НАН України |
| record_format | dspace |
| spelling | Гобштис, Н.А. Одинцов, В.Б. Кириллов, С.В. 2019-06-14T16:45:53Z 2019-06-14T16:45:53Z 1988 Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n / Η.А. Гобштис, В.Б. Одинцов, С.В. Кириллов // Биополимеры и клетка. — 1988. — Т. 4, № 1. — С. 3-7. — Бібліогр.: 16 назв. — рос. 0233-7657 DOI: http://dx.doi.org/10.7124/bc.00020A https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153808 577.217 В модельной системе инициации биосинтеза белка показано, что деаци- лированная инициаторная тРНК (TPHKfMet или fMet-tPHKfMet – в случае образования дипептида) связывается на Р-сайт 30S субчастицы комплекса [30S+AUG(U)„]. Далее этот тройной комплекс способен связывать вторую молекулу тРНК – Рhе-тРНКPhe на А-сайт, и при добавлении 50S субчастиц образовывается дипептид fMet-Phe. Таким образом, на 30S субчастице имеются два сайта связывания тРНК, которые реализуются как функциональные Р- и А-сайты 70S рибосомы не только в поли (U)-зависимой системе, но и в исследованной системе с матрицей, несущей инициаторный кодон AUG. Измерены константы ассоциации TPHKfMet с комплексом [30S +AUG(U)n] и Phe-тPHKphe с комплексом [30S+AUG(U)n+тPHKfMet] при разных температурах и концентрациях ионов магния, рассчитаны термодинамические параметры этих взаимодействий. У модельній системі ініціації біосинтезу білка показано, що деаці-лированной инициаторного тРНК (TPHKfMet або fMet-tPHKfMet-в разі утворення дипептида) зв'язується на Р-сайт 30S субчастіци комплексу [30S + AUG (U) "]. Далі цей потрійний комплекс здатний зв'язувати другий молекулу тРНК-Рhе-тРНКPhe на А-сайт, і при додаванні 50S субчастиц утворюється дипептид fMet-Phe. Таким чином, на 30S субчастиц є два сайта зв'язування тРНК, які реалізуються як функціональні Р-і А-сайти 70S рибосоми не тільки в полі (U)-залежної системі, а й у дослідженій системі з матрицею, несучої инициаторного кодон AUG. Виміряні константи асоціації TPHKfMet з комплексом [30S + AUG (U) n] і Phe-тPHKPhe з комплексом [30S + AUG (U) n + тPHKfMet] при різних температурах і концентраціях іонів магнію, розраховані термодинамічні параметри цих взаємодій. Small ribosomal subunit of E. coli ribosome programmed by AUG(U)n is capable to bind two molecules of tRNA (tRNA,Met or fMet-tRNAfMet plus Phe-tRNAPhe). tRNAfMet is bound to P-site of SOS subunit of the complex [30S+AUG(U)n] (or to the site overlapped with P-site). Phe-tRNAphe is bound to A-site of 30S subunits of the complex [30S + 4-AUG(U)n+tRNAfMet] and its binding is inhibited by tetracycline. The association constants tRNAfMet with the complex [30S+AUG(U)n] and Phe-tRNAphe with the complex [30S+AUG(U)n+tRNAfMet] are measured at different temperatures and magnesium concentrations and thermodynamic parameters of these interactions are calculated. When fMet-tRNAfMet is bound instead of tRNAtMet, dipeptide (fMet-Phe) formation is observed after addition of SOS subunits. Thus, there are two tRNA binding sites on 30 S subunits which are realized as functional P- and A-sites of 70S ribosome not only in the poly(U)-dependent system but in the studied system with matrix carrying an initiator codon AUG. ru Інститут молекулярної біології і генетики НАН України Биополимеры и клетка Структура и функции биополимеров Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n Термодинаміка взаємодії деацильованої ініціаторної тРНК і аміноацил-тРНК з Р- і А-сайтами 30S субчастинок рибосом Escherichia coli на матриці AUG(U)n Thermodynamics of interaction of deacylated initiator tRNA and aminoacyl-tRNA with P- and A-sites of 30S subunits of Escherichia coli ribosomes programmed by AUG(U)n Article published earlier |
| spellingShingle | Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n Гобштис, Н.А. Одинцов, В.Б. Кириллов, С.В. Структура и функции биополимеров |
| title | Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n |
| title_alt | Термодинаміка взаємодії деацильованої ініціаторної тРНК і аміноацил-тРНК з Р- і А-сайтами 30S субчастинок рибосом Escherichia coli на матриці AUG(U)n Thermodynamics of interaction of deacylated initiator tRNA and aminoacyl-tRNA with P- and A-sites of 30S subunits of Escherichia coli ribosomes programmed by AUG(U)n |
| title_full | Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n |
| title_fullStr | Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n |
| title_full_unstemmed | Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n |
| title_short | Термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной тРНК и аминоацил-тРНК с Р- и А-сайтами 30S субчастиц рибосом Escherichia coli на матрице AUG(U)n |
| title_sort | термодинамика взаимодействия деацилированной инициаторной трнк и аминоацил-трнк с р- и а-сайтами 30s субчастиц рибосом escherichia coli на матрице aug(u)n |
| topic | Структура и функции биополимеров |
| topic_facet | Структура и функции биополимеров |
| url | https://nasplib.isofts.kiev.ua/handle/123456789/153808 |
| work_keys_str_mv | AT gobštisna termodinamikavzaimodeistviâdeacilirovannoiiniciatornoitrnkiaminoaciltrnksriasaitami30ssubčasticribosomescherichiacolinamatriceaugun AT odincovvb termodinamikavzaimodeistviâdeacilirovannoiiniciatornoitrnkiaminoaciltrnksriasaitami30ssubčasticribosomescherichiacolinamatriceaugun AT kirillovsv termodinamikavzaimodeistviâdeacilirovannoiiniciatornoitrnkiaminoaciltrnksriasaitami30ssubčasticribosomescherichiacolinamatriceaugun AT gobštisna termodinamíkavzaêmodíídeacilʹovanoíínícíatornoítrnkíamínoaciltrnkzríasaitami30ssubčastinokribosomescherichiacolinamatricíaugun AT odincovvb termodinamíkavzaêmodíídeacilʹovanoíínícíatornoítrnkíamínoaciltrnkzríasaitami30ssubčastinokribosomescherichiacolinamatricíaugun AT kirillovsv termodinamíkavzaêmodíídeacilʹovanoíínícíatornoítrnkíamínoaciltrnkzríasaitami30ssubčastinokribosomescherichiacolinamatricíaugun AT gobštisna thermodynamicsofinteractionofdeacylatedinitiatortrnaandaminoacyltrnawithpandasitesof30ssubunitsofescherichiacoliribosomesprogrammedbyaugun AT odincovvb thermodynamicsofinteractionofdeacylatedinitiatortrnaandaminoacyltrnawithpandasitesof30ssubunitsofescherichiacoliribosomesprogrammedbyaugun AT kirillovsv thermodynamicsofinteractionofdeacylatedinitiatortrnaandaminoacyltrnawithpandasitesof30ssubunitsofescherichiacoliribosomesprogrammedbyaugun |